MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia sp. CCGE1001 chromosome 1

Total Repeats: 63393

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015136	TGA	2	6	144	149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	323524378
2	NC_015136	CAG	2	6	200	205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524378
3	NC_015136	CGC	2	6	247	252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323524378
4	NC_015136	GCG	2	6	272	277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323524378
5	NC_015136	GCG	2	6	416	421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323524378
6	NC_015136	GGC	2	6	458	463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323524378
7	NC_015136	GGC	2	6	523	528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323524378
8	NC_015136	GCC	2	6	566	571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323524378
9	NC_015136	CGC	2	6	574	579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323524378
10	NC_015136	CGC	2	6	622	627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323524378
11	NC_015136	CGG	2	6	666	671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323524378
12	NC_015136	CGC	2	6	674	679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323524378
13	NC_015136	GGC	2	6	872	877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323524378
14	NC_015136	GCT	2	6	922	927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524378
15	NC_015136	CGT	2	6	985	990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524378
16	NC_015136	CGA	2	6	1015	1020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524378
17	NC_015136	CTA	2	6	1030	1035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	323524378
18	NC_015136	CTG	3	9	1049	1057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524378
19	NC_015136	CGA	2	6	1060	1065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524378
20	NC_015136	TTC	2	6	1106	1111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	323524378
21	NC_015136	TCG	2	6	1128	1133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524378
22	NC_015136	ATC	2	6	1151	1156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	323524378
23	NC_015136	CGA	2	6	1192	1197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524378
24	NC_015136	GCC	2	6	1243	1248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323524378
25	NC_015136	TCG	2	6	1329	1334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524378
26	NC_015136	AAG	2	6	1437	1442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	323524378
27	NC_015136	CTG	2	6	1454	1459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524378
28	NC_015136	AGA	2	6	1497	1502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	323524378
29	NC_015136	CGG	2	6	1645	1650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323524378
30	NC_015136	CGA	2	6	1693	1698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524378
31	NC_015136	CCT	2	6	2019	2024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	323524379
32	NC_015136	CGC	2	6	2059	2064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323524379
33	NC_015136	CAC	2	6	2151	2156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	323524379
34	NC_015136	GCG	2	6	2177	2182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323524379
35	NC_015136	CTC	2	6	2215	2220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	323524379
36	NC_015136	CGC	2	6	2322	2327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323524379
37	NC_015136	GCT	2	6	2403	2408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524379
38	NC_015136	CAG	2	6	2434	2439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524379
39	NC_015136	CTA	2	6	2448	2453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	323524379
40	NC_015136	TGC	2	6	2465	2470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524379
41	NC_015136	TGG	3	9	2471	2479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	323524379
42	NC_015136	TCG	2	6	2530	2535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524379
43	NC_015136	CGA	2	6	2622	2627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524379
44	NC_015136	TGG	2	6	2699	2704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	323524379
45	NC_015136	GAA	2	6	2773	2778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	323524379
46	NC_015136	GAA	2	6	2902	2907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	323524379
47	NC_015136	ACG	2	6	2921	2926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524379
48	NC_015136	TGC	2	6	2996	3001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524379
49	NC_015136	ACG	2	6	3053	3058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524379
50	NC_015136	GTG	2	6	3070	3075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	323524379
51	NC_015136	ACA	2	6	3235	3240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	323524380
52	NC_015136	CAC	2	6	3339	3344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	323524380
53	NC_015136	GAC	2	6	3483	3488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524380
54	NC_015136	TGA	2	6	3523	3528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	323524380
55	NC_015136	CGG	2	6	3542	3547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323524380
56	NC_015136	GGC	2	6	3579	3584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323524380
57	NC_015136	AAG	2	6	3657	3662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	323524380
58	NC_015136	GAA	2	6	3708	3713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	323524380
59	NC_015136	TGA	2	6	3724	3729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	323524380
60	NC_015136	CGA	2	6	3791	3796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524380
61	NC_015136	GAA	2	6	3912	3917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	323524380
62	NC_015136	TCG	2	6	3928	3933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524380
