MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 5761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015067	CGGT	2	8	428	435	0 %	25 %	50 %	25 %	322690194
2	NC_015067	ACGA	2	8	694	701	50 %	0 %	25 %	25 %	322690194
3	NC_015067	ATGC	2	8	1399	1406	25 %	25 %	25 %	25 %	322690194
4	NC_015067	GACT	2	8	1541	1548	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_015067	GCGA	2	8	1751	1758	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_015067	TTAC	2	8	2115	2122	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_015067	CGTA	2	8	2171	2178	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_015067	GCGT	2	8	2653	2660	0 %	25 %	50 %	25 %	322690195
9	NC_015067	GCCG	2	8	2923	2930	0 %	0 %	50 %	50 %	322690195
10	NC_015067	ATGG	2	8	3166	3173	25 %	25 %	50 %	0 %	322690195
11	NC_015067	GATG	2	8	3924	3931	25 %	25 %	50 %	0 %	322690196
12	NC_015067	CCCG	2	8	4240	4247	0 %	0 %	25 %	75 %	322690196
13	NC_015067	TGGG	2	8	4568	4575	0 %	25 %	75 %	0 %	322690196
14	NC_015067	CGCC	2	8	4640	4647	0 %	0 %	25 %	75 %	322690197
15	NC_015067	GCCG	2	8	4673	4680	0 %	0 %	50 %	50 %	322690197
16	NC_015067	GCCA	2	8	4893	4900	25 %	0 %	25 %	50 %	322690197
17	NC_015067	ACCT	2	8	4974	4981	25 %	25 %	0 %	50 %	322690197
18	NC_015067	CAAA	2	8	5106	5113	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015067	GGAA	2	8	5264	5271	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015067	GCCA	2	8	5535	5542	25 %	0 %	25 %	50 %	322690198
21	NC_015067	CGTG	2	8	6386	6393	0 %	25 %	50 %	25 %	322690198
22	NC_015067	CCTC	2	8	7381	7388	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
23	NC_015067	CGCC	2	8	8625	8632	0 %	0 %	25 %	75 %	322690199
24	NC_015067	TCCA	2	8	9325	9332	25 %	25 %	0 %	50 %	322690199
25	NC_015067	ATCG	2	8	11994	12001	25 %	25 %	25 %	25 %	322690201
26	NC_015067	CGGC	2	8	12336	12343	0 %	0 %	50 %	50 %	322690202
27	NC_015067	ACCG	2	8	12437	12444	25 %	0 %	25 %	50 %	322690202
28	NC_015067	GCCG	2	8	12745	12752	0 %	0 %	50 %	50 %	322690202
29	NC_015067	ACCT	2	8	13193	13200	25 %	25 %	0 %	50 %	322690202
30	NC_015067	GCCA	2	8	13319	13326	25 %	0 %	25 %	50 %	322690202
31	NC_015067	TGTC	2	8	15601	15608	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_015067	GGTC	2	8	16175	16182	0 %	25 %	50 %	25 %	322690204
33	NC_015067	CGTT	2	8	16211	16218	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_015067	TTGA	2	8	17455	17462	25 %	50 %	25 %	0 %	322690205
35	NC_015067	GCGA	2	8	17780	17787	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_015067	GCTG	2	8	17913	17920	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015067	GCCG	2	8	18093	18100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015067	TTGC	2	8	18352	18359	0 %	50 %	25 %	25 %	322690206
39	NC_015067	CAGC	2	8	18982	18989	25 %	0 %	25 %	50 %	322690207
40	NC_015067	TCAG	2	8	19356	19363	25 %	25 %	25 %	25 %	322690207
41	NC_015067	CTTC	2	8	19593	19600	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015067	GTCG	2	8	19825	19832	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_015067	CCTC	2	8	20655	20662	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
44	NC_015067	CGGG	2	8	20911	20918	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
45	NC_015067	GGCC	2	8	21045	21052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_015067	ACGG	2	8	21200	21207	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_015067	GCGG	2	8	21945	21952	0 %	0 %	75 %	25 %	322690210
