MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia sp. CCGE1001 chromosome 2

Total Repeats: 419

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015137	TTGCG	2	10	16775	16784	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_015137	GTGCG	3	15	16785	16799	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3	NC_015137	GGCGA	2	10	28904	28913	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4	NC_015137	GGCCT	2	10	43433	43442	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_015137	GACGG	2	10	48995	49004	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_015137	GACGC	2	10	58334	58343	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_015137	GCCCC	2	10	59112	59121	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
8	NC_015137	ATGCG	2	10	59132	59141	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_015137	CTACA	2	10	59171	59180	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_015137	GCGCG	2	10	66183	66192	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11	NC_015137	CGCGG	2	10	90757	90766	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
12	NC_015137	TGCGC	2	10	98296	98305	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_015137	CATTG	2	10	107291	107300	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_015137	GCAGC	2	10	107438	107447	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_015137	CTCGC	2	10	128806	128815	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
16	NC_015137	CGCGC	2	10	132554	132563	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
17	NC_015137	GCGCG	2	10	132573	132582	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
18	NC_015137	GCACG	2	10	140598	140607	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_015137	GCTGC	2	10	144277	144286	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_015137	GCCGC	2	10	146943	146952	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
21	NC_015137	GCGCG	2	10	162395	162404	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
22	NC_015137	CGCAT	2	10	169024	169033	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_015137	CGCGG	2	10	173726	173735	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
24	NC_015137	GCCCC	2	10	178467	178476	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
25	NC_015137	CCCCG	2	10	178496	178505	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
26	NC_015137	CGCGC	2	10	180712	180721	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
27	NC_015137	GACTC	2	10	185757	185766	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_015137	CCGCC	2	10	188390	188399	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
29	NC_015137	GCGCC	2	10	189398	189407	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
30	NC_015137	GGCGA	2	10	189457	189466	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_015137	CGCGG	2	10	193261	193270	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
32	NC_015137	CTCGT	2	10	198014	198023	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_015137	GCCAG	2	10	199863	199872	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_015137	TCGGC	2	10	200787	200796	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
35	NC_015137	CGCGG	2	10	200906	200915	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
36	NC_015137	GCGCG	2	10	200921	200930	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
37	NC_015137	TGCAA	2	10	203823	203832	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_015137	CGCGC	2	10	205743	205752	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
39	NC_015137	GCAAT	2	10	205798	205807	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_015137	CTTCG	2	10	207785	207794	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_015137	TGGAG	2	10	248083	248092	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015137	GGCGC	2	10	281828	281837	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
43	NC_015137	AGCTG	2	10	285726	285735	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_015137	GCGCG	2	10	285815	285824	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
45	NC_015137	TGCCG	2	10	285899	285908	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_015137	CGTCT	2	10	292197	292206	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_015137	CATTG	2	10	309582	309591	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_015137	GCGGA	2	10	314691	314700	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
49	NC_015137	GGCGA	2	10	316858	316867	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
50	NC_015137	GCAAT	2	10	334501	334510	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_015137	GCCGC	2	10	349214	349223	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
52	NC_015137	TGGCG	2	10	371177	371186	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
53	NC_015137	ACCGC	2	10	377547	377556	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
54	NC_015137	GCGCG	2	10	388946	388955	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
55	NC_015137	GCCGC	2	10	389681	389690	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
56	NC_015137	CCGCG	2	10	390874	390883	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
57	NC_015137	GCAAG	2	10	398477	398486	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_015137	GTTCG	2	10	406849	406858	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_015137	TGCGC	2	10	417190	417199	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
60	NC_015137	GCGCA	2	10	417239	417248	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
61	NC_015137	AGTCA	2	10	436866	436875	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_015137	AGCCC	2	10	448849	448858	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
63	NC_015137	CTGCG	2	10	449599	449608	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
64	NC_015137	GGTGC	2	10	449822	449831	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
65	NC_015137	GCATG	2	10	450788	450797	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_015137	TCGAT	2	10	461515	461524	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_015137	TGCAT	2	10	461532	461541	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_015137	CATGC	2	10	484325	484334	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_015137	CCCCG	2	10	487737	487746	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
70	NC_015137	TTGCG	2	10	488855	488864	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_015137	TGCAT	2	10	493617	493626	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_015137	CGCGC	2	10	502127	502136	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
73	NC_015137	CTTTT	2	10	507402	507411	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_015137	CCGCA	2	10	509398	509407	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
75	NC_015137	ACGGC	2	10	512108	512117	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
76	NC_015137	CAACA	2	10	524345	524354	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
77	NC_015137	TCGCG	2	10	524851	524860	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
78	NC_015137	CCGGC	2	10	528469	528478	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
