MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 plasmid pRAHAQ02

Total Repeats: 1228

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015063	ATG	2	6	547	552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836371
2	NC_015063	CGC	2	6	615	620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322836371
3	NC_015063	TCG	2	6	647	652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836371
4	NC_015063	TCG	2	6	752	757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836371
5	NC_015063	GAA	2	6	790	795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322836371
6	NC_015063	ACT	2	6	894	899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322836371
7	NC_015063	TAT	2	6	976	981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322836371
8	NC_015063	CAG	2	6	1082	1087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836371
9	NC_015063	AAC	2	6	1102	1107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322836371
10	NC_015063	GCC	2	6	1126	1131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322836371
11	NC_015063	GCT	2	6	1237	1242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836371
12	NC_015063	CGA	2	6	1440	1445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836371
13	NC_015063	TCC	2	6	1542	1547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322836371
14	NC_015063	AAG	2	6	1645	1650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322836371
15	NC_015063	GAA	2	6	1669	1674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322836372
16	NC_015063	TCG	2	6	1723	1728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836372
17	NC_015063	ACG	2	6	1741	1746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836372
18	NC_015063	TGA	2	6	1800	1805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836372
19	NC_015063	CAG	2	6	1850	1855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836372
20	NC_015063	AAT	2	6	1960	1965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322836372
21	NC_015063	GCA	2	6	2004	2009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836372
22	NC_015063	TGA	2	6	2028	2033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836372
23	NC_015063	GCG	2	6	2040	2045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322836372
24	NC_015063	TCG	2	6	2085	2090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836372
25	NC_015063	GGC	2	6	2131	2136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322836372
26	NC_015063	CAT	2	6	2233	2238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322836372
27	NC_015063	CCT	2	6	2350	2355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322836372
28	NC_015063	GTG	2	6	2466	2471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322836372
29	NC_015063	TGC	2	6	2497	2502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836372
30	NC_015063	TCC	2	6	2556	2561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322836372
31	NC_015063	GAT	2	6	2586	2591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836372
32	NC_015063	TCT	2	6	2604	2609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322836373
33	NC_015063	CAG	2	6	2666	2671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836373
34	NC_015063	TCG	2	6	2807	2812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836373
35	NC_015063	TGC	3	9	2876	2884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836373
36	NC_015063	CCA	2	6	2896	2901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322836373
37	NC_015063	ATA	2	6	2902	2907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322836373
38	NC_015063	GCT	2	6	2946	2951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836373
39	NC_015063	CAA	2	6	3086	3091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322836373
40	NC_015063	TAT	2	6	3114	3119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322836373
41	NC_015063	TCT	2	6	3213	3218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322836373
42	NC_015063	CGG	2	6	3278	3283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322836373
43	NC_015063	TTC	2	6	3301	3306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322836373
44	NC_015063	TCC	2	6	3393	3398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322836374
45	NC_015063	TCA	2	6	3433	3438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322836374
46	NC_015063	GTT	2	6	3662	3667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322836374
47	NC_015063	GCC	2	6	3684	3689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322836374
48	NC_015063	TCG	2	6	3766	3771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836374
49	NC_015063	GCG	2	6	3788	3793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322836374
50	NC_015063	GGC	2	6	3813	3818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322836374
51	NC_015063	CAA	2	6	3853	3858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322836374
52	NC_015063	TGA	2	6	3878	3883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836374
53	NC_015063	CAC	2	6	3962	3967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322836374
54	NC_015063	CAC	2	6	4057	4062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322836374
55	NC_015063	TCG	2	6	4093	4098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836374
56	NC_015063	TCC	2	6	4392	4397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322836374
57	NC_015063	CCG	2	6	4398	4403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322836374
58	NC_015063	AAT	2	6	4465	4470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322836374
59	NC_015063	TTG	2	6	4662	4667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322836375
60	NC_015063	AAC	2	6	5909	5914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322836376
61	NC_015063	AGC	2	6	5919	5924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836376
62	NC_015063	CCT	2	6	6034	6039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322836376
63	NC_015063	TGC	2	6	6098	6103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836376
64	NC_015063	GGC	2	6	6245	6250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322836376
65	NC_015063	GCT	2	6	6318	6323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836376
66	NC_015063	GAT	2	6	6343	6348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836376
67	NC_015063	CTG	2	6	6443	6448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836376
68	NC_015063	TTA	2	6	6517	6522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322836376
69	NC_015063	AGA	2	6	6543	6548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322836376
70	NC_015063	TTG	2	6	6751	6756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322836376
71	NC_015063	TTC	2	6	6907	6912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322836376
72	NC_015063	TGA	2	6	6958	6963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836376
73	NC_015063	GAA	2	6	7184	7189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322836377
74	NC_015063	CAT	2	6	7322	7327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322836377
75	NC_015063	ATT	2	6	7665	7670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322836377
76	NC_015063	CAT	2	6	7762	7767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322836377
77	NC_015063	ATG	2	6	7778	7783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836377
78	NC_015063	GAT	2	6	7826	7831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836377
79	NC_015063	ATT	2	6	7922	7927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322836377
80	NC_015063	AGC	2	6	8222	8227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836378
81	NC_015063	GTC	2	6	8230	8235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836378
82	NC_015063	TCG	2	6	8244	8249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836378
83	NC_015063	GCT	2	6	8379	8384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836378
84	NC_015063	TCT	2	6	8457	8462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322836378