48	NC_015067	GCCG	2	8	22500	22507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015067	GTTT	2	8	22511	22518	0 %	75 %	25 %	0 %	322690211
50	NC_015067	GTCC	2	8	23257	23264	0 %	25 %	25 %	50 %	322690211
51	NC_015067	GTCG	2	8	23624	23631	0 %	25 %	50 %	25 %	322690212
52	NC_015067	GGCC	2	8	23875	23882	0 %	0 %	50 %	50 %	322690212
53	NC_015067	TTCC	2	8	24881	24888	0 %	50 %	0 %	50 %	322690213
54	NC_015067	CCCG	2	8	25153	25160	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
55	NC_015067	GCCG	2	8	25202	25209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_015067	CATC	2	8	26475	26482	25 %	25 %	0 %	50 %	322690215
57	NC_015067	CCTA	2	8	27128	27135	25 %	25 %	0 %	50 %	322690215
58	NC_015067	GACC	2	8	27822	27829	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_015067	CAGG	2	8	27939	27946	25 %	0 %	50 %	25 %	322690217
60	NC_015067	ACGA	2	8	28610	28617	50 %	0 %	25 %	25 %	322690217
61	NC_015067	GGCA	2	8	28627	28634	25 %	0 %	50 %	25 %	322690217
62	NC_015067	TATG	2	8	29374	29381	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015067	GTGC	2	8	29817	29824	0 %	25 %	50 %	25 %	322690218
64	NC_015067	CGAA	2	8	30002	30009	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_015067	CGGC	2	8	30057	30064	0 %	0 %	50 %	50 %	322690219
66	NC_015067	CCGT	2	8	30422	30429	0 %	25 %	25 %	50 %	322690219
67	NC_015067	GATG	2	8	30459	30466	25 %	25 %	50 %	0 %	322690219
68	NC_015067	GCTG	2	8	31415	31422	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_015067	ATGG	2	8	32215	32222	25 %	25 %	50 %	0 %	322690220
70	NC_015067	CTGA	2	8	32305	32312	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_015067	CGGC	2	8	33316	33323	0 %	0 %	50 %	50 %	322690222
72	NC_015067	CGCT	2	8	33338	33345	0 %	25 %	25 %	50 %	322690222
73	NC_015067	GCCG	2	8	33639	33646	0 %	0 %	50 %	50 %	322690222
74	NC_015067	CACG	2	8	34055	34062	25 %	0 %	25 %	50 %	322690222
75	NC_015067	CGGC	2	8	34096	34103	0 %	0 %	50 %	50 %	322690222
76	NC_015067	CCCG	2	8	34420	34427	0 %	0 %	25 %	75 %	322690222
77	NC_015067	CGCT	2	8	34432	34439	0 %	25 %	25 %	50 %	322690222
78	NC_015067	CGCC	2	8	34703	34710	0 %	0 %	25 %	75 %	322690222
79	NC_015067	TCGT	2	8	34830	34837	0 %	50 %	25 %	25 %	322690222
80	NC_015067	TGCT	2	8	34972	34979	0 %	50 %	25 %	25 %	322690222
81	NC_015067	CGAT	2	8	35243	35250	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_015067	ACGA	2	8	35436	35443	50 %	0 %	25 %	25 %	322690223
83	NC_015067	CGTG	2	8	35497	35504	0 %	25 %	50 %	25 %	322690223
84	NC_015067	GCCG	2	8	35999	36006	0 %	0 %	50 %	50 %	322690223
85	NC_015067	TGAT	2	8	36891	36898	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015067	CGTG	2	8	37233	37240	0 %	25 %	50 %	25 %	322690224
87	NC_015067	CCTT	2	8	37316	37323	0 %	50 %	0 %	50 %	322690224
88	NC_015067	GGAT	2	8	38236	38243	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015067	AAAG	2	8	38354	38361	75 %	0 %	25 %	0 %	322690225
90	NC_015067	TGTT	2	8	38712	38719	0 %	75 %	25 %	0 %	322690225
91	NC_015067	ATCG	2	8	38982	38989	25 %	25 %	25 %	25 %	322690225
92	NC_015067	TCGA	2	8	39165	39172	25 %	25 %	25 %	25 %	322690225
93	NC_015067	TCGT	2	8	39724	39731	0 %	50 %	25 %	25 %	322690225
94	NC_015067	TTTG	2	8	39880	39887	0 %	75 %	25 %	0 %	322690225
95	NC_015067	AAGT	2	8	40005	40012	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015067	CCTG	2	8	40222	40229	0 %	25 %	25 %	50 %	322690226
97	NC_015067	GCCA	2	8	40588	40595	25 %	0 %	25 %	50 %	322690227
98	NC_015067	GTTG	2	8	41132	41139	0 %	50 %	50 %	0 %	322690227
