MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Burkholderia sp. CCGE1001 chromosome 2

Total Repeats: 2453

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015137	CGCGC	2	10	3111	3120	0 %	0 %	40 %	60 %	323527926
2	NC_015137	ACGCG	2	10	7867	7876	20 %	0 %	40 %	40 %	323527929
3	NC_015137	TCGAG	2	10	7925	7934	20 %	20 %	40 %	20 %	323527929
4	NC_015137	CATCG	2	10	8398	8407	20 %	20 %	20 %	40 %	323527929
5	NC_015137	CCGGA	2	10	10168	10177	20 %	0 %	40 %	40 %	323527931
6	NC_015137	ATCGA	2	10	11120	11129	40 %	20 %	20 %	20 %	323527931
7	NC_015137	GGCGA	2	10	12261	12270	20 %	0 %	60 %	20 %	323527933
8	NC_015137	GAAGC	2	10	13533	13542	40 %	0 %	40 %	20 %	323527934
9	NC_015137	GCGCG	2	10	14471	14480	0 %	0 %	60 %	40 %	323527935
10	NC_015137	TGTCG	2	10	15719	15728	0 %	40 %	40 %	20 %	323527937
11	NC_015137	GCACG	2	10	15791	15800	20 %	0 %	40 %	40 %	323527937
12	NC_015137	TTGCG	2	10	16775	16784	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_015137	GTGCG	3	15	16785	16799	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_015137	GCACA	2	10	17126	17135	40 %	0 %	20 %	40 %	323527939
15	NC_015137	TGCCC	2	10	17834	17843	0 %	20 %	20 %	60 %	323527940
16	NC_015137	GCGCC	2	10	19367	19376	0 %	0 %	40 %	60 %	323527941
17	NC_015137	CCGCG	2	10	20510	20519	0 %	0 %	40 %	60 %	323527942
18	NC_015137	CATGT	2	10	21731	21740	20 %	40 %	20 %	20 %	323527944
19	NC_015137	GCGCC	2	10	23985	23994	0 %	0 %	40 %	60 %	323527946
20	NC_015137	CGCTT	2	10	25442	25451	0 %	40 %	20 %	40 %	323527947
21	NC_015137	TGGGC	2	10	25635	25644	0 %	20 %	60 %	20 %	323527947
22	NC_015137	CGGGA	2	10	26964	26973	20 %	0 %	60 %	20 %	323527947
23	NC_015137	ACCGC	2	10	28034	28043	20 %	0 %	20 %	60 %	323527949
24	NC_015137	GGCGA	2	10	28904	28913	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
25	NC_015137	TGGCG	2	10	29490	29499	0 %	20 %	60 %	20 %	323527951
26	NC_015137	CAATC	2	10	29952	29961	40 %	20 %	0 %	40 %	323527951
27	NC_015137	CGGCA	2	10	30358	30367	20 %	0 %	40 %	40 %	323527952
28	NC_015137	GCGCG	2	10	31200	31209	0 %	0 %	60 %	40 %	323527952
29	NC_015137	GCGCG	3	15	31628	31642	0 %	0 %	60 %	40 %	323527952
30	NC_015137	AGCGC	2	10	33337	33346	20 %	0 %	40 %	40 %	323527955
31	NC_015137	ACGGC	2	10	37527	37536	20 %	0 %	40 %	40 %	323527958
32	NC_015137	TGCCG	2	10	38080	38089	0 %	20 %	40 %	40 %	323527958
33	NC_015137	CAGCA	2	10	40658	40667	40 %	0 %	20 %	40 %	323527960
34	NC_015137	GCGTC	2	10	41398	41407	0 %	20 %	40 %	40 %	323527962
35	NC_015137	GGCCT	2	10	43433	43442	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_015137	CGTCG	2	10	43872	43881	0 %	20 %	40 %	40 %	323527963
37	NC_015137	GACGG	2	10	48995	49004	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
38	NC_015137	TGCGC	2	10	51232	51241	0 %	20 %	40 %	40 %	323527969
39	NC_015137	CGCGC	2	10	51832	51841	0 %	0 %	40 %	60 %	323527970
40	NC_015137	CAGAA	2	10	52115	52124	60 %	0 %	20 %	20 %	323527970
41	NC_015137	TCGGT	2	10	54161	54170	0 %	40 %	40 %	20 %	323527972
42	NC_015137	GGCGC	2	10	54586	54595	0 %	0 %	60 %	40 %	323527972
43	NC_015137	GAACT	2	10	56127	56136	40 %	20 %	20 %	20 %	323527973
44	NC_015137	GCCGC	2	10	57052	57061	0 %	0 %	40 %	60 %	323527974
45	NC_015137	GACGC	2	10	58334	58343	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_015137	GTGGA	2	10	58792	58801	20 %	20 %	60 %	0 %	323527975
47	NC_015137	GCCCC	2	10	59112	59121	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
