Hexa-nucleotide Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 plasmid pRAHAQ01

Total Repeats: 211

Go To Repeat Summary Page

Download The Result in

S.No.Genome IDMotifIterationsLengthStartEndA%T%G%C% Protein ID
1NC_015062TCCTGA2123019303016.67 %33.33 %16.67 %33.33 %322835128
2NC_015062CGCCAG2123678368916.67 %0 %33.33 %50 %322835128
3NC_015062CTGCTT212630763180 %50 %16.67 %33.33 %322835131
4NC_015062CTGATG212139651397616.67 %33.33 %33.33 %16.67 %322835139
5NC_015062TGCCGT21215106151170 %33.33 %33.33 %33.33 %322835140
6NC_015062CCAGCG212152051521616.67 %0 %33.33 %50 %322835140
7NC_015062CATCGA212153131532433.33 %16.67 %16.67 %33.33 %322835140
8NC_015062CAGCAC212169691698033.33 %0 %16.67 %50 %322835142
9NC_015062GTTTTC21219784197950 %66.67 %16.67 %16.67 %322835143
10NC_015062CATTAA212203682037950 %33.33 %0 %16.67 %322835143
11NC_015062ATAACG212216822169350 %16.67 %16.67 %16.67 %322835145
12NC_015062CAGCGC212246522466316.67 %0 %33.33 %50 %322835147
13NC_015062TACCGA212249122492333.33 %16.67 %16.67 %33.33 %322835147
14NC_015062TTTTTA212295782958916.67 %83.33 %0 %0 %322835152
15NC_015062GTTTTT21233569335800 %83.33 %16.67 %0 %322835156
16NC_015062TGCTGG21236409364200 %33.33 %50 %16.67 %322835158
17NC_015062CAGGGT212398113982216.67 %16.67 %50 %16.67 %322835161
18NC_015062TGCCGT21240341403520 %33.33 %33.33 %33.33 %322835162
19NC_015062AACTGC212408994091033.33 %16.67 %16.67 %33.33 %322835162
20NC_015062GTGCCG21241582415930 %16.67 %50 %33.33 %322835162
21NC_015062CCTGCG21242964429750 %16.67 %33.33 %50 %322835162
22NC_015062AGCCGG212435894360016.67 %0 %50 %33.33 %322835163
23NC_015062TGGTAT212447694478016.67 %50 %33.33 %0 %322835163
24NC_015062CCTGAT212466464665716.67 %33.33 %16.67 %33.33 %322835164
25NC_015062CGCTTC21253060530710 %33.33 %16.67 %50 %322835170
26NC_015062AAATAA212595285953983.33 %16.67 %0 %0 %322835178
27NC_015062TCGATG212602246023516.67 %33.33 %33.33 %16.67 %322835178
28NC_015062AGATGA212615106152150 %16.67 %33.33 %0 %322835179
29NC_015062CGTCTG21263698637090 %33.33 %33.33 %33.33 %322835179
30NC_015062GAGATG212662676627833.33 %16.67 %50 %0 %322835182
31NC_015062TGACTT212694476945816.67 %50 %16.67 %16.67 %322835186
32NC_015062AAAATA212697556976683.33 %16.67 %0 %0 %322835186
33NC_015062TACGAT212698926990333.33 %33.33 %16.67 %16.67 %322835186
34NC_015062TGGCGG21270849708600 %16.67 %66.67 %16.67 %322835187
35NC_015062TACCGT212713147132516.67 %33.33 %16.67 %33.33 %322835187
36NC_015062GTACCG212720547206516.67 %16.67 %33.33 %33.33 %322835187
37NC_015062TTTGAA212725697258033.33 %50 %16.67 %0 %322835189
38NC_015062GGTTGC21276694767050 %33.33 %50 %16.67 %322835190
39NC_015062GCCGCT21279103791140 %16.67 %33.33 %50 %322835194
40NC_015062CCAGGC212825758258616.67 %0 %33.33 %50 %322835196
41NC_015062GTCGGC21284275842860 %16.67 %50 %33.33 %322835199
