MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 plasmid pRAHAQ01

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015062	ATCGGT	2	12	68532	68543	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_015062	TCAGCC	2	12	105989	106000	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015062	CTATAT	2	12	106117	106128	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_015062	TTAATT	2	12	178420	178431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015062	CCACTC	2	12	195578	195589	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_015062	TCAAGG	2	12	203109	203120	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_015062	TAAAAT	2	12	284242	284253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015062	TTTATT	2	12	295906	295917	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015062	TCAGGA	2	12	297672	297683	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_015062	TTATTT	2	12	301835	301846	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015062	TATTGA	2	12	359324	359335	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015062	AGTGTG	2	12	361317	361328	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015062	AATGAT	2	12	414302	414313	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015062	AGGTAC	2	12	503479	503490	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_015062	TTTCAT	2	12	590761	590772	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_015062	CCCAAT	2	12	591027	591038	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015062	GTTATT	2	12	598636	598647	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015062	TTGATC	2	12	598721	598732	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.