MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 4031

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015067	TGG	2	6	1587	1592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015067	GAC	2	6	1665	1670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015067	CGA	2	6	1802	1807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015067	CGG	2	6	1890	1895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015067	TGT	2	6	1921	1926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015067	CGA	2	6	1973	1978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015067	TTA	2	6	2103	2108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015067	CAT	2	6	2139	2144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015067	CGA	2	6	2218	2223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015067	TCG	2	6	5138	5143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015067	AGA	2	6	5185	5190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015067	TCC	2	6	7373	7378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_015067	AAC	2	6	7428	7433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015067	CAG	2	6	10119	10124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015067	GTT	2	6	10766	10771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015067	GAT	2	6	10793	10798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015067	CGT	2	6	10834	10839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015067	GAC	2	6	10915	10920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015067	CGT	2	6	10937	10942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015067	CGT	2	6	11040	11045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015067	GCC	2	6	11067	11072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_015067	GTG	2	6	11092	11097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015067	TTG	2	6	11219	11224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015067	CAG	2	6	11310	11315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015067	GTT	2	6	11372	11377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015067	TGC	2	6	13713	13718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015067	GAT	2	6	13913	13918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015067	GTG	2	6	13943	13948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015067	TTG	2	6	13977	13982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015067	CCT	2	6	14010	14015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_015067	TGC	2	6	15504	15509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015067	GGT	2	6	15556	15561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015067	TCT	2	6	16204	16209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015067	AGT	2	6	16284	16289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015067	TGT	2	6	16305	16310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015067	GTG	2	6	16311	16316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015067	TAA	2	6	16348	16353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015067	ACG	2	6	16373	16378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015067	AAT	2	6	16380	16385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015067	GAG	2	6	16392	16397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015067	GAT	2	6	16399	16404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015067	GCC	2	6	17758	17763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_015067	TCG	2	6	17772	17777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015067	CTT	2	6	17795	17800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015067	GCA	2	6	17806	17811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015067	AAC	2	6	17867	17872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015067	CTG	2	6	18137	18142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015067	ACC	2	6	18159	18164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_015067	CGC	2	6	18201	18206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_015067	CTC	2	6	18586	18591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_015067	GCG	3	9	19467	19475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015067	TCA	2	6	19555	19560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015067	TGG	2	6	19794	19799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015067	TGC	2	6	19806	19811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015067	GTC	2	6	19890	19895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015067	ATC	2	6	19927	19932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015067	CCT	2	6	19963	19968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_015067	CGG	2	6	19975	19980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015067	TCC	2	6	20084	20089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_015067	CGC	2	6	20105	20110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_015067	GGT	2	6	20187	20192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015067	ACC	2	6	20203	20208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_015067	TAT	2	6	20283	20288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015067	GGA	2	6	20427	20432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015067	CGG	2	6	20539	20544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015067	TGC	2	6	20642	20647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015067	CTG	2	6	20696	20701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015067	CGG	2	6	20899	20904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015067	CGA	2	6	20921	20926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015067	CGG	2	6	20962	20967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_015067	GCC	2	6	21028	21033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_015067	TTC	2	6	21117	21122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015067	GCC	2	6	21137	21142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_015067	GTT	2	6	21374	21379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015067	GAG	2	6	22493	22498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015067	GGT	2	6	24800	24805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015067	CCT	2	6	25113	25118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_015067	GAG	2	6	25167	25172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015067	GTA	2	6	26237	26242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015067	TTG	2	6	26348	26353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015067	CCG	2	6	26355	26360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_015067	TCG	2	6	27240	27245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015067	CCA	2	6	27272	27277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_015067	GCG	2	6	27689	27694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015067	CGA	2	6	27698	27703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015067	TTG	2	6	27884	27889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015067	CTT	2	6	29942	29947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015067	GGT	2	6	30012	30017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015067	CGA	2	6	31512	31517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015067	GCT	2	6	32338	32343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015067	GTG	2	6	32416	32421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015067	CAC	2	6	32461	32466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_015067	GGT	3	9	32476	32484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015067	CAA	3	9	35198	35206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015067	GTT	2	6	35272	35277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015067	ACG	2	6	36657	36662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015067	GCT	2	6	36764	36769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015067	CAC	2	6	37002	37007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_015067	AGC	2	6	38199	38204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015067	GAT	2	6	38205	38210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015067	AAT	2	6	38271	38276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015067	ATT	2	6	38312	38317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015067	TCA	2	6	40017	40022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015067	AAT	2	6	40029	40034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015067	ATT	2	6	40070	40075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015067	GAT	2	6	40080	40085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015067	CTC	2	6	40449	40454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_015067	CCG	2	6	40477	40482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_015067	AAG	2	6	41966	41971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015067	TGA	2	6	41999	42004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015067	CCG	2	6	42096	42101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_015067	TGC	2	6	42484	42489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015067	CGA	2	6	42533	42538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015067	CAT	2	6	42540	42545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015067	TCT	2	6	43959	43964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015067	CAG	2	6	44135	44140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015067	TGG	2	6	44155	44160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015067	GTT	2	6	44343	44348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015067	GGA	2	6	44407	44412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015067	TTA	2	6	44428	44433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015067	CTT	2	6	44514	44519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015067	GGA	2	6	44542	44547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015067	CAG	2	6	44604	44609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015067	AGG	2	6	45123	45128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015067	GTC	2	6	47562	47567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_015067	TGT	2	6	47583	47588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015067	CGA	2	6	47851	47856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015067	TGA	2	6	47858	47863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015067	CCA	2	6	47978	47983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_015067	GCC	2	6	48035	48040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_015067	ATC	2	6	48141	48146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015067	TCA	2	6	48262	48267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015067	CAG	2	6	49377	49382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_015067	ATC	3	9	49490	49498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_015067	AGC	2	6	49542	49547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015067	CCA	2	6	49559	49564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_015067	GCT	2	6	49626	49631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_015067	ATC	2	6	49830	49835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015067	CCT	2	6	52737	52742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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