42NC_015062ACGCCG212870378704816.67 %0 %33.33 %50 %322835204
43NC_015062ATAAAT212880388804966.67 %33.33 %0 %0 %322835204
44NC_015062TTGAGT212923789238916.67 %50 %33.33 %0 %322835208
45NC_015062GCTCAT212971049711516.67 %33.33 %16.67 %33.33 %322835216
46NC_015062TCCCCT21298256982670 %33.33 %0 %66.67 %322835217
47NC_015062GCCAGC212991389914916.67 %0 %33.33 %50 %322835218
48NC_015062GATGGG21210435710436816.67 %16.67 %66.67 %0 %322835225
49NC_015062GCCAGA21211719411720533.33 %0 %33.33 %33.33 %322835241
50NC_015062AGCCGA21212149112150233.33 %0 %33.33 %33.33 %322835243
51NC_015062TTCAGG21212198812199916.67 %33.33 %33.33 %16.67 %322835243
52NC_015062AACAAG21212365812366966.67 %0 %16.67 %16.67 %322835244
53NC_015062GAATTT21212614512615633.33 %50 %16.67 %0 %322835246
54NC_015062GAACTG21212638512639633.33 %16.67 %33.33 %16.67 %322835246
55NC_015062AAAGCG21212659812660950 %0 %33.33 %16.67 %322835246
56NC_015062CCGTGG2121294101294210 %16.67 %50 %33.33 %322835249
57NC_015062GCGCTG2121336021336130 %16.67 %50 %33.33 %322835251
58NC_015062AGTATC21213974213975333.33 %33.33 %16.67 %16.67 %322835254
59NC_015062GCGCCA21214388414389516.67 %0 %33.33 %50 %322835260
60NC_015062TGCCCA21214685714686816.67 %16.67 %16.67 %50 %322835261
61NC_015062GATACC21214765914767033.33 %16.67 %16.67 %33.33 %322835261
62NC_015062ACGGCT21215151115152216.67 %16.67 %33.33 %33.33 %322835264
63NC_015062CGCTGG2121653191653300 %16.67 %50 %33.33 %322835276
64NC_015062CCACGC21216726416727516.67 %0 %16.67 %66.67 %322835279
65NC_015062CACGTT21216767816768916.67 %33.33 %16.67 %33.33 %322835279
66NC_015062CTTCCA21217079017080116.67 %33.33 %0 %50 %322835281
67NC_015062ATCTGC21217123717124816.67 %33.33 %16.67 %33.33 %322835282
68NC_015062CCATCG21217218817219916.67 %16.67 %16.67 %50 %322835283
69NC_015062TCAGCA21217256317257433.33 %16.67 %16.67 %33.33 %322835283
70NC_015062CAGCGC21217302517303616.67 %0 %33.33 %50 %322835284
71NC_015062TGCCGG2121805901806010 %16.67 %50 %33.33 %322835290
72NC_015062AAAGGT21218343318344450 %16.67 %33.33 %0 %322835294
73NC_015062CGCTGG2121838411838520 %16.67 %50 %33.33 %322835295
74NC_015062GACACT21218390918392033.33 %16.67 %16.67 %33.33 %322835295
75NC_015062ATCTGC21218596218597316.67 %33.33 %16.67 %33.33 %322835297
76NC_015062GTCTGT2121874651874760 %50 %33.33 %16.67 %322835299
77NC_015062CGATGA21219298419299533.33 %16.67 %33.33 %16.67 %322835305
78NC_015062CAATAT21219383619384750 %33.33 %0 %16.67 %322835306
79NC_015062CATGAT21219662619663733.33 %33.33 %16.67 %16.67 %322835308
80NC_015062TAAAAG21219777819778966.67 %16.67 %16.67 %0 %322835310
81NC_015062TGCCGG2121985591985700 %16.67 %50 %33.33 %322835311
82NC_015062ACACTG21221320921322033.33 %16.67 %16.67 %33.33 %322835327
83NC_015062ACTGGC21221390921392016.67 %16.67 %33.33 %33.33 %322835328
84NC_015062GGCAAA21222160522161650 %0 %33.33 %16.67 %322835336
