MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia sp. CCGE1001 chromosome 2

Total Repeats: 2034

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015137	CGCGC	2	10	3111	3120	0 %	0 %	40 %	60 %	323527926
2	NC_015137	ACGCG	2	10	7867	7876	20 %	0 %	40 %	40 %	323527929
3	NC_015137	TCGAG	2	10	7925	7934	20 %	20 %	40 %	20 %	323527929
4	NC_015137	CATCG	2	10	8398	8407	20 %	20 %	20 %	40 %	323527929
5	NC_015137	CCGGA	2	10	10168	10177	20 %	0 %	40 %	40 %	323527931
6	NC_015137	ATCGA	2	10	11120	11129	40 %	20 %	20 %	20 %	323527931
7	NC_015137	GGCGA	2	10	12261	12270	20 %	0 %	60 %	20 %	323527933
8	NC_015137	GAAGC	2	10	13533	13542	40 %	0 %	40 %	20 %	323527934
9	NC_015137	GCGCG	2	10	14471	14480	0 %	0 %	60 %	40 %	323527935
10	NC_015137	TGTCG	2	10	15719	15728	0 %	40 %	40 %	20 %	323527937
11	NC_015137	GCACG	2	10	15791	15800	20 %	0 %	40 %	40 %	323527937
12	NC_015137	GCACA	2	10	17126	17135	40 %	0 %	20 %	40 %	323527939
13	NC_015137	TGCCC	2	10	17834	17843	0 %	20 %	20 %	60 %	323527940
14	NC_015137	GCGCC	2	10	19367	19376	0 %	0 %	40 %	60 %	323527941
15	NC_015137	CCGCG	2	10	20510	20519	0 %	0 %	40 %	60 %	323527942
16	NC_015137	CATGT	2	10	21731	21740	20 %	40 %	20 %	20 %	323527944
17	NC_015137	GCGCC	2	10	23985	23994	0 %	0 %	40 %	60 %	323527946
18	NC_015137	CGCTT	2	10	25442	25451	0 %	40 %	20 %	40 %	323527947
19	NC_015137	TGGGC	2	10	25635	25644	0 %	20 %	60 %	20 %	323527947
20	NC_015137	CGGGA	2	10	26964	26973	20 %	0 %	60 %	20 %	323527947
21	NC_015137	ACCGC	2	10	28034	28043	20 %	0 %	20 %	60 %	323527949
22	NC_015137	TGGCG	2	10	29490	29499	0 %	20 %	60 %	20 %	323527951
23	NC_015137	CAATC	2	10	29952	29961	40 %	20 %	0 %	40 %	323527951
24	NC_015137	CGGCA	2	10	30358	30367	20 %	0 %	40 %	40 %	323527952
25	NC_015137	GCGCG	2	10	31200	31209	0 %	0 %	60 %	40 %	323527952
26	NC_015137	GCGCG	3	15	31628	31642	0 %	0 %	60 %	40 %	323527952
27	NC_015137	AGCGC	2	10	33337	33346	20 %	0 %	40 %	40 %	323527955
28	NC_015137	ACGGC	2	10	37527	37536	20 %	0 %	40 %	40 %	323527958
29	NC_015137	TGCCG	2	10	38080	38089	0 %	20 %	40 %	40 %	323527958
30	NC_015137	CAGCA	2	10	40658	40667	40 %	0 %	20 %	40 %	323527960
31	NC_015137	GCGTC	2	10	41398	41407	0 %	20 %	40 %	40 %	323527962
32	NC_015137	CGTCG	2	10	43872	43881	0 %	20 %	40 %	40 %	323527963
33	NC_015137	TGCGC	2	10	51232	51241	0 %	20 %	40 %	40 %	323527969
34	NC_015137	CGCGC	2	10	51832	51841	0 %	0 %	40 %	60 %	323527970
35	NC_015137	CAGAA	2	10	52115	52124	60 %	0 %	20 %	20 %	323527970
36	NC_015137	TCGGT	2	10	54161	54170	0 %	40 %	40 %	20 %	323527972
37	NC_015137	GGCGC	2	10	54586	54595	0 %	0 %	60 %	40 %	323527972
38	NC_015137	GAACT	2	10	56127	56136	40 %	20 %	20 %	20 %	323527973
39	NC_015137	GCCGC	2	10	57052	57061	0 %	0 %	40 %	60 %	323527974
40	NC_015137	GTGGA	2	10	58792	58801	20 %	20 %	60 %	0 %	323527975
