MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Granulicella tundricola plasmid pACIX902

Total Repeats: 145

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015065	TGAAGC	2	12	2081	2092	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	322437481
2	NC_015065	CTTGCT	2	12	4760	4771	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	322437482
3	NC_015065	GTAGAT	2	12	6355	6366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322437483
4	NC_015065	GGATGC	2	12	12068	12079	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	322437485
5	NC_015065	GCAACA	2	12	12319	12330	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	322437485
6	NC_015065	CTGCCG	2	12	12713	12724	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	322437486
7	NC_015065	CCATCG	2	12	13475	13486	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	322437486
8	NC_015065	CGGCAC	2	12	14874	14885	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	322437486
9	NC_015065	CGGCAC	2	12	15582	15593	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	322437486
10	NC_015065	CAGCAC	2	12	16941	16952	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	322437486
11	NC_015065	GTGACG	2	12	21632	21643	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	322437490
12	NC_015065	TGGCGC	2	12	22553	22564	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	322437491
13	NC_015065	GATGGG	2	12	22675	22686	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	322437491
14	NC_015065	GATGCG	2	12	22729	22740	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	322437491
15	NC_015065	GGCAGA	2	12	23761	23772	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	322437492
16	NC_015065	TGTTGG	2	12	25387	25398	0 %	50 %	50 %	0 %	322437493
17	NC_015065	CGCGGG	2	12	26977	26988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322437495
18	NC_015065	CGGTGA	2	12	27721	27732	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	322437495
19	NC_015065	AGGGTG	2	12	28458	28469	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	322437496
20	NC_015065	CCGGTG	2	12	28914	28925	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	322437496
21	NC_015065	GACGTG	2	12	30488	30499	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	322437497
22	NC_015065	TTGAAG	2	12	30905	30916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322437498
23	NC_015065	GGGTGA	2	12	31041	31052	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	322437498
24	NC_015065	GAGCCG	2	12	31262	31273	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	322437498
25	NC_015065	TGGATG	2	12	31697	31708	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	322437498
26	NC_015065	CCGTCG	2	12	33655	33666	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	322437500
27	NC_015065	GTCTGG	2	12	37843	37854	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	322437502
28	NC_015065	GGTTGG	2	12	40331	40342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322437504
29	NC_015065	TCCAGG	2	12	40390	40401	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	322437504
30	NC_015065	GGGCCG	2	12	44676	44687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322437506
31	NC_015065	CGTCCG	2	12	45874	45885	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	322437507
32	NC_015065	GGGGAG	2	12	49613	49624	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	322437510
33	NC_015065	TTGCCG	2	12	51304	51315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322437511
34	NC_015065	CGAAGC	2	12	51329	51340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322437511
35	NC_015065	CGGTGA	2	12	51866	51877	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	322437511
36	NC_015065	GGGAAG	2	12	52762	52773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322437511
37	NC_015065	GGAGGT	2	12	53019	53030	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	322437511
38	NC_015065	TGGTGA	2	12	57651	57662	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	322437515
39	NC_015065	TGGCGG	2	12	58536	58547	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	322437515
40	NC_015065	GAGGTT	2	12	65180	65191	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	322437517
41	NC_015065	CGCCAT	2	12	65280	65291	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	322437517
42	NC_015065	GCTGCC	2	12	66541	66552	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	322437517
43	NC_015065	GCACGG	2	12	67958	67969	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	322437518
44	NC_015065	GGATTG	2	12	69565	69576	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	322437518
45	NC_015065	ACGGTG	2	12	77442	77453	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	322437522
46	NC_015065	ATTCCG	2	12	77802	77813	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	322437522
47	NC_015065	ACGTGG	2	12	77890	77901	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	322437522
48	NC_015065	CTGCCT	2	12	79269	79280	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	322437522
49	NC_015065	GGTGCT	2	12	82177	82188	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	322437524
50	NC_015065	GCGCGA	2	12	82405	82416	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	322437524
51	NC_015065	GCCTGA	2	12	83602	83613	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	322437525
52	NC_015065	AGGGTG	2	12	87146	87157	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	322437526
53	NC_015065	TGCCGA	2	12	88176	88187	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	322437526
54	NC_015065	GAGAGC	2	12	88859	88870	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	322437526
55	NC_015065	GAGCCA	2	12	89201	89212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322437526
56	NC_015065	ACGGTG	2	12	89501	89512	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	322437526
57	NC_015065	TGTGGC	2	12	90527	90538	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	322437527
58	NC_015065	CATCGA	2	12	90725	90736	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	322437527
59	NC_015065	ATCGGC	2	12	90897	90908	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	322437527
60	NC_015065	GCAGAA	2	12	97769	97780	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	322437535
61	NC_015065	TGCTCG	2	12	99147	99158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322437536
62	NC_015065	TCGAAG	2	12	99237	99248	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	322437536
63	NC_015065	GCGGCT	2	12	103106	103117	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	322437537
64	NC_015065	CCTGGC	2	12	106523	106534	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	322437540
65	NC_015065	CCTGCG	2	12	110411	110422	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
66	NC_015065	TGTAGC	2	12	117000	117011	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	322437545
67	NC_015065	TGCGCG	2	12	126553	126564	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	322437553
68	NC_015065	TATTGG	2	12	126640	126651	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	322437553
69	NC_015065	ATGTAG	2	12	128728	128739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322437554
70	NC_015065	AGGTTG	2	12	131988	131999	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	322437556
71	NC_015065	TGATGG	2	12	132819	132830	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	322437557
72	NC_015065	CGGTGC	2	12	133911	133922	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	322437557