85NC_015062ATCTGG21222350522351616.67 %33.33 %33.33 %16.67 %322835337
86NC_015062CGTTCA21223221923223016.67 %33.33 %16.67 %33.33 %322835348
87NC_015062TTTATC21223408023409116.67 %66.67 %0 %16.67 %322835353
88NC_015062CCAGCG21223691123692216.67 %0 %33.33 %50 %322835358
89NC_015062GCCAGC21223705423706516.67 %0 %33.33 %50 %322835358
90NC_015062CGCCAG21223742223743316.67 %0 %33.33 %50 %322835358
91NC_015062GATTTT21223989623990716.67 %66.67 %16.67 %0 %322835361
92NC_015062TCTGGC2122423662423770 %33.33 %33.33 %33.33 %322835363
93NC_015062ACGCAT21224670924672033.33 %16.67 %16.67 %33.33 %322835367
94NC_015062CAGGCG21224789524790616.67 %0 %50 %33.33 %322835369
95NC_015062CCCGGC2122481232481340 %0 %33.33 %66.67 %322835369
96NC_015062TGGCGG2122588802588910 %16.67 %66.67 %16.67 %322835380
97NC_015062GGTTTA21225956225957316.67 %50 %33.33 %0 %322835381
98NC_015062AGCATC21226089326090433.33 %16.67 %16.67 %33.33 %322835382
99NC_015062CCAGCA21226225026226133.33 %0 %16.67 %50 %322835382
100NC_015062GCTGGC2122658352658460 %16.67 %50 %33.33 %322835385
101NC_015062AATACC21226732626733750 %16.67 %0 %33.33 %322835387
102NC_015062ATCCCC21226944526945616.67 %16.67 %0 %66.67 %322835390
103NC_015062GCGTTT2122700762700870 %50 %33.33 %16.67 %322835390
104NC_015062GCTGGC2122710292710400 %16.67 %50 %33.33 %322835391
105NC_015062CCAGCG21227218927220016.67 %0 %33.33 %50 %322835391
106NC_015062CAGCGC21227475527476616.67 %0 %33.33 %50 %322835394
107NC_015062GCCAGC21227509227510316.67 %0 %33.33 %50 %322835394
108NC_015062TGCCGT2122792892793000 %33.33 %33.33 %33.33 %322835398
109NC_015062GTCTGG2122820132820240 %33.33 %50 %16.67 %322835399
110NC_015062CCGCCC2122830492830600 %0 %16.67 %83.33 %322835400
111NC_015062TAATGA21228377928379050 %33.33 %16.67 %0 %322835400
112NC_015062CTGATC21228575728576816.67 %33.33 %16.67 %33.33 %322835403
113NC_015062GTGCTG2122942172942280 %33.33 %50 %16.67 %322835411
114NC_015062TTTCAT21229849329850416.67 %66.67 %0 %16.67 %322835413
115NC_015062AATTTC21229853429854533.33 %50 %0 %16.67 %322835414
116NC_015062CCGGAA21230150430151533.33 %0 %33.33 %33.33 %322835415
117NC_015062CACCGG21230269530270616.67 %0 %33.33 %50 %322835416
118NC_015062TCAGGC21230517830518916.67 %16.67 %33.33 %33.33 %322835418
119NC_015062GTTTGC2123082183082290 %50 %33.33 %16.67 %322835420
120NC_015062GCGACG21231003431004516.67 %0 %50 %33.33 %322835422
121NC_015062TTTATC21231284131285216.67 %66.67 %0 %16.67 %322835424
122NC_015062TTCCAG21231353731354816.67 %33.33 %16.67 %33.33 %322835425
123NC_015062TTCCGG2123293073293180 %33.33 %33.33 %33.33 %322835441
124NC_015062CGATTT21232966132967216.67 %50 %16.67 %16.67 %322835442
125NC_015062TGGAAA21233138733139850 %16.67 %33.33 %0 %322835444
126NC_015062TCAGTA21233835133836233.33 %33.33 %16.67 %16.67 %322835450
