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Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 917

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015067	GACT	2	8	1541	1548	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015067	GCGA	2	8	1751	1758	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015067	TTAC	2	8	2115	2122	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015067	CGTA	2	8	2171	2178	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_015067	CAAA	2	8	5106	5113	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_015067	GGAA	2	8	5264	5271	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015067	CCTC	2	8	7381	7388	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8	NC_015067	TGTC	2	8	15601	15608	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_015067	CGTT	2	8	16211	16218	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015067	GCGA	2	8	17780	17787	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015067	GCTG	2	8	17913	17920	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015067	GCCG	2	8	18093	18100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015067	CTTC	2	8	19593	19600	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_015067	GTCG	2	8	19825	19832	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015067	CCTC	2	8	20655	20662	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
16	NC_015067	CGGG	2	8	20911	20918	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015067	GGCC	2	8	21045	21052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015067	ACGG	2	8	21200	21207	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015067	GCCG	2	8	22500	22507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015067	CCCG	2	8	25153	25160	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
21	NC_015067	GCCG	2	8	25202	25209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015067	GACC	2	8	27822	27829	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015067	TATG	2	8	29374	29381	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015067	CGAA	2	8	30002	30009	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_015067	GCTG	2	8	31415	31422	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_015067	CTGA	2	8	32305	32312	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_015067	CGAT	2	8	35243	35250	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015067	TGAT	2	8	36891	36898	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015067	GGAT	2	8	38236	38243	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015067	AAGT	2	8	40005	40012	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015067	ATTG	2	8	41978	41985	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015067	AGAA	2	8	42661	42668	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015067	CATG	2	8	44063	44070	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_015067	CTGC	2	8	44075	44082	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015067	TGGG	2	8	44193	44200	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015067	TGGT	2	8	44478	44485	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015067	ATGC	2	8	44861	44868	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_015067	GCGT	2	8	47986	47993	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_015067	CGTC	2	8	48091	48098	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015067	CCGT	2	8	48102	48109	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_015067	ACGC	2	8	49346	49353	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015067	CGTT	2	8	49740	49747	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_015067	CCGT	2	8	49773	49780	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015067	CGCT	2	8	49948	49955	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015067	TCGG	2	8	49964	49971	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_015067	GACT	2	8	57081	57088	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_015067	GCAG	2	8	58260	58267	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015067	TAAA	2	8	61253	61260	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015067	CTTA	2	8	61839	61846	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_015067	GGAA	2	8	62470	62477	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015067	CATC	2	8	65103	65110	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015067	GATA	2	8	66922	66929	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015067	GGCA	2	8	68314	68321	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_015067	ACCG	2	8	85350	85357	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015067	CAAG	2	8	85437	85444	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_015067	TGGA	2	8	85921	85928	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015067	GGTT	2	8	89605	89612	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015067	GCTG	2	8	89630	89637	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_015067	TTGT	2	8	99029	99036	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015067	AAAG	2	8	99614	99621	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015067	CTGT	2	8	101436	101443	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_015067	TGTT	2	8	103539	103546	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015067	TCAA	2	8	105214	105221	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_015067	ATTG	2	8	109928	109935	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015067	TGAG	2	8	113092	113099	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015067	CTTT	2	8	113103	113110	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_015067	CATA	2	8	113237	113244	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_015067	CGTC	2	8	113405	113412	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015067	AGAA	2	8	115935	115942	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015067	GGTC	2	8	118622	118629	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_015067	AATG	2	8	118713	118720	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015067	CCTC	2	8	119704	119711	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
73	NC_015067	GCCC	2	8	121202	121209	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
74	NC_015067	ACGG	2	8	128388	128395	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_015067	GAAA	2	8	128410	128417	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015067	AATG	2	8	128577	128584	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015067	CAGT	2	8	132011	132018	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_015067	TGCA	2	8	132117	132124	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_015067	CCGC	2	8	139307	139314	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
80	NC_015067	GCAG	2	8	142278	142285	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015067	GCGG	2	8	142289	142296	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
82	NC_015067	CGCC	2	8	142775	142782	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
83	NC_015067	AAAT	2	8	144354	144361	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015067	ATTC	2	8	147053	147060	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_015067	CTTG	2	8	152480	152487	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_015067	TTCG	2	8	153017	153024	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_015067	CCGG	2	8	155725	155732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_015067	CTCG	2	8	158592	158599	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_015067	CTGG	2	8	158638	158645	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_015067	GTCA	2	8	159171	159178	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_015067	TGTT	2	8	163644	163651	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015067	ACGA	2	8	171145	171152	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_015067	GGCT	2	8	172708	172715	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_015067	CTTG	2	8	173186	173193	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_015067	GGCT	2	8	174851	174858	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_015067	AAAG	2	8	177292	177299	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015067	AGGT	2	8	177427	177434	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015067	GGAT	2	8	184462	184469	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015067	GTAA	2	8	185434	185441	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015067	CAAG	2	8	185445	185452	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_015067	TTAC	2	8	187240	187247	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_015067	ACTG	2	8	202176	202183	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_015067	GGGT	2	8	202185	202192	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015067	CTGA	2	8	205807	205814	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_015067	GGCA	2	8	213109	213116	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_015067	TTCC	2	8	214766	214773	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_015067	CGCT	2	8	215050	215057	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_015067	ATTG	2	8	216276	216283	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015067	