MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rahnella sp. Y9602 plasmid pRAHAQ02

Total Repeats: 217

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015063	GA	3	6	541	546	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015063	CT	3	6	1931	1936	0 %	50 %	0 %	50 %	322836372
3	NC_015063	AT	3	6	2981	2986	50 %	50 %	0 %	0 %	322836373
4	NC_015063	AG	3	6	3248	3253	50 %	0 %	50 %	0 %	322836373
5	NC_015063	AG	4	8	3367	3374	50 %	0 %	50 %	0 %	322836373
6	NC_015063	GA	3	6	3599	3604	50 %	0 %	50 %	0 %	322836374
7	NC_015063	CG	3	6	4405	4410	0 %	0 %	50 %	50 %	322836374
8	NC_015063	CG	3	6	5496	5501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015063	CA	3	6	6466	6471	50 %	0 %	0 %	50 %	322836376
10	NC_015063	AT	3	6	7813	7818	50 %	50 %	0 %	0 %	322836377
11	NC_015063	CT	3	6	8812	8817	0 %	50 %	0 %	50 %	322836378
12	NC_015063	CG	3	6	8844	8849	0 %	0 %	50 %	50 %	322836378
13	NC_015063	CG	3	6	10032	10037	0 %	0 %	50 %	50 %	322836380
14	NC_015063	TG	4	8	11142	11149	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015063	TC	3	6	11182	11187	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_015063	CA	3	6	11353	11358	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015063	GA	4	8	11683	11690	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015063	GT	3	6	11770	11775	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015063	GC	3	6	13209	13214	0 %	0 %	50 %	50 %	322836385
20	NC_015063	AC	3	6	13641	13646	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_015063	GC	3	6	14016	14021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015063	CG	3	6	14407	14412	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015063	GT	3	6	14683	14688	0 %	50 %	50 %	0 %	322836388
24	NC_015063	GC	3	6	14823	14828	0 %	0 %	50 %	50 %	322836388
25	NC_015063	GA	3	6	15626	15631	50 %	0 %	50 %	0 %	322836389
26	NC_015063	GT	3	6	15763	15768	0 %	50 %	50 %	0 %	322836389
27	NC_015063	TA	3	6	16471	16476	50 %	50 %	0 %	0 %	322836390
28	NC_015063	GC	4	8	16688	16695	0 %	0 %	50 %	50 %	322836391
29	NC_015063	CG	3	6	19181	19186	0 %	0 %	50 %	50 %	322836394
30	NC_015063	AG	3	6	19512	19517	50 %	0 %	50 %	0 %	322836394
31	NC_015063	GC	3	6	22418	22423	0 %	0 %	50 %	50 %	322836398
32	NC_015063	TC	3	6	22848	22853	0 %	50 %	0 %	50 %	322836398
33	NC_015063	AG	3	6	23166	23171	50 %	0 %	50 %	0 %	322836398
34	NC_015063	GC	3	6	24717	24722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015063	AT	3	6	25845	25850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015063	TA	3	6	26515	26520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015063	AG	3	6	27378	27383	50 %	0 %	50 %	0 %	322836403
38	NC_015063	TG	3	6	27544	27549	0 %	50 %	50 %	0 %	322836403
39	NC_015063	CG	3	6	28218	28223	0 %	0 %	50 %	50 %	322836404
40	NC_015063	CG	3	6	28555	28560	0 %	0 %	50 %	50 %	322836404
41	NC_015063	CA	3	6	28747	28752	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015063	TC	3	6	28803	28808	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015063	GA	3	6	30029	30034	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015063	TG	3	6	30152	30157	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015063	CA	3	6	30586	30591	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_015063	TC	4	8	30822	30829	0 %	50 %	0 %	50 %	322836406
47	NC_015063	CT	3	6	31794	31799	0 %	50 %	0 %	50 %	322836407
