MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 plasmid pRAHAQ02

Total Repeats: 150

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015063	CT	3	6	1931	1936	0 %	50 %	0 %	50 %	322836372
2	NC_015063	AT	3	6	2981	2986	50 %	50 %	0 %	0 %	322836373
3	NC_015063	AG	3	6	3248	3253	50 %	0 %	50 %	0 %	322836373
4	NC_015063	AG	4	8	3367	3374	50 %	0 %	50 %	0 %	322836373
5	NC_015063	GA	3	6	3599	3604	50 %	0 %	50 %	0 %	322836374
6	NC_015063	CG	3	6	4405	4410	0 %	0 %	50 %	50 %	322836374
7	NC_015063	CA	3	6	6466	6471	50 %	0 %	0 %	50 %	322836376
8	NC_015063	AT	3	6	7813	7818	50 %	50 %	0 %	0 %	322836377
9	NC_015063	CT	3	6	8812	8817	0 %	50 %	0 %	50 %	322836378
10	NC_015063	CG	3	6	8844	8849	0 %	0 %	50 %	50 %	322836378
11	NC_015063	CG	3	6	10032	10037	0 %	0 %	50 %	50 %	322836380
12	NC_015063	GC	3	6	13209	13214	0 %	0 %	50 %	50 %	322836385
13	NC_015063	GT	3	6	14683	14688	0 %	50 %	50 %	0 %	322836388
14	NC_015063	GC	3	6	14823	14828	0 %	0 %	50 %	50 %	322836388
15	NC_015063	GA	3	6	15626	15631	50 %	0 %	50 %	0 %	322836389
16	NC_015063	GT	3	6	15763	15768	0 %	50 %	50 %	0 %	322836389
17	NC_015063	TA	3	6	16471	16476	50 %	50 %	0 %	0 %	322836390
18	NC_015063	GC	4	8	16688	16695	0 %	0 %	50 %	50 %	322836391
19	NC_015063	CG	3	6	19181	19186	0 %	0 %	50 %	50 %	322836394
20	NC_015063	AG	3	6	19512	19517	50 %	0 %	50 %	0 %	322836394
21	NC_015063	GC	3	6	22418	22423	0 %	0 %	50 %	50 %	322836398
22	NC_015063	TC	3	6	22848	22853	0 %	50 %	0 %	50 %	322836398
23	NC_015063	AG	3	6	23166	23171	50 %	0 %	50 %	0 %	322836398
24	NC_015063	AG	3	6	27378	27383	50 %	0 %	50 %	0 %	322836403
25	NC_015063	TG	3	6	27544	27549	0 %	50 %	50 %	0 %	322836403
26	NC_015063	CG	3	6	28218	28223	0 %	0 %	50 %	50 %	322836404
27	NC_015063	CG	3	6	28555	28560	0 %	0 %	50 %	50 %	322836404
28	NC_015063	TC	4	8	30822	30829	0 %	50 %	0 %	50 %	322836406
29	NC_015063	CT	3	6	31794	31799	0 %	50 %	0 %	50 %	322836407
30	NC_015063	AT	3	6	32680	32685	50 %	50 %	0 %	0 %	322836408
31	NC_015063	GC	3	6	33004	33009	0 %	0 %	50 %	50 %	322836408
32	NC_015063	CT	3	6	33098	33103	0 %	50 %	0 %	50 %	322836408
33	NC_015063	TC	3	6	33225	33230	0 %	50 %	0 %	50 %	322836408
34	NC_015063	GC	3	6	33555	33560	0 %	0 %	50 %	50 %	322836408
35	NC_015063	GC	3	6	33835	33840	0 %	0 %	50 %	50 %	322836408
36	NC_015063	AT	4	8	36277	36284	50 %	50 %	0 %	0 %	322836411
37	NC_015063	AC	3	6	39794	39799	50 %	0 %	0 %	50 %	322836412
38	NC_015063	GC	3	6	41928	41933	0 %	0 %	50 %	50 %	322836415
39	NC_015063	TA	3	6	42534	42539	50 %	50 %	0 %	0 %	322836416
40	NC_015063	AC	3	6	47657	47662	50 %	0 %	0 %	50 %	322836421
41	NC_015063	AC	3	6	47849	47854	50 %	0 %	0 %	50 %	322836421
42	NC_015063	TC	3	6	48370	48375	0 %	50 %	0 %	50 %	322836421
43	NC_015063	CT	3	6	49204	49209	0 %	50 %	0 %	50 %	322836421
44	NC_015063	CA	3	6	49545	49550	50 %	0 %	0 %	50 %	322836421
45	NC_015063	TA	3	6	49954	49959	50 %	50 %	0 %	0 %	322836421