127NC_015062AGGCAA21234108334109450 %0 %33.33 %16.67 %322835453
128NC_015062CGGCAA21234699034700133.33 %0 %33.33 %33.33 %322835457
129NC_015062ACCGAT21234788534789633.33 %16.67 %16.67 %33.33 %322835457
130NC_015062GACGCT21235099435100516.67 %16.67 %33.33 %33.33 %322835458
131NC_015062TTTGCA21235522535523616.67 %50 %16.67 %16.67 %322835464
132NC_015062CAATTT21235739035740133.33 %50 %0 %16.67 %322835468
133NC_015062CATGAA21236271636272750 %16.67 %16.67 %16.67 %322835473
134NC_015062ACCCAA21236308536309650 %0 %0 %50 %322835473
135NC_015062TACCGG21236381136382216.67 %16.67 %33.33 %33.33 %322835473
136NC_015062CCGCAT21236389636390716.67 %16.67 %16.67 %50 %322835473
137NC_015062GAAACA21236404836405966.67 %0 %16.67 %16.67 %322835473
138NC_015062GCTGGC2123657593657700 %16.67 %50 %33.33 %322835475
139NC_015062AACCTG21236709336710433.33 %16.67 %16.67 %33.33 %322835477
140NC_015062TCCGGT2123671953672060 %33.33 %33.33 %33.33 %322835477
141NC_015062CAGCGC21236750436751516.67 %0 %33.33 %50 %322835477
142NC_015062CAGCGT21237354737355816.67 %16.67 %33.33 %33.33 %322835481
143NC_015062CAGGGC21237455537456616.67 %0 %50 %33.33 %322835481
144NC_015062CCAGAA21237584637585750 %0 %16.67 %33.33 %322835482
145NC_015062GCTTTC2123780373780480 %50 %16.67 %33.33 %322835486
146NC_015062CGCCAG21238464038465116.67 %0 %33.33 %50 %322835490
147NC_015062CAGCGC21238562138563216.67 %0 %33.33 %50 %322835490
148NC_015062ATGCAG21238976838977933.33 %16.67 %33.33 %16.67 %322835493
149NC_015062CGCCAG21239014839015916.67 %0 %33.33 %50 %322835494
150NC_015062GCGCCA21239308939310016.67 %0 %33.33 %50 %322835496
151NC_015062AAAAAC21239842939844083.33 %0 %0 %16.67 %322835500
152NC_015062CCGCTG2124035404035510 %16.67 %33.33 %50 %322835503
153NC_015062CTGCAC21240506340507416.67 %16.67 %16.67 %50 %322835503
154NC_015062GCCGGG2124103064103170 %0 %66.67 %33.33 %322835509
155NC_015062CGTCGA21241369141370216.67 %16.67 %33.33 %33.33 %322835511
156NC_015062GTGAAA21241577041578150 %16.67 %33.33 %0 %322835513
157NC_015062CCTGCC2124158984159090 %16.67 %16.67 %66.67 %322835513
158NC_015062ATGCCG21241682441683516.67 %16.67 %33.33 %33.33 %322835515
159NC_015062AAACGG21241908841909950 %0 %33.33 %16.67 %322835519
160NC_015062AAATCA21241987341988466.67 %16.67 %0 %16.67 %322835520
161NC_015062AACACC21242348842349950 %0 %0 %50 %322835523
162NC_015062ATCAAA21242655942657066.67 %16.67 %0 %16.67 %322835527
163NC_015062TCGAGA21242720842721933.33 %16.67 %33.33 %16.67 %322835527
164NC_015062TGAAAG21244389044390150 %16.67 %33.33 %0 %322835542
165NC_015062TGAAAA21244617144618266.67 %16.67 %16.67 %0 %322835544
166NC_015062TTTTAT21244880944882016.67 %83.33 %0 %0 %322835546
167NC_015062CTGGCG2124489664489770 %16.67 %50 %33.33 %322835546
168NC_015062ATCTGG21245134745135816.67 %33.33 %33.33 %16.67 %322835548
169NC_015062CCGGCT2124553374553480 %16.67 %33.33 %50 %322835551
