MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 1710

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015067	ACGTC	2	10	674	683	20 %	20 %	20 %	40 %	322690194
2	NC_015067	AAGCA	2	10	1483	1492	60 %	0 %	20 %	20 %	322690194
3	NC_015067	CATCG	2	10	4477	4486	20 %	20 %	20 %	40 %	322690196
4	NC_015067	CCGGC	2	10	5050	5059	0 %	0 %	40 %	60 %	322690197
5	NC_015067	CCGCG	2	10	6299	6308	0 %	0 %	40 %	60 %	322690198
6	NC_015067	AAGGC	2	10	7117	7126	40 %	0 %	40 %	20 %	322690198
7	NC_015067	GCTCG	2	10	13375	13384	0 %	20 %	40 %	40 %	322690202
8	NC_015067	TCGGC	2	10	13449	13458	0 %	20 %	40 %	40 %	322690202
9	NC_015067	CGCCT	2	10	13558	13567	0 %	20 %	20 %	60 %	322690202
10	NC_015067	GCCAC	2	10	14314	14323	20 %	0 %	20 %	60 %	322690203
11	NC_015067	GGCCG	2	10	14340	14349	0 %	0 %	60 %	40 %	322690203
12	NC_015067	GCCGC	2	10	16612	16621	0 %	0 %	40 %	60 %	322690205
13	NC_015067	TGGAA	2	10	19680	19689	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015067	TGGGT	2	10	20708	20717	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015067	GCGCT	2	10	21179	21188	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_015067	GGCGT	2	10	23357	23366	0 %	20 %	60 %	20 %	322690212
17	NC_015067	CCCGG	2	10	23384	23393	0 %	0 %	40 %	60 %	322690212
18	NC_015067	TCGCG	2	10	23545	23554	0 %	20 %	40 %	40 %	322690212
19	NC_015067	GGCCA	2	10	26795	26804	20 %	0 %	40 %	40 %	322690215
20	NC_015067	CCAGC	2	10	27801	27810	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
21	NC_015067	AAGGG	2	10	31442	31451	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015067	CCGAC	2	10	32815	32824	20 %	0 %	20 %	60 %	322690221
23	NC_015067	CGAAT	2	10	36692	36701	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_015067	AATCG	2	10	36704	36713	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_015067	TGTGT	2	10	42704	42713	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015067	CCAGA	2	10	43554	43563	40 %	0 %	20 %	40 %	322690229
27	NC_015067	ATCGT	2	10	47304	47313	20 %	40 %	20 %	20 %	322690231
28	NC_015067	CGAAT	2	10	48899	48908	40 %	20 %	20 %	20 %	322690233
29	NC_015067	CAGAT	2	10	51447	51456	40 %	20 %	20 %	20 %	322690234
30	NC_015067	TTACG	2	10	52881	52890	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_015067	GGCCT	2	10	55329	55338	0 %	20 %	40 %	40 %	322690236
32	NC_015067	GCGCC	2	10	58736	58745	0 %	0 %	40 %	60 %	322690238
33	NC_015067	CGGCG	2	10	60257	60266	0 %	0 %	60 %	40 %	322690239
34	NC_015067	CTCAT	2	10	61186	61195	20 %	40 %	0 %	40 %	322690239
35	NC_015067	CACCG	2	10	62496	62505	20 %	0 %	20 %	60 %	322690242
36	NC_015067	CTCGC	2	10	62890	62899	0 %	20 %	20 %	60 %	322690242
37	NC_015067	GTGGC	3	15	66100	66114	0 %	20 %	60 %	20 %	322690244
38	NC_015067	GCCAA	2	10	66655	66664	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_015067	CCATC	2	10	66954	66963	20 %	20 %	0 %	60 %	322690246
40	NC_015067	CAAGG	2	10	67784	67793	40 %	0 %	40 %	20 %	322690247
41	NC_015067	AGGGG	2	10	70351	70360	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015067	ACCGA	2	10	71414	71423	40 %	0 %	20 %	40 %	322690250
43	NC_015067	ATGCG	2	10	72116	72125	20 %	20 %	40 %	20 %	322690250
44	NC_015067	GCGTG	2	10	72579	72588	0 %	20 %	60 %	20 %	322690251
45	NC_015067	TGACA	2	10	72744	72753	40 %	20 %	20 %	20 %	322690251
46	NC_015067	AGCGC	2	10	73346	73355	20 %	0 %	40 %	40 %	322690251
47	NC_015067	GCTGG	2	10	78517	78526	0 %	20 %	60 %	20 %	322690255
48	NC_015067	GTCTT	2	10	78991	79000	0 %	60 %	20 %	20 %	322690256