48	NC_015137	ATGCG	2	10	59132	59141	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_015137	CTACA	2	10	59171	59180	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_015137	GATGC	2	10	59388	59397	20 %	20 %	40 %	20 %	323527977
51	NC_015137	GCTCG	2	10	59539	59548	0 %	20 %	40 %	40 %	323527977
52	NC_015137	CTGAT	2	10	62354	62363	20 %	40 %	20 %	20 %	323527982
53	NC_015137	ACCGC	2	10	64571	64580	20 %	0 %	20 %	60 %	323527983
54	NC_015137	GCGGT	2	10	65959	65968	0 %	20 %	60 %	20 %	323527984
55	NC_015137	GCGCG	2	10	66183	66192	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
56	NC_015137	GCTGG	2	10	66530	66539	0 %	20 %	60 %	20 %	323527985
57	NC_015137	GGCCG	2	10	69459	69468	0 %	0 %	60 %	40 %	323527987
58	NC_015137	GCGAG	2	10	70823	70832	20 %	0 %	60 %	20 %	323527988
59	NC_015137	GCGAG	2	10	71356	71365	20 %	0 %	60 %	20 %	323527989
60	NC_015137	CCGTT	2	10	71904	71913	0 %	40 %	20 %	40 %	323527989
61	NC_015137	GCGTC	2	10	72944	72953	0 %	20 %	40 %	40 %	323527991
62	NC_015137	CCCTG	2	10	73057	73066	0 %	20 %	20 %	60 %	323527991
63	NC_015137	TCGCC	2	10	73193	73202	0 %	20 %	20 %	60 %	323527991
64	NC_015137	TGCCG	2	10	77387	77396	0 %	20 %	40 %	40 %	323527993
65	NC_015137	CCCGG	2	10	78173	78182	0 %	0 %	40 %	60 %	323527994
66	NC_015137	TGGCG	2	10	78837	78846	0 %	20 %	60 %	20 %	323527995
67	NC_015137	CGTCG	2	10	78921	78930	0 %	20 %	40 %	40 %	323527995
68	NC_015137	GAGCA	2	10	80167	80176	40 %	0 %	40 %	20 %	323527996
69	NC_015137	GTTCA	2	10	83121	83130	20 %	40 %	20 %	20 %	323527998
70	NC_015137	TTCAT	2	10	84136	84145	20 %	60 %	0 %	20 %	323527999
71	NC_015137	CTTTC	2	10	84168	84177	0 %	60 %	0 %	40 %	323527999
72	NC_015137	ATCGG	2	10	85090	85099	20 %	20 %	40 %	20 %	323527999
73	NC_015137	CACGC	2	10	85362	85371	20 %	0 %	20 %	60 %	323527999
74	NC_015137	GCCTC	2	10	85409	85418	0 %	20 %	20 %	60 %	323527999
75	NC_015137	TCCAC	2	10	85898	85907	20 %	20 %	0 %	60 %	323527999
76	NC_015137	CGCAT	2	10	86349	86358	20 %	20 %	20 %	40 %	323527999
77	NC_015137	GTGCG	2	10	86485	86494	0 %	20 %	60 %	20 %	323528000
78	NC_015137	GCCGC	2	10	88222	88231	0 %	0 %	40 %	60 %	323528000
79	NC_015137	CGCGG	2	10	90757	90766	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
80	NC_015137	GCACG	2	10	92187	92196	20 %	0 %	40 %	40 %	323528003
81	NC_015137	GGGCT	2	10	93906	93915	0 %	20 %	60 %	20 %	323528005
82	NC_015137	CACCT	2	10	94206	94215	20 %	20 %	0 %	60 %	323528005
83	NC_015137	GCTTC	2	10	95306	95315	0 %	40 %	20 %	40 %	323528007
84	NC_015137	GCGTC	2	10	95699	95708	0 %	20 %	40 %	40 %	323528007
85	NC_015137	AGCCG	2	10	97926	97935	20 %	0 %	40 %	40 %	323528009
86	NC_015137	TGCGC	2	10	98296	98305	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
87	NC_015137	TGCGC	2	10	99052	99061	0 %	20 %	40 %	40 %	323528010
88	NC_015137	GAGCG	2	10	99739	99748	20 %	0 %	60 %	20 %	323528010
89	NC_015137	GCCTC	2	10	99812	99821	0 %	20 %	20 %	60 %	323528010
90	NC_015137	CGACG	2	10	100165	100174	20 %	0 %	40 %	40 %	323528010
91	NC_015137	CGGCG	2	10	100784	100793	0 %	0 %	60 %	40 %	323528011
92	NC_015137	CGGGC	2	10	100960	100969	0 %	0 %	60 %	40 %	323528012
93	NC_015137	TCGCG	2	10	103644	103653	0 %	20 %	40 %	40 %	323528014
94	NC_015137	TTGCG	2	10	105407	105416	0 %	40 %	40 %	20 %	323528014
95	NC_015137	GTCGT	2	10	106855	106864	0 %	40 %	40 %	20 %	323528015
96	NC_015137	CATTG	2	10	107291	107300	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_015137	GCAGC	2	10	107438	107447	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
98	NC_015137	AACGG	2	10	108729	108738	40 %	0 %	40 %	20 %	323528016
99	NC_015137	GCCTC	2	10	109041	109050	0 %	20 %	20 %	60 %	323528017