170NC_015062TGGGCG2124586564586670 %16.67 %66.67 %16.67 %322835553
171NC_015062TATCGC21245866945868016.67 %33.33 %16.67 %33.33 %322835553
172NC_015062CGTTGG2124615514615620 %33.33 %50 %16.67 %322835554
173NC_015062TGCCGT2124676404676510 %33.33 %33.33 %33.33 %322835560
174NC_015062CGCTGG2124697264697370 %16.67 %50 %33.33 %322835562
175NC_015062CAGATT21247490947492033.33 %33.33 %16.67 %16.67 %322835566
176NC_015062CTTTCA21248318148319216.67 %50 %0 %33.33 %322835575
177NC_015062GTTCAC21248825548826616.67 %33.33 %16.67 %33.33 %322835579
178NC_015062CAAAAT21248877548878666.67 %16.67 %0 %16.67 %322835579
179NC_015062ACGCCG21249122849123916.67 %0 %33.33 %50 %322835581
180NC_015062GCGGGT2125023235023340 %16.67 %66.67 %16.67 %322835591
181NC_015062CCGCGT2125049775049880 %16.67 %33.33 %50 %322835594
182NC_015062ATTGTT21250612250613316.67 %66.67 %16.67 %0 %322835595
183NC_015062TGCCGG2125136765136870 %16.67 %50 %33.33 %322835603
184NC_015062CTGCAT21251660951662016.67 %33.33 %16.67 %33.33 %322835606
185NC_015062CGCCAT21252055952057016.67 %16.67 %16.67 %50 %322835607
186NC_015062GCTGGC2125223135223240 %16.67 %50 %33.33 %322835608
187NC_015062GTTTGC2125264455264560 %50 %33.33 %16.67 %322835611
188NC_015062CTGGAA21252883152884233.33 %16.67 %33.33 %16.67 %322835614
189NC_015062TCCAGA21254098954100033.33 %16.67 %16.67 %33.33 %322835627
190NC_015062CGATGG21254278354279416.67 %16.67 %50 %16.67 %322835628
191NC_015062AGATAC21255026755027850 %16.67 %16.67 %16.67 %322835641
192NC_015062CAATCC21255293955295033.33 %16.67 %0 %50 %322835646
193NC_015062TCAAAG21255406055407150 %16.67 %16.67 %16.67 %322835649
194NC_015062ACCAAA21255781255782366.67 %0 %0 %33.33 %322835659
195NC_015062TGCAGG21255961055962116.67 %16.67 %50 %16.67 %322835663
196NC_015062TCCCGT2125615805615910 %33.33 %16.67 %50 %322835667
197NC_015062ACGTCA21256680156681233.33 %16.67 %16.67 %33.33 %322835671
198NC_015062AGGCGA21256886956888033.33 %0 %50 %16.67 %322835675
199NC_015062ACCCTC21257487357488416.67 %16.67 %0 %66.67 %322835682
200NC_015062TAACAA21257638757639866.67 %16.67 %0 %16.67 %322835685
201NC_015062AACGGA21258401158402250 %0 %33.33 %16.67 %322835693
202NC_015062AAAGAT21258547758548866.67 %16.67 %16.67 %0 %322835695
203NC_015062CCCGCG2125865845865950 %0 %33.33 %66.67 %322835696
204NC_015062CAGCAA21258800558801650 %0 %16.67 %33.33 %322835697
205NC_015062TGGGCG2126001476001580 %16.67 %66.67 %16.67 %322835707
206NC_015062TCTGCA21260346760347816.67 %33.33 %16.67 %33.33 %322835709
207NC_015062GTCGGT2126056356056460 %33.33 %50 %16.67 %322835711
208NC_015062CAGGAT21260977860978933.33 %16.67 %33.33 %16.67 %322835716
209NC_015062TGCGCG2126112076112180 %16.67 %50 %33.33 %322835716
210NC_015062TGATAA21261585761586850 %33.33 %16.67 %0 %322835720
211NC_015062CGCAAA21261632461633550 %0 %16.67 %33.33 %322835721