MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Microbacterium testaceum StLB037

Total Repeats: 182

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015125	TGAGGA	2	12	23188	23199	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015125	GCCTCA	2	12	28472	28483	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015125	CCGCAA	2	12	30764	30775	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015125	TCGGCC	2	12	47201	47212	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015125	GTCGCG	2	12	49921	49932	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015125	GGTGAG	2	12	51075	51086	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015125	CCCGAA	2	12	91223	91234	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015125	CCTCGG	2	12	162560	162571	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015125	GCCCGC	2	12	172108	172119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_015125	GGAGCC	2	12	177973	177984	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015125	CGAGCC	2	12	177991	178002	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015125	AGGCGG	2	12	199311	199322	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_015125	GGGCGC	2	12	200759	200770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015125	GCCGCG	2	12	244021	244032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015125	ATCCCG	2	12	244503	244514	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
16	NC_015125	CGGGGC	2	12	256998	257009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015125	GGCATC	2	12	292515	292526	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015125	TTTCGG	2	12	342027	342038	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_015125	GCCGCG	4	24	358798	358821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015125	GTCGCG	2	12	358833	358844	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015125	GTCGCG	2	12	358850	358861	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015125	GTCGCG	2	12	358867	358878	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015125	GGCTGG	2	12	358902	358913	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_015125	CCTTCT	2	12	375347	375358	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015125	CGCGGC	2	12	467161	467172	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015125	GCGTCG	2	12	495297	495308	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015125	TGTCGG	2	12	498838	498849	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_015125	GTAGCC	2	12	519023	519034	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015125	CAGCCC	3	18	519084	519101	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_015125	CGGGGG	2	12	541284	541295	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_015125	CCGGAC	2	12	575625	575636	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
32	NC_015125	GACGGA	2	12	586186	586197	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_015125	AGACGA	2	12	627209	627220	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_015125	CGGGCG	2	12	672413	672424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015125	CGGGCG	2	12	672481	672492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015125	ATTTAC	2	12	686359	686370	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_015125	CGGCCG	2	12	701533	701544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015125	CGTCTC	2	12	720880	720891	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015125	GCGGCC	2	12	727130	727141	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015125	CGCGGG	2	12	736181	736192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015125	CTCGGC	3	18	800732	800749	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015125	CCCCGC	2	12	805645	805656	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
43	NC_015125	CTCGCG	2	12	811723	811734	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015125	GCGGCC	2	12	814346	814357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015125	CCGCGC	4	24	814410	814433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_015125	CGCGGG	2	12	819022	819033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015125	GTGGCG	2	12	849304	849315	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_015125	GCCCCG	2	12	888707	888718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_015125	GCCCGC	2	12	923548	923559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_015125	AGCAGA	2	12	930651	930662	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_015125	CGCTCA	2	12	943749	943760	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015125	TTGAGT	2	12	994866	994877	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015125	CGATGG	2	12	1042206	1042217	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_015125	GCGCCC	2	12	1042875	1042886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_015125	GTTTTC	2	12	1059397	1059408	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_015125	CCGAGA	2	12	1077215	1077226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015125	CTGACG	2	12	1087571	1087582	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015125	CACCCC	2	12	1108765	1108776	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
59	NC_015125	CCAGCG	2	12	1148511	1148522	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
60	NC_015125	TTTTGC	2	12	1150534	1150545	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_015125	TGGCCG	2	12	1150697	1150708	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015125	CACGGC	2	12	1173671	1173682	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_015125	CTCGTT	2	12	1181205	1181216	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015125	CGCGGG	2	12	1189725	1189736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015125	CGTGCG	2	12	1230237	1230248	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015125	GCGCCC	2	12	1274041	1274052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_015125	CCCGCA	2	12	1274108	1274119	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_015125	CCCGCG	3	18	1274120	1274137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_015125	GGCGGG	2	12	1278919	1278930	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_015125	TGCGGC	2	12	1284684	1284695	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_015125	GCGGCA	2	12	1330388	1330399	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015125	GCACCC	2	12	1389106	1389117	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_015125	GGGGGC	2	12	1400872	1400883	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_015125	CGCGCC	2	12	1427411	1427422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_015125	GCGGGA	4	24	1427548	1427571	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_015125	CGGGCG	2	12	1434590	1434601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015125	GCCCGC	2	12	1449264	1449275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_015125	CGGGCG	2	12	1453106	1453117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015125	CGCGGG	2	12	1453118	1453129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015125	GCGCGG	2	12	1453131	1453142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015125	CCACGC	4	24	1464886	1464909	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_015125	TCCCCC	2	12	1493092	1493103	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
83	NC_015125	CGGGGC	2	12	1500314	1500325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015125	GGCACG	3	18	1504097	1504114	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015125	CGCCCC	2	12	1547399	1547410	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
