MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Rahnella sp. Y9602 plasmid pRAHAQ02

Total Repeats: 218

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015063	T	6	6	312	317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015063	T	6	6	2640	2645	0 %	100 %	0 %	0 %	322836373
3	NC_015063	T	6	6	4626	4631	0 %	100 %	0 %	0 %	322836375
4	NC_015063	T	6	6	7942	7947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015063	A	6	6	8080	8085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015063	T	8	8	8114	8121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015063	A	6	6	10012	10017	100 %	0 %	0 %	0 %	322836380
8	NC_015063	C	6	6	11098	11103	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9	NC_015063	T	6	6	11982	11987	0 %	100 %	0 %	0 %	322836382
10	NC_015063	T	6	6	12168	12173	0 %	100 %	0 %	0 %	322836382
11	NC_015063	A	7	7	12352	12358	100 %	0 %	0 %	0 %	322836383
12	NC_015063	A	7	7	14236	14242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015063	T	6	6	14458	14463	0 %	100 %	0 %	0 %	322836387
14	NC_015063	T	6	6	14646	14651	0 %	100 %	0 %	0 %	322836387
15	NC_015063	T	6	6	15484	15489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015063	A	7	7	18201	18207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015063	T	6	6	18374	18379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015063	T	6	6	18512	18517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015063	T	6	6	20026	20031	0 %	100 %	0 %	0 %	322836396
20	NC_015063	A	6	6	20300	20305	100 %	0 %	0 %	0 %	322836396
21	NC_015063	T	6	6	21127	21132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015063	T	6	6	21407	21412	0 %	100 %	0 %	0 %	322836397
23	NC_015063	A	7	7	23214	23220	100 %	0 %	0 %	0 %	322836398
24	NC_015063	A	6	6	23580	23585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015063	A	7	7	23858	23864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015063	T	6	6	24077	24082	0 %	100 %	0 %	0 %	322836399
27	NC_015063	T	7	7	24900	24906	0 %	100 %	0 %	0 %	322836401
28	NC_015063	A	7	7	25091	25097	100 %	0 %	0 %	0 %	322836401
29	NC_015063	T	6	6	25303	25308	0 %	100 %	0 %	0 %	322836401
30	NC_015063	T	7	7	25531	25537	0 %	100 %	0 %	0 %	322836401
31	NC_015063	T	6	6	25785	25790	0 %	100 %	0 %	0 %	322836401
32	NC_015063	T	6	6	25835	25840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015063	A	6	6	25857	25862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015063	C	6	6	26602	26607	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
35	NC_015063	A	6	6	26638	26643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015063	A	6	6	27409	27414	100 %	0 %	0 %	0 %	322836403
37	NC_015063	A	7	7	28681	28687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015063	A	6	6	28707	28712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015063	A	6	6	29000	29005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015063	A	6	6	29524	29529	100 %	0 %	0 %	0 %	322836405
41	NC_015063	A	6	6	30265	30270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015063	C	11	11	30561	30571	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
43	NC_015063	A	6	6	30746	30751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015063	A	6	6	30777	30782	100 %	0 %	0 %	0 %	322836406
45	NC_015063	T	6	6	33631	33636	0 %	100 %	0 %	0 %	322836408
46	NC_015063	G	6	6	34127	34132	0 %	0 %	100 %	0 %	322836408
47	NC_015063	G	6	6	34782	34787	0 %	0 %	100 %	0 %	322836408
48	NC_015063	A	7	7	34902	34908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015063	A	7	7	37508	37514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015063	T	6	6	37600	37605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015063	A	7	7	38048	38054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015063	A	6	6	39975	39980	100 %	0 %	0 %	0 %	322836412
53	NC_015063	A	6	6	40711	40716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015063	G	9	9	40872	40880	0 %	0 %	100 %	0 %	322836413
55	NC_015063	A	7	7	41445	41451	100 %	0 %	0 %	0 %	322836414
56	NC_015063	A	6	6	41803	41808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015063	A	6	6	41915	41920	100 %	0 %	0 %	0 %	322836415
58	NC_015063	A	6	6	42364	42369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015063	A	7	7	42376	42382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015063	A	6	6	43228	43233	100 %	0 %	0 %	0 %	322836416
61	NC_015063	T	6	6	43337	43342	0 %	100 %	0 %	0 %	322836417
62	NC_015063	T	6	6	43504	43509	0 %	100 %	0 %	0 %	322836417
63	NC_015063	A	6	6	43592	43597	100 %	0 %	0 %	0 %	322836417