41	NC_015137	GATGC	2	10	59388	59397	20 %	20 %	40 %	20 %	323527977
42	NC_015137	GCTCG	2	10	59539	59548	0 %	20 %	40 %	40 %	323527977
43	NC_015137	CTGAT	2	10	62354	62363	20 %	40 %	20 %	20 %	323527982
44	NC_015137	ACCGC	2	10	64571	64580	20 %	0 %	20 %	60 %	323527983
45	NC_015137	GCGGT	2	10	65959	65968	0 %	20 %	60 %	20 %	323527984
46	NC_015137	GCTGG	2	10	66530	66539	0 %	20 %	60 %	20 %	323527985
47	NC_015137	GGCCG	2	10	69459	69468	0 %	0 %	60 %	40 %	323527987
48	NC_015137	GCGAG	2	10	70823	70832	20 %	0 %	60 %	20 %	323527988
49	NC_015137	GCGAG	2	10	71356	71365	20 %	0 %	60 %	20 %	323527989
50	NC_015137	CCGTT	2	10	71904	71913	0 %	40 %	20 %	40 %	323527989
51	NC_015137	GCGTC	2	10	72944	72953	0 %	20 %	40 %	40 %	323527991
52	NC_015137	CCCTG	2	10	73057	73066	0 %	20 %	20 %	60 %	323527991
53	NC_015137	TCGCC	2	10	73193	73202	0 %	20 %	20 %	60 %	323527991
54	NC_015137	TGCCG	2	10	77387	77396	0 %	20 %	40 %	40 %	323527993
55	NC_015137	CCCGG	2	10	78173	78182	0 %	0 %	40 %	60 %	323527994
56	NC_015137	TGGCG	2	10	78837	78846	0 %	20 %	60 %	20 %	323527995
57	NC_015137	CGTCG	2	10	78921	78930	0 %	20 %	40 %	40 %	323527995
58	NC_015137	GAGCA	2	10	80167	80176	40 %	0 %	40 %	20 %	323527996
59	NC_015137	GTTCA	2	10	83121	83130	20 %	40 %	20 %	20 %	323527998
60	NC_015137	TTCAT	2	10	84136	84145	20 %	60 %	0 %	20 %	323527999
61	NC_015137	CTTTC	2	10	84168	84177	0 %	60 %	0 %	40 %	323527999
62	NC_015137	ATCGG	2	10	85090	85099	20 %	20 %	40 %	20 %	323527999
63	NC_015137	CACGC	2	10	85362	85371	20 %	0 %	20 %	60 %	323527999
64	NC_015137	GCCTC	2	10	85409	85418	0 %	20 %	20 %	60 %	323527999
65	NC_015137	TCCAC	2	10	85898	85907	20 %	20 %	0 %	60 %	323527999
66	NC_015137	CGCAT	2	10	86349	86358	20 %	20 %	20 %	40 %	323527999
67	NC_015137	GTGCG	2	10	86485	86494	0 %	20 %	60 %	20 %	323528000
68	NC_015137	GCCGC	2	10	88222	88231	0 %	0 %	40 %	60 %	323528000
69	NC_015137	GCACG	2	10	92187	92196	20 %	0 %	40 %	40 %	323528003
70	NC_015137	GGGCT	2	10	93906	93915	0 %	20 %	60 %	20 %	323528005
71	NC_015137	CACCT	2	10	94206	94215	20 %	20 %	0 %	60 %	323528005
72	NC_015137	GCTTC	2	10	95306	95315	0 %	40 %	20 %	40 %	323528007
73	NC_015137	GCGTC	2	10	95699	95708	0 %	20 %	40 %	40 %	323528007
74	NC_015137	AGCCG	2	10	97926	97935	20 %	0 %	40 %	40 %	323528009
75	NC_015137	TGCGC	2	10	99052	99061	0 %	20 %	40 %	40 %	323528010
76	NC_015137	GAGCG	2	10	99739	99748	20 %	0 %	60 %	20 %	323528010
77	NC_015137	GCCTC	2	10	99812	99821	0 %	20 %	20 %	60 %	323528010
78	NC_015137	CGACG	2	10	100165	100174	20 %	0 %	40 %	40 %	323528010
79	NC_015137	CGGCG	2	10	100784	100793	0 %	0 %	60 %	40 %	323528011
80	NC_015137	CGGGC	2	10	100960	100969	0 %	0 %	60 %	40 %	323528012
81	NC_015137	TCGCG	2	10	103644	103653	0 %	20 %	40 %	40 %	323528014
82	NC_015137	TTGCG	2	10	105407	105416	0 %	40 %	40 %	20 %	323528014
