MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 plasmid pRAHAQ02

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015063	CGGGG	2	10	4957	4966	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
2	NC_015063	CAGGT	2	10	11083	11092	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_015063	CCTTT	2	10	13620	13629	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_015063	CGACA	2	10	15238	15247	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_015063	TGCCG	2	10	16095	16104	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_015063	CATTT	2	10	30039	30048	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_015063	AGAAA	2	10	30248	30257	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015063	AATAT	2	10	37106	37115	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015063	CCCGT	2	10	37158	37167	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
10	NC_015063	GAGAA	2	10	41604	41613	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015063	CCATT	2	10	41703	41712	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_015063	ATTTT	2	10	42436	42445	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015063	AGCAG	2	10	43795	43804	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_015063	AAAAC	2	10	44675	44684	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_015063	AACAG	2	10	52541	52550	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_015063	GATAA	2	10	62127	62136	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015063	CATTG	2	10	65500	65509	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_015063	AAAAC	2	10	71288	71297	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_015063	TATGC	2	10	75010	75019	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_015063	CCCAG	2	10	75288	75297	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
21	NC_015063	TGTTT	2	10	75309	75318	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015063	TAATA	2	10	77254	77263	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015063	GTTCA	2	10	99989	99998	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_015063	ATGTT	2	10	103839	103848	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015063	ATAAA	2	10	108871	108880	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015063	CGGGT	2	10	109205	109214	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
27	NC_015063	TGAGT	2	10	115995	116004	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015063	AAGCA	2	10	119058	119067	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_015063	AGCGC	2	10	119323	119332	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_015063	GCAGG	2	10	119679	119688	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_015063	TCCAA	2	10	121974	121983	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_015063	GGATG	2	10	126754	126763	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015063	TGCTT	2	10	128632	128641	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_015063	TGCAC	2	10	128651	128660	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_015063	TGCAG	2	10	128688	128697	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.