46	NC_015063	TC	3	6	50311	50316	0 %	50 %	0 %	50 %	322836421
47	NC_015063	TA	3	6	50359	50364	50 %	50 %	0 %	0 %	322836421
48	NC_015063	AG	3	6	57520	57525	50 %	0 %	50 %	0 %	322836423
49	NC_015063	AT	3	6	58556	58561	50 %	50 %	0 %	0 %	322836424
50	NC_015063	TG	3	6	58649	58654	0 %	50 %	50 %	0 %	322836425
51	NC_015063	AT	3	6	59480	59485	50 %	50 %	0 %	0 %	322836426
52	NC_015063	AT	3	6	61173	61178	50 %	50 %	0 %	0 %	322836427
53	NC_015063	CG	3	6	62878	62883	0 %	0 %	50 %	50 %	322836429
54	NC_015063	CG	3	6	64874	64879	0 %	0 %	50 %	50 %	322836431
55	NC_015063	CG	3	6	65835	65840	0 %	0 %	50 %	50 %	322836432
56	NC_015063	TA	3	6	65867	65872	50 %	50 %	0 %	0 %	322836432
57	NC_015063	AG	4	8	65994	66001	50 %	0 %	50 %	0 %	322836432
58	NC_015063	GA	3	6	66309	66314	50 %	0 %	50 %	0 %	322836432
59	NC_015063	TA	3	6	66946	66951	50 %	50 %	0 %	0 %	322836432
60	NC_015063	TA	3	6	66975	66980	50 %	50 %	0 %	0 %	322836432
61	NC_015063	TA	3	6	67693	67698	50 %	50 %	0 %	0 %	322836433
62	NC_015063	TA	3	6	68475	68480	50 %	50 %	0 %	0 %	322836434
63	NC_015063	TC	3	6	70046	70051	0 %	50 %	0 %	50 %	322836435
64	NC_015063	AT	3	6	71606	71611	50 %	50 %	0 %	0 %	322836436
65	NC_015063	TC	3	6	71638	71643	0 %	50 %	0 %	50 %	322836436
66	NC_015063	CA	3	6	72076	72081	50 %	0 %	0 %	50 %	322836436
67	NC_015063	AG	3	6	73682	73687	50 %	0 %	50 %	0 %	322836436
68	NC_015063	AT	3	6	73752	73757	50 %	50 %	0 %	0 %	322836437
69	NC_015063	AG	3	6	74071	74076	50 %	0 %	50 %	0 %	322836437
70	NC_015063	TG	4	8	74284	74291	0 %	50 %	50 %	0 %	322836437
71	NC_015063	AG	3	6	74320	74325	50 %	0 %	50 %	0 %	322836437
72	NC_015063	GC	3	6	74482	74487	0 %	0 %	50 %	50 %	322836437
73	NC_015063	AT	4	8	75961	75968	50 %	50 %	0 %	0 %	322836438
74	NC_015063	TA	3	6	76339	76344	50 %	50 %	0 %	0 %	322836439
75	NC_015063	AT	3	6	76384	76389	50 %	50 %	0 %	0 %	322836439
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77	NC_015063	GC	3	6	77994	77999	0 %	0 %	50 %	50 %	322836440
78	NC_015063	GC	3	6	78320	78325	0 %	0 %	50 %	50 %	322836440
79	NC_015063	TG	3	6	78739	78744	0 %	50 %	50 %	0 %	322836441
80	NC_015063	CT	4	8	78761	78768	0 %	50 %	0 %	50 %	322836441
81	NC_015063	CG	3	6	79523	79528	0 %	0 %	50 %	50 %	322836442
82	NC_015063	CT	3	6	80282	80287	0 %	50 %	0 %	50 %	322836442
83	NC_015063	GT	3	6	80509	80514	0 %	50 %	50 %	0 %	322836443
84	NC_015063	GA	3	6	83321	83326	50 %	0 %	50 %	0 %	322836447
85	NC_015063	CA	3	6	83342	83347	50 %	0 %	0 %	50 %	322836447
86	NC_015063	TA	4	8	84490	84497	50 %	50 %	0 %	0 %	322836448
87	NC_015063	GT	3	6	84844	84849	0 %	50 %	50 %	0 %	322836448
88	NC_015063	TG	3	6	85493	85498	0 %	50 %	50 %	0 %	322836448
89	NC_015063	TC	3	6	86022	86027	0 %	50 %	0 %	50 %	322836448
90	NC_015063	CT	3	6	86257	86262	0 %	50 %	0 %	50 %	322836448
91	NC_015063	CT	3	6	86989	86994	0 %	50 %	0 %	50 %	322836448
92	NC_015063	CG	3	6	87847	87852	0 %	0 %	50 %	50 %	322836449
93	NC_015063	GC	3	6	88358	88363	0 %	0 %	50 %	50 %	322836450
