MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Granulicella tundricola plasmid pACIX902

Total Repeats: 172

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015065	GCGCT	2	10	386	395	0 %	20 %	40 %	40 %	322437480
2	NC_015065	CTGGG	2	10	1388	1397	0 %	20 %	60 %	20 %	322437480
3	NC_015065	ACCCC	2	10	13991	14000	20 %	0 %	0 %	80 %	322437486
4	NC_015065	CAGCG	2	10	15894	15903	20 %	0 %	40 %	40 %	322437486
5	NC_015065	GCTGC	2	10	17655	17664	0 %	20 %	40 %	40 %	322437487
6	NC_015065	GCCGT	2	10	18625	18634	0 %	20 %	40 %	40 %	322437488
7	NC_015065	GGGCT	2	10	25016	25025	0 %	20 %	60 %	20 %	322437493
8	NC_015065	GGGGT	2	10	26482	26491	0 %	20 %	80 %	0 %	322437494
9	NC_015065	ATGCG	2	10	28003	28012	20 %	20 %	40 %	20 %	322437495
10	NC_015065	GGCGT	2	10	28304	28313	0 %	20 %	60 %	20 %	322437496
11	NC_015065	GTGCG	2	10	29456	29465	0 %	20 %	60 %	20 %	322437497
12	NC_015065	TGGGG	2	10	36033	36042	0 %	20 %	80 %	0 %	322437502
13	NC_015065	CGAGG	2	10	36443	36452	20 %	0 %	60 %	20 %	322437502
14	NC_015065	GGCGA	2	10	38947	38956	20 %	0 %	60 %	20 %	322437503
15	NC_015065	CAGAG	2	10	42367	42376	40 %	0 %	40 %	20 %	322437504
16	NC_015065	GGGTG	2	10	43341	43350	0 %	20 %	80 %	0 %	322437505
17	NC_015065	GTCTT	2	10	44862	44871	0 %	60 %	20 %	20 %	322437506
18	NC_015065	CTCCA	2	10	44877	44886	20 %	20 %	0 %	60 %	322437506
19	NC_015065	GATGG	2	10	49121	49130	20 %	20 %	60 %	0 %	322437510
20	NC_015065	GCGAA	2	10	49809	49818	40 %	0 %	40 %	20 %	322437510
21	NC_015065	TGGTG	2	10	51189	51198	0 %	40 %	60 %	0 %	322437511
22	NC_015065	GGAGG	2	10	52206	52215	20 %	0 %	80 %	0 %	322437511
23	NC_015065	TTCGA	2	10	53047	53056	20 %	40 %	20 %	20 %	322437511
24	NC_015065	CGGCG	2	10	56500	56509	0 %	0 %	60 %	40 %	322437514
25	NC_015065	ATCCC	2	10	58975	58984	20 %	20 %	0 %	60 %	322437515
26	NC_015065	TGTGG	2	10	60067	60076	0 %	40 %	60 %	0 %	322437515
27	NC_015065	TGGAT	2	10	60105	60114	20 %	40 %	40 %	0 %	322437515
28	NC_015065	GAAGG	2	10	61171	61180	40 %	0 %	60 %	0 %	322437516
29	NC_015065	AGGCG	2	10	62097	62106	20 %	0 %	60 %	20 %	322437516
30	NC_015065	GGGAA	2	10	62483	62492	40 %	0 %	60 %	0 %	322437516
31	NC_015065	CTGTC	2	10	62524	62533	0 %	40 %	20 %	40 %	322437516
32	NC_015065	GGTTC	2	10	65136	65145	0 %	40 %	40 %	20 %	322437517
33	NC_015065	GGGTA	2	10	67276	67285	20 %	20 %	60 %	0 %	322437517
34	NC_015065	CAGGA	2	10	68518	68527	40 %	0 %	40 %	20 %	322437518
35	NC_015065	TGTCG	2	10	69456	69465	0 %	40 %	40 %	20 %	322437518
