MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 35395

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015067	GCC	2	6	34	39	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690194
2	NC_015067	GTT	2	6	118	123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690194
3	NC_015067	ACA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690194
4	NC_015067	CAG	2	6	436	441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690194
5	NC_015067	CGG	2	6	810	815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690194
6	NC_015067	TTC	2	6	838	843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690194
7	NC_015067	GCC	2	6	975	980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690194
8	NC_015067	TTC	2	6	1004	1009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690194
9	NC_015067	CTT	2	6	1185	1190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690194
10	NC_015067	CAC	2	6	1191	1196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690194
11	NC_015067	CAT	2	6	1221	1226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690194
12	NC_015067	CAC	2	6	1389	1394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690194
13	NC_015067	GCA	2	6	1431	1436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690194
14	NC_015067	CCA	2	6	2400	2405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690195
15	NC_015067	GCT	2	6	2454	2459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690195
16	NC_015067	GAA	2	6	2674	2679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690195
17	NC_015067	GTC	2	6	2728	2733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690195
18	NC_015067	ACC	2	6	2806	2811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690195
19	NC_015067	GCT	2	6	2904	2909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690195
20	NC_015067	CGG	2	6	2966	2971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690195
21	NC_015067	CGA	2	6	2988	2993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690195
22	NC_015067	CAA	2	6	3015	3020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690195
23	NC_015067	CCG	2	6	3116	3121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690195
24	NC_015067	CGA	2	6	3129	3134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690195
25	NC_015067	CGA	2	6	3174	3179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690195
26	NC_015067	AGG	2	6	3212	3217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690195
27	NC_015067	CCG	2	6	3224	3229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690195
28	NC_015067	GAC	2	6	3258	3263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690195
29	NC_015067	CAG	2	6	3292	3297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690195
30	NC_015067	CGA	2	6	3309	3314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690195
31	NC_015067	AAC	2	6	3355	3360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690195
32	NC_015067	TGG	2	6	3506	3511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690196
33	NC_015067	CCA	2	6	3593	3598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690196
34	NC_015067	TGA	2	6	3615	3620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690196
35	NC_015067	GTG	2	6	3662	3667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690196
36	NC_015067	GTC	2	6	3693	3698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690196
37	NC_015067	ATC	2	6	3715	3720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690196
38	NC_015067	CGC	2	6	3787	3792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690196
39	NC_015067	ATG	2	6	3796	3801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690196
40	NC_015067	TTG	2	6	3883	3888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690196
41	NC_015067	CAA	2	6	3909	3914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690196
42	NC_015067	CGA	2	6	4101	4106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690196
43	NC_015067	CGA	2	6	4119	4124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690196
44	NC_015067	GAT	2	6	4354	4359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690196
45	NC_015067	GAC	2	6	4375	4380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690196
46	NC_015067	CGC	2	6	4731	4736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690197
47	NC_015067	TGA	2	6	4798	4803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690197
48	NC_015067	CCA	2	6	4804	4809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690197
49	NC_015067	GTG	2	6	4875	4880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690197
50	NC_015067	CGG	3	9	5085	5093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690197
51	NC_015067	AGC	2	6	5302	5307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690198
52	NC_015067	GGC	2	6	5312	5317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690198
53	NC_015067	CAA	2	6	5330	5335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690198
54	NC_015067	CAC	2	6	5478	5483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690198
55	NC_015067	TCG	2	6	5497	5502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690198
56	NC_015067	CGA	2	6	5513	5518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690198
57	NC_015067	GTG	2	6	5580	5585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690198
58	NC_015067	TGA	2	6	5650	5655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690198
59	NC_015067	CGG	2	6	5669	5674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690198
60	NC_015067	CGG	4	12	5681	5692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690198
61	NC_015067	CGG	2	6	5705	5710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690198
62	NC_015067	ACC	2	6	5910	5915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690198
63	NC_015067	CAG	2	6	5949	5954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690198
64	NC_015067	CGA	2	6	5993	5998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690198
65	NC_015067	CGA	2	6	6020	6025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690198
66	NC_015067	CGC	2	6	6038	6043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690198
67	NC_015067	TCA	2	6	6157	6162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690198
68	NC_015067	CCG	2	6	6196	6201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690198
69	NC_015067	CCA	2	6	6265	6270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690198
70	NC_015067	GGC	2	6	6276	6281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690198
71	NC_015067	GAG	2	6	6288	6293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690198
72	NC_015067	CGA	2	6	6380	6385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690198
73	NC_015067	CCG	2	6	6403	6408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690198
74	NC_015067	TGA	2	6	6499	6504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690198
75	NC_015067	CAT	2	6	6554	6559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690198