100	NC_015137	GCCGC	2	10	109365	109374	0 %	0 %	40 %	60 %	323528017
101	NC_015137	TCACC	2	10	112553	112562	20 %	20 %	0 %	60 %	323528018
102	NC_015137	CTCGC	2	10	112983	112992	0 %	20 %	20 %	60 %	323528019
103	NC_015137	CGGCG	2	10	116084	116093	0 %	0 %	60 %	40 %	323528022
104	NC_015137	CCTCG	2	10	116648	116657	0 %	20 %	20 %	60 %	323528023
105	NC_015137	GCCGC	2	10	119559	119568	0 %	0 %	40 %	60 %	323528026
106	NC_015137	ACACG	2	10	120371	120380	40 %	0 %	20 %	40 %	323528027
107	NC_015137	GCGTC	2	10	122943	122952	0 %	20 %	40 %	40 %	323528028
108	NC_015137	GTTCT	2	10	123098	123107	0 %	60 %	20 %	20 %	323528028
109	NC_015137	GCGCA	2	10	124953	124962	20 %	0 %	40 %	40 %	323528029
110	NC_015137	ACGTC	2	10	125999	126008	20 %	20 %	20 %	40 %	323528029
111	NC_015137	CACGC	2	10	128499	128508	20 %	0 %	20 %	60 %	323528031
112	NC_015137	GCCGC	2	10	128711	128720	0 %	0 %	40 %	60 %	323528031
113	NC_015137	CTCGC	2	10	128806	128815	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
114	NC_015137	ACGGT	2	10	131210	131219	20 %	20 %	40 %	20 %	323528034
115	NC_015137	ACCGC	2	10	132155	132164	20 %	0 %	20 %	60 %	323528035
116	NC_015137	CGCGC	2	10	132554	132563	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
117	NC_015137	GCGCG	2	10	132573	132582	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
118	NC_015137	CTTCA	2	10	132965	132974	20 %	40 %	0 %	40 %	323528036
119	NC_015137	ACGCC	2	10	133249	133258	20 %	0 %	20 %	60 %	323528036
120	NC_015137	GCGAC	2	10	134188	134197	20 %	0 %	40 %	40 %	323528036
121	NC_015137	GTCGG	2	10	134763	134772	0 %	20 %	60 %	20 %	323528037
122	NC_015137	TGACT	2	10	135040	135049	20 %	40 %	20 %	20 %	323528037
123	NC_015137	CGCGG	2	10	135257	135266	0 %	0 %	60 %	40 %	323528038
124	NC_015137	GGCCC	2	10	135776	135785	0 %	0 %	40 %	60 %	323528038
125	NC_015137	GCGCC	2	10	136108	136117	0 %	0 %	40 %	60 %	323528038
126	NC_015137	CGCGC	2	10	137419	137428	0 %	0 %	40 %	60 %	323528039
127	NC_015137	GACGC	2	10	138189	138198	20 %	0 %	40 %	40 %	323528039
128	NC_015137	GCACG	2	10	140598	140607	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
129	NC_015137	TTCCG	2	10	141314	141323	0 %	40 %	20 %	40 %	323528042
130	NC_015137	CGCGC	2	10	141380	141389	0 %	0 %	40 %	60 %	323528042
131	NC_015137	CGCTT	2	10	141392	141401	0 %	40 %	20 %	40 %	323528042
132	NC_015137	GCGGT	2	10	142451	142460	0 %	20 %	60 %	20 %	323528044
133	NC_015137	GCGCC	2	10	143139	143148	0 %	0 %	40 %	60 %	323528044
134	NC_015137	TTGCG	2	10	143278	143287	0 %	40 %	40 %	20 %	323528044
135	NC_015137	GCGCG	3	15	144195	144209	0 %	0 %	60 %	40 %	323528045
136	NC_015137	GCTGC	2	10	144277	144286	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
137	NC_015137	CGGCA	2	10	145907	145916	20 %	0 %	40 %	40 %	323528046
138	NC_015137	CGGCC	2	10	146662	146671	0 %	0 %	40 %	60 %	323528046
139	NC_015137	GCCGC	2	10	146943	146952	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
140	NC_015137	GCGCC	2	10	147485	147494	0 %	0 %	40 %	60 %	323528047
141	NC_015137	TGTGC	2	10	148346	148355	0 %	40 %	40 %	20 %	323528047
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143	NC_015137	CATTC	2	10	151110	151119	20 %	40 %	0 %	40 %	323528048
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145	NC_015137	CGACG	2	10	154975	154984	20 %	0 %	40 %	40 %	323528051
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147	NC_015137	GCCCA	2	10	158400	158409	20 %	0 %	20 %	60 %	323528054
148	NC_015137	CCTGC	2	10	159107	159116	0 %	20 %	20 %	60 %	323528054
149	NC_015137	GCGCG	2	10	162395	162404	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
