MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Acidovorax avenae subsp. avenae ATCC 19860 chromosome

Total Repeats: 4056

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015138	CGCAGC	2	12	5397809	5397820	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	326319486
4002	NC_015138	TTGGCC	2	12	5400144	5400155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319487
4003	NC_015138	CAGGCC	2	12	5400939	5400950	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	326319488
4004	NC_015138	CGGGCT	2	12	5402429	5402440	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	326319490
4005	NC_015138	TCCACC	2	12	5403438	5403449	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	326319491
4006	NC_015138	CCGGCA	2	12	5404066	5404077	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	326319491
4007	NC_015138	CGTGGC	2	12	5404391	5404402	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	326319491
4008	NC_015138	GCACGT	2	12	5404724	5404735	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	326319492
4009	NC_015138	AGTCGT	2	12	5408036	5408047	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	326319493
4010	NC_015138	ACGGCA	2	12	5409811	5409822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319494
4011	NC_015138	CGATGA	2	12	5411249	5411260	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	326319496
4012	NC_015138	CCGGCC	2	12	5411735	5411746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326319497
4013	NC_015138	CACCGG	2	12	5412221	5412232	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	326319497
4014	NC_015138	CCATGC	2	12	5413395	5413406	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	326319498
4015	NC_015138	ACGGCA	2	12	5421626	5421637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326319508
4016	NC_015138	ACGTGG	2	12	5426049	5426060	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	326319512
4017	NC_015138	ATCGGC	2	12	5426226	5426237	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	326319513
4018	NC_015138	TCGTGG	2	12	5426869	5426880	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	326319513
4019	NC_015138	CTCACG	2	12	5427269	5427280	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	326319514
4020	NC_015138	GGGCAT	2	12	5428593	5428604	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	326319515
4021	NC_015138	ACCGTC	2	12	5428708	5428719	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	326319515
4022	NC_015138	CGTGGC	2	12	5431197	5431208	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	326319518
4023	NC_015138	GGCCGA	2	12	5431455	5431466	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	326319518
4024	NC_015138	ATCGCC	2	12	5433884	5433895	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	326319521
4025	NC_015138	CGGGCG	2	12	5434401	5434412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326319521
4026	NC_015138	CCAACC	2	12	5434680	5434691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326319521
4027	NC_015138	TGGAAA	2	12	5434842	5434853	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	326319521
4028	NC_015138	GCCATC	2	12	5436265	5436276	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	326319522
4029	NC_015138	CCGCGG	2	12	5438733	5438744	0 %	0 %	50 %	50 %	326319525
4030	NC_015138	ACGCGC	2	12	5439200	5439211	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	326319525
4031	NC_015138	TCGCGC	2	12	5439221	5439232	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	326319525
4032	NC_015138	GCGGTC	2	12	5441732	5441743	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	326319526
4033	NC_015138	CGGCAG	2	12	5443231	5443242	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	326319527
4034	NC_015138	GGCTGC	2	12	5444042	5444053	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	326319528
4035	NC_015138	CGAGCG	2	12	5447245	5447256	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	326319531
4036	NC_015138	GCAGGA	2	12	5447599	5447610	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	326319531
4037	NC_015138	CCGCAC	2	12	5449409	5449420	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	326319532
4038	NC_015138	CGGAGC	2	12	5451700	5451711	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	326319533
4039	NC_015138	CGCGCC	2	12	5452269	5452280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326319534
4040	NC_015138	GCAGGC	2	12	5454021	5454032	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	326319536
4041	NC_015138	GCTGGC	2	12	5457535	5457546	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	326319537
4042	NC_015138	CGCTGG	2	12	5459070	5459081	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	326319538
4043	NC_015138	ATGAAA	2	12	5460587	5460598	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	326319540
4044	NC_015138	GCTTCG	2	12	5464339	5464350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319544
4045	NC_015138	GCTTCG	2	12	5464976	5464987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326319545
4046	NC_015138	CAGGGC	2	12	5466197	5466208	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	326319546
4047	NC_015138	TGCCCA	2	12	5468339	5468350	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	326319549
4048	NC_015138	GCGCTC	2	12	5468807	5468818	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	326319550
4049	NC_015138	CTCACC	2	12	5468960	5468971	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	326319550
4050	NC_015138	CTGGCG	2	12	5470631	5470642	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	326319550
4051	NC_015138	GGCCCT	2	12	5472608	5472619	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	326319552
4052	NC_015138	CGCAGG	2	12	5474553	5474564	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	326319553
4053	NC_015138	GCCGCG	2	12	5480661	5480672	0 %	0 %	50 %	50 %	326319557
4054	NC_015138	CGCGGC	2	12	5480935	5480946	0 %	0 %	50 %	50 %	326319558
4055	NC_015138	GGCACG	2	12	5481232	5481243	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	326319559
4056	NC_015138	GCCGGT	2	12	5481247	5481258	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	326319559

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.