48	NC_015063	AT	3	6	32680	32685	50 %	50 %	0 %	0 %	322836408
49	NC_015063	GC	3	6	33004	33009	0 %	0 %	50 %	50 %	322836408
50	NC_015063	CT	3	6	33098	33103	0 %	50 %	0 %	50 %	322836408
51	NC_015063	TC	3	6	33225	33230	0 %	50 %	0 %	50 %	322836408
52	NC_015063	GC	3	6	33555	33560	0 %	0 %	50 %	50 %	322836408
53	NC_015063	GC	3	6	33835	33840	0 %	0 %	50 %	50 %	322836408
54	NC_015063	AT	4	8	36277	36284	50 %	50 %	0 %	0 %	322836411
55	NC_015063	AC	3	6	39794	39799	50 %	0 %	0 %	50 %	322836412
56	NC_015063	GT	3	6	40742	40747	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015063	TC	3	6	41460	41465	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015063	TG	3	6	41769	41774	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015063	GC	3	6	41928	41933	0 %	0 %	50 %	50 %	322836415
60	NC_015063	TA	3	6	42534	42539	50 %	50 %	0 %	0 %	322836416
61	NC_015063	TC	3	6	43774	43779	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015063	AG	3	6	44327	44332	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015063	AT	3	6	44588	44593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015063	AT	3	6	46807	46812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015063	AC	3	6	47657	47662	50 %	0 %	0 %	50 %	322836421
66	NC_015063	AC	3	6	47849	47854	50 %	0 %	0 %	50 %	322836421
67	NC_015063	TC	3	6	48370	48375	0 %	50 %	0 %	50 %	322836421
68	NC_015063	CT	3	6	49204	49209	0 %	50 %	0 %	50 %	322836421
69	NC_015063	CA	3	6	49545	49550	50 %	0 %	0 %	50 %	322836421
70	NC_015063	TA	3	6	49954	49959	50 %	50 %	0 %	0 %	322836421
71	NC_015063	TC	3	6	50311	50316	0 %	50 %	0 %	50 %	322836421
72	NC_015063	TA	3	6	50359	50364	50 %	50 %	0 %	0 %	322836421
73	NC_015063	GA	4	8	52234	52241	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015063	GT	3	6	52493	52498	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015063	AC	3	6	52602	52607	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015063	AT	3	6	53020	53025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015063	AT	3	6	54512	54517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015063	AT	3	6	55037	55042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015063	TC	3	6	55886	55891	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015063	AG	3	6	57520	57525	50 %	0 %	50 %	0 %	322836423
81	NC_015063	AT	3	6	58082	58087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015063	AT	3	6	58556	58561	50 %	50 %	0 %	0 %	322836424
83	NC_015063	TG	3	6	58649	58654	0 %	50 %	50 %	0 %	322836425
84	NC_015063	AT	3	6	59480	59485	50 %	50 %	0 %	0 %	322836426
85	NC_015063	AT	3	6	61173	61178	50 %	50 %	0 %	0 %	322836427
86	NC_015063	CG	3	6	62878	62883	0 %	0 %	50 %	50 %	322836429
87	NC_015063	CG	3	6	64874	64879	0 %	0 %	50 %	50 %	322836431
88	NC_015063	GA	3	6	65584	65589	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015063	CG	3	6	65835	65840	0 %	0 %	50 %	50 %	322836432
90	NC_015063	TA	3	6	65867	65872	50 %	50 %	0 %	0 %	322836432
91	NC_015063	AG	4	8	65994	66001	50 %	0 %	50 %	0 %	322836432
92	NC_015063	GA	3	6	66309	66314	50 %	0 %	50 %	0 %	322836432
93	NC_015063	TA	3	6	66946	66951	50 %	50 %	0 %	0 %	322836432
94	NC_015063	TA	3	6	66975	66980	50 %	50 %	0 %	0 %	322836432
95	NC_015063	AT	3	6	67226	67231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015063	TA	3	6	67693	67698	50 %	50 %	0 %	0 %	322836433
