MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Burkholderia sp. CCGE1001 chromosome 1

Total Repeats: 3499

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015136	ACGTG	2	10	207	216	20 %	20 %	40 %	20 %	323524378
2	NC_015136	AGCGC	2	10	3502	3511	20 %	0 %	40 %	40 %	323524380
3	NC_015136	GTGCT	2	10	4071	4080	0 %	40 %	40 %	20 %	323524380
4	NC_015136	GAAGC	2	10	5166	5175	40 %	0 %	40 %	20 %	323524380
5	NC_015136	GCGAG	2	10	6490	6499	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_015136	TCCAA	2	10	11551	11560	40 %	20 %	0 %	40 %	323524386
7	NC_015136	GCAGT	2	10	12069	12078	20 %	20 %	40 %	20 %	323524386
8	NC_015136	AGCGA	2	10	13067	13076	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_015136	AGAGA	2	10	13295	13304	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015136	TGGAA	2	10	14717	14726	40 %	20 %	40 %	0 %	323524388
11	NC_015136	GTATG	2	10	17613	17622	20 %	40 %	40 %	0 %	323524391
12	NC_015136	CGCAA	2	10	18313	18322	40 %	0 %	20 %	40 %	323524391
13	NC_015136	CAAAA	2	10	20018	20027	80 %	0 %	0 %	20 %	323524392
14	NC_015136	AGCTG	2	10	20228	20237	20 %	20 %	40 %	20 %	323524392
15	NC_015136	CGATC	2	10	21247	21256	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_015136	CATCA	2	10	21724	21733	40 %	20 %	0 %	40 %	323524394
17	NC_015136	GCGAA	2	10	24250	24259	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_015136	GCGCC	2	10	25658	25667	0 %	0 %	40 %	60 %	323524399
19	NC_015136	TCCGT	2	10	25685	25694	0 %	40 %	20 %	40 %	323524399
20	NC_015136	GCGCC	2	10	27550	27559	0 %	0 %	40 %	60 %	323524401
21	NC_015136	GCCGC	2	10	27616	27625	0 %	0 %	40 %	60 %	323524401
22	NC_015136	GGCCT	2	10	27856	27865	0 %	20 %	40 %	40 %	323524401
23	NC_015136	CGCAA	2	10	27928	27937	40 %	0 %	20 %	40 %	323524401
24	NC_015136	TGGCG	2	10	33213	33222	0 %	20 %	60 %	20 %	323524405
25	NC_015136	GTTCT	2	10	33937	33946	0 %	60 %	20 %	20 %	323524405
26	NC_015136	GCCCG	2	10	34731	34740	0 %	0 %	40 %	60 %	323524407
27	NC_015136	CGCTG	2	10	36303	36312	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_015136	ATGGC	2	10	40944	40953	20 %	20 %	40 %	20 %	323524413
29	NC_015136	GCAAA	2	10	43952	43961	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_015136	CCCGT	2	10	46883	46892	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
31	NC_015136	GCTCG	2	10	47471	47480	0 %	20 %	40 %	40 %	323524418
32	NC_015136	TGCGC	2	10	47762	47771	0 %	20 %	40 %	40 %	323524418
33	NC_015136	TTTTG	2	10	48959	48968	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015136	GCGCC	2	10	54953	54962	0 %	0 %	40 %	60 %	323524422
35	NC_015136	GCGCC	2	10	55525	55534	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
36	NC_015136	GGCGC	2	10	56608	56617	0 %	0 %	60 %	40 %	323524424
37	NC_015136	ACGGC	2	10	56986	56995	20 %	0 %	40 %	40 %	323524424
38	NC_015136	GCGCG	2	10	59323	59332	0 %	0 %	60 %	40 %	323524427
39	NC_015136	CGTGC	2	10	60175	60184	0 %	20 %	40 %	40 %	323524427
40	NC_015136	TACGT	2	10	60323	60332	20 %	40 %	20 %	20 %	323524427
41	NC_015136	AGCGC	2	10	60489	60498	20 %	0 %	40 %	40 %	323524427
42	NC_015136	GCTCG	2	10	62461	62470	0 %	20 %	40 %	40 %	323524429
43	NC_015136	GCGCG	2	10	62635	62644	0 %	0 %	60 %	40 %	323524429
44	NC_015136	GCGCG	2	10	62881	62890	0 %	0 %	60 %	40 %	323524429