73	NC_015065	CCAGTT	2	12	133946	133957	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	322437557
74	NC_015065	CCGGTT	2	12	133964	133975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322437557
75	NC_015065	GTTCCG	2	12	134003	134014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322437557
76	NC_015065	CGTGTC	2	12	136663	136674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322437557
77	NC_015065	CGTCAC	2	12	136912	136923	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	322437557
78	NC_015065	ACGCAG	2	12	140980	140991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322437558
79	NC_015065	TTCGCT	2	12	141593	141604	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	322437558
80	NC_015065	GCCCAG	2	12	144530	144541	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
81	NC_015065	GATGCG	2	12	148813	148824	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	322437565
82	NC_015065	CTGCGA	2	12	149666	149677	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	322437566
83	NC_015065	CGTTCA	2	12	154175	154186	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	322437569
84	NC_015065	GCCGCT	2	12	156657	156668	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	322437569
85	NC_015065	GCAGAA	2	12	161256	161267	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	322437572
86	NC_015065	AAATTG	2	12	168269	168280	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	322437577
87	NC_015065	GCCGAA	2	12	170440	170451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322437579
88	NC_015065	GAACCA	2	12	177384	177395	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015065	TCCTGC	2	12	179821	179832	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	322437583
90	NC_015065	TCTTCA	2	12	180644	180655	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	322437584
91	NC_015065	ACGTCA	2	12	183793	183804	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	322437587
92	NC_015065	CATCAC	2	12	189356	189367	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	322437590
93	NC_015065	CTTCAG	2	12	189752	189763	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015065	CTGCGC	2	12	189853	189864	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	322437591
95	NC_015065	TGGCCC	2	12	190887	190898	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	322437592
96	NC_015065	CTCGGC	2	12	191219	191230	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	322437592
97	NC_015065	CCCTCG	2	12	192622	192633	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	322437593
98	NC_015065	CAAGGT	2	12	193418	193429	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	322437593
99	NC_015065	TCACCA	2	12	193695	193706	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	322437594
100	NC_015065	CCTCCG	2	12	194265	194276	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	322437594
101	NC_015065	CCGTAG	2	12	194403	194414	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	322437594
102	NC_015065	TCCTCT	2	12	194568	194579	0 %	50 %	0 %	50 %	322437594
103	NC_015065	TCCTCT	2	12	194646	194657	0 %	50 %	0 %	50 %	322437594
104	NC_015065	CTCATC	2	12	195116	195127	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	322437594
105	NC_015065	GGTCAA	2	12	196012	196023	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	322437594
106	NC_015065	GCTCGC	2	12	196129	196140	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	322437594
107	NC_015065	GGCTCC	2	12	196472	196483	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	322437594
108	NC_015065	CACCCC	2	12	197395	197406	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	322437595
109	NC_015065	TTCGCT	2	12	199480	199491	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015065	CACCAG	2	12	205086	205097	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	322437602
111	NC_015065	TCGCAT	2	12	205466	205477	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	322437602
112	NC_015065	GCAATC	2	12	218761	218772	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	322437615
113	NC_015065	TCCGTC	2	12	219812	219823	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	322437616
114	NC_015065	CTGCGG	2	12	220488	220499	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	322437616
115	NC_015065	CCAGGC	2	12	220650	220661	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	322437616
116	NC_015065	CTCATC	2	12	220708	220719	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	322437616
117	NC_015065	CAACAT	2	12	221506	221517	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	322437617
118	NC_015065	TCGACT	2	12	222561	222572	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	322437617
119	NC_015065	ACATCG	2	12	224236	224247	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	322437618
120	NC_015065	CGCCTT	2	12	224954	224965	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	322437618
121	NC_015065	TTCACC	2	12	227211	227222	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	322437619
122	NC_015065	ACCGTA	2	12	227421	227432	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	322437619
123	NC_015065	TCGGCT	2	12	231879	231890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322437620
124	NC_015065	ATCCGC	2	12	239934	239945	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	322437625
125	NC_015065	CTCCGC	2	12	240995	241006	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	322437625
126	NC_015065	CACCCG	2	12	241375	241386	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	322437626
127	NC_015065	CATCAC	2	12	243117	243128	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	322437627
128	NC_015065	GGCGTA	2	12	243531	243542	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	322437628
129	NC_015065	GGCACC	2	12	244059	244070	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	322437628
130	NC_015065	CCTCAT	2	12	245529	245540	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	322437630
131	NC_015065	TCATGG	2	12	248375	248386	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	322437633
132	NC_015065	TGTGTT	2	12	253873	253884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322437637
133	NC_015065	TCCGGC	2	12	259428	259439	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	322437642
134	NC_015065	TCTCCA	2	12	259735	259746	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	322437642
135	NC_015065	GACTGC	2	12	260759	260770	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	322437642
136	NC_015065	GTCTTG	2	12	273021	273032	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	322437653
137	NC_015065	GCGGTG	2	12	273524	273535	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	322437653
138	NC_015065	CGTTTG	2	12	275075	275086	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	322437655
139	NC_015065	GCTTGT	2	12	279585	279596	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	322437659
140	NC_015065	CTGGCG	2	12	279669	279680	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	322437659
141	NC_015065	CGGTGG	2	12	283555	283566	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	322437662
142	NC_015065	GCTGGG	2	12	284944	284955	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	322437663
143	NC_015065	TGCGTT	2	12	292574	292585	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	322437667
144	NC_015065	TGGTGA	2	12	297978	297989	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	322437670
145	NC_015065	GGTTGG	2	12	299317	299328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.