MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rahnella sp. Y9602 plasmid pRAHAQ01

Total Repeats: 1583

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015062	CTGG	2	8	342	349	0 %	25 %	50 %	25 %	322835127
2	NC_015062	CAGC	2	8	417	424	25 %	0 %	25 %	50 %	322835127
3	NC_015062	ATGA	2	8	1372	1379	50 %	25 %	25 %	0 %	322835127
4	NC_015062	TCCA	2	8	2107	2114	25 %	25 %	0 %	50 %	322835128
5	NC_015062	GCCA	2	8	2544	2551	25 %	0 %	25 %	50 %	322835128
6	NC_015062	TGCG	2	8	2848	2855	0 %	25 %	50 %	25 %	322835128
7	NC_015062	CCAG	2	8	3008	3015	25 %	0 %	25 %	50 %	322835128
8	NC_015062	TGTT	2	8	3103	3110	0 %	75 %	25 %	0 %	322835128
9	NC_015062	GCCC	2	8	3198	3205	0 %	0 %	25 %	75 %	322835128
10	NC_015062	GACG	2	8	3297	3304	25 %	0 %	50 %	25 %	322835128
11	NC_015062	TATT	2	8	3807	3814	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015062	CGTC	2	8	4089	4096	0 %	25 %	25 %	50 %	322835129
13	NC_015062	GCAG	2	8	5058	5065	25 %	0 %	50 %	25 %	322835129
14	NC_015062	TCAG	2	8	5546	5553	25 %	25 %	25 %	25 %	322835130
15	NC_015062	ATGC	2	8	5827	5834	25 %	25 %	25 %	25 %	322835130
16	NC_015062	TGAT	2	8	5837	5844	25 %	50 %	25 %	0 %	322835130
17	NC_015062	ACGC	2	8	6181	6188	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015062	GTCT	2	8	7645	7652	0 %	50 %	25 %	25 %	322835133
19	NC_015062	ACGG	2	8	7695	7702	25 %	0 %	50 %	25 %	322835133
20	NC_015062	CAGC	2	8	7962	7969	25 %	0 %	25 %	50 %	322835133
21	NC_015062	CTGG	2	8	7993	8000	0 %	25 %	50 %	25 %	322835133
22	NC_015062	CTGC	2	8	8181	8188	0 %	25 %	25 %	50 %	322835133
23	NC_015062	AGCC	2	8	8564	8571	25 %	0 %	25 %	50 %	322835134
24	NC_015062	CGCT	2	8	8599	8606	0 %	25 %	25 %	50 %	322835134
25	NC_015062	CTGA	2	8	9268	9275	25 %	25 %	25 %	25 %	322835134
26	NC_015062	CAGC	2	8	9440	9447	25 %	0 %	25 %	50 %	322835135
27	NC_015062	CCAC	2	8	9930	9937	25 %	0 %	0 %	75 %	322835136
28	NC_015062	AAAT	2	8	10005	10012	75 %	25 %	0 %	0 %	322835136
29	NC_015062	CATG	2	8	10626	10633	25 %	25 %	25 %	25 %	322835137
30	NC_015062	ATTT	2	8	10775	10782	25 %	75 %	0 %	0 %	322835137
31	NC_015062	GGCG	2	8	10891	10898	0 %	0 %	75 %	25 %	322835137
32	NC_015062	TGGC	2	8	11227	11234	0 %	25 %	50 %	25 %	322835137
33	NC_015062	GGAA	2	8	11313	11320	50 %	0 %	50 %	0 %	322835137
34	NC_015062	GCTG	2	8	11477	11484	0 %	25 %	50 %	25 %	322835137
35	NC_015062	CCAT	2	8	11747	11754	25 %	25 %	0 %	50 %	322835138
36	NC_015062	GAGT	2	8	11828	11835	25 %	25 %	50 %	0 %	322835138
37	NC_015062	TGGC	2	8	11878	11885	0 %	25 %	50 %	25 %	322835138
38	NC_015062	GGCA	2	8	12337	12344	25 %	0 %	50 %	25 %	322835138
39	NC_015062	TCCA	2	8	12391	12398	25 %	25 %	0 %	50 %	322835138
40	NC_015062	CGCC	2	8	12661	12668	0 %	0 %	25 %	75 %	322835138
41	NC_015062	CATC	2	8	13055	13062	25 %	25 %	0 %	50 %	322835138
42	NC_015062	GCTC	2	8	13094	13101	0 %	25 %	25 %	50 %	322835138
43	NC_015062	GTAA	2	8	14415	14422	50 %	25 %	25 %	0 %	322835139
44	NC_015062	GGCT	2	8	15700	15707	0 %	25 %	50 %	25 %	322835141
45	NC_015062	ATCA	2	8	16018	16025	50 %	25 %	0 %	25 %	322835142
46	NC_015062	GCTG	2	8	16248	16255	0 %	25 %	50 %	25 %	322835142
47	NC_015062	GCCA	2	8	17856	17863	25 %	0 %	25 %	50 %	322835143