76	NC_015067	GCC	2	6	6594	6599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690198
77	NC_015067	AAG	2	6	6600	6605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690198
78	NC_015067	CGC	2	6	6621	6626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690198
79	NC_015067	CCG	2	6	6643	6648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690198
80	NC_015067	AAC	2	6	6681	6686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690198
81	NC_015067	GGC	2	6	6729	6734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690198
82	NC_015067	ATG	2	6	6825	6830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690198
83	NC_015067	CGG	3	9	6866	6874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690198
84	NC_015067	TCA	3	9	6919	6927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690198
85	NC_015067	TTC	2	6	6981	6986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690198
86	NC_015067	GAT	2	6	7001	7006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690198
87	NC_015067	CCG	2	6	7009	7014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690198
88	NC_015067	GCC	2	6	7034	7039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690198
89	NC_015067	ACC	2	6	7209	7214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690198
90	NC_015067	CGC	3	9	7259	7267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690198
91	NC_015067	CGA	2	6	7271	7276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690198
92	NC_015067	CGC	2	6	7314	7319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690198
93	NC_015067	ACA	2	6	7448	7453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690199
94	NC_015067	CGA	2	6	7458	7463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690199
95	NC_015067	AGG	2	6	7505	7510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690199
96	NC_015067	GCA	2	6	7569	7574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690199
97	NC_015067	TCG	2	6	7616	7621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690199
98	NC_015067	CGC	2	6	7666	7671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690199
99	NC_015067	ACG	2	6	7688	7693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690199
100	NC_015067	ACA	2	6	7718	7723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690199
101	NC_015067	ACC	2	6	7760	7765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690199
102	NC_015067	TCG	2	6	7835	7840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690199
103	NC_015067	CGA	2	6	7869	7874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690199
104	NC_015067	GCC	3	9	7879	7887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690199
105	NC_015067	ACG	2	6	7976	7981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690199
106	NC_015067	TGC	2	6	8003	8008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690199
107	NC_015067	CCG	2	6	8042	8047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690199
108	NC_015067	CCA	2	6	8066	8071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690199
109	NC_015067	CGC	2	6	8078	8083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690199
110	NC_015067	ACA	2	6	8084	8089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690199
111	NC_015067	ACC	2	6	8126	8131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690199
112	NC_015067	CTG	2	6	8152	8157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690199
113	NC_015067	CAT	2	6	8172	8177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690199
114	NC_015067	CCA	2	6	8204	8209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690199
115	NC_015067	GAG	2	6	8287	8292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690199
116	NC_015067	TGG	2	6	8312	8317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690199
117	NC_015067	TCG	2	6	8354	8359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690199
118	NC_015067	CGA	2	6	8415	8420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690199
119	NC_015067	GGT	2	6	8481	8486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690199
120	NC_015067	AAC	2	6	8491	8496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690199
121	NC_015067	GCA	2	6	8517	8522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690199
122	NC_015067	ACC	2	6	8606	8611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690199
123	NC_015067	GCT	2	6	8775	8780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690199
124	NC_015067	ATC	2	6	8938	8943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690199
125	NC_015067	CGA	2	6	8946	8951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690199
126	NC_015067	CGA	2	6	8955	8960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690199
127	NC_015067	TCG	2	6	8963	8968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690199
128	NC_015067	CGA	2	6	8979	8984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690199
129	NC_015067	CCG	2	6	8985	8990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690199
130	NC_015067	GTG	2	6	9052	9057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690199
131	NC_015067	CGA	2	6	9099	9104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690199
132	NC_015067	CGG	2	6	9123	9128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690199
133	NC_015067	GAC	2	6	9160	9165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690199
134	NC_015067	GTG	2	6	9166	9171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690199
135	NC_015067	CTT	2	6	9177	9182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690199
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139	NC_015067	TGA	2	6	9318	9323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690199
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242	NC_015067	AGT	2	6	15968	15973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690204
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245	NC_015067	TGA	2	6	16049	16054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690204
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250	NC_015067	GGC	2	6	16629	16634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690205
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252	NC_015067	TTC	2	6	16852	16857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690205
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254	NC_015067	GCC	2	6	16892	16897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690205
255	NC_015067	CGG	2	6	16943	16948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690205
256	NC_015067	GCG	2	6	16957	16962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690205
257	NC_015067	ATC	2	6	16987	16992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690205
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259	NC_015067	CGA	2	6	17088	17093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690205
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