79	NC_015137	CCATG	2	10	529086	529095	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_015137	TGCAT	2	10	539523	539532	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_015137	AGGCA	2	10	542186	542195	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_015137	GCGCC	2	10	557398	557407	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
83	NC_015137	TCACT	2	10	560535	560544	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_015137	CGCTA	2	10	567205	567214	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_015137	CCGGT	2	10	574662	574671	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
86	NC_015137	ATTCG	2	10	576706	576715	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_015137	GTCAT	2	10	580752	580761	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_015137	CGCGG	2	10	580894	580903	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
89	NC_015137	CCGAT	2	10	582769	582778	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_015137	CCCGT	2	10	591417	591426	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
91	NC_015137	CGGAT	2	10	616013	616022	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_015137	ACGGC	2	10	618085	618094	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
93	NC_015137	CGGCG	2	10	627072	627081	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
94	NC_015137	GCCGG	2	10	632024	632033	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
95	NC_015137	GCCCG	2	10	642706	642715	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
96	NC_015137	GCCGC	2	10	660318	660327	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
97	NC_015137	GGCAC	2	10	660391	660400	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
98	NC_015137	CCGCG	2	10	661158	661167	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
99	NC_015137	GGCCA	2	10	667929	667938	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
100	NC_015137	TGCGC	2	10	669402	669411	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
101	NC_015137	ACGCG	2	10	675942	675951	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
102	NC_015137	CGGCG	2	10	678896	678905	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
103	NC_015137	GCGGA	2	10	681686	681695	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
104	NC_015137	GAATG	2	10	699516	699525	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015137	ATCCG	2	10	706088	706097	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_015137	CGATT	2	10	727102	727111	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_015137	ATGCC	2	10	739066	739075	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
108	NC_015137	GCGCG	2	10	773059	773068	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
109	NC_015137	CGTCG	2	10	802611	802620	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
110	NC_015137	GTCGG	2	10	806177	806186	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
111	NC_015137	TTCAT	2	10	815196	815205	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_015137	CTTTC	2	10	815228	815237	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_015137	ATCGG	2	10	816150	816159	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_015137	CACGC	2	10	816421	816430	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
115	NC_015137	GCCTC	2	10	816468	816477	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
116	NC_015137	TCCAC	2	10	816957	816966	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
117	NC_015137	CGCAT	2	10	817408	817417	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_015137	CGCAC	2	10	822544	822553	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
119	NC_015137	GCGAT	2	10	823296	823305	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_015137	GCGTC	2	10	830706	830715	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
121	NC_015137	CGCTG	2	10	832729	832738	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
122	NC_015137	GTCGC	2	10	833636	833645	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
123	NC_015137	TGGCA	2	10	840818	840827	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_015137	GGGGC	2	10	842512	842521	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
125	NC_015137	ATTGC	2	10	844164	844173	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_015137	CTGCG	2	10	844329	844338	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
127	NC_015137	TCGCC	2	10	847409	847418	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
128	NC_015137	CGCGA	2	10	850959	850968	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
129	NC_015137	TTATT	2	10	880380	880389	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015137	GTCAA	2	10	897820	897829	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_015137	TGACC	2	10	904751	904760	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
132	NC_015137	GCCCT	2	10	916377	916386	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
133	NC_015137	GCGCC	2	10	916703	916712	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
134	NC_015137	CGCAT	2	10	917134	917143	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
135	NC_015137	AAGGC	2	10	934867	934876	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_015137	CCAGA	2	10	939079	939088	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
137	NC_015137	CGCGA	2	10	947943	947952	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
138	NC_015137	TCCCG	2	10	950214	950223	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
139	NC_015137	TCTAT	2	10	967582	967591	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_015137	GGCGC	2	10	988332	988341	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
141	NC_015137	CGGTC	2	10	989404	989413	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
142	NC_015137	TGAAT	2	10	1013269	1013278	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015137	CCTGC	2	10	1013365	1013374	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
144	NC_015137	CACGC	2	10	1013652	1013661	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
145	NC_015137	CATGC	2	10	1041190	1041199	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
146	NC_015137	TTGCT	2	10	1043572	1043581	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_015137	GCGAA	2	10	1043650	1043659	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
148	NC_015137	GCGAA	2	10	1055601	1055610	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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161	NC_015137	GCTTC	2	10	1140504	1140513	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
162	NC_015137	CGGTT	2	10	1141725	1141734	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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403	NC_015137	CGCAG	2	10	2673247	2673256	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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406	NC_015137	GCGCC	5	25	2678600	2678624	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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415	NC_015137	ACGCG	2	10	2738149	2738158	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
416	NC_015137	GTCGC	2	10	2745023	2745032	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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418	NC_015137	ACCGC	2	10	2764356	2764365	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.