49	NC_015067	CGGCA	2	10	79071	79080	20 %	0 %	40 %	40 %	322690256
50	NC_015067	GAGGT	2	10	79099	79108	20 %	20 %	60 %	0 %	322690256
51	NC_015067	GGGCG	2	10	79951	79960	0 %	0 %	80 %	20 %	322690257
52	NC_015067	GGCCC	2	10	83337	83346	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
53	NC_015067	GGCTG	2	10	83832	83841	0 %	20 %	60 %	20 %	322690259
54	NC_015067	CTCAA	2	10	84753	84762	40 %	20 %	0 %	40 %	322690260
55	NC_015067	TCGAC	2	10	85775	85784	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_015067	GACCA	2	10	86636	86645	40 %	0 %	20 %	40 %	322690261
57	NC_015067	GCTCG	2	10	87182	87191	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
58	NC_015067	TGAAG	2	10	87273	87282	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015067	AACCA	2	10	88001	88010	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
60	NC_015067	TACCC	2	10	88102	88111	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
61	NC_015067	TCGGA	2	10	89407	89416	20 %	20 %	40 %	20 %	322690264
62	NC_015067	GCTGG	2	10	90293	90302	0 %	20 %	60 %	20 %	322690265
63	NC_015067	CAAGG	2	10	90594	90603	40 %	0 %	40 %	20 %	322690265
64	NC_015067	GGCGC	2	10	92116	92125	0 %	0 %	60 %	40 %	322690266
65	NC_015067	GGTGG	2	10	93740	93749	0 %	20 %	80 %	0 %	322690266
66	NC_015067	CGGCC	2	10	95376	95385	0 %	0 %	40 %	60 %	322690267
67	NC_015067	CCCAC	2	10	95737	95746	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
68	NC_015067	ATTTC	2	10	96083	96092	20 %	60 %	0 %	20 %	322690268
69	NC_015067	GTTCG	2	10	96367	96376	0 %	40 %	40 %	20 %	322690268
70	NC_015067	CGATG	2	10	96855	96864	20 %	20 %	40 %	20 %	322690268
71	NC_015067	TGGCG	2	10	97797	97806	0 %	20 %	60 %	20 %	322690268
72	NC_015067	CGGAA	2	10	98343	98352	40 %	0 %	40 %	20 %	322690268
73	NC_015067	CTTGG	2	10	102200	102209	0 %	40 %	40 %	20 %	322690272
74	NC_015067	CTGGC	2	10	103061	103070	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
75	NC_015067	GCCGA	2	10	105428	105437	20 %	0 %	40 %	40 %	322690275
76	NC_015067	CAGAC	2	10	105657	105666	40 %	0 %	20 %	40 %	322690275
77	NC_015067	GCCCA	2	10	105770	105779	20 %	0 %	20 %	60 %	322690275
78	NC_015067	CCAAG	2	10	108157	108166	40 %	0 %	20 %	40 %	322690276
79	NC_015067	GCCGC	2	10	108197	108206	0 %	0 %	40 %	60 %	322690276
80	NC_015067	CCCGT	2	10	110577	110586	0 %	20 %	20 %	60 %	322690277
81	NC_015067	CGGTT	2	10	110779	110788	0 %	40 %	40 %	20 %	322690277
82	NC_015067	GTGCT	2	10	113492	113501	0 %	40 %	40 %	20 %	322690281
83	NC_015067	CGCAG	2	10	113643	113652	20 %	0 %	40 %	40 %	322690281
84	NC_015067	ACCGC	2	10	118167	118176	20 %	0 %	20 %	60 %	322690282
85	NC_015067	GATTT	2	10	118983	118992	20 %	60 %	20 %	0 %	322690283
86	NC_015067	GCACC	2	10	120719	120728	20 %	0 %	20 %	60 %	322690284
87	NC_015067	CGGGC	2	10	121297	121306	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
88	NC_015067	AAGGC	2	10	123852	123861	40 %	0 %	40 %	20 %	322690287
89	NC_015067	CGGCC	2	10	124201	124210	0 %	0 %	40 %	60 %	322690287
90	NC_015067	GGACC	2	10	124351	124360	20 %	0 %	40 %	40 %	322690287
91	NC_015067	CCGAC	2	10	127952	127961	20 %	0 %	20 %	60 %	322690289
92	NC_015067	GACCA	2	10	128476	128485	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_015067	GTTCG	2	10	132222	132231	0 %	40 %	40 %	20 %	322690293
94	NC_015067	CTGGC	2	10	132442	132451	0 %	20 %	40 %	40 %	322690293
95	NC_015067	GAATG	2	10	133051	133060	40 %	20 %	40 %	0 %	322690293
96	NC_015067	CGGCC	2	10	133272	133281	0 %	0 %	40 %	60 %	322690293