97	NC_015063	TA	3	6	68475	68480	50 %	50 %	0 %	0 %	322836434
98	NC_015063	AC	3	6	69523	69528	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_015063	TC	3	6	70046	70051	0 %	50 %	0 %	50 %	322836435
100	NC_015063	AT	3	6	71606	71611	50 %	50 %	0 %	0 %	322836436
101	NC_015063	TC	3	6	71638	71643	0 %	50 %	0 %	50 %	322836436
102	NC_015063	CA	3	6	72076	72081	50 %	0 %	0 %	50 %	322836436
103	NC_015063	AG	3	6	73682	73687	50 %	0 %	50 %	0 %	322836436
104	NC_015063	AT	3	6	73752	73757	50 %	50 %	0 %	0 %	322836437
105	NC_015063	AG	3	6	74071	74076	50 %	0 %	50 %	0 %	322836437
106	NC_015063	TG	4	8	74284	74291	0 %	50 %	50 %	0 %	322836437
107	NC_015063	AG	3	6	74320	74325	50 %	0 %	50 %	0 %	322836437
108	NC_015063	GC	3	6	74482	74487	0 %	0 %	50 %	50 %	322836437
109	NC_015063	GC	3	6	75116	75121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_015063	TA	4	8	75682	75689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015063	AT	4	8	75961	75968	50 %	50 %	0 %	0 %	322836438
112	NC_015063	TA	3	6	76225	76230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015063	TA	3	6	76339	76344	50 %	50 %	0 %	0 %	322836439
114	NC_015063	AT	3	6	76384	76389	50 %	50 %	0 %	0 %	322836439
115	NC_015063	GT	3	6	77890	77895	0 %	50 %	50 %	0 %	322836440
116	NC_015063	GC	3	6	77994	77999	0 %	0 %	50 %	50 %	322836440
117	NC_015063	GC	3	6	78320	78325	0 %	0 %	50 %	50 %	322836440
118	NC_015063	TG	3	6	78739	78744	0 %	50 %	50 %	0 %	322836441
119	NC_015063	CT	4	8	78761	78768	0 %	50 %	0 %	50 %	322836441
120	NC_015063	CG	3	6	79523	79528	0 %	0 %	50 %	50 %	322836442
121	NC_015063	CT	3	6	80282	80287	0 %	50 %	0 %	50 %	322836442
122	NC_015063	GT	3	6	80509	80514	0 %	50 %	50 %	0 %	322836443
123	NC_015063	AG	3	6	82683	82688	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015063	GA	3	6	83321	83326	50 %	0 %	50 %	0 %	322836447
125	NC_015063	CA	3	6	83342	83347	50 %	0 %	0 %	50 %	322836447
126	NC_015063	TA	3	6	83981	83986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015063	TG	3	6	84159	84164	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015063	TA	4	8	84490	84497	50 %	50 %	0 %	0 %	322836448
129	NC_015063	GT	3	6	84844	84849	0 %	50 %	50 %	0 %	322836448
130	NC_015063	TG	3	6	85493	85498	0 %	50 %	50 %	0 %	322836448
131	NC_015063	TC	3	6	86022	86027	0 %	50 %	0 %	50 %	322836448
132	NC_015063	CT	3	6	86257	86262	0 %	50 %	0 %	50 %	322836448
133	NC_015063	CT	3	6	86989	86994	0 %	50 %	0 %	50 %	322836448
134	NC_015063	CG	3	6	87847	87852	0 %	0 %	50 %	50 %	322836449
135	NC_015063	TC	3	6	88233	88238	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_015063	GC	3	6	88358	88363	0 %	0 %	50 %	50 %	322836450
137	NC_015063	TC	4	8	89331	89338	0 %	50 %	0 %	50 %	322836451
138	NC_015063	GC	3	6	89949	89954	0 %	0 %	50 %	50 %	322836452
139	NC_015063	CT	3	6	90073	90078	0 %	50 %	0 %	50 %	322836452
140	NC_015063	GC	3	6	90104	90109	0 %	0 %	50 %	50 %	322836452
141	NC_015063	GT	3	6	90584	90589	0 %	50 %	50 %	0 %	322836452
142	NC_015063	GC	3	6	90718	90723	0 %	0 %	50 %	50 %	322836452
143	NC_015063	GC	3	6	91925	91930	0 %	0 %	50 %	50 %	322836453
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145	NC_015063	AC	3	6	92429	92434	50 %	0 %	0 %	50 %	322836454
146	NC_015063	GC	3	6	92821	92826	0 %	0 %	50 %	50 %	322836454
147	NC_015063	TG	3	6	93709	93714	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.