36	NC_015065	CTTCG	2	10	72488	72497	0 %	40 %	20 %	40 %	322437519
37	NC_015065	TCCGC	2	10	74427	74436	0 %	20 %	20 %	60 %	322437520
38	NC_015065	GGATG	2	10	75446	75455	20 %	20 %	60 %	0 %	322437520
39	NC_015065	CGACC	2	10	78731	78740	20 %	0 %	20 %	60 %	322437522
40	NC_015065	GCGCG	2	10	80449	80458	0 %	0 %	60 %	40 %	322437522
41	NC_015065	TGCGC	2	10	81726	81735	0 %	20 %	40 %	40 %	322437523
42	NC_015065	GTCAC	2	10	85108	85117	20 %	20 %	20 %	40 %	322437525
43	NC_015065	GCCGG	2	10	85180	85189	0 %	0 %	60 %	40 %	322437525
44	NC_015065	TGGTG	2	10	91881	91890	0 %	40 %	60 %	0 %	322437528
45	NC_015065	CGCTG	2	10	92202	92211	0 %	20 %	40 %	40 %	322437528
46	NC_015065	GCGTC	2	10	92819	92828	0 %	20 %	40 %	40 %	322437529
47	NC_015065	TGCCC	2	10	95832	95841	0 %	20 %	20 %	60 %	322437532
48	NC_015065	ATGCG	2	10	96969	96978	20 %	20 %	40 %	20 %	322437533
49	NC_015065	GAAGT	2	10	98452	98461	40 %	20 %	40 %	0 %	322437535
50	NC_015065	CTTCG	2	10	98476	98485	0 %	40 %	20 %	40 %	322437535
51	NC_015065	CGATG	2	10	100696	100705	20 %	20 %	40 %	20 %	322437537
52	NC_015065	GCTTC	2	10	104881	104890	0 %	40 %	20 %	40 %	322437538
53	NC_015065	CTGAT	2	10	105565	105574	20 %	40 %	20 %	20 %	322437539
54	NC_015065	TCCAG	2	10	107675	107684	20 %	20 %	20 %	40 %	322437540
55	NC_015065	TGGCG	2	10	110656	110665	0 %	20 %	60 %	20 %	322437541
56	NC_015065	TGGCG	2	10	115151	115160	0 %	20 %	60 %	20 %	322437544
57	NC_015065	GGCGT	2	10	117625	117634	0 %	20 %	60 %	20 %	322437546
58	NC_015065	AACCT	2	10	117725	117734	40 %	20 %	0 %	40 %	322437546
59	NC_015065	TCGGA	2	10	119469	119478	20 %	20 %	40 %	20 %	322437548
60	NC_015065	AAGCG	2	10	120516	120525	40 %	0 %	40 %	20 %	322437548
61	NC_015065	ACCTC	2	10	122090	122099	20 %	20 %	0 %	60 %	322437549
62	NC_015065	AGCAC	2	10	130713	130722	40 %	0 %	20 %	40 %	322437555
63	NC_015065	TGCGG	2	10	135416	135425	0 %	20 %	60 %	20 %	322437557
64	NC_015065	GTACG	2	10	135726	135735	20 %	20 %	40 %	20 %	322437557
65	NC_015065	CAGGT	2	10	135740	135749	20 %	20 %	40 %	20 %	322437557
66	NC_015065	GGCAT	2	10	136274	136283	20 %	20 %	40 %	20 %	322437557
67	NC_015065	CCAGG	2	10	138678	138687	20 %	0 %	40 %	40 %	322437557
68	NC_015065	TGGTC	2	10	138903	138912	0 %	40 %	40 %	20 %	322437557
69	NC_015065	CATCT	2	10	141157	141166	20 %	40 %	0 %	40 %	322437558
70	NC_015065	TGACC	2	10	141429	141438	20 %	20 %	20 %	40 %	322437558
71	NC_015065	AGTTG	2	10	142752	142761	20 %	40 %	40 %	0 %	322437559
72	NC_015065	GGTTT	2	10	143535	143544	0 %	60 %	40 %	0 %	322437560