85	NC_015063	CTT	2	6	8527	8532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322836378
86	NC_015063	GGC	2	6	8577	8582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322836378
87	NC_015063	TGC	2	6	8629	8634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836378
88	NC_015063	TCG	2	6	8642	8647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836378
89	NC_015063	TAG	2	6	8660	8665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836378
90	NC_015063	GAC	2	6	8752	8757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836378
91	NC_015063	CAC	2	6	8758	8763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322836378
92	NC_015063	GAT	2	6	8923	8928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836378
93	NC_015063	CAG	2	6	9159	9164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836379
94	NC_015063	CGC	2	6	9176	9181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322836379
95	NC_015063	AGG	2	6	9250	9255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322836379
96	NC_015063	TCC	2	6	9277	9282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322836379
97	NC_015063	CTG	2	6	9306	9311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836379
98	NC_015063	CGG	2	6	9336	9341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322836379
99	NC_015063	CGG	2	6	9410	9415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322836379
100	NC_015063	GAG	2	6	9469	9474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322836379
101	NC_015063	CTT	2	6	9498	9503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322836379
102	NC_015063	ATG	2	6	9616	9621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836379
103	NC_015063	GTT	2	6	9627	9632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322836379
104	NC_015063	GAT	2	6	9780	9785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836379
105	NC_015063	TTG	2	6	9790	9795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322836379
106	NC_015063	TGA	2	6	9851	9856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836379
107	NC_015063	AAG	2	6	10125	10130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322836380
108	NC_015063	TGC	2	6	10405	10410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836380
109	NC_015063	CAC	2	6	10451	10456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322836380
110	NC_015063	GAC	2	6	10458	10463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836380
111	NC_015063	TTC	2	6	10464	10469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322836380
112	NC_015063	CTG	2	6	10477	10482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836380
113	NC_015063	TGA	2	6	11879	11884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836382
114	NC_015063	ATG	2	6	11998	12003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836382
115	NC_015063	CAC	2	6	12098	12103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322836382
116	NC_015063	CAC	2	6	12282	12287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322836383
117	NC_015063	GGT	2	6	12337	12342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322836383
118	NC_015063	ATC	2	6	12394	12399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322836383
119	NC_015063	ATC	2	6	12415	12420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322836383
120	NC_015063	TGG	2	6	12441	12446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322836383
121	NC_015063	CTG	2	6	12459	12464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836383
122	NC_015063	CAA	2	6	12465	12470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322836383
123	NC_015063	CGC	2	6	12657	12662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322836384
124	NC_015063	CAT	2	6	12677	12682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322836384
125	NC_015063	CAT	2	6	12706	12711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322836384
126	NC_015063	GAC	2	6	12738	12743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836384
127	NC_015063	AGT	2	6	12920	12925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836384
128	NC_015063	CGG	2	6	12928	12933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322836384
129	NC_015063	ATC	2	6	12938	12943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322836384
130	NC_015063	CCT	2	6	12949	12954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322836384
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151	NC_015063	TCA	2	6	15735	15740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322836389
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243	NC_015063	TCA	2	6	24868	24873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322836401
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248	NC_015063	CCA	2	6	25229	25234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322836401
249	NC_015063	CAC	2	6	25428	25433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322836401
250	NC_015063	AGA	2	6	25491	25496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322836401
251	NC_015063	GCT	2	6	25595	25600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836401
252	NC_015063	TCA	2	6	25726	25731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322836401
253	NC_015063	TAT	2	6	25763	25768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322836401
254	NC_015063	ATA	2	6	26933	26938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322836402
255	NC_015063	CAG	2	6	26993	26998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836402
256	NC_015063	CAT	2	6	27105	27110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322836402
257	NC_015063	GTG	2	6	27329	27334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322836402
258	NC_015063	TGC	2	6	27425	27430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836403
259	NC_015063	AGA	2	6	27550	27555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322836403
260	NC_015063	CTG	2	6	27925	27930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836404
261	NC_015063	GGC	2	6	28308	28313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322836404
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266	NC_015063	TGA	2	6	29405	29410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836405
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270	NC_015063	TCA	2	6	29664	29669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322836405
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274	NC_015063	CTT	2	6	30793	30798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322836406
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376	NC_015063	GAT	2	6	40899	40904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836413
377	NC_015063	TGA	2	6	40924	40929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836413
378	NC_015063	GCA	2	6	40997	41002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836413
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380	NC_015063	CGG	2	6	41055	41060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322836413
381	NC_015063	GCT	2	6	41093	41098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836413
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385	NC_015063	TGA	2	6	42037	42042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836415
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405	NC_015063	TCT	2	6	43359	43364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322836417
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495	NC_015063	TAT	2	6	59569	59574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322836426
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499	NC_015063	TTA	2	6	60024	60029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322836426
500	NC_015063	GAA	2	6	60089	60094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322836426

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