83	NC_015137	GTCGT	2	10	106855	106864	0 %	40 %	40 %	20 %	323528015
84	NC_015137	AACGG	2	10	108729	108738	40 %	0 %	40 %	20 %	323528016
85	NC_015137	GCCTC	2	10	109041	109050	0 %	20 %	20 %	60 %	323528017
86	NC_015137	GCCGC	2	10	109365	109374	0 %	0 %	40 %	60 %	323528017
87	NC_015137	TCACC	2	10	112553	112562	20 %	20 %	0 %	60 %	323528018
88	NC_015137	CTCGC	2	10	112983	112992	0 %	20 %	20 %	60 %	323528019
89	NC_015137	CGGCG	2	10	116084	116093	0 %	0 %	60 %	40 %	323528022
90	NC_015137	CCTCG	2	10	116648	116657	0 %	20 %	20 %	60 %	323528023
91	NC_015137	GCCGC	2	10	119559	119568	0 %	0 %	40 %	60 %	323528026
92	NC_015137	ACACG	2	10	120371	120380	40 %	0 %	20 %	40 %	323528027
93	NC_015137	GCGTC	2	10	122943	122952	0 %	20 %	40 %	40 %	323528028
94	NC_015137	GTTCT	2	10	123098	123107	0 %	60 %	20 %	20 %	323528028
95	NC_015137	GCGCA	2	10	124953	124962	20 %	0 %	40 %	40 %	323528029
96	NC_015137	ACGTC	2	10	125999	126008	20 %	20 %	20 %	40 %	323528029
97	NC_015137	CACGC	2	10	128499	128508	20 %	0 %	20 %	60 %	323528031
98	NC_015137	GCCGC	2	10	128711	128720	0 %	0 %	40 %	60 %	323528031
99	NC_015137	ACGGT	2	10	131210	131219	20 %	20 %	40 %	20 %	323528034
100	NC_015137	ACCGC	2	10	132155	132164	20 %	0 %	20 %	60 %	323528035
101	NC_015137	CTTCA	2	10	132965	132974	20 %	40 %	0 %	40 %	323528036
102	NC_015137	ACGCC	2	10	133249	133258	20 %	0 %	20 %	60 %	323528036
103	NC_015137	GCGAC	2	10	134188	134197	20 %	0 %	40 %	40 %	323528036
104	NC_015137	GTCGG	2	10	134763	134772	0 %	20 %	60 %	20 %	323528037
105	NC_015137	TGACT	2	10	135040	135049	20 %	40 %	20 %	20 %	323528037
106	NC_015137	CGCGG	2	10	135257	135266	0 %	0 %	60 %	40 %	323528038
107	NC_015137	GGCCC	2	10	135776	135785	0 %	0 %	40 %	60 %	323528038
108	NC_015137	GCGCC	2	10	136108	136117	0 %	0 %	40 %	60 %	323528038
109	NC_015137	CGCGC	2	10	137419	137428	0 %	0 %	40 %	60 %	323528039
110	NC_015137	GACGC	2	10	138189	138198	20 %	0 %	40 %	40 %	323528039
111	NC_015137	TTCCG	2	10	141314	141323	0 %	40 %	20 %	40 %	323528042
112	NC_015137	CGCGC	2	10	141380	141389	0 %	0 %	40 %	60 %	323528042
113	NC_015137	CGCTT	2	10	141392	141401	0 %	40 %	20 %	40 %	323528042
114	NC_015137	GCGGT	2	10	142451	142460	0 %	20 %	60 %	20 %	323528044
115	NC_015137	GCGCC	2	10	143139	143148	0 %	0 %	40 %	60 %	323528044
116	NC_015137	TTGCG	2	10	143278	143287	0 %	40 %	40 %	20 %	323528044
117	NC_015137	GCGCG	3	15	144195	144209	0 %	0 %	60 %	40 %	323528045
118	NC_015137	CGGCA	2	10	145907	145916	20 %	0 %	40 %	40 %	323528046
119	NC_015137	CGGCC	2	10	146662	146671	0 %	0 %	40 %	60 %	323528046
120	NC_015137	GCGCC	2	10	147485	147494	0 %	0 %	40 %	60 %	323528047
121	NC_015137	TGTGC	2	10	148346	148355	0 %	40 %	40 %	20 %	323528047
122	NC_015137	CGCAA	2	10	149803	149812	40 %	0 %	20 %	40 %	323528047
123	NC_015137	CATTC	2	10	151110	151119	20 %	40 %	0 %	40 %	323528048