45	NC_015136	AAGGC	2	10	63213	63222	40 %	0 %	40 %	20 %	323524429
46	NC_015136	TCGCG	2	10	64741	64750	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_015136	TGGCG	2	10	69689	69698	0 %	20 %	60 %	20 %	323524437
48	NC_015136	GCCGT	2	10	70496	70505	0 %	20 %	40 %	40 %	323524437
49	NC_015136	CCGGG	2	10	72174	72183	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
50	NC_015136	CTTCA	2	10	74390	74399	20 %	40 %	0 %	40 %	323524440
51	NC_015136	GCCGA	2	10	74412	74421	20 %	0 %	40 %	40 %	323524440
52	NC_015136	GCACG	2	10	74738	74747	20 %	0 %	40 %	40 %	323524440
53	NC_015136	GGGCC	2	10	75109	75118	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
54	NC_015136	GCCAG	2	10	75229	75238	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
55	NC_015136	CGCGG	2	10	75798	75807	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
56	NC_015136	CGTGC	2	10	77275	77284	0 %	20 %	40 %	40 %	323524442
57	NC_015136	GCGCC	2	10	77528	77537	0 %	0 %	40 %	60 %	323524443
58	NC_015136	CGCGC	2	10	77649	77658	0 %	0 %	40 %	60 %	323524443
59	NC_015136	ATCAG	2	10	77708	77717	40 %	20 %	20 %	20 %	323524443
60	NC_015136	CGAAG	2	10	78699	78708	40 %	0 %	40 %	20 %	323524443
61	NC_015136	GCGCC	2	10	80965	80974	0 %	0 %	40 %	60 %	323524446
62	NC_015136	CAGCA	2	10	82027	82036	40 %	0 %	20 %	40 %	323524446
63	NC_015136	CGAGG	2	10	82260	82269	20 %	0 %	60 %	20 %	323524447
64	NC_015136	ACGAT	2	10	83776	83785	40 %	20 %	20 %	20 %	323524448
65	NC_015136	CGGCG	2	10	87162	87171	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
66	NC_015136	CGGCG	2	10	88686	88695	0 %	0 %	60 %	40 %	323524453
67	NC_015136	GCAGC	2	10	89961	89970	20 %	0 %	40 %	40 %	323524453
68	NC_015136	AGCGA	2	10	90160	90169	40 %	0 %	40 %	20 %	323524453
69	NC_015136	TCACG	2	10	91400	91409	20 %	20 %	20 %	40 %	323524454
70	NC_015136	GCTGC	2	10	91482	91491	0 %	20 %	40 %	40 %	323524454
71	NC_015136	TCCGG	2	10	91671	91680	0 %	20 %	40 %	40 %	323524454
72	NC_015136	GCGCC	2	10	91690	91699	0 %	0 %	40 %	60 %	323524454
73	NC_015136	CGCGG	2	10	91791	91800	0 %	0 %	60 %	40 %	323524455
74	NC_015136	CTGCA	2	10	92058	92067	20 %	20 %	20 %	40 %	323524455
75	NC_015136	GCGCG	2	10	92318	92327	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
76	NC_015136	AAACG	2	10	92374	92383	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_015136	TCAGA	2	10	92430	92439	40 %	20 %	20 %	20 %	323524456
78	NC_015136	GCCGC	2	10	94574	94583	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
79	NC_015136	CCGGG	2	10	96346	96355	0 %	0 %	60 %	40 %	323524459
80	NC_015136	CAGCG	2	10	99162	99171	20 %	0 %	40 %	40 %	323524462
81	NC_015136	GCCAT	2	10	99208	99217	20 %	20 %	20 %	40 %	323524462
82	NC_015136	GCCGA	2	10	101482	101491	20 %	0 %	40 %	40 %	323524464
83	NC_015136	TCGCG	2	10	102901	102910	0 %	20 %	40 %	40 %	323524465
84	NC_015136	GCGTG	2	10	103647	103656	0 %	20 %	60 %	20 %	323524466
85	NC_015136	CGACA	2	10	105669	105678	40 %	0 %	20 %	40 %	323524469
86	NC_015136	GCGAC	2	10	107528	107537	20 %	0 %	40 %	40 %	323524471
87	NC_015136	TGCCG	2	10	107895	107904	0 %	20 %	40 %	40 %	323524471
88	NC_015136	GCGCG	2	10	109667	109676	0 %	0 %	60 %	40 %	323524473
89	NC_015136	TGGCG	2	10	112864	112873	0 %	20 %	60 %	20 %	323524477
90	NC_015136	GCGCC	2	10	113187	113196	0 %	0 %	40 %	60 %	323524477
