MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 1394

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015067	ACGTC	2	10	674	683	20 %	20 %	20 %	40 %	322690194
2	NC_015067	AAGCA	2	10	1483	1492	60 %	0 %	20 %	20 %	322690194
3	NC_015067	CATCG	2	10	4477	4486	20 %	20 %	20 %	40 %	322690196
4	NC_015067	CCGGC	2	10	5050	5059	0 %	0 %	40 %	60 %	322690197
5	NC_015067	CCGCG	2	10	6299	6308	0 %	0 %	40 %	60 %	322690198
6	NC_015067	AAGGC	2	10	7117	7126	40 %	0 %	40 %	20 %	322690198
7	NC_015067	GCTCG	2	10	13375	13384	0 %	20 %	40 %	40 %	322690202
8	NC_015067	TCGGC	2	10	13449	13458	0 %	20 %	40 %	40 %	322690202
9	NC_015067	CGCCT	2	10	13558	13567	0 %	20 %	20 %	60 %	322690202
10	NC_015067	GCCAC	2	10	14314	14323	20 %	0 %	20 %	60 %	322690203
11	NC_015067	GGCCG	2	10	14340	14349	0 %	0 %	60 %	40 %	322690203
12	NC_015067	GCCGC	2	10	16612	16621	0 %	0 %	40 %	60 %	322690205
13	NC_015067	GGCGT	2	10	23357	23366	0 %	20 %	60 %	20 %	322690212
14	NC_015067	CCCGG	2	10	23384	23393	0 %	0 %	40 %	60 %	322690212
15	NC_015067	TCGCG	2	10	23545	23554	0 %	20 %	40 %	40 %	322690212
16	NC_015067	GGCCA	2	10	26795	26804	20 %	0 %	40 %	40 %	322690215
17	NC_015067	CCGAC	2	10	32815	32824	20 %	0 %	20 %	60 %	322690221
18	NC_015067	CCAGA	2	10	43554	43563	40 %	0 %	20 %	40 %	322690229
19	NC_015067	ATCGT	2	10	47304	47313	20 %	40 %	20 %	20 %	322690231
20	NC_015067	CGAAT	2	10	48899	48908	40 %	20 %	20 %	20 %	322690233
21	NC_015067	CAGAT	2	10	51447	51456	40 %	20 %	20 %	20 %	322690234
22	NC_015067	GGCCT	2	10	55329	55338	0 %	20 %	40 %	40 %	322690236
23	NC_015067	GCGCC	2	10	58736	58745	0 %	0 %	40 %	60 %	322690238
24	NC_015067	CGGCG	2	10	60257	60266	0 %	0 %	60 %	40 %	322690239
25	NC_015067	CTCAT	2	10	61186	61195	20 %	40 %	0 %	40 %	322690239
26	NC_015067	CACCG	2	10	62496	62505	20 %	0 %	20 %	60 %	322690242
27	NC_015067	CTCGC	2	10	62890	62899	0 %	20 %	20 %	60 %	322690242
28	NC_015067	GTGGC	3	15	66100	66114	0 %	20 %	60 %	20 %	322690244
29	NC_015067	CCATC	2	10	66954	66963	20 %	20 %	0 %	60 %	322690246
30	NC_015067	CAAGG	2	10	67784	67793	40 %	0 %	40 %	20 %	322690247
31	NC_015067	ACCGA	2	10	71414	71423	40 %	0 %	20 %	40 %	322690250
32	NC_015067	ATGCG	2	10	72116	72125	20 %	20 %	40 %	20 %	322690250
33	NC_015067	GCGTG	2	10	72579	72588	0 %	20 %	60 %	20 %	322690251
34	NC_015067	TGACA	2	10	72744	72753	40 %	20 %	20 %	20 %	322690251
35	NC_015067	AGCGC	2	10	73346	73355	20 %	0 %	40 %	40 %	322690251
36	NC_015067	GCTGG	2	10	78517	78526	0 %	20 %	60 %	20 %	322690255
37	NC_015067	GTCTT	2	10	78991	79000	0 %	60 %	20 %	20 %	322690256
38	NC_015067	CGGCA	2	10	79071	79080	20 %	0 %	40 %	40 %	322690256
39	NC_015067	GAGGT	2	10	79099	79108	20 %	20 %	60 %	0 %	322690256
40	NC_015067	GGGCG	2	10	79951	79960	0 %	0 %	80 %	20 %	322690257