63	NC_015136	GCG	2	6	3934	3939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323524380
64	NC_015136	CAA	2	6	3962	3967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	323524380
65	NC_015136	TGC	2	6	3979	3984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524380
66	NC_015136	AAC	2	6	4086	4091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	323524380
67	NC_015136	CGG	2	6	4106	4111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323524380
68	NC_015136	GAA	2	6	4184	4189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	323524380
69	NC_015136	CGA	2	6	4211	4216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524380
70	NC_015136	GTC	2	6	4298	4303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524380
71	NC_015136	GAA	2	6	4323	4328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	323524380
72	NC_015136	GTC	2	6	4329	4334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524380
73	NC_015136	GAA	2	6	4347	4352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	323524380
74	NC_015136	ACG	2	6	4372	4377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524380
75	NC_015136	GCA	2	6	4390	4395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524380
76	NC_015136	TCG	2	6	4399	4404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524380
77	NC_015136	TCG	2	6	4540	4545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524380
78	NC_015136	GGC	2	6	4560	4565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323524380
79	NC_015136	GCT	2	6	4655	4660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524380
80	NC_015136	TCG	2	6	4662	4667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524380
81	NC_015136	CAT	4	12	4751	4762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	323524380
82	NC_015136	GCT	2	6	4799	4804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524380
83	NC_015136	TTC	2	6	4812	4817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	323524380
84	NC_015136	GAT	2	6	4835	4840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	323524380
85	NC_015136	GCC	2	6	4868	4873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323524380
86	NC_015136	TGC	2	6	4972	4977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524380
87	NC_015136	CTG	2	6	5037	5042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524380
88	NC_015136	GGT	2	6	5051	5056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	323524380
89	NC_015136	ACG	2	6	5077	5082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524380
90	NC_015136	GCG	2	6	5136	5141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323524380
91	NC_015136	CGA	2	6	5294	5299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524380
92	NC_015136	CCG	2	6	5314	5319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323524380
93	NC_015136	CAG	2	6	5325	5330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524380
94	NC_015136	AGC	2	6	5470	5475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524380
95	NC_015136	AGC	2	6	5506	5511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524380
96	NC_015136	ACG	2	6	5520	5525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524380
97	NC_015136	CGT	2	6	5541	5546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524380
98	NC_015136	TGC	2	6	5548	5553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524380
99	NC_015136	GCG	2	6	5577	5582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323524380
100	NC_015136	ACG	2	6	5595	5600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524380
101	NC_015136	GAT	2	6	5610	5615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	323524380
102	NC_015136	CGG	2	6	5625	5630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323524380
103	NC_015136	TCA	2	6	7282	7287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	323524381
104	NC_015136	GGA	2	6	7344	7349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	323524381
105	NC_015136	GCC	2	6	7388	7393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323524381
106	NC_015136	TGT	2	6	7515	7520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	323524381
107	NC_015136	TCT	2	6	7698	7703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	323524381
108	NC_015136	TTG	2	6	7798	7803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	323524381
109	NC_015136	CAG	2	6	7835	7840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524381
110	NC_015136	GAA	2	6	7902	7907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	323524381
111	NC_015136	TGC	2	6	8051	8056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524381
112	NC_015136	CCA	3	9	8144	8152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	323524382
113	NC_015136	TCG	2	6	8184	8189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524382
114	NC_015136	TGA	2	6	8245	8250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	323524382
115	NC_015136	TCC	2	6	8273	8278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	323524382
116	NC_015136	CGA	2	6	8316	8321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524382
117	NC_015136	CTC	2	6	8323	8328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	323524382
118	NC_015136	ATC	2	6	8539	8544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	323524382
119	NC_015136	AAC	2	6	8659	8664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	323524382
120	NC_015136	AAG	2	6	8735	8740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	323524382
121	NC_015136	ACC	2	6	8744	8749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	323524382
122	NC_015136	TCG	2	6	8809	8814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524383
123	NC_015136	GCG	2	6	9004	9009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323524383
124	NC_015136	CAT	2	6	9059	9064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	323524383
125	NC_015136	CTT	2	6	9104	9109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	323524383