91	NC_015136	CGTGC	2	10	113512	113521	0 %	20 %	40 %	40 %	323524477
92	NC_015136	CGGCG	2	10	114168	114177	0 %	0 %	60 %	40 %	323524478
93	NC_015136	TGGCC	2	10	116273	116282	0 %	20 %	40 %	40 %	323524480
94	NC_015136	CTTCG	2	10	116640	116649	0 %	40 %	20 %	40 %	323524480
95	NC_015136	GCCGC	2	10	116976	116985	0 %	0 %	40 %	60 %	323524480
96	NC_015136	AGCGG	2	10	119526	119535	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
97	NC_015136	GCCGG	2	10	121076	121085	0 %	0 %	60 %	40 %	323524482
98	NC_015136	GGCGC	2	10	121872	121881	0 %	0 %	60 %	40 %	323524483
99	NC_015136	TGCCG	2	10	125352	125361	0 %	20 %	40 %	40 %	323524486
100	NC_015136	CGATG	2	10	130285	130294	20 %	20 %	40 %	20 %	323524491
101	NC_015136	GCGCG	2	10	130330	130339	0 %	0 %	60 %	40 %	323524491
102	NC_015136	ACGCG	2	10	131012	131021	20 %	0 %	40 %	40 %	323524491
103	NC_015136	CGGCG	2	10	132412	132421	0 %	0 %	60 %	40 %	323524493
104	NC_015136	GCGAC	2	10	134677	134686	20 %	0 %	40 %	40 %	323524494
105	NC_015136	GCCGA	2	10	135581	135590	20 %	0 %	40 %	40 %	323524495
106	NC_015136	GTAAC	2	10	137014	137023	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_015136	GCCAT	2	10	137776	137785	20 %	20 %	20 %	40 %	323524496
108	NC_015136	CATGC	2	10	137838	137847	20 %	20 %	20 %	40 %	323524496
109	NC_015136	ATGAA	2	10	139352	139361	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015136	AAACG	2	10	142141	142150	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_015136	CGCAC	2	10	144443	144452	20 %	0 %	20 %	60 %	323524503
112	NC_015136	CGCGC	2	10	144646	144655	0 %	0 %	40 %	60 %	323524503
113	NC_015136	ACGCG	2	10	144895	144904	20 %	0 %	40 %	40 %	323524504
114	NC_015136	TGCGG	2	10	145191	145200	0 %	20 %	60 %	20 %	323524504
115	NC_015136	CGCGG	2	10	147668	147677	0 %	0 %	60 %	40 %	323524507
116	NC_015136	CGGCG	2	10	147805	147814	0 %	0 %	60 %	40 %	323524507
117	NC_015136	CGCGC	2	10	150720	150729	0 %	0 %	40 %	60 %	323524510
118	NC_015136	CGCGC	2	10	150886	150895	0 %	0 %	40 %	60 %	323524510
119	NC_015136	GTTCG	2	10	151575	151584	0 %	40 %	40 %	20 %	323524511
120	NC_015136	CCGCG	2	10	153360	153369	0 %	0 %	40 %	60 %	323524512
121	NC_015136	GCGAC	2	10	153675	153684	20 %	0 %	40 %	40 %	323524512
122	NC_015136	CCGGC	2	10	154048	154057	0 %	0 %	40 %	60 %	323524512
123	NC_015136	ACGTG	2	10	154323	154332	20 %	20 %	40 %	20 %	323524512
124	NC_015136	CGCGC	2	10	154678	154687	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
125	NC_015136	CCGGC	2	10	155026	155035	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
126	NC_015136	TTCGG	2	10	156970	156979	0 %	40 %	40 %	20 %	323524514
127	NC_015136	CGGCG	2	10	157776	157785	0 %	0 %	60 %	40 %	323524515
128	NC_015136	GCGTC	2	10	158202	158211	0 %	20 %	40 %	40 %	323524515
129	NC_015136	CGGCG	2	10	158548	158557	0 %	0 %	60 %	40 %	323524515
130	NC_015136	GCGCC	2	10	162357	162366	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
131	NC_015136	CGGCA	2	10	164907	164916	20 %	0 %	40 %	40 %	323524520
132	NC_015136	ACGCG	2	10	165418	165427	20 %	0 %	40 %	40 %	323524521
133	NC_015136	GCCGT	2	10	167506	167515	0 %	20 %	40 %	40 %	323524522
134	NC_015136	GCGCG	2	10	167958	167967	0 %	0 %	60 %	40 %	323524522
135	NC_015136	AGCCG	2	10	168517	168526	20 %	0 %	40 %	40 %	323524523
136	NC_015136	GGCCG	2	10	170063	170072	0 %	0 %	60 %	40 %	323524524