41	NC_015067	GGCTG	2	10	83832	83841	0 %	20 %	60 %	20 %	322690259
42	NC_015067	CTCAA	2	10	84753	84762	40 %	20 %	0 %	40 %	322690260
43	NC_015067	GACCA	2	10	86636	86645	40 %	0 %	20 %	40 %	322690261
44	NC_015067	TCGGA	2	10	89407	89416	20 %	20 %	40 %	20 %	322690264
45	NC_015067	GCTGG	2	10	90293	90302	0 %	20 %	60 %	20 %	322690265
46	NC_015067	CAAGG	2	10	90594	90603	40 %	0 %	40 %	20 %	322690265
47	NC_015067	GGCGC	2	10	92116	92125	0 %	0 %	60 %	40 %	322690266
48	NC_015067	GGTGG	2	10	93740	93749	0 %	20 %	80 %	0 %	322690266
49	NC_015067	CGGCC	2	10	95376	95385	0 %	0 %	40 %	60 %	322690267
50	NC_015067	ATTTC	2	10	96083	96092	20 %	60 %	0 %	20 %	322690268
51	NC_015067	GTTCG	2	10	96367	96376	0 %	40 %	40 %	20 %	322690268
52	NC_015067	CGATG	2	10	96855	96864	20 %	20 %	40 %	20 %	322690268
53	NC_015067	TGGCG	2	10	97797	97806	0 %	20 %	60 %	20 %	322690268
54	NC_015067	CGGAA	2	10	98343	98352	40 %	0 %	40 %	20 %	322690268
55	NC_015067	CTTGG	2	10	102200	102209	0 %	40 %	40 %	20 %	322690272
56	NC_015067	GCCGA	2	10	105428	105437	20 %	0 %	40 %	40 %	322690275
57	NC_015067	CAGAC	2	10	105657	105666	40 %	0 %	20 %	40 %	322690275
58	NC_015067	GCCCA	2	10	105770	105779	20 %	0 %	20 %	60 %	322690275
59	NC_015067	CCAAG	2	10	108157	108166	40 %	0 %	20 %	40 %	322690276
60	NC_015067	GCCGC	2	10	108197	108206	0 %	0 %	40 %	60 %	322690276
61	NC_015067	CCCGT	2	10	110577	110586	0 %	20 %	20 %	60 %	322690277
62	NC_015067	CGGTT	2	10	110779	110788	0 %	40 %	40 %	20 %	322690277
63	NC_015067	GTGCT	2	10	113492	113501	0 %	40 %	40 %	20 %	322690281
64	NC_015067	CGCAG	2	10	113643	113652	20 %	0 %	40 %	40 %	322690281
65	NC_015067	ACCGC	2	10	118167	118176	20 %	0 %	20 %	60 %	322690282
66	NC_015067	GATTT	2	10	118983	118992	20 %	60 %	20 %	0 %	322690283
67	NC_015067	GCACC	2	10	120719	120728	20 %	0 %	20 %	60 %	322690284
68	NC_015067	AAGGC	2	10	123852	123861	40 %	0 %	40 %	20 %	322690287
69	NC_015067	CGGCC	2	10	124201	124210	0 %	0 %	40 %	60 %	322690287
70	NC_015067	GGACC	2	10	124351	124360	20 %	0 %	40 %	40 %	322690287
71	NC_015067	CCGAC	2	10	127952	127961	20 %	0 %	20 %	60 %	322690289
72	NC_015067	GTTCG	2	10	132222	132231	0 %	40 %	40 %	20 %	322690293
73	NC_015067	CTGGC	2	10	132442	132451	0 %	20 %	40 %	40 %	322690293
74	NC_015067	GAATG	2	10	133051	133060	40 %	20 %	40 %	0 %	322690293
75	NC_015067	CGGCC	2	10	133272	133281	0 %	0 %	40 %	60 %	322690293
76	NC_015067	TCCAG	2	10	136073	136082	20 %	20 %	20 %	40 %	322690296
77	NC_015067	CGCGC	2	10	136800	136809	0 %	0 %	40 %	60 %	322690296
78	NC_015067	CAGGT	2	10	139734	139743	20 %	20 %	40 %	20 %	322690299
79	NC_015067	TGGCA	2	10	140222	140231	20 %	20 %	40 %	20 %	322690299
80	NC_015067	CTGCT	2	10	141422	141431	0 %	40 %	20 %	40 %	322690300
