MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 39426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015067	GCC	2	6	34	39	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690194
2	NC_015067	GTT	2	6	118	123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690194
3	NC_015067	ACA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690194
4	NC_015067	CAG	2	6	436	441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690194
5	NC_015067	CGG	2	6	810	815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690194
6	NC_015067	TTC	2	6	838	843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690194
7	NC_015067	GCC	2	6	975	980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690194
8	NC_015067	TTC	2	6	1004	1009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690194
9	NC_015067	CTT	2	6	1185	1190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690194
10	NC_015067	CAC	2	6	1191	1196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690194
11	NC_015067	CAT	2	6	1221	1226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690194
12	NC_015067	CAC	2	6	1389	1394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690194
13	NC_015067	GCA	2	6	1431	1436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690194
14	NC_015067	TGG	2	6	1587	1592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015067	GAC	2	6	1665	1670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015067	CGA	2	6	1802	1807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015067	CGG	2	6	1890	1895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015067	TGT	2	6	1921	1926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015067	CGA	2	6	1973	1978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015067	TTA	2	6	2103	2108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015067	CAT	2	6	2139	2144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015067	CGA	2	6	2218	2223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015067	CCA	2	6	2400	2405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690195
24	NC_015067	GCT	2	6	2454	2459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690195
25	NC_015067	GAA	2	6	2674	2679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690195
26	NC_015067	GTC	2	6	2728	2733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690195
27	NC_015067	ACC	2	6	2806	2811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690195
28	NC_015067	GCT	2	6	2904	2909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690195
29	NC_015067	CGG	2	6	2966	2971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690195
30	NC_015067	CGA	2	6	2988	2993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690195
31	NC_015067	CAA	2	6	3015	3020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690195
32	NC_015067	CCG	2	6	3116	3121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690195
33	NC_015067	CGA	2	6	3129	3134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690195
34	NC_015067	CGA	2	6	3174	3179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690195
35	NC_015067	AGG	2	6	3212	3217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690195
36	NC_015067	CCG	2	6	3224	3229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690195
37	NC_015067	GAC	2	6	3258	3263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690195
38	NC_015067	CAG	2	6	3292	3297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690195
39	NC_015067	CGA	2	6	3309	3314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690195
40	NC_015067	AAC	2	6	3355	3360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690195
41	NC_015067	TGG	2	6	3506	3511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690196
42	NC_015067	CCA	2	6	3593	3598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690196
43	NC_015067	TGA	2	6	3615	3620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690196
44	NC_015067	GTG	2	6	3662	3667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690196
45	NC_015067	GTC	2	6	3693	3698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690196
46	NC_015067	ATC	2	6	3715	3720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690196
47	NC_015067	CGC	2	6	3787	3792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690196
48	NC_015067	ATG	2	6	3796	3801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690196
49	NC_015067	TTG	2	6	3883	3888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690196
50	NC_015067	CAA	2	6	3909	3914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690196
51	NC_015067	CGA	2	6	4101	4106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690196
52	NC_015067	CGA	2	6	4119	4124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690196
53	NC_015067	GAT	2	6	4354	4359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690196
54	NC_015067	GAC	2	6	4375	4380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690196
55	NC_015067	CGC	2	6	4731	4736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690197
56	NC_015067	TGA	2	6	4798	4803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690197
57	NC_015067	CCA	2	6	4804	4809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690197
58	NC_015067	GTG	2	6	4875	4880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690197
59	NC_015067	CGG	3	9	5085	5093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690197
60	NC_015067	TCG	2	6	5138	5143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015067	AGA	2	6	5185	5190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015067	AGC	2	6	5302	5307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690198
63	NC_015067	GGC	2	6	5312	5317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690198
64	NC_015067	CAA	2	6	5330	5335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690198
65	NC_015067	CAC	2	6	5478	5483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690198
66	NC_015067	TCG	2	6	5497	5502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690198
67	NC_015067	CGA	2	6	5513	5518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690198
68	NC_015067	GTG	2	6	5580	5585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690198
69	NC_015067	TGA	2	6	5650	5655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690198
70	NC_015067	CGG	2	6	5669	5674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690198
71	NC_015067	CGG	4	12	5681	5692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690198
72	NC_015067	CGG	2	6	5705	5710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690198
73	NC_015067	ACC	2	6	5910	5915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690198
74	NC_015067	CAG	2	6	5949	5954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690198
75	NC_015067	CGA	2	6	5993	5998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690198
76	NC_015067	CGA	2	6	6020	6025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690198
77	NC_015067	CGC	2	6	6038	6043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690198
78	NC_015067	TCA	2	6	6157	6162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690198
79	NC_015067	CCG	2	6	6196	6201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690198
80	NC_015067	CCA	2	6	6265	6270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690198
81	NC_015067	GGC	2	6	6276	6281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690198
82	NC_015067	GAG	2	6	6288	6293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690198
83	NC_015067	CGA	2	6	6380	6385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690198
84	NC_015067	CCG	2	6	6403	6408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690198
85	NC_015067	TGA	2	6	6499	6504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690198
86	NC_015067	CAT	2	6	6554	6559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690198
87	NC_015067	GCC	2	6	6594	6599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690198
88	NC_015067	AAG	2	6	6600	6605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690198
89	NC_015067	CGC	2	6	6621	6626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690198
90	NC_015067	CCG	2	6	6643	6648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690198
91	NC_015067	AAC	2	6	6681	6686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690198