126	NC_015136	CCA	2	6	9163	9168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	323524383
127	NC_015136	AAC	2	6	9178	9183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	323524383
128	NC_015136	ATT	2	6	9376	9381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	323524383
129	NC_015136	TAA	2	6	9416	9421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	323524383
130	NC_015136	AGT	2	6	9498	9503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	323524383
131	NC_015136	AAT	2	6	9537	9542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	323524383
132	NC_015136	ATT	3	9	9552	9560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	323524383
133	NC_015136	CAA	2	6	9606	9611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	323524383
134	NC_015136	ATG	2	6	9630	9635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	323524383
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136	NC_015136	TTA	2	6	9743	9748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	323524383
137	NC_015136	TTC	2	6	9784	9789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	323524383
138	NC_015136	TCA	2	6	9841	9846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	323524383
139	NC_015136	TTC	2	6	9924	9929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	323524384
140	NC_015136	ACT	2	6	10158	10163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	323524384
141	NC_015136	CGT	2	6	10210	10215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524384
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143	NC_015136	ACA	2	6	11032	11037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	323524385
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150	NC_015136	TTG	2	6	12099	12104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	323524386
151	NC_015136	TGA	2	6	12303	12308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	323524386
152	NC_015136	TGA	2	6	12508	12513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	323524386
153	NC_015136	GCC	2	6	12608	12613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323524386
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155	NC_015136	TGT	2	6	14199	14204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	323524387
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162	NC_015136	TAA	2	6	15000	15005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	323524389
163	NC_015136	AAG	2	6	15160	15165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	323524389
164	NC_015136	ATG	2	6	15370	15375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	323524389
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169	NC_015136	ATT	2	6	15975	15980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	323524390
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241	NC_015136	GAA	2	6	23237	23242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	323524397
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245	NC_015136	CGC	3	9	23544	23552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323524398
246	NC_015136	CCA	2	6	23649	23654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	323524398
247	NC_015136	TCG	2	6	23663	23668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524398
248	NC_015136	GCA	2	6	23696	23701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524398
249	NC_015136	GCT	2	6	23947	23952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524398
250	NC_015136	CGG	2	6	24009	24014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323524398
251	NC_015136	GGC	2	6	24043	24048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323524398
252	NC_015136	GAT	2	6	24147	24152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	323524398
253	NC_015136	TGT	2	6	24219	24224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	323524398
254	NC_015136	TCA	2	6	24646	24651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	323524399
255	NC_015136	CGC	2	6	24665	24670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323524399
256	NC_015136	ACC	2	6	24678	24683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	323524399
257	NC_015136	CAC	2	6	24707	24712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	323524399
258	NC_015136	GGC	2	6	24729	24734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323524399
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282	NC_015136	CGA	2	6	26145	26150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524400
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369	NC_015136	TCG	2	6	32021	32026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524405
370	NC_015136	CGC	2	6	32047	32052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323524405
371	NC_015136	AGC	2	6	32250	32255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524405
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373	NC_015136	CGC	2	6	32313	32318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323524405
374	NC_015136	CGC	2	6	32322	32327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323524405
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376	NC_015136	AGC	2	6	32458	32463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524405
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381	NC_015136	GCG	2	6	32781	32786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323524405
382	NC_015136	GCG	2	6	32823	32828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323524405
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497	NC_015136	CAG	2	6	40997	41002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	323524413
498	NC_015136	CGC	2	6	41005	41010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	323524413
499	NC_015136	CGT	2	6	41011	41016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	323524413
500	NC_015136	CGG	2	6	41024	41029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	323524413

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