73	NC_015065	AAGAA	2	10	145597	145606	80 %	0 %	20 %	0 %	322437561
74	NC_015065	AAAGA	2	10	146074	146083	80 %	0 %	20 %	0 %	322437561
75	NC_015065	GGCTG	2	10	147246	147255	0 %	20 %	60 %	20 %	322437563
76	NC_015065	GGTTG	2	10	148707	148716	0 %	40 %	60 %	0 %	322437565
77	NC_015065	GAGGT	2	10	149209	149218	20 %	20 %	60 %	0 %	322437566
78	NC_015065	CGAGA	2	10	150179	150188	40 %	0 %	40 %	20 %	322437567
79	NC_015065	GCGGA	2	10	150336	150345	20 %	0 %	60 %	20 %	322437567
80	NC_015065	CGTGC	2	10	153760	153769	0 %	20 %	40 %	40 %	322437569
81	NC_015065	ATTCG	2	10	154938	154947	20 %	40 %	20 %	20 %	322437569
82	NC_015065	AGCGT	2	10	156514	156523	20 %	20 %	40 %	20 %	322437569
83	NC_015065	ATGGC	2	10	158565	158574	20 %	20 %	40 %	20 %	322437570
84	NC_015065	GAAGC	2	10	163235	163244	40 %	0 %	40 %	20 %	322437573
85	NC_015065	ACTCG	2	10	165048	165057	20 %	20 %	20 %	40 %	322437574
86	NC_015065	GCCAG	2	10	166464	166473	20 %	0 %	40 %	40 %	322437575
87	NC_015065	ATGTG	2	10	166829	166838	20 %	40 %	40 %	0 %	322437575
88	NC_015065	TTTCC	2	10	167666	167675	0 %	60 %	0 %	40 %	322437577
89	NC_015065	GCGCG	2	10	168474	168483	0 %	0 %	60 %	40 %	322437577
90	NC_015065	GAAGG	2	10	170290	170299	40 %	0 %	60 %	0 %	322437579
91	NC_015065	CAATC	2	10	170301	170310	40 %	20 %	0 %	40 %	322437579
92	NC_015065	GCGAT	2	10	171417	171426	20 %	20 %	40 %	20 %	322437580
93	NC_015065	GTGAA	2	10	173445	173454	40 %	20 %	40 %	0 %	322437581
94	NC_015065	GGGTG	2	10	173687	173696	0 %	20 %	80 %	0 %	322437581
95	NC_015065	GCGCG	2	10	175270	175279	0 %	0 %	60 %	40 %	322437581
96	NC_015065	CCAAC	2	10	178097	178106	40 %	0 %	0 %	60 %	322437582
97	NC_015065	GATCG	2	10	180691	180700	20 %	20 %	40 %	20 %	322437584
98	NC_015065	GCTCC	2	10	182229	182238	0 %	20 %	20 %	60 %	322437586
99	NC_015065	GACTG	2	10	182958	182967	20 %	20 %	40 %	20 %	322437586
100	NC_015065	TCAGC	2	10	184868	184877	20 %	20 %	20 %	40 %	322437588
101	NC_015065	CCTCA	2	10	186590	186599	20 %	20 %	0 %	60 %	322437588
102	NC_015065	CGCTC	2	10	190804	190813	0 %	20 %	20 %	60 %	322437591
103	NC_015065	CCAGC	2	10	190919	190928	20 %	0 %	20 %	60 %	322437592
104	NC_015065	CGCGA	2	10	196373	196382	20 %	0 %	40 %	40 %	322437594
105	NC_015065	CCCAC	2	10	197664	197673	20 %	0 %	0 %	80 %	322437595
106	NC_015065	CTTCC	2	10	198844	198853	0 %	40 %	0 %	60 %	322437596
107	NC_015065	GGCGC	2	10	199811	199820	0 %	0 %	60 %	40 %	322437597
108	NC_015065	ATGAA	2	10	200129	200138	60 %	20 %	20 %	0 %	322437598