64	NC_015063	T	6	6	43783	43788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015063	T	6	6	43987	43992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015063	T	7	7	44267	44273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015063	A	6	6	44284	44289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015063	T	6	6	44434	44439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015063	A	6	6	45128	45133	100 %	0 %	0 %	0 %	322836419
70	NC_015063	T	6	6	45673	45678	0 %	100 %	0 %	0 %	322836420
71	NC_015063	T	6	6	46287	46292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015063	T	6	6	46492	46497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015063	T	6	6	47050	47055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015063	T	6	6	47409	47414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015063	A	6	6	48560	48565	100 %	0 %	0 %	0 %	322836421
76	NC_015063	A	7	7	50410	50416	100 %	0 %	0 %	0 %	322836421
77	NC_015063	A	6	6	51731	51736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015063	A	9	9	52402	52410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015063	C	6	6	52417	52422	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
80	NC_015063	A	6	6	53215	53220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015063	A	6	6	53290	53295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015063	C	6	6	54321	54326	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
83	NC_015063	A	6	6	55013	55018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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88	NC_015063	A	7	7	60867	60873	100 %	0 %	0 %	0 %	322836427
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90	NC_015063	G	6	6	61160	61165	0 %	0 %	100 %	0 %	322836427
91	NC_015063	G	6	6	61631	61636	0 %	0 %	100 %	0 %	322836427
92	NC_015063	A	7	7	62384	62390	100 %	0 %	0 %	0 %	322836429
93	NC_015063	A	6	6	62864	62869	100 %	0 %	0 %	0 %	322836429
94	NC_015063	A	6	6	63102	63107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015063	T	7	7	63376	63382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015063	A	8	8	64301	64308	100 %	0 %	0 %	0 %	322836430
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98	NC_015063	T	7	7	65444	65450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015063	G	7	7	65604	65610	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015063	A	6	6	65966	65971	100 %	0 %	0 %	0 %	322836432
101	NC_015063	T	6	6	66545	66550	0 %	100 %	0 %	0 %	322836432
102	NC_015063	T	6	6	66842	66847	0 %	100 %	0 %	0 %	322836432
103	NC_015063	A	6	6	67067	67072	100 %	0 %	0 %	0 %	322836432
104	NC_015063	A	6	6	67110	67115	100 %	0 %	0 %	0 %	322836432
105	NC_015063	A	6	6	67118	67123	100 %	0 %	0 %	0 %	322836432
106	NC_015063	T	6	6	68171	68176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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108	NC_015063	A	7	7	69198	69204	100 %	0 %	0 %	0 %	322836434
109	NC_015063	T	6	6	69208	69213	0 %	100 %	0 %	0 %	322836434
110	NC_015063	T	6	6	69276	69281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015063	T	7	7	70246	70252	0 %	100 %	0 %	0 %	322836435
112	NC_015063	T	6	6	71756	71761	0 %	100 %	0 %	0 %	322836436
113	NC_015063	A	6	6	73156	73161	100 %	0 %	0 %	0 %	322836436
114	NC_015063	T	6	6	73673	73678	0 %	100 %	0 %	0 %	322836436
115	NC_015063	T	6	6	73763	73768	0 %	100 %	0 %	0 %	322836437
116	NC_015063	T	6	6	74562	74567	0 %	100 %	0 %	0 %	322836437
117	NC_015063	A	8	8	75346	75353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015063	A	6	6	75403	75408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015063	T	6	6	75437	75442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015063	T	6	6	75646	75651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015063	T	6	6	75719	75724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015063	A	7	7	75807	75813	100 %	0 %	0 %	0 %	322836438
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124	NC_015063	A	6	6	76408	76413	100 %	0 %	0 %	0 %	322836439
125	NC_015063	A	6	6	76416	76421	100 %	0 %	0 %	0 %	322836439
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129	NC_015063	A	6	6	76784	76789	100 %	0 %	0 %	0 %	322836439
130	NC_015063	T	8	8	76859	76866	0 %	100 %	0 %	0 %	322836439
131	NC_015063	T	6	6	77219	77224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015063	T	6	6	78997	79002	0 %	100 %	0 %	0 %	322836441
133	NC_015063	A	6	6	79426	79431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015063	A	6	6	80525	80530	100 %	0 %	0 %	0 %	322836443
135	NC_015063	A	6	6	80933	80938	100 %	0 %	0 %	0 %	322836443
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149	NC_015063	A	6	6	92086	92091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.