124	NC_015137	GCGCG	2	10	152807	152816	0 %	0 %	60 %	40 %	323528049
125	NC_015137	CGACG	2	10	154975	154984	20 %	0 %	40 %	40 %	323528051
126	NC_015137	TGATC	2	10	157825	157834	20 %	40 %	20 %	20 %	323528053
127	NC_015137	GCCCA	2	10	158400	158409	20 %	0 %	20 %	60 %	323528054
128	NC_015137	CCTGC	2	10	159107	159116	0 %	20 %	20 %	60 %	323528054
129	NC_015137	ACGCC	2	10	164465	164474	20 %	0 %	20 %	60 %	323528061
130	NC_015137	CCCGG	2	10	167906	167915	0 %	0 %	40 %	60 %	323528066
131	NC_015137	GCGAT	2	10	168732	168741	20 %	20 %	40 %	20 %	323528067
132	NC_015137	CAAGC	2	10	168926	168935	40 %	0 %	20 %	40 %	323528067
133	NC_015137	GCCTT	2	10	169643	169652	0 %	40 %	20 %	40 %	323528068
134	NC_015137	CGGCG	2	10	169857	169866	0 %	0 %	60 %	40 %	323528068
135	NC_015137	CGCTG	2	10	171262	171271	0 %	20 %	40 %	40 %	323528070
136	NC_015137	GCGCC	2	10	171877	171886	0 %	0 %	40 %	60 %	323528070
137	NC_015137	CGGCG	2	10	172495	172504	0 %	0 %	60 %	40 %	323528071
138	NC_015137	CACCC	2	10	172578	172587	20 %	0 %	0 %	80 %	323528072
139	NC_015137	CGCGC	2	10	173315	173324	0 %	0 %	40 %	60 %	323528072
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142	NC_015137	CACGC	2	10	175773	175782	20 %	0 %	20 %	60 %	323528073
143	NC_015137	CGCGC	2	10	175934	175943	0 %	0 %	40 %	60 %	323528073
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148	NC_015137	GCCGA	2	10	186426	186435	20 %	0 %	40 %	40 %	323528080
149	NC_015137	GCGCG	2	10	188642	188651	0 %	0 %	60 %	40 %	323528082
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173	NC_015137	TGCGC	2	10	219516	219525	0 %	20 %	40 %	40 %	323528106
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246	NC_015137	ATCGA	2	10	307257	307266	40 %	20 %	20 %	20 %	323528185
247	NC_015137	GGACA	2	10	308745	308754	40 %	0 %	40 %	20 %	323528187
248	NC_015137	GCGCG	2	10	309898	309907	0 %	0 %	60 %	40 %	323528188
249	NC_015137	CGGGC	2	10	310039	310048	0 %	0 %	60 %	40 %	323528188
250	NC_015137	CAACG	2	10	310516	310525	40 %	0 %	20 %	40 %	323528188
251	NC_015137	TGATT	2	10	313533	313542	20 %	60 %	20 %	0 %	323528192
252	NC_015137	TGCGC	2	10	316523	316532	0 %	20 %	40 %	40 %	323528197
253	NC_015137	GGCGT	2	10	320048	320057	0 %	20 %	60 %	20 %	323528200
254	NC_015137	CGATG	2	10	320803	320812	20 %	20 %	40 %	20 %	323528201
255	NC_015137	ACCGA	2	10	321291	321300	40 %	0 %	20 %	40 %	323528202
256	NC_015137	TGTCC	2	10	323933	323942	0 %	40 %	20 %	40 %	323528204
257	NC_015137	CCACG	2	10	324807	324816	20 %	0 %	20 %	60 %	323528205
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259	NC_015137	CTTCG	2	10	332766	332775	0 %	40 %	20 %	40 %	323528212
260	NC_015137	GCGAG	2	10	333248	333257	20 %	0 %	60 %	20 %	323528212
261	NC_015137	GCGCG	2	10	334203	334212	0 %	0 %	60 %	40 %	323528213
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