92	NC_015067	GGC	2	6	6729	6734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690198
93	NC_015067	ATG	2	6	6825	6830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690198
94	NC_015067	CGG	3	9	6866	6874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690198
95	NC_015067	TCA	3	9	6919	6927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690198
96	NC_015067	TTC	2	6	6981	6986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690198
97	NC_015067	GAT	2	6	7001	7006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690198
98	NC_015067	CCG	2	6	7009	7014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690198
99	NC_015067	GCC	2	6	7034	7039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690198
100	NC_015067	ACC	2	6	7209	7214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690198
101	NC_015067	CGC	3	9	7259	7267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690198
102	NC_015067	CGA	2	6	7271	7276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690198
103	NC_015067	CGC	2	6	7314	7319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690198
104	NC_015067	TCC	2	6	7373	7378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_015067	AAC	2	6	7428	7433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015067	ACA	2	6	7448	7453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690199
107	NC_015067	CGA	2	6	7458	7463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690199
108	NC_015067	AGG	2	6	7505	7510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690199
109	NC_015067	GCA	2	6	7569	7574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690199
110	NC_015067	TCG	2	6	7616	7621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690199
111	NC_015067	CGC	2	6	7666	7671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690199
112	NC_015067	ACG	2	6	7688	7693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690199
113	NC_015067	ACA	2	6	7718	7723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690199
114	NC_015067	ACC	2	6	7760	7765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690199
115	NC_015067	TCG	2	6	7835	7840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690199
116	NC_015067	CGA	2	6	7869	7874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690199
117	NC_015067	GCC	3	9	7879	7887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690199
118	NC_015067	ACG	2	6	7976	7981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690199
119	NC_015067	TGC	2	6	8003	8008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690199
120	NC_015067	CCG	2	6	8042	8047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690199
121	NC_015067	CCA	2	6	8066	8071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690199
122	NC_015067	CGC	2	6	8078	8083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690199
123	NC_015067	ACA	2	6	8084	8089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690199
124	NC_015067	ACC	2	6	8126	8131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690199
125	NC_015067	CTG	2	6	8152	8157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690199
126	NC_015067	CAT	2	6	8172	8177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690199
127	NC_015067	CCA	2	6	8204	8209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690199
128	NC_015067	GAG	2	6	8287	8292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690199
129	NC_015067	TGG	2	6	8312	8317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690199
130	NC_015067	TCG	2	6	8354	8359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690199
131	NC_015067	CGA	2	6	8415	8420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690199
132	NC_015067	GGT	2	6	8481	8486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690199
133	NC_015067	AAC	2	6	8491	8496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690199
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136	NC_015067	GCT	2	6	8775	8780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690199
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139	NC_015067	CGA	2	6	8955	8960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690199
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141	NC_015067	CGA	2	6	8979	8984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690199
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143	NC_015067	GTG	2	6	9052	9057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690199
144	NC_015067	CGA	2	6	9099	9104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690199
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165	NC_015067	GTG	2	6	9829	9834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690199
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192	NC_015067	CGT	2	6	10937	10942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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244	NC_015067	GAT	2	6	13913	13918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
245	NC_015067	GTG	2	6	13943	13948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
246	NC_015067	TTG	2	6	13977	13982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
247	NC_015067	CCT	2	6	14010	14015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
248	NC_015067	GCG	2	6	14149	14154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690203
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253	NC_015067	CGA	2	6	14414	14419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690203
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257	NC_015067	GCG	2	6	14701	14706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690203
258	NC_015067	ACG	2	6	14737	14742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690203
259	NC_015067	GCA	2	6	14768	14773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690203
260	NC_015067	GTA	2	6	14793	14798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690203
261	NC_015067	CCG	2	6	14839	14844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690203
262	NC_015067	TCG	2	6	14881	14886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690203
263	NC_015067	ACC	2	6	14928	14933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690203
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266	NC_015067	GCC	3	9	15066	15074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690203
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271	NC_015067	GGT	2	6	15556	15561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
272	NC_015067	ATC	2	6	15790	15795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690204
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280	NC_015067	AGT	2	6	16284	16289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
281	NC_015067	TGT	2	6	16305	16310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
282	NC_015067	GTG	2	6	16311	16316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
283	NC_015067	TAA	2	6	16348	16353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_015067	AAT	2	6	16380	16385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_015067	GAT	2	6	16399	16404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
288	NC_015067	CTG	3	9	16445	16453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690205
289	NC_015067	CTG	2	6	16457	16462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690205
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342	NC_015067	GTC	2	6	19890	19895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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380	NC_015067	TGA	2	6	21824	21829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690210
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383	NC_015067	GCC	2	6	22156	22161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690210
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385	NC_015067	CCG	2	6	22225	22230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690210
386	NC_015067	CAG	2	6	22287	22292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690210
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500	NC_015067	TGA	2	6	29112	29117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690217

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