MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia sp. CCGE1001 chromosome 1

Total Repeats: 629

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015136	GCGAG	2	10	6490	6499	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2	NC_015136	AGCGA	2	10	13067	13076	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_015136	AGAGA	2	10	13295	13304	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015136	CGATC	2	10	21247	21256	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_015136	GCGAA	2	10	24250	24259	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_015136	CGCTG	2	10	36303	36312	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_015136	GCAAA	2	10	43952	43961	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_015136	CCCGT	2	10	46883	46892	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
9	NC_015136	TTTTG	2	10	48959	48968	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015136	GCGCC	2	10	55525	55534	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11	NC_015136	TCGCG	2	10	64741	64750	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_015136	CCGGG	2	10	72174	72183	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13	NC_015136	GGGCC	2	10	75109	75118	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
14	NC_015136	GCCAG	2	10	75229	75238	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_015136	CGCGG	2	10	75798	75807	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
16	NC_015136	CGGCG	2	10	87162	87171	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
17	NC_015136	GCGCG	2	10	92318	92327	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
18	NC_015136	AAACG	2	10	92374	92383	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_015136	GCCGC	2	10	94574	94583	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
20	NC_015136	AGCGG	2	10	119526	119535	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
21	NC_015136	GTAAC	2	10	137014	137023	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_015136	ATGAA	2	10	139352	139361	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015136	AAACG	2	10	142141	142150	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_015136	CGCGC	2	10	154678	154687	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
25	NC_015136	CCGGC	2	10	155026	155035	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
26	NC_015136	GCGCC	2	10	162357	162366	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
27	NC_015136	GCCGC	2	10	172013	172022	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
28	NC_015136	GCGGG	2	10	176598	176607	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
29	NC_015136	GGCGC	2	10	184911	184920	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
30	NC_015136	GCGCG	2	10	185761	185770	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
31	NC_015136	GATGT	2	10	187970	187979	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015136	GCCGG	2	10	191355	191364	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
33	NC_015136	GCGAA	2	10	198191	198200	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_015136	TTTTG	2	10	213837	213846	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015136	CGAGC	2	10	214034	214043	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_015136	CGTCG	2	10	244442	244451	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_015136	GCGCC	2	10	257739	257748	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
38	NC_015136	GCCGC	2	10	260505	260514	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
39	NC_015136	AAGTC	2	10	275438	275447	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_015136	GCGCC	2	10	288429	288438	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
41	NC_015136	GAGCA	2	10	298895	298904	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_015136	GCGGT	2	10	300039	300048	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
43	NC_015136	CGCGC	2	10	322482	322491	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
44	NC_015136	AACGG	2	10	324153	324162	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_015136	GAGCC	2	10	336262	336271	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_015136	AGAGG	2	10	349613	349622	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015136	CCGGT	2	10	356396	356405	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
48	NC_015136	GCCGC	2	10	356416	356425	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
49	NC_015136	TGCCG	2	10	357824	357833	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
50	NC_015136	CGCGC	2	10	377888	377897	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
51	NC_015136	CGCGG	2	10	393340	393349	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
52	NC_015136	TCGCC	2	10	393642	393651	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
53	NC_015136	CGCGG	2	10	400569	400578	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
54	NC_015136	GCCGC	2	10	417096	417105	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
55	NC_015136	CAGCC	2	10	417788	417797	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
56	NC_015136	TCGCA	2	10	417914	417923	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_015136	CGGCG	2	10	432899	432908	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
58	NC_015136	GCCGC	2	10	440056	440065	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
59	NC_015136	GGGAG	2	10	440148	440157	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015136	TCAAT	2	10	460934	460943	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_015136	CGGCG	2	10	460987	460996	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
62	NC_015136	GCGCC	2	10	465845	465854	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
63	NC_015136	TGCCG	2	10	467353	467362	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
64	NC_015136	AAGCG	2	10	468871	468880	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_015136	GCCGC	2	10	478470	478479	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
66	NC_015136	ACGCG	2	10	478527	478536	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
67	NC_015136	CCAAT	2	10	481385	481394	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_015136	GGCGC	2	10	485448	485457	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
69	NC_015136	GGCTC	2	10	492805	492814	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
70	NC_015136	TCGCG	2	10	510834	510843	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
71	NC_015136	GCGCC	2	10	520931	520940	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
72	NC_015136	CCAGC	2	10	525011	525020	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
73	NC_015136	ATGCG	2	10	529959	529968	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_015136	CACGC	2	10	531429	531438	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
75	NC_015136	AACGA	2	10	535951	535960	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_015136	CGGCG	2	10	539922	539931	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
77	NC_015136	GGCGC	2	10	541628	541637	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
78	NC_015136	TGCAC	2	10	542036	542045	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_015136	ATTCG	2	10	542159	542168	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_015136	CGCAT	2	10	544008	544017	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_015136	CATCC	2	10	557711	557720	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
82	NC_015136	GCGCG	2	10	558431	558440	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
83	NC_015136	CGGCG	2	10	559900	559909	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
84	NC_015136	CTTGC	2	10	561849	561858	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_015136	TGGCG	2	10	599478	599487	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
86	NC_015136	TATGG	2	10	606645	606654	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015136	AGGGT	2	10	615435	615444	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015136	CCATG	2	10	615460	615469	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_015136	CGCGG	2	10	619244	619253	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
90	NC_015136	TGGCG	2	10	626156	626165	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
91	NC_015136	TCCAT	2	10	627786	627795	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
92	NC_015136	GCCGG	2	10	660333	660342	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
93	NC_015136	TGATC	2	10	666465	666474	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_015136	ACACC	2	10	669806	669815	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