97	NC_015067	CGGGC	2	10	133750	133759	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
98	NC_015067	GACCG	2	10	133766	133775	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
99	NC_015067	TCCAG	2	10	136073	136082	20 %	20 %	20 %	40 %	322690296
100	NC_015067	CGCGC	2	10	136800	136809	0 %	0 %	40 %	60 %	322690296
101	NC_015067	TTTGG	2	10	137395	137404	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015067	CAGGT	2	10	139734	139743	20 %	20 %	40 %	20 %	322690299
103	NC_015067	TGGCA	2	10	140222	140231	20 %	20 %	40 %	20 %	322690299
104	NC_015067	TCCAG	2	10	141115	141124	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_015067	CTGCT	2	10	141422	141431	0 %	40 %	20 %	40 %	322690300
106	NC_015067	ACCCA	2	10	142127	142136	40 %	0 %	0 %	60 %	322690300
107	NC_015067	GGCCG	2	10	148437	148446	0 %	0 %	60 %	40 %	322690304
108	NC_015067	GGTTG	2	10	148938	148947	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015067	TACGT	2	10	150904	150913	20 %	40 %	20 %	20 %	322690306
110	NC_015067	CGCGG	2	10	153739	153748	0 %	0 %	60 %	40 %	322690309
111	NC_015067	ACGCC	2	10	155901	155910	20 %	0 %	20 %	60 %	322690311
112	NC_015067	CGTGA	2	10	157334	157343	20 %	20 %	40 %	20 %	322690311
113	NC_015067	GGGGC	2	10	157878	157887	0 %	0 %	80 %	20 %	322690311
114	NC_015067	TCGGC	2	10	163833	163842	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
115	NC_015067	TCTGG	2	10	164031	164040	0 %	40 %	40 %	20 %	322690317
116	NC_015067	TCGCT	2	10	164170	164179	0 %	40 %	20 %	40 %	322690317
117	NC_015067	GCTGT	2	10	164820	164829	0 %	40 %	40 %	20 %	322690317
118	NC_015067	TGATG	2	10	165269	165278	20 %	40 %	40 %	0 %	322690318
119	NC_015067	CAGGG	2	10	166311	166320	20 %	0 %	60 %	20 %	322690318
120	NC_015067	TGAGA	2	10	167439	167448	40 %	20 %	40 %	0 %	322690319
121	NC_015067	CATCC	2	10	169143	169152	20 %	20 %	0 %	60 %	322690321
122	NC_015067	TCGCC	2	10	169168	169177	0 %	20 %	20 %	60 %	322690321
123	NC_015067	ACACC	2	10	170621	170630	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
124	NC_015067	GCGAT	2	10	171023	171032	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_015067	GGAGC	2	10	176940	176949	20 %	0 %	60 %	20 %	322690329
126	NC_015067	TCCGT	2	10	177964	177973	0 %	40 %	20 %	40 %	322690330
127	NC_015067	GCCAA	2	10	178407	178416	40 %	0 %	20 %	40 %	322690330
128	NC_015067	GGCGA	2	10	180224	180233	20 %	0 %	60 %	20 %	322690330
129	NC_015067	GGGCA	2	10	180950	180959	20 %	0 %	60 %	20 %	322690331
130	NC_015067	GTTGC	2	10	181910	181919	0 %	40 %	40 %	20 %	322690332
131	NC_015067	GACCG	2	10	184994	185003	20 %	0 %	40 %	40 %	322690335
132	NC_015067	GAGCG	2	10	188197	188206	20 %	0 %	60 %	20 %	322690339
133	NC_015067	TGCCC	2	10	188959	188968	0 %	20 %	20 %	60 %	322690340
134	NC_015067	CCGTA	2	10	192911	192920	20 %	20 %	20 %	40 %	322690342
135	NC_015067	CGCTG	2	10	194857	194866	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
136	NC_015067	CAGCC	2	10	196447	196456	20 %	0 %	20 %	60 %	322690344
137	NC_015067	CACCG	2	10	200631	200640	20 %	0 %	20 %	60 %	322690346
138	NC_015067	GATTC	2	10	201743	201752	20 %	40 %	20 %	20 %	322690347
139	NC_015067	CTCCC	2	10	203894	203903	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
140	NC_015067	CTGGC	2	10	204962	204971	0 %	20 %	40 %	40 %	322690349
141	NC_015067	ACCGA	2	10	208286	208295	40 %	0 %	20 %	40 %	322690352
142	NC_015067	GCGCA	2	10	209092	209101	20 %	0 %	40 %	40 %	322690353
143	NC_015067	TACGA	2	10	209732	209741	40 %	20 %	20 %	20 %	322690354