94	NC_015063	TC	4	8	89331	89338	0 %	50 %	0 %	50 %	322836451
95	NC_015063	GC	3	6	89949	89954	0 %	0 %	50 %	50 %	322836452
96	NC_015063	CT	3	6	90073	90078	0 %	50 %	0 %	50 %	322836452
97	NC_015063	GC	3	6	90104	90109	0 %	0 %	50 %	50 %	322836452
98	NC_015063	GT	3	6	90584	90589	0 %	50 %	50 %	0 %	322836452
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100	NC_015063	GC	3	6	91925	91930	0 %	0 %	50 %	50 %	322836453
101	NC_015063	TC	3	6	92214	92219	0 %	50 %	0 %	50 %	322836454
102	NC_015063	AC	3	6	92429	92434	50 %	0 %	0 %	50 %	322836454
103	NC_015063	GC	3	6	92821	92826	0 %	0 %	50 %	50 %	322836454
104	NC_015063	GT	3	6	94483	94488	0 %	50 %	50 %	0 %	322836456
105	NC_015063	CA	4	8	94591	94598	50 %	0 %	0 %	50 %	322836456
106	NC_015063	AT	3	6	94986	94991	50 %	50 %	0 %	0 %	322836456
107	NC_015063	AT	3	6	95354	95359	50 %	50 %	0 %	0 %	322836457
108	NC_015063	CA	3	6	95366	95371	50 %	0 %	0 %	50 %	322836457
109	NC_015063	GA	3	6	95869	95874	50 %	0 %	50 %	0 %	322836457
110	NC_015063	GC	3	6	98023	98028	0 %	0 %	50 %	50 %	322836459
111	NC_015063	AT	3	6	98768	98773	50 %	50 %	0 %	0 %	322836460
112	NC_015063	CT	3	6	99050	99055	0 %	50 %	0 %	50 %	322836460
113	NC_015063	CG	3	6	99330	99335	0 %	0 %	50 %	50 %	322836461
114	NC_015063	CA	3	6	99661	99666	50 %	0 %	0 %	50 %	322836461
115	NC_015063	AC	3	6	100075	100080	50 %	0 %	0 %	50 %	322836462
116	NC_015063	GT	3	6	100404	100409	0 %	50 %	50 %	0 %	322836462
117	NC_015063	TG	3	6	100654	100659	0 %	50 %	50 %	0 %	322836463
118	NC_015063	AT	3	6	103374	103379	50 %	50 %	0 %	0 %	322836466
119	NC_015063	TC	3	6	104209	104214	0 %	50 %	0 %	50 %	322836467
120	NC_015063	CG	3	6	104579	104584	0 %	0 %	50 %	50 %	322836467
121	NC_015063	GC	3	6	104797	104802	0 %	0 %	50 %	50 %	322836467
122	NC_015063	GC	3	6	106120	106125	0 %	0 %	50 %	50 %	322836469
123	NC_015063	GA	3	6	106280	106285	50 %	0 %	50 %	0 %	322836469
124	NC_015063	TG	3	6	106551	106556	0 %	50 %	50 %	0 %	322836470
125	NC_015063	AT	3	6	107948	107953	50 %	50 %	0 %	0 %	322836472
126	NC_015063	TA	3	6	109855	109860	50 %	50 %	0 %	0 %	322836473
127	NC_015063	AT	4	8	115277	115284	50 %	50 %	0 %	0 %	322836477
128	NC_015063	CT	3	6	116356	116361	0 %	50 %	0 %	50 %	322836478
129	NC_015063	TA	3	6	116948	116953	50 %	50 %	0 %	0 %	322836480
130	NC_015063	AG	3	6	117180	117185	50 %	0 %	50 %	0 %	322836480
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132	NC_015063	GC	3	6	118709	118714	0 %	0 %	50 %	50 %	322836482
133	NC_015063	AG	3	6	119802	119807	50 %	0 %	50 %	0 %	322836483
134	NC_015063	AT	3	6	119839	119844	50 %	50 %	0 %	0 %	322836483
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141	NC_015063	GC	3	6	128425	128430	0 %	0 %	50 %	50 %	322836488
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143	NC_015063	CG	3	6	128896	128901	0 %	0 %	50 %	50 %	322836489
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.