MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Bifidobacterium longum subsp. infantis 157F plasmid p157F-NC2

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015066	GCG	2	6	102	107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690190
2	NC_015066	TGC	2	6	143	148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690190
3	NC_015066	CTG	2	6	160	165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690190
4	NC_015066	CCG	2	6	197	202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690190
5	NC_015066	AAG	2	6	256	261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690190
6	NC_015066	GTG	2	6	265	270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690190
7	NC_015066	GGA	2	6	315	320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690190
8	NC_015066	CAA	2	6	390	395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690190
9	NC_015066	TCG	2	6	413	418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690190
10	NC_015066	GGC	2	6	445	450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690190
11	NC_015066	AGC	2	6	464	469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690190
12	NC_015066	CCA	2	6	719	724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690190
13	NC_015066	GCA	2	6	806	811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690190
14	NC_015066	CTG	2	6	817	822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690190
15	NC_015066	CGC	2	6	876	881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690190
16	NC_015066	GAG	2	6	1051	1056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690190
17	NC_015066	TGG	2	6	1057	1062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690190
18	NC_015066	GAG	2	6	1078	1083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690190
19	NC_015066	GCC	2	6	1090	1095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690190
20	NC_015066	ATC	2	6	1102	1107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690190
21	NC_015066	GCC	2	6	1120	1125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690190
22	NC_015066	GCT	2	6	1167	1172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690190
23	NC_015066	ACC	2	6	1291	1296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690190
24	NC_015066	GCG	2	6	1450	1455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690190
25	NC_015066	GAG	2	6	1552	1557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690190
26	NC_015066	CAG	2	6	1627	1632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690190
27	NC_015066	ATG	2	6	1725	1730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690191
28	NC_015066	CTC	2	6	2256	2261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690191
29	NC_015066	CCT	2	6	2285	2290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690191
30	NC_015066	GAT	2	6	2328	2333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690191
31	NC_015066	CAG	2	6	2367	2372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690191
32	NC_015066	GCT	2	6	2405	2410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690191
33	NC_015066	TTC	2	6	2422	2427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690191
34	NC_015066	CTC	2	6	2451	2456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690191
35	NC_015066	CTT	2	6	2541	2546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690191
36	NC_015066	GTT	2	6	2556	2561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690191
37	NC_015066	GGC	2	6	2890	2895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690192
38	NC_015066	GTC	3	9	2928	2936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690192
39	NC_015066	CCA	2	6	3110	3115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690192
40	NC_015066	TCG	2	6	3160	3165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690192
41	NC_015066	CGG	2	6	3179	3184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690192
42	NC_015066	GTC	2	6	3264	3269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690192
43	NC_015066	CAT	2	6	3363	3368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015066	CGC	2	6	3541	3546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_015066	GCC	3	9	3572	3580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_015066	CGC	2	6	3589	3594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.