MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia sp. CCGE1001 chromosome 2

Total Repeats: 91

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015137	TTCCTC	2	12	9987	9998	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015137	GCGACA	2	12	16852	16863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015137	ATTTTT	2	12	76679	76690	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015137	GGTTCG	2	12	88524	88535	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_015137	ATTGGA	2	12	145156	145167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015137	GCTTTC	2	12	195002	195013	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015137	TGTCCC	2	12	212490	212501	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015137	ACGGCC	2	12	267421	267432	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015137	GCGCTC	2	12	317917	317928	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015137	ACGCGA	2	12	318138	318149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015137	TCCCCA	2	12	320177	320188	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_015137	TGCGCT	2	12	402743	402754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015137	GAAGCT	2	12	472604	472615	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_015137	CATGCG	2	12	488413	488424	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015137	CTGCCT	2	12	497260	497271	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
16	NC_015137	TTTGGC	2	12	516300	516311	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_015137	GCCGTC	2	12	524770	524781	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015137	GTGCGC	2	12	580703	580714	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015137	CGCCGG	2	12	737925	737936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015137	GACGCG	2	12	784528	784539	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015137	CAGTCG	2	12	815383	815394	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015137	GGTTCG	2	12	819583	819594	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_015137	TGCGGG	2	12	837718	837729	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_015137	GGCGCG	2	12	839608	839619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015137	CGTCGC	2	12	847745	847756	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015137	TGTCGC	2	12	857084	857095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015137	TAGCAA	2	12	901718	901729	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_015137	CTCCTT	2	12	945304	945315	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015137	CGTCTG	2	12	956336	956347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015137	TTTATT	2	12	960983	960994	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015137	GGGGGC	2	12	1006198	1006209	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_015137	GCCGCG	2	12	1056498	1056509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015137	TGACGA	2	12	1072522	1072533	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_015137	CGTCGG	2	12	1085470	1085481	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015137	TTTTCA	2	12	1095939	1095950	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_015137	GACGCT	2	12	1153468	1153479	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015137	TGCGCG	2	12	1168192	1168203	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015137	TTGCCG	2	12	1212803	1212814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015137	GGCGCG	2	12	1230366	1230377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015137	TACTGC	2	12	1235915	1235926	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015137	GTGAGG	2	12	1238231	1238242	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015137	GGAAAC	2	12	1286051	1286062	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_015137	CGCCAG	2	12	1296469	1296480	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015137	GCTGTC	40	240	1311597	1311836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015137	GGCTAA	11	66	1311837	1311902	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_015137	GATGCC	2	12	1312034	1312045	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015137	CTTCAC	2	12	1316928	1316939	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015137	GACCGC	2	12	1340343	1340354	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015137	CTATCG	2	12	1340380	1340391	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015137	CCGCTA	2	12	1340535	1340546	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015137	CGCGCA	2	12	1350362	1350373	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015137	GCGGCT	2	12	1371031	1371042	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015137	CTGTTT	2	12	1439230	1439241	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_015137	TACGCG	2	12	1501046	1501057	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015137	CACCTC	2	12	1543302	1543313	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_015137	GCGTGC	2	12	1700152	1700163	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015137	ACGATG	2	12	1709619	1709630	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_015137	TTGAAG	2	12	1725880	1725891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015137	TGGCGT	2	12	1728809	1728820	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_015137	GAAGGT	2	12	1753904	1753915	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015137	GCAAAG	2	12	1834183	1834194	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_015137	TCACGC	2	12	1838130	1838141	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
63	NC_015137	CGCGGG	2	12	1846941	1846952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015137	GCCAAA	2	12	1903363	1903374	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015137	CGGTCG	2	12	1913931	1913942	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015137	TGCGAA	2	12	2004542	2004553	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_015137	AAGGCA	2	12	2032082	2032093	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_015137	CGTTCT	2	12	2085422	2085433	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015137	GCGGCA	2	12	2104742	2104753	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015137	GCGCCG	2	12	2116734	2116745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_015137	CGGACG	2	12	2140532	2140543	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015137	GCGATC	2	12	2145194	2145205	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015137	GCCAAT	2	12	2156034	2156045	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015137	CAAGCG	2	12	2168770	2168781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015137	GCAATG	2	12	2184416	2184427	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_015137	TTGACG	2	12	2196039	2196050	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_015137	AACGCG	2	12	2268546	2268557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015137	TGCGGC	2	12	2321671	2321682	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015137	CAAGCA	2	12	2321704	2321715	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015137	GGCTGC	2	12	2325700	2325711	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015137	GCATCG	2	12	2331624	2331635	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015137	GCTCAC	2	12	2344995	2345006	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
83	NC_015137	CTGGAA	2	12	2356038	2356049	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_015137	TTCGGC	2	12	2379358	2379369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015137	GCGAGC	2	12	2428232	2428243	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015137	GGGAAG	2	12	2487861	2487872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015137	CTCGCG	2	12	2494118	2494129	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
88	NC_015137	TTTCAC	2	12	2675686	2675697	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015137	CAACGA	2	12	2675739	2675750	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015137	AGAATA	2	12	2705840	2705851	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015137	GGCTGC	2	12	2721132	2721143	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.