48	NC_015062	ACCG	2	8	17933	17940	25 %	0 %	25 %	50 %	322835143
49	NC_015062	TGAA	2	8	17988	17995	50 %	25 %	25 %	0 %	322835143
50	NC_015062	CCAG	2	8	18059	18066	25 %	0 %	25 %	50 %	322835143
51	NC_015062	GACC	2	8	18724	18731	25 %	0 %	25 %	50 %	322835143
52	NC_015062	AAGG	2	8	18845	18852	50 %	0 %	50 %	0 %	322835143
53	NC_015062	ATAA	2	8	19890	19897	75 %	25 %	0 %	0 %	322835143
54	NC_015062	CTGC	2	8	20006	20013	0 %	25 %	25 %	50 %	322835143
55	NC_015062	ATAA	2	8	20234	20241	75 %	25 %	0 %	0 %	322835143
56	NC_015062	TTTC	3	12	20438	20449	0 %	75 %	0 %	25 %	322835143
57	NC_015062	TTTC	2	8	20457	20464	0 %	75 %	0 %	25 %	322835143
58	NC_015062	TTAA	2	8	20628	20635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015062	TCAG	2	8	20757	20764	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_015062	TGCG	2	8	20898	20905	0 %	25 %	50 %	25 %	322835144
61	NC_015062	TGGA	2	8	20934	20941	25 %	25 %	50 %	0 %	322835144
62	NC_015062	TCTT	2	8	20945	20952	0 %	75 %	0 %	25 %	322835144
63	NC_015062	CAGC	2	8	20958	20965	25 %	0 %	25 %	50 %	322835144
64	NC_015062	TTGT	2	8	21487	21494	0 %	75 %	25 %	0 %	322835145
65	NC_015062	AAAT	2	8	21701	21708	75 %	25 %	0 %	0 %	322835145
66	NC_015062	TGGC	2	8	22786	22793	0 %	25 %	50 %	25 %	322835146
67	NC_015062	GCCC	2	8	22801	22808	0 %	0 %	25 %	75 %	322835146
68	NC_015062	TGAC	2	8	24189	24196	25 %	25 %	25 %	25 %	322835146
69	NC_015062	GCCC	2	8	24561	24568	0 %	0 %	25 %	75 %	322835147
70	NC_015062	TAAA	2	8	25932	25939	75 %	25 %	0 %	0 %	322835147
71	NC_015062	ATGA	2	8	26038	26045	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015062	GCAC	2	8	27206	27213	25 %	0 %	25 %	50 %	322835148
73	NC_015062	GCGT	2	8	28851	28858	0 %	25 %	50 %	25 %	322835150
74	NC_015062	GGCT	2	8	29619	29626	0 %	25 %	50 %	25 %	322835152
75	NC_015062	GATT	2	8	29627	29634	25 %	50 %	25 %	0 %	322835152
76	NC_015062	AGGC	2	8	29806	29813	25 %	0 %	50 %	25 %	322835152
77	NC_015062	TTAT	2	8	29898	29905	25 %	75 %	0 %	0 %	322835153
78	NC_015062	TTGA	2	8	30108	30115	25 %	50 %	25 %	0 %	322835153
79	NC_015062	GCCC	2	8	30245	30252	0 %	0 %	25 %	75 %	322835153
80	NC_015062	TCGT	2	8	31067	31074	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015062	CAAT	2	8	31107	31114	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_015062	TCGG	2	8	31787	31794	0 %	25 %	50 %	25 %	322835154
83	NC_015062	TCAG	2	8	31902	31909	25 %	25 %	25 %	25 %	322835154
84	NC_015062	TGCG	2	8	31995	32002	0 %	25 %	50 %	25 %	322835154
85	NC_015062	TGAT	2	8	32772	32779	25 %	50 %	25 %	0 %	322835155
86	NC_015062	CCGG	2	8	33268	33275	0 %	0 %	50 %	50 %	322835155
87	NC_015062	GAAA	2	8	33361	33368	75 %	0 %	25 %	0 %	322835155
88	NC_015062	GGCA	2	8	34008	34015	25 %	0 %	50 %	25 %	322835156
89	NC_015062	GCCA	2	8	34021	34028	25 %	0 %	25 %	50 %	322835156
90	NC_015062	TTCA	2	8	34466	34473	25 %	50 %	0 %	25 %	322835156
91	NC_015062	TTTC	2	8	35617	35624	0 %	75 %	0 %	25 %	322835158
92	NC_015062	TCAG	2	8	36157	36164	25 %	25 %	25 %	25 %	322835158
93	NC_015062	CTGG	2	8	36566	36573	0 %	25 %	50 %	25 %	322835158
94	NC_015062	CTGT	2	8	36705	36712	0 %	50 %	25 %	25 %	322835158
95	NC_015062	GGCT	2	8	36846	36853	0 %	25 %	50 %	25 %	322835158