144	NC_015067	ATGCG	2	10	209956	209965	20 %	20 %	40 %	20 %	322690354
145	NC_015067	GCCTG	2	10	213041	213050	0 %	20 %	40 %	40 %	322690357
146	NC_015067	TTTTC	2	10	213068	213077	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_015067	AAAAG	2	10	213094	213103	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015067	GCCAA	2	10	215460	215469	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
149	NC_015067	CGGGG	2	10	223161	223170	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
150	NC_015067	CATGG	2	10	224600	224609	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
151	NC_015067	CGGAG	2	10	224748	224757	20 %	0 %	60 %	20 %	322690366
152	NC_015067	GGCCA	2	10	225193	225202	20 %	0 %	40 %	40 %	322690366
153	NC_015067	GCGCA	2	10	225541	225550	20 %	0 %	40 %	40 %	322690366
154	NC_015067	GGTGG	2	10	228045	228054	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015067	TTGGC	2	10	230594	230603	0 %	40 %	40 %	20 %	322690371
156	NC_015067	CGACC	2	10	233292	233301	20 %	0 %	20 %	60 %	322690374
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159	NC_015067	TCTCT	2	10	237705	237714	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
160	NC_015067	GTGCG	2	10	241919	241928	0 %	20 %	60 %	20 %	322690380
161	NC_015067	CGATG	2	10	243224	243233	20 %	20 %	40 %	20 %	322690381
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164	NC_015067	TGGCG	2	10	245527	245536	0 %	20 %	60 %	20 %	322690382
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166	NC_015067	TCACG	2	10	248538	248547	20 %	20 %	20 %	40 %	322690385
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168	NC_015067	GTCTG	2	10	253054	253063	0 %	40 %	40 %	20 %	322690388
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172	NC_015067	GGCCG	2	10	262977	262986	0 %	0 %	60 %	40 %	322690395
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175	NC_015067	GGCGT	2	10	268019	268028	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
176	NC_015067	GACCA	2	10	274881	274890	40 %	0 %	20 %	40 %	322690404
177	NC_015067	TCCGG	2	10	277725	277734	0 %	20 %	40 %	40 %	322690404
178	NC_015067	GAAGT	2	10	278232	278241	40 %	20 %	40 %	0 %	322690404
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186	NC_015067	GCATT	2	10	291043	291052	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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196	NC_015067	GGTCG	2	10	313926	313935	0 %	20 %	60 %	20 %	322690432
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198	NC_015067	ACGAT	2	10	319347	319356	40 %	20 %	20 %	20 %	322690436
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215	NC_015067	GTTCT	2	10	349811	349820	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
216	NC_015067	GCCGT	2	10	350019	350028	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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222	NC_015067	GAATA	2	10	361405	361414	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
223	NC_015067	TCGCT	2	10	361447	361456	0 %	40 %	20 %	40 %	322690475
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233	NC_015067	GCCGC	2	10	376216	376225	0 %	0 %	40 %	60 %	322690485
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236	NC_015067	TTGAT	2	10	379105	379114	20 %	60 %	20 %	0 %	322690488
237	NC_015067	GCACT	2	10	379132	379141	20 %	20 %	20 %	40 %	322690488
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240	NC_015067	ACAAG	2	10	384233	384242	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