86	NC_015125	CGTGAG	2	12	1609013	1609024	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_015125	CTCCCG	2	12	1662162	1662173	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_015125	GCCCGC	2	12	1768616	1768627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_015125	GGGACC	2	12	1768725	1768736	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015125	ACGGCG	2	12	1785386	1785397	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015125	GGTCCC	2	12	1792550	1792561	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
92	NC_015125	TCGACG	2	12	1795813	1795824	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015125	GCTCCG	2	12	1797880	1797891	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
94	NC_015125	CGATTT	2	12	1808984	1808995	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_015125	TTCGGA	2	12	1818682	1818693	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_015125	GGGGGC	2	12	1822791	1822802	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_015125	TTCGAA	2	12	1866802	1866813	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_015125	AGCCGT	2	12	1898869	1898880	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015125	GGGACC	2	12	1917011	1917022	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015125	GGGACC	2	12	1917064	1917075	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015125	GGCGCG	2	12	1948510	1948521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_015125	CGCGGG	3	18	1948530	1948547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015125	GGTCGA	2	12	1957081	1957092	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_015125	CGGAAT	2	12	1989073	1989084	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_015125	TGCGGG	2	12	2017214	2017225	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_015125	ACCGCG	3	18	2019098	2019115	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
107	NC_015125	TCGCGC	2	12	2024404	2024415	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
108	NC_015125	GGTCCC	2	12	2028944	2028955	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
109	NC_015125	GCGGGG	2	12	2065546	2065557	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_015125	GGCCGG	9	54	2094717	2094770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015125	CCGGTG	2	12	2095465	2095476	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015125	GTCCCG	2	12	2100762	2100773	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
113	NC_015125	GTGGCG	4	24	2103513	2103536	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_015125	GGGCCA	2	12	2154491	2154502	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015125	CGTGCG	2	12	2203756	2203767	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015125	ATCGGA	2	12	2226470	2226481	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_015125	TCCGAT	2	12	2226499	2226510	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015125	CGGAAA	2	12	2252877	2252888	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_015125	GCCCCG	2	12	2270117	2270128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_015125	GGACCA	2	12	2284751	2284762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015125	TCGGAT	2	12	2295949	2295960	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_015125	GCAAGG	2	12	2366174	2366185	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_015125	CGGCCC	2	12	2425056	2425067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_015125	CCCGAA	2	12	2517821	2517832	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
125	NC_015125	CATCCC	2	12	2525718	2525729	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_015125	CCGCGC	2	12	2537813	2537824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_015125	CGCCCG	2	12	2537850	2537861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_015125	CCGCGC	3	18	2537867	2537884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_015125	CCGCGC	3	18	2537887	2537904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_015125	GCCGCG	2	12	2552482	2552493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_015125	CGTGAC	2	12	2561286	2561297	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015125	CCCGCT	2	12	2594670	2594681	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_015125	TCGGGG	2	12	2612603	2612614	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_015125	CGGGCC	2	12	2612635	2612646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_015125	TCGGTG	2	12	2635309	2635320	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_015125	AGCGGG	4	24	2635457	2635480	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_015125	GAGCGG	3	18	2635486	2635503	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
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139	NC_015125	GACGCG	2	12	2689923	2689934	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_015125	TGCGCC	2	12	2691427	2691438	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
141	NC_015125	GCGCCG	2	12	2717808	2717819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_015125	GGTCCC	2	12	2753090	2753101	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
143	NC_015125	CCCTCG	2	12	2758744	2758755	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_015125	GCCCCC	2	12	2758776	2758787	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
145	NC_015125	CGGACG	2	12	2799294	2799305	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_015125	TCGCGA	2	12	2799321	2799332	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_015125	TGCGGG	2	12	2874289	2874300	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_015125	GGGCAC	2	12	2910635	2910646	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_015125	CCGCCC	2	12	2913857	2913868	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
150	NC_015125	CGGTCC	2	12	2941903	2941914	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
151	NC_015125	TTCGGC	2	12	2963085	2963096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_015125	TCGGGT	2	12	2976399	2976410	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
153	NC_015125	GTGACG	2	12	2992977	2992988	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
154	NC_015125	GGTCCC	2	12	3023006	3023017	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
155	NC_015125	GGTCCC	2	12	3023081	3023092	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
156	NC_015125	GTAAGT	2	12	3036871	3036882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_015125	CGCCCG	2	12	3039824	3039835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
158	NC_015125	GGGGGT	2	12	3058150	3058161	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
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160	NC_015125	GCTCTC	2	12	3106239	3106250	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
161	NC_015125	GTGGCT	2	12	3137889	3137900	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
162	NC_015125	TCCTTC	2	12	3196608	3196619	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
163	NC_015125	CGCCCC	2	12	3240730	3240741	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
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166	NC_015125	CCGCGG	2	12	3360526	3360537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
167	NC_015125	GCGACC	2	12	3377750	3377761	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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169	NC_015125	CGGGCG	2	12	3398928	3398939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.