95	NC_015136	CGGGC	2	10	673076	673085	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
96	NC_015136	AAGCG	2	10	675745	675754	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_015136	GCGTC	2	10	678548	678557	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
98	NC_015136	CCAAC	2	10	679942	679951	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
99	NC_015136	ATGGA	2	10	683030	683039	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015136	GTCAG	2	10	690313	690322	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_015136	TGTCC	2	10	699761	699770	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
102	NC_015136	TGATG	2	10	709656	709665	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015136	CATCG	2	10	715573	715582	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_015136	CGTGC	2	10	724791	724800	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
105	NC_015136	TGCTC	2	10	728481	728490	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_015136	CGCGC	2	10	764226	764235	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
107	NC_015136	CGCGG	2	10	773435	773444	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
108	NC_015136	CCGCG	2	10	773455	773464	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
109	NC_015136	TGCGG	2	10	782396	782405	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
110	NC_015136	CGGGC	2	10	789552	789561	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
111	NC_015136	AAAGG	2	10	830998	831007	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015136	GCCCG	2	10	864201	864210	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
113	NC_015136	CGCGC	2	10	865262	865271	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
114	NC_015136	ATGCA	2	10	872123	872132	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_015136	GGCGG	2	10	882353	882362	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
116	NC_015136	GGTCC	2	10	882365	882374	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
117	NC_015136	GATCC	2	10	884726	884735	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_015136	CGGTT	2	10	897733	897742	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_015136	TCGCG	2	10	905789	905798	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
120	NC_015136	CGCGG	2	10	905820	905829	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
121	NC_015136	CGGAC	2	10	924990	924999	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
122	NC_015136	CGTAG	2	10	925005	925014	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_015136	CTACC	2	10	937476	937485	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
124	NC_015136	TGCGA	2	10	939220	939229	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_015136	TCCTT	2	10	939251	939260	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
126	NC_015136	TCCGT	2	10	960876	960885	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_015136	CGGCG	2	10	962771	962780	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
128	NC_015136	CTTTC	2	10	962799	962808	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
129	NC_015136	ACGAG	2	10	962821	962830	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_015136	TCCTG	2	10	964590	964599	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_015136	ATGGG	2	10	964943	964952	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015136	CCCCA	2	10	982178	982187	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
133	NC_015136	CGCGC	2	10	982492	982501	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
134	NC_015136	GCCGC	2	10	988293	988302	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
135	NC_015136	CGGTG	2	10	1009040	1009049	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
136	NC_015136	CAATG	2	10	1009286	1009295	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_015136	GCCGC	2	10	1012424	1012433	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
138	NC_015136	CACCG	2	10	1012518	1012527	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
139	NC_015136	GTTTC	2	10	1012637	1012646	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_015136	GTCCG	2	10	1019271	1019280	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
141	NC_015136	GCCGG	2	10	1023409	1023418	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
142	NC_015136	CCGCG	2	10	1025969	1025978	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
143	NC_015136	CCGCA	2	10	1027935	1027944	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
144	NC_015136	TGGCC	2	10	1034326	1034335	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
145	NC_015136	CGGCG	2	10	1046528	1046537	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
146	NC_015136	GCTCG	2	10	1056811	1056820	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
147	NC_015136	CGGCG	2	10	1078963	1078972	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
148	NC_015136	GCGCA	2	10	1078982	1078991	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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156	NC_015136	CTGGA	2	10	1116411	1116420	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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262	NC_015136	CGAGG	2	10	1732501	1732510	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
263	NC_015136	GCCGG	2	10	1741399	1741408	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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281	NC_015136	ATTCA	2	10	1841275	1841284	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
282	NC_015136	CGCGC	2	10	1849613	1849622	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
283	NC_015136	AGCGA	2	10	1849798	1849807	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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388	NC_015136	CGTGC	2	10	2472716	2472725	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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390	NC_015136	AGCGC	2	10	2489441	2489450	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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403	NC_015136	ACGAC	2	10	2530404	2530413	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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410	NC_015136	TGAGC	2	10	2580785	2580794	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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412	NC_015136	GCGCC	2	10	2592960	2592969	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
413	NC_015136	GCCGC	2	10	2597178	2597187	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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418	NC_015136	CGCGC	2	10	2647701	2647710	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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420	NC_015136	CGCAG	2	10	2688076	2688085	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
421	NC_015136	GCGCA	2	10	2693267	2693276	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
422	NC_015136	CGTCT	2	10	2697379	2697388	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
423	NC_015136	GGACC	2	10	2697415	2697424	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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425	NC_015136	CGGGC	2	10	2699901	2699910	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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488	NC_015136	GCAAC	2	10	3111103	3111112	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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490	NC_015136	GCTTC	2	10	3112561	3112570	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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492	NC_015136	ATCTT	2	10	3119088	3119097	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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494	NC_015136	GCCTG	2	10	3145460	3145469	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
495	NC_015136	CGGCG	2	10	3145511	3145520	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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497	NC_015136	AGTAC	2	10	3151800	3151809	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
498	NC_015136	GTTTT	2	10	3152952	3152961	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
499	NC_015136	CGGCG	2	10	3163134	3163143	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
500	NC_015136	CGGCG	3	15	3167015	3167029	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding

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