241	NC_015067	CTCGT	2	10	385923	385932	0 %	40 %	20 %	40 %	322690494
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244	NC_015067	GTCCG	2	10	389326	389335	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
245	NC_015067	GCTCG	2	10	391478	391487	0 %	20 %	40 %	40 %	322690500
246	NC_015067	TGCCG	2	10	393975	393984	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
247	NC_015067	CCACA	2	10	396970	396979	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
248	NC_015067	TCTCC	2	10	401495	401504	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
249	NC_015067	TGTGT	4	20	404393	404412	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
250	NC_015067	TGCGA	2	10	404417	404426	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
251	NC_015067	AATCG	2	10	405248	405257	40 %	20 %	20 %	20 %	322690512
252	NC_015067	CTTCG	2	10	405996	406005	0 %	40 %	20 %	40 %	322690513
253	NC_015067	ATCGG	2	10	406541	406550	20 %	20 %	40 %	20 %	322690514
254	NC_015067	GTGGC	2	10	413505	413514	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
255	NC_015067	CGCGC	2	10	413821	413830	0 %	0 %	40 %	60 %	322690523
256	NC_015067	CGTGG	2	10	416177	416186	0 %	20 %	60 %	20 %	322690524
257	NC_015067	CGTCT	2	10	417734	417743	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
258	NC_015067	GCGCC	2	10	419336	419345	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
259	NC_015067	TGTTC	2	10	419398	419407	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
260	NC_015067	GGAAT	2	10	419490	419499	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
261	NC_015067	CGGCC	2	10	420414	420423	0 %	0 %	40 %	60 %	322690527
262	NC_015067	GCTGT	2	10	421245	421254	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
263	NC_015067	GCGCC	2	10	422116	422125	0 %	0 %	40 %	60 %	322690528
264	NC_015067	ACTTG	2	10	423358	423367	20 %	40 %	20 %	20 %	322690530
265	NC_015067	AGGCC	2	10	423634	423643	20 %	0 %	40 %	40 %	322690530
266	NC_015067	ACCTG	2	10	424173	424182	20 %	20 %	20 %	40 %	322690530
267	NC_015067	CGACA	2	10	424192	424201	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
268	NC_015067	CAAGC	2	10	424324	424333	40 %	0 %	20 %	40 %	322690531
269	NC_015067	CAGCC	2	10	426236	426245	20 %	0 %	20 %	60 %	322690532
270	NC_015067	CGTTC	2	10	426716	426725	0 %	40 %	20 %	40 %	322690532
271	NC_015067	GGAAA	2	10	427295	427304	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
272	NC_015067	CGGCG	2	10	435291	435300	0 %	0 %	60 %	40 %	322690539
273	NC_015067	CGGCG	2	10	445230	445239	0 %	0 %	60 %	40 %	322690544
274	NC_015067	CAACA	2	10	446856	446865	60 %	0 %	0 %	40 %	322690544
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276	NC_015067	CTCCG	2	10	448392	448401	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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291	NC_015067	GAGCT	2	10	464980	464989	20 %	20 %	40 %	20 %	322690557
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294	NC_015067	TTTGC	2	10	470700	470709	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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296	NC_015067	TTCTG	2	10	472366	472375	0 %	60 %	20 %	20 %	322690562
297	NC_015067	TACAA	2	10	473414	473423	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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397	NC_015067	CCAAT	2	10	605552	605561	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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