81	NC_015067	ACCCA	2	10	142127	142136	40 %	0 %	0 %	60 %	322690300
82	NC_015067	GGCCG	2	10	148437	148446	0 %	0 %	60 %	40 %	322690304
83	NC_015067	TACGT	2	10	150904	150913	20 %	40 %	20 %	20 %	322690306
84	NC_015067	CGCGG	2	10	153739	153748	0 %	0 %	60 %	40 %	322690309
85	NC_015067	ACGCC	2	10	155901	155910	20 %	0 %	20 %	60 %	322690311
86	NC_015067	CGTGA	2	10	157334	157343	20 %	20 %	40 %	20 %	322690311
87	NC_015067	GGGGC	2	10	157878	157887	0 %	0 %	80 %	20 %	322690311
88	NC_015067	TCTGG	2	10	164031	164040	0 %	40 %	40 %	20 %	322690317
89	NC_015067	TCGCT	2	10	164170	164179	0 %	40 %	20 %	40 %	322690317
90	NC_015067	GCTGT	2	10	164820	164829	0 %	40 %	40 %	20 %	322690317
91	NC_015067	TGATG	2	10	165269	165278	20 %	40 %	40 %	0 %	322690318
92	NC_015067	CAGGG	2	10	166311	166320	20 %	0 %	60 %	20 %	322690318
93	NC_015067	TGAGA	2	10	167439	167448	40 %	20 %	40 %	0 %	322690319
94	NC_015067	CATCC	2	10	169143	169152	20 %	20 %	0 %	60 %	322690321
95	NC_015067	TCGCC	2	10	169168	169177	0 %	20 %	20 %	60 %	322690321
96	NC_015067	GGAGC	2	10	176940	176949	20 %	0 %	60 %	20 %	322690329
97	NC_015067	TCCGT	2	10	177964	177973	0 %	40 %	20 %	40 %	322690330
98	NC_015067	GCCAA	2	10	178407	178416	40 %	0 %	20 %	40 %	322690330
99	NC_015067	GGCGA	2	10	180224	180233	20 %	0 %	60 %	20 %	322690330
100	NC_015067	GGGCA	2	10	180950	180959	20 %	0 %	60 %	20 %	322690331
101	NC_015067	GTTGC	2	10	181910	181919	0 %	40 %	40 %	20 %	322690332
102	NC_015067	GACCG	2	10	184994	185003	20 %	0 %	40 %	40 %	322690335
103	NC_015067	GAGCG	2	10	188197	188206	20 %	0 %	60 %	20 %	322690339
104	NC_015067	TGCCC	2	10	188959	188968	0 %	20 %	20 %	60 %	322690340
105	NC_015067	CCGTA	2	10	192911	192920	20 %	20 %	20 %	40 %	322690342
106	NC_015067	CAGCC	2	10	196447	196456	20 %	0 %	20 %	60 %	322690344
107	NC_015067	CACCG	2	10	200631	200640	20 %	0 %	20 %	60 %	322690346
108	NC_015067	GATTC	2	10	201743	201752	20 %	40 %	20 %	20 %	322690347
109	NC_015067	CTGGC	2	10	204962	204971	0 %	20 %	40 %	40 %	322690349
110	NC_015067	ACCGA	2	10	208286	208295	40 %	0 %	20 %	40 %	322690352
111	NC_015067	GCGCA	2	10	209092	209101	20 %	0 %	40 %	40 %	322690353
112	NC_015067	TACGA	2	10	209732	209741	40 %	20 %	20 %	20 %	322690354
113	NC_015067	ATGCG	2	10	209956	209965	20 %	20 %	40 %	20 %	322690354
114	NC_015067	GCCTG	2	10	213041	213050	0 %	20 %	40 %	40 %	322690357
115	NC_015067	CGGAG	2	10	224748	224757	20 %	0 %	60 %	20 %	322690366
116	NC_015067	GGCCA	2	10	225193	225202	20 %	0 %	40 %	40 %	322690366
117	NC_015067	GCGCA	2	10	225541	225550	20 %	0 %	40 %	40 %	322690366
118	NC_015067	TTGGC	2	10	230594	230603	0 %	40 %	40 %	20 %	322690371
119	NC_015067	CGACC	2	10	233292	233301	20 %	0 %	20 %	60 %	322690374
120	NC_015067	CCACG	2	10	233388	233397	20 %	0 %	20 %	60 %	322690374