96	NC_015062	TTAA	2	8	36933	36940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015062	GTTT	2	8	38059	38066	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015062	CTGC	2	8	38663	38670	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_015062	CTGC	2	8	40166	40173	0 %	25 %	25 %	50 %	322835162
100	NC_015062	CAGC	2	8	40741	40748	25 %	0 %	25 %	50 %	322835162
101	NC_015062	CTGC	2	8	41264	41271	0 %	25 %	25 %	50 %	322835162
102	NC_015062	GGCG	2	8	41881	41888	0 %	0 %	75 %	25 %	322835162
103	NC_015062	CTGC	2	8	42209	42216	0 %	25 %	25 %	50 %	322835162
104	NC_015062	CTGA	2	8	42653	42660	25 %	25 %	25 %	25 %	322835162
105	NC_015062	GGCC	2	8	42783	42790	0 %	0 %	50 %	50 %	322835162
106	NC_015062	ACGG	2	8	43325	43332	25 %	0 %	50 %	25 %	322835163
107	NC_015062	TCAG	2	8	43898	43905	25 %	25 %	25 %	25 %	322835163
108	NC_015062	ACCG	2	8	44167	44174	25 %	0 %	25 %	50 %	322835163
109	NC_015062	CGTG	2	8	44214	44221	0 %	25 %	50 %	25 %	322835163
110	NC_015062	GATG	2	8	44427	44434	25 %	25 %	50 %	0 %	322835163
111	NC_015062	GGCG	2	8	44568	44575	0 %	0 %	75 %	25 %	322835163
112	NC_015062	CTGG	2	8	45114	45121	0 %	25 %	50 %	25 %	322835163
113	NC_015062	AAGC	2	8	45130	45137	50 %	0 %	25 %	25 %	322835163
114	NC_015062	CTGG	2	8	45285	45292	0 %	25 %	50 %	25 %	322835163
115	NC_015062	AGTG	2	8	45453	45460	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015062	AGGC	2	8	45908	45915	25 %	0 %	50 %	25 %	322835164
117	NC_015062	ATTT	2	8	46102	46109	25 %	75 %	0 %	0 %	322835164
118	NC_015062	GATT	2	8	46454	46461	25 %	50 %	25 %	0 %	322835164
119	NC_015062	TGGC	2	8	47243	47250	0 %	25 %	50 %	25 %	322835165
120	NC_015062	CCAG	2	8	47323	47330	25 %	0 %	25 %	50 %	322835165
121	NC_015062	TGAC	2	8	47812	47819	25 %	25 %	25 %	25 %	322835166
122	NC_015062	CATC	2	8	47889	47896	25 %	25 %	0 %	50 %	322835166
123	NC_015062	TTCA	2	8	48007	48014	25 %	50 %	0 %	25 %	322835166
124	NC_015062	ACCC	2	8	48493	48500	25 %	0 %	0 %	75 %	322835167
125	NC_015062	GCTG	2	8	48937	48944	0 %	25 %	50 %	25 %	322835167
126	NC_015062	AGTG	2	8	49993	50000	25 %	25 %	50 %	0 %	322835167
127	NC_015062	TGTC	2	8	50327	50334	0 %	50 %	25 %	25 %	322835168
128	NC_015062	TCAG	2	8	50373	50380	25 %	25 %	25 %	25 %	322835168
129	NC_015062	CCCG	2	8	50418	50425	0 %	0 %	25 %	75 %	322835168
130	NC_015062	CAGG	2	8	50897	50904	25 %	0 %	50 %	25 %	322835169
131	NC_015062	TCAG	2	8	51058	51065	25 %	25 %	25 %	25 %	322835169
132	NC_015062	GCAG	2	8	52299	52306	25 %	0 %	50 %	25 %	322835170
133	NC_015062	GATG	2	8	52633	52640	25 %	25 %	50 %	0 %	322835170
134	NC_015062	TTCT	2	8	53132	53139	0 %	75 %	0 %	25 %	322835170
135	NC_015062	CAAA	2	8	53284	53291	75 %	0 %	0 %	25 %	322835170
136	NC_015062	GGCG	2	8	53339	53346	0 %	0 %	75 %	25 %	322835170
137	NC_015062	CAGC	2	8	53374	53381	25 %	0 %	25 %	50 %	322835170
138	NC_015062	TTTC	2	8	53772	53779	0 %	75 %	0 %	25 %	322835171
139	NC_015062	CCAG	2	8	54588	54595	25 %	0 %	25 %	50 %	322835171
140	NC_015062	CCAC	2	8	54665	54672	25 %	0 %	0 %	75 %	322835171
141	NC_015062	TAAT	2	8	55329	55336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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