137	NC_015136	GCCGC	2	10	172013	172022	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
138	NC_015136	CGGCG	2	10	172409	172418	0 %	0 %	60 %	40 %	323524526
139	NC_015136	TGCCG	2	10	173084	173093	0 %	20 %	40 %	40 %	323524526
140	NC_015136	GCGGG	2	10	176598	176607	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
141	NC_015136	GGCGA	2	10	177546	177555	20 %	0 %	60 %	20 %	323524528
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149	NC_015136	GATCA	2	10	186858	186867	40 %	20 %	20 %	20 %	323524539
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151	NC_015136	AGACG	2	10	188636	188645	40 %	0 %	40 %	20 %	323524541
152	NC_015136	GCGAG	2	10	189947	189956	20 %	0 %	60 %	20 %	323524543
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168	NC_015136	TTTTG	2	10	213837	213846	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_015136	GCCGT	2	10	227196	227205	0 %	20 %	40 %	40 %	323524572
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231	NC_015136	GCGCC	2	10	288429	288438	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
232	NC_015136	GCCTT	2	10	288450	288459	0 %	40 %	20 %	40 %	323524629
233	NC_015136	CGCGG	2	10	289525	289534	0 %	0 %	60 %	40 %	323524630
234	NC_015136	AAGCA	2	10	290388	290397	60 %	0 %	20 %	20 %	323524632
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241	NC_015136	CGGCG	2	10	294476	294485	0 %	0 %	60 %	40 %	323524637
242	NC_015136	GGCAT	2	10	294561	294570	20 %	20 %	40 %	20 %	323524637
243	NC_015136	ATCTG	2	10	294938	294947	20 %	40 %	20 %	20 %	323524638
244	NC_015136	GATCA	2	10	295290	295299	40 %	20 %	20 %	20 %	323524638
245	NC_015136	GAGCA	2	10	298895	298904	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
246	NC_015136	CGAGG	2	10	299564	299573	20 %	0 %	60 %	20 %	323524642
247	NC_015136	GCGGT	2	10	300039	300048	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
248	NC_015136	CGGCG	2	10	304407	304416	0 %	0 %	60 %	40 %	323524649
249	NC_015136	ACCGC	2	10	305487	305496	20 %	0 %	20 %	60 %	323524650
250	NC_015136	GCGCC	2	10	305710	305719	0 %	0 %	40 %	60 %	323524650
251	NC_015136	GCGGT	2	10	306103	306112	0 %	20 %	60 %	20 %	323524651
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262	NC_015136	TGCGC	2	10	316668	316677	0 %	20 %	40 %	40 %	323524659
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264	NC_015136	CGCGC	2	10	321022	321031	0 %	0 %	40 %	60 %	323524664
265	NC_015136	GCCGT	2	10	321297	321306	0 %	20 %	40 %	40 %	323524665
266	NC_015136	CGCGC	2	10	322482	322491	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
267	NC_015136	GCCGC	2	10	323035	323044	0 %	0 %	40 %	60 %	323524666
268	NC_015136	AACGG	2	10	324153	324162	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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285	NC_015136	CGCTG	2	10	351569	351578	0 %	20 %	40 %	40 %	323524695
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401	NC_015136	ACGCG	2	10	478527	478536	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
402	NC_015136	CGCGG	2	10	480508	480517	0 %	0 %	60 %	40 %	323524805
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500	NC_015136	TGGCG	2	10	599478	599487	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding

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