TCAC	2	8	216403	216410	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_015067	CGGC	2	8	222526	222533	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_015067	GCCG	2	8	222554	222561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_015067	GTAT	2	8	222567	222574	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015067	ACGC	2	8	222609	222616	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_015067	CCGG	2	8	223723	223730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_015067	TGAA	2	8	225734	225741	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015067	AGTA	2	8	227061	227068	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015067	TCAT	2	8	228026	228033	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_015067	TGCT	2	8	228381	228388	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_015067	TCGT	2	8	228517	228524	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_015067	CAGG	2	8	233028	233035	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_015067	GCTG	2	8	237750	237757	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_015067	TGAT	2	8	242720	242727	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015067	AGAC	2	8	242878	242885	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_015067	ACCG	2	8	242890	242897	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_015067	GTGG	2	8	244315	244322	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015067	CTAT	2	8	249842	249849	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_015067	CGTC	2	8	255174	255181	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_015067	GCCG	2	8	255429	255436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_015067	GAAA	2	8	268061	268068	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015067	TTTG	2	8	268089	268096	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015067	GAGC	2	8	268286	268293	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_015067	AGAA	2	8	268355	268362	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015067	TCCC	2	8	269771	269778	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
134	NC_015067	CTTC	2	8	269842	269849	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_015067	TCAC	2	8	280338	280345	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_015067	CTCG	2	8	284083	284090	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_015067	TTTG	2	8	286143	286150	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015067	GTAA	2	8	287227	287234	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015067	CAAT	2	8	287931	287938	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_015067	TTGA	2	8	291976	291983	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015067	TTCC	2	8	294769	294776	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_015067	TTGT	2	8	294779	294786	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015067	TGCC	2	8	298270	298277	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_015067	GGAA	2	8	300208	300215	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015067	TTGC	2	8	303544	303551	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_015067	TGAT	2	8	309582	309589	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015067	ACGA	2	8	315489	315496	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_015067	CCGT	2	8	315533	315540	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_015067	CAAA	2	8	319617	319624	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_015067	TGCC	2	8	327724	327731	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_015067	GACC	2	8	328640	328647	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
152	NC_015067	TATG	2	8	334830	334837	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015067	CAAT	2	8	339023	339030	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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445	NC_015067	GCCG	2	8	1172042	1172049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
446	NC_015067	CCGG	2	8	1174759	1174766	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
447	NC_015067	AGGA	2	8	1174900	1174907	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
448	NC_015067	TTTA	2	8	1174964	1174971	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
449	NC_015067	AGGA	2	8	1175486	1175493	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
450	NC_015067	TGCT	2	8	1176324	1176331	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
451	NC_015067	GCTT	2	8	1176359	1176366	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
452	NC_015067	GCTT	2	8	1176379	1176386	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
453	NC_015067	CCAA	2	8	1181052	1181059	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
454	NC_015067	CGGT	2	8	1183640	1183647	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
455	NC_015067	CCGG	2	8	1187551	1187558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
456	NC_015067	GCCG	2	8	1187600	1187607	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
457	NC_015067	CGGC	2	8	1187791	1187798	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
458	NC_015067	CGTC	2	8	1187837	1187844	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
459	NC_015067	AACG	2	8	1188610	1188617	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
460	NC_015067	CAAA	2	8	1190381	1190388	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
461	NC_015067	GACG	2	8	1192853	1192860	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
462	NC_015067	GGAC	2	8	1204868	1204875	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
463	NC_015067	TCGT	2	8	1205740	1205747	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
464	NC_015067	CGAC	2	8	1205763	1205770	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
465	NC_015067	CGGC	2	8	1209090	1209097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
466	NC_015067	CGCA	2	8	1209132	1209139	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
467	NC_015067	GCCG	2	8	1209652	1209659	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
468	NC_015067	GGGA	2	8	1212979	1212986	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
469	NC_015067	GCGG	2	8	1213823	1213830	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
470	NC_015067	ACGG	2	8	1214963	1214970	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
471	NC_015067	GCAG	2	8	1218142	1218149	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
472	NC_015067	GCCG	2	8	1222477	1222484	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
473	NC_015067	CGGC	3	12	1222503	1222514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
474	NC_015067	GCCA	2	8	1225850	1225857	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
475	NC_015067	GGCC	2	8	1225891	1225898	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
476	NC_015067	ACCG	2	8	1225913	1225920	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
477	NC_015067	CCCG	2	8	1227821	1227828	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
478	NC_015067	CGGG	2	8	1228155	1228162	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
479	NC_015067	TCCT	2	8	1230091	1230098	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
480	NC_015067	GGCC	2	8	1230232	1230239	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
481	NC_015067	GAAA	2	8	1230645	1230652	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
482	NC_015067	GCCC	2	8	1230690	1230697	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
483	NC_015067	GCCG	2	8	1233230	1233237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
484	NC_015067	ACCG	2	8	1234180	1234187	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
485	NC_015067	GAGG	2	8	1234188	1234195	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
486	NC_015067	GCAT	2	8	1235831	1235838	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
487	NC_015067	CGTC	2	8	1245233	1245240	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
488	NC_015067	CACT	2	8	1252162	1252169	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
489	NC_015067	TCGG	2	8	1253991	1253998	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
490	NC_015067	TTGG	2	8	1261510	1261517	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
491	NC_015067	ACTG	2	8	1263705	1263712	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
492	NC_015067	TTGA	2	8	1275664	1275671	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
493	NC_015067	CATA	2	8	1276857	1276864	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
494	NC_015067	CGGT	2	8	1276902	1276909	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
495	NC_015067	CGTT	2	8	1277031	1277038	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
496	NC_015067	GGAA	2	8	1277196	1277203	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
497	NC_015067	CGGT	3	12	1282090	1282101	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
498	NC_015067	GATT	2	8	1287301	1287308	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
499	NC_015067	ACTG	2	8	1289511	1289518	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
500	NC_015067	TGGG	2	8	1295206	1295213	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding

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