121	NC_015067	ACAAT	2	10	237357	237366	60 %	20 %	0 %	20 %	322690378
122	NC_015067	GTGCG	2	10	241919	241928	0 %	20 %	60 %	20 %	322690380
123	NC_015067	CGATG	2	10	243224	243233	20 %	20 %	40 %	20 %	322690381
124	NC_015067	TGGTG	2	10	243971	243980	0 %	40 %	60 %	0 %	322690381
125	NC_015067	AGGCA	2	10	244418	244427	40 %	0 %	40 %	20 %	322690382
126	NC_015067	TGGCG	2	10	245527	245536	0 %	20 %	60 %	20 %	322690382
127	NC_015067	GTTCG	2	10	248039	248048	0 %	40 %	40 %	20 %	322690384
128	NC_015067	TCACG	2	10	248538	248547	20 %	20 %	20 %	40 %	322690385
129	NC_015067	CCAGC	2	10	248756	248765	20 %	0 %	20 %	60 %	322690385
130	NC_015067	GTCTG	2	10	253054	253063	0 %	40 %	40 %	20 %	322690388
131	NC_015067	CGTTT	2	10	260746	260755	0 %	60 %	20 %	20 %	322690394
132	NC_015067	GCCAC	2	10	260776	260785	20 %	0 %	20 %	60 %	322690394
133	NC_015067	GCGCC	2	10	261700	261709	0 %	0 %	40 %	60 %	322690394
134	NC_015067	GGCCG	2	10	262977	262986	0 %	0 %	60 %	40 %	322690395
135	NC_015067	ACTTC	2	10	263483	263492	20 %	40 %	0 %	40 %	322690395
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137	NC_015067	GACCA	2	10	274881	274890	40 %	0 %	20 %	40 %	322690404
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140	NC_015067	ACGGT	2	10	278533	278542	20 %	20 %	40 %	20 %	322690404
141	NC_015067	AAGGC	2	10	278878	278887	40 %	0 %	40 %	20 %	322690404
142	NC_015067	GGCAA	2	10	279027	279036	40 %	0 %	40 %	20 %	322690404
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145	NC_015067	GCTCA	2	10	289477	289486	20 %	20 %	20 %	40 %	322690414
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147	NC_015067	CTCTC	2	10	294369	294378	0 %	40 %	0 %	60 %	322690416
148	NC_015067	TGAGC	2	10	297081	297090	20 %	20 %	40 %	20 %	322690419
149	NC_015067	AGCGA	2	10	303730	303739	40 %	0 %	40 %	20 %	322690426
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151	NC_015067	AGATG	2	10	310363	310372	40 %	20 %	40 %	0 %	322690431
152	NC_015067	TGATC	2	10	311498	311507	20 %	40 %	20 %	20 %	322690431
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165	NC_015067	GGCGA	2	10	334547	334556	20 %	0 %	60 %	20 %	322690449
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169	NC_015067	TCGAT	2	10	347315	347324	20 %	40 %	20 %	20 %	322690462
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172	NC_015067	TCGGC	2	10	350204	350213	0 %	20 %	40 %	40 %	322690465
173	NC_015067	CGTCA	2	10	352922	352931	20 %	20 %	20 %	40 %	322690467
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177	NC_015067	TCGTA	2	10	361740	361749	20 %	40 %	20 %	20 %	322690475
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260	NC_015067	GGTGT	2	10	518118	518127	0 %	40 %	60 %	0 %	322690598
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