MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Granulicella tundricola plasmid pACIX902

Total Repeats: 118

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015065	AACA	2	8	25	32	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015065	TTCA	3	12	296	307	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015065	GGAC	2	8	4367	4374	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015065	CAGC	2	8	4706	4713	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015065	TCAA	2	8	12543	12550	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_015065	GTTA	2	8	28123	28130	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015065	TGCG	2	8	32435	32442	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_015065	AACC	2	8	38568	38575	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015065	ACGC	2	8	64259	64266	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015065	TAGA	2	8	89861	89868	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015065	TTTG	2	8	89905	89912	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015065	ATGG	2	8	94508	94515	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015065	AAGA	2	8	100050	100057	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015065	ACCT	2	8	109033	109040	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015065	GTCG	2	8	109166	109173	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_015065	CGCA	2	8	109509	109516	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015065	GAAG	2	8	109919	109926	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015065	GCCC	2	8	110044	110051	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19	NC_015065	GCCC	2	8	110521	110528	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
20	NC_015065	AGGC	2	8	112662	112669	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015065	TCGA	2	8	112733	112740	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_015065	GACA	2	8	114449	114456	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_015065	ATTG	2	8	118432	118439	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015065	GCGT	2	8	129434	129441	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_015065	ATGT	2	8	129707	129714	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015065	CAGT	2	8	129730	129737	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_015065	GAAC	2	8	129803	129810	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015065	TACC	2	8	131239	131246	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015065	CACC	2	8	131413	131420	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
30	NC_015065	GGAA	2	8	132241	132248	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015065	GGTT	2	8	148161	148168	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015065	TCAG	2	8	151278	151285	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_015065	TCTG	2	8	151378	151385	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_015065	CTTG	2	8	151486	151493	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_015065	ACCG	2	8	151503	151510	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015065	ACTG	2	8	151697	151704	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015065	CGTG	2	8	151927	151934	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_015065	GTCA	2	8	152024	152031	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_015065	CGAT	2	8	153093	153100	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_015065	GCTG	2	8	153192	153199	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_015065	TCAA	2	8	161987	161994	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_015065	GGAT	2	8	163775	163782	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015065	GAGC	2	8	163787	163794	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_015065	GTGG	2	8	163917	163924	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015065	ACGG	2	8	164646	164653	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_015065	AGAT	2	8	167116	167123	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015065	ATTG	2	8	167185	167192	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015065	GCCA	2	8	167205	167212	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015065	CCAA	2	8	167255	167262	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_015065	GCCT	2	8	167328	167335	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015065	CTCG	2	8	168810	168817	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015065	CGAT	2	8	171563	171570	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_015065	GAGC	2	8	171708	171715	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_015065	GGCG	2	8	172356	172363	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
55	NC_015065	AGGT	2	8	172847	172854	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015065	GCGT	2	8	173041	173048	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_015065	GTTC	2	8	173078	173085	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_015065	TTCT	2	8	173086	173093	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_015065	GCCG	2	8	173096	173103	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_015065	CAGG	2	8	173123	173130	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_015065	CGTA	2	8	175525	175532	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_015065	AGGG	2	8	175561	175568	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015065	GGCC	2	8	175937	175944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_015065	TCGA	2	8	176559	176566	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_015065	CGCA	2	8	176781	176788	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_015065	ACTC	2	8	177178	177185	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_015065	ATTC	2	8	177328	177335	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_015065	CTTA	2	8	187495	187502	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_015065	CAGC	2	8	187618	187625	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_015065	CAGG	2	8	189811	189818	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_015065	CTTA	2	8	198378	198385	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_015065	ACCC	2	8	199430	199437	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
73	NC_015065	CGGT	2	8	200620	200627	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_015065	CAGA	2	8	200630	200637	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_015065	CTCC	2	8	200665	200672	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
76	NC_015065	CCCA	2	8	200684	200691	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
77	NC_015065	CTGC	2	8	201912	201919	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_015065	CGCC	2	8	206564	206571	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
79	NC_015065	GCCA	2	8	211967	211974	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015065	AGCA	2	8	212022	212029	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015065	AAAT	2	8	219676	219683	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015065	AGCT	2	8	225224	225231	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_015065	GAAG	2	8	229224	229231	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015065	CCTG	2	8	229444	229451	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_015065	CTAT	2	8	232205	232212	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_015065	ACGA	2	8	239297	239304	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_015065	ATTG	2	8	239535	239542	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015065	GAAC	2	8	239647	239654	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_015065	CGGA	2	8	248612	248619	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_015065	CTTC	2	8	264120	264127	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_015065	GGGC	2	8	264142	264149	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
92	NC_015065	GATG	2	8	264378	264385	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015065	CTGC	2	8	265553	265560	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_015065	TTTG	2	8	265774	265781	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015065	CTCG	2	8	266932	266939	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_015065	CTGA	2	8	267178	267185	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_015065	CGGC	2	8	267680	267687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_015065	GGAA	2	8	267758	267765	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015065	GAGC	2	8	269662	269669	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_015065	TTCT	2	8	270718	270725	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_015065	AGTT	2	8	272420	272427	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015065	GGAT	2	8	272926	272933	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015065	GATG	2	8	272953	272960	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015065	TGGG	2	8	276640	276647	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015065	CAGG	2	8	276656	276663	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_015065	TCGT	2	8	276668	276675	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_015065	AGGA	2	8	278999	279006	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015065	AGAA	2	8	281538	281545	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015065	AGGG	2	8	283952	283959	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015065	TGGA	2	8	287013	287020	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015065	ACGG	2	8	290691	290698	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_015065	CCGT	2	8	290708	290715	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_015065	GTGA	2	8	295690	295697	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015065	GTGG	2	8	298991	298998	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015065	CTTC	2	8	299122	299129	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_015065	GGCC	2	8	299503	299510	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_015065	GGCG	2	8	299737	299744	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
118	NC_015065	GACT	2	8	300260	300267	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.