150	NC_015137	ACGCC	2	10	164465	164474	20 %	0 %	20 %	60 %	323528061
151	NC_015137	CCCGG	2	10	167906	167915	0 %	0 %	40 %	60 %	323528066
152	NC_015137	GCGAT	2	10	168732	168741	20 %	20 %	40 %	20 %	323528067
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154	NC_015137	CGCAT	2	10	169024	169033	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
155	NC_015137	GCCTT	2	10	169643	169652	0 %	40 %	20 %	40 %	323528068
156	NC_015137	CGGCG	2	10	169857	169866	0 %	0 %	60 %	40 %	323528068
157	NC_015137	CGCTG	2	10	171262	171271	0 %	20 %	40 %	40 %	323528070
158	NC_015137	GCGCC	2	10	171877	171886	0 %	0 %	40 %	60 %	323528070
159	NC_015137	CGGCG	2	10	172495	172504	0 %	0 %	60 %	40 %	323528071
160	NC_015137	CACCC	2	10	172578	172587	20 %	0 %	0 %	80 %	323528072
161	NC_015137	CGCGC	2	10	173315	173324	0 %	0 %	40 %	60 %	323528072
162	NC_015137	CGCGG	2	10	173726	173735	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
163	NC_015137	TCACC	2	10	174856	174865	20 %	20 %	0 %	60 %	323528073
164	NC_015137	GCGCC	3	15	175291	175305	0 %	0 %	40 %	60 %	323528073
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166	NC_015137	CGCGC	2	10	175934	175943	0 %	0 %	40 %	60 %	323528073
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169	NC_015137	CCCCG	2	10	178496	178505	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
170	NC_015137	ATCTG	2	10	179329	179338	20 %	40 %	20 %	20 %	323528074
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172	NC_015137	CGAAC	2	10	182424	182433	40 %	0 %	20 %	40 %	323528076
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174	NC_015137	GACTC	2	10	185757	185766	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
175	NC_015137	GCCGA	2	10	186426	186435	20 %	0 %	40 %	40 %	323528080
176	NC_015137	CCGCC	2	10	188390	188399	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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179	NC_015137	GGCGA	2	10	189457	189466	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
180	NC_015137	CGTCG	2	10	190367	190376	0 %	20 %	40 %	40 %	323528085
181	NC_015137	GTGGC	2	10	191248	191257	0 %	20 %	60 %	20 %	323528086
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188	NC_015137	TCGGC	2	10	200787	200796	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
189	NC_015137	CGCGG	2	10	200906	200915	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
190	NC_015137	GCGCG	2	10	200921	200930	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
191	NC_015137	TCCGC	2	10	201055	201064	0 %	20 %	20 %	60 %	323528093
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196	NC_015137	TGCAA	2	10	203823	203832	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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199	NC_015137	CGCGC	2	10	205743	205752	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
200	NC_015137	GCAAT	2	10	205798	205807	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
201	NC_015137	CTTCG	2	10	207785	207794	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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227	NC_015137	GCTCG	2	10	233732	233741	0 %	20 %	40 %	40 %	323528118
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233	NC_015137	CGTGA	2	10	244052	244061	20 %	20 %	40 %	20 %	323528127
234	NC_015137	GCGGT	2	10	244486	244495	0 %	20 %	60 %	20 %	323528128
235	NC_015137	CGTCC	2	10	246217	246226	0 %	20 %	20 %	60 %	323528129
236	NC_015137	TGGAG	2	10	248083	248092	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