99	NC_015067	ATTG	2	8	41978	41985	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015067	AGAA	2	8	42661	42668	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015067	CTTT	2	8	42784	42791	0 %	75 %	0 %	25 %	322690229
102	NC_015067	TTCC	2	8	43000	43007	0 %	50 %	0 %	50 %	322690229
103	NC_015067	GAAG	2	8	43353	43360	50 %	0 %	50 %	0 %	322690229
104	NC_015067	CAGG	2	8	43497	43504	25 %	0 %	50 %	25 %	322690229
105	NC_015067	CATG	2	8	44063	44070	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_015067	CTGC	2	8	44075	44082	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_015067	TGGG	2	8	44193	44200	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015067	TGGT	2	8	44478	44485	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015067	GAAA	2	8	44792	44799	75 %	0 %	25 %	0 %	322690230
110	NC_015067	ATGC	2	8	44861	44868	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_015067	TCCG	2	8	45602	45609	0 %	25 %	25 %	50 %	322690231
112	NC_015067	GGGC	2	8	45868	45875	0 %	0 %	75 %	25 %	322690231
113	NC_015067	CCGT	2	8	46006	46013	0 %	25 %	25 %	50 %	322690231
114	NC_015067	TCCG	2	8	46152	46159	0 %	25 %	25 %	50 %	322690231
115	NC_015067	TCCC	2	8	46302	46309	0 %	25 %	0 %	75 %	322690231
116	NC_015067	TGCC	2	8	46647	46654	0 %	25 %	25 %	50 %	322690231
117	NC_015067	TGGC	2	8	47074	47081	0 %	25 %	50 %	25 %	322690231
118	NC_015067	TTCT	2	8	47259	47266	0 %	75 %	0 %	25 %	322690231
119	NC_015067	AGTG	2	8	47482	47489	25 %	25 %	50 %	0 %	322690231
120	NC_015067	CATT	2	8	47505	47512	25 %	50 %	0 %	25 %	322690231
121	NC_015067	GCGT	2	8	47986	47993	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_015067	CGTC	2	8	48091	48098	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_015067	CCGT	2	8	48102	48109	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_015067	GCAT	2	8	48462	48469	25 %	25 %	25 %	25 %	322690233
125	NC_015067	ACGA	2	8	48625	48632	50 %	0 %	25 %	25 %	322690233
126	NC_015067	AATC	2	8	49127	49134	50 %	25 %	0 %	25 %	322690233
127	NC_015067	ACGC	2	8	49346	49353	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_015067	CGTT	2	8	49740	49747	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_015067	CCGT	2	8	49773	49780	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_015067	CGCT	2	8	49948	49955	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_015067	TCGG	2	8	49964	49971	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_015067	CGGG	2	8	50525	50532	0 %	0 %	75 %	25 %	322690234
133	NC_015067	ACCG	2	8	50828	50835	25 %	0 %	25 %	50 %	322690234
134	NC_015067	CGAC	2	8	50874	50881	25 %	0 %	25 %	50 %	322690234
135	NC_015067	GCTC	2	8	51664	51671	0 %	25 %	25 %	50 %	322690234
136	NC_015067	CGTG	2	8	53233	53240	0 %	25 %	50 %	25 %	322690235
137	NC_015067	TGGC	2	8	54667	54674	0 %	25 %	50 %	25 %	322690235
138	NC_015067	TCTG	2	8	54831	54838	0 %	50 %	25 %	25 %	322690235
139	NC_015067	GCGG	2	8	55242	55249	0 %	0 %	75 %	25 %	322690236
140	NC_015067	GGCT	2	8	55305	55312	0 %	25 %	50 %	25 %	322690236
141	NC_015067	TTCA	2	8	55698	55705	25 %	50 %	0 %	25 %	322690236
142	NC_015067	GCGG	2	8	55761	55768	0 %	0 %	75 %	25 %	322690236
143	NC_015067	GACT	2	8	57081	57088	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_015067	CCAG	2	8	57329	57336	25 %	0 %	25 %	50 %	322690237
145	NC_015067	GCAG	2	8	58260	58267	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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