109	NC_015065	CCGCC	2	10	202331	202340	0 %	0 %	20 %	80 %	322437600
110	NC_015065	CCAGC	2	10	203155	203164	20 %	0 %	20 %	60 %	322437601
111	NC_015065	TTGCC	2	10	203945	203954	0 %	40 %	20 %	40 %	322437602
112	NC_015065	TCGCC	2	10	205316	205325	0 %	20 %	20 %	60 %	322437602
113	NC_015065	AATGC	2	10	205764	205773	40 %	20 %	20 %	20 %	322437602
114	NC_015065	CCGCA	2	10	207068	207077	20 %	0 %	20 %	60 %	322437603
115	NC_015065	GCACA	2	10	207231	207240	40 %	0 %	20 %	40 %	322437603
116	NC_015065	GCTCC	2	10	208142	208151	0 %	20 %	20 %	60 %	322437605
117	NC_015065	ACCCT	2	10	208234	208243	20 %	20 %	0 %	60 %	322437605
118	NC_015065	CTGAA	2	10	211102	211111	40 %	20 %	20 %	20 %	322437607
119	NC_015065	TTCCC	2	10	211245	211254	0 %	40 %	0 %	60 %	322437607
120	NC_015065	TAACC	2	10	213384	213393	40 %	20 %	0 %	40 %	322437608
121	NC_015065	CTCCA	2	10	216201	216210	20 %	20 %	0 %	60 %	322437612
122	NC_015065	AATCC	2	10	219280	219289	40 %	20 %	0 %	40 %	322437615
123	NC_015065	CCAGC	2	10	219864	219873	20 %	0 %	20 %	60 %	322437616
124	NC_015065	CCGGC	2	10	220793	220802	0 %	0 %	40 %	60 %	322437616
125	NC_015065	CGCCA	2	10	221644	221653	20 %	0 %	20 %	60 %	322437617
126	NC_015065	GACAT	2	10	222467	222476	40 %	20 %	20 %	20 %	322437617
127	NC_015065	CACGC	2	10	222816	222825	20 %	0 %	20 %	60 %	322437617
128	NC_015065	CTCGC	2	10	225150	225159	0 %	20 %	20 %	60 %	322437618
129	NC_015065	CATGG	2	10	227370	227379	20 %	20 %	40 %	20 %	322437619
130	NC_015065	GCCTC	2	10	229650	229659	0 %	20 %	20 %	60 %	322437620
131	NC_015065	TCCAC	2	10	229998	230007	20 %	20 %	0 %	60 %	322437620
132	NC_015065	TTGAG	2	10	231915	231924	20 %	40 %	40 %	0 %	322437620
133	NC_015065	GCTTG	2	10	232302	232311	0 %	40 %	40 %	20 %	322437621
134	NC_015065	TGCTG	2	10	238829	238838	0 %	40 %	40 %	20 %	322437624
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165	NC_015065	TGCTT	2	10	281157	281166	0 %	60 %	20 %	20 %	322437660
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167	NC_015065	ACCTG	2	10	281783	281792	20 %	20 %	20 %	40 %	322437661
168	NC_015065	TGGGC	2	10	292353	292362	0 %	20 %	60 %	20 %	322437666
169	NC_015065	CTTGT	2	10	294197	294206	0 %	60 %	20 %	20 %	322437668
170	NC_015065	CCGAT	2	10	294576	294585	20 %	20 %	20 %	40 %	322437668
171	NC_015065	GGACC	2	10	294605	294614	20 %	0 %	40 %	40 %	322437668
172	NC_015065	CGGGG	2	10	296736	296745	0 %	0 %	80 %	20 %	322437669

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.