237	NC_015137	CAAGG	2	10	248993	249002	40 %	0 %	40 %	20 %	323528131
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239	NC_015137	GACCA	2	10	251126	251135	40 %	0 %	20 %	40 %	323528133
240	NC_015137	GCAGG	2	10	252014	252023	20 %	0 %	60 %	20 %	323528134
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242	NC_015137	GGACA	2	10	254370	254379	40 %	0 %	40 %	20 %	323528134
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245	NC_015137	CCGAC	2	10	255801	255810	20 %	0 %	20 %	60 %	323528135
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247	NC_015137	TCGAC	2	10	257596	257605	20 %	20 %	20 %	40 %	323528137
248	NC_015137	GCGCG	2	10	261030	261039	0 %	0 %	60 %	40 %	323528140
249	NC_015137	CTGCC	2	10	261810	261819	0 %	20 %	20 %	60 %	323528141
250	NC_015137	GCGAG	2	10	262378	262387	20 %	0 %	60 %	20 %	323528141
251	NC_015137	GCGGA	2	10	264079	264088	20 %	0 %	60 %	20 %	323528142
252	NC_015137	GTTGC	2	10	264140	264149	0 %	40 %	40 %	20 %	323528142
253	NC_015137	CGAAT	2	10	265572	265581	40 %	20 %	20 %	20 %	323528143
254	NC_015137	GCCGC	2	10	266362	266371	0 %	0 %	40 %	60 %	323528144
255	NC_015137	TCACC	2	10	268234	268243	20 %	20 %	0 %	60 %	323528145
256	NC_015137	GCCTG	2	10	269560	269569	0 %	20 %	40 %	40 %	323528147
257	NC_015137	CGGCG	2	10	270100	270109	0 %	0 %	60 %	40 %	323528147
258	NC_015137	CGACG	2	10	272130	272139	20 %	0 %	40 %	40 %	323528151
259	NC_015137	CTGCA	2	10	272872	272881	20 %	20 %	20 %	40 %	323528152
260	NC_015137	ATCGC	2	10	272999	273008	20 %	20 %	20 %	40 %	323528152
261	NC_015137	ACGCC	2	10	273021	273030	20 %	0 %	20 %	60 %	323528152
262	NC_015137	GCGCC	2	10	273249	273258	0 %	0 %	40 %	60 %	323528153
263	NC_015137	GCAGC	2	10	275075	275084	20 %	0 %	40 %	40 %	323528154
264	NC_015137	TCGCA	2	10	276070	276079	20 %	20 %	20 %	40 %	323528155
265	NC_015137	TGGCG	2	10	281183	281192	0 %	20 %	60 %	20 %	323528159
266	NC_015137	GGCGC	2	10	281828	281837	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
267	NC_015137	CTGCG	2	10	282251	282260	0 %	20 %	40 %	40 %	323528161
268	NC_015137	GCCGC	2	10	283707	283716	0 %	0 %	40 %	60 %	323528161
269	NC_015137	ACGCA	2	10	285139	285148	40 %	0 %	20 %	40 %	323528164
270	NC_015137	TGGTC	2	10	285278	285287	0 %	40 %	40 %	20 %	323528164
271	NC_015137	AGCGT	2	10	285354	285363	20 %	20 %	40 %	20 %	323528164
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273	NC_015137	GCGCG	2	10	285815	285824	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
274	NC_015137	TGCCG	2	10	285899	285908	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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283	NC_015137	ACGGC	2	10	294288	294297	20 %	0 %	40 %	40 %	323528173
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385	NC_015137	ACGAA	2	10	410140	410149	60 %	0 %	20 %	20 %	323528282
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391	NC_015137	CGACG	2	10	415926	415935	20 %	0 %	40 %	40 %	323528288
392	NC_015137	TGCGC	2	10	417190	417199	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
393	NC_015137	GCGCA	2	10	417239	417248	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
394	NC_015137	TGACC	2	10	417486	417495	20 %	20 %	20 %	40 %	323528290
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396	NC_015137	GCTTG	2	10	420182	420191	0 %	40 %	40 %	20 %	323528291
397	NC_015137	AGCGA	2	10	420408	420417	40 %	0 %	40 %	20 %	323528291
398	NC_015137	CCGCG	2	10	422421	422430	0 %	0 %	40 %	60 %	323528294
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