MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 plasmid pRAHAQ01

Total Repeats: 825

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015062	GT	3	6	656	661	0 %	50 %	50 %	0 %	322835127
2	NC_015062	GC	3	6	799	804	0 %	0 %	50 %	50 %	322835127
3	NC_015062	CA	3	6	1257	1262	50 %	0 %	0 %	50 %	322835127
4	NC_015062	GA	3	6	2493	2498	50 %	0 %	50 %	0 %	322835128
5	NC_015062	TG	3	6	2725	2730	0 %	50 %	50 %	0 %	322835128
6	NC_015062	CG	3	6	3485	3490	0 %	0 %	50 %	50 %	322835128
7	NC_015062	GC	3	6	5077	5082	0 %	0 %	50 %	50 %	322835129
8	NC_015062	CG	3	6	5137	5142	0 %	0 %	50 %	50 %	322835129
9	NC_015062	GC	3	6	6929	6934	0 %	0 %	50 %	50 %	322835132
10	NC_015062	TG	3	6	7030	7035	0 %	50 %	50 %	0 %	322835132
11	NC_015062	TG	3	6	7092	7097	0 %	50 %	50 %	0 %	322835132
12	NC_015062	AC	3	6	7180	7185	50 %	0 %	0 %	50 %	322835132
13	NC_015062	TA	3	6	7370	7375	50 %	50 %	0 %	0 %	322835133
14	NC_015062	GT	3	6	8235	8240	0 %	50 %	50 %	0 %	322835133
15	NC_015062	CA	3	6	8901	8906	50 %	0 %	0 %	50 %	322835134
16	NC_015062	GT	3	6	9779	9784	0 %	50 %	50 %	0 %	322835135
17	NC_015062	GC	3	6	10132	10137	0 %	0 %	50 %	50 %	322835136
18	NC_015062	CG	3	6	12287	12292	0 %	0 %	50 %	50 %	322835138
19	NC_015062	GT	3	6	12293	12298	0 %	50 %	50 %	0 %	322835138
20	NC_015062	CA	3	6	14069	14074	50 %	0 %	0 %	50 %	322835139
21	NC_015062	TG	3	6	14639	14644	0 %	50 %	50 %	0 %	322835140
22	NC_015062	GA	3	6	16211	16216	50 %	0 %	50 %	0 %	322835142
23	NC_015062	GC	3	6	16410	16415	0 %	0 %	50 %	50 %	322835142
24	NC_015062	CA	3	6	16787	16792	50 %	0 %	0 %	50 %	322835142
25	NC_015062	GC	3	6	16909	16914	0 %	0 %	50 %	50 %	322835142
26	NC_015062	AC	3	6	17056	17061	50 %	0 %	0 %	50 %	322835142
27	NC_015062	GA	3	6	17914	17919	50 %	0 %	50 %	0 %	322835143
28	NC_015062	GT	3	6	19198	19203	0 %	50 %	50 %	0 %	322835143
29	NC_015062	CA	3	6	19993	19998	50 %	0 %	0 %	50 %	322835143
30	NC_015062	GC	3	6	20175	20180	0 %	0 %	50 %	50 %	322835143
31	NC_015062	CG	3	6	20357	20362	0 %	0 %	50 %	50 %	322835143
32	NC_015062	CG	3	6	20417	20422	0 %	0 %	50 %	50 %	322835143
33	NC_015062	GC	3	6	22454	22459	0 %	0 %	50 %	50 %	322835146
34	NC_015062	CG	3	6	23589	23594	0 %	0 %	50 %	50 %	322835146
35	NC_015062	CA	3	6	25209	25214	50 %	0 %	0 %	50 %	322835147
36	NC_015062	AC	3	6	25239	25244	50 %	0 %	0 %	50 %	322835147
37	NC_015062	AG	3	6	25354	25359	50 %	0 %	50 %	0 %	322835147
38	NC_015062	GA	3	6	25751	25756	50 %	0 %	50 %	0 %	322835147
39	NC_015062	CG	3	6	28255	28260	0 %	0 %	50 %	50 %	322835149
40	NC_015062	CA	3	6	29141	29146	50 %	0 %	0 %	50 %	322835151
41	NC_015062	GC	3	6	30119	30124	0 %	0 %	50 %	50 %	322835153
42	NC_015062	GC	3	6	30496	30501	0 %	0 %	50 %	50 %	322835153
43	NC_015062	CA	3	6	30586	30591	50 %	0 %	0 %	50 %	322835153
44	NC_015062	AC	3	6	30785	30790	50 %	0 %	0 %	50 %	322835153
45	NC_015062	GC	3	6	31839	31844	0 %	0 %	50 %	50 %	322835154
46	NC_015062	TC	3	6	32291	32296	0 %	50 %	0 %	50 %	322835155
47	NC_015062	GC	3	6	33003	33008	0 %	0 %	50 %	50 %	322835155
48	NC_015062	CA	3	6	33811	33816	50 %	0 %	0 %	50 %	322835156
49	NC_015062	GC	3	6	34657	34662	0 %	0 %	50 %	50 %	322835157
50	NC_015062	CG	4	8	34748	34755	0 %	0 %	50 %	50 %	322835157
51	NC_015062	GC	3	6	34792	34797	0 %	0 %	50 %	50 %	322835157
52	NC_015062	GC	3	6	34828	34833	0 %	0 %	50 %	50 %	322835157
53	NC_015062	CT	3	6	34880	34885	0 %	50 %	0 %	50 %	322835157
54	NC_015062	AC	3	6	34959	34964	50 %	0 %	0 %	50 %	322835157
55	NC_015062	GC	4	8	35010	35017	0 %	0 %	50 %	50 %	322835157
56	NC_015062	CG	3	6	35160	35165	0 %	0 %	50 %	50 %	322835157
57	NC_015062	GC	3	6	36733	36738	0 %	0 %	50 %	50 %	322835158
58	NC_015062	TG	3	6	37341	37346	0 %	50 %	50 %	0 %	322835159
59	NC_015062	CG	3	6	37625	37630	0 %	0 %	50 %	50 %	322835159
60	NC_015062	CG	4	8	38943	38950	0 %	0 %	50 %	50 %	322835161
61	NC_015062	CG	3	6	39304	39309	0 %	0 %	50 %	50 %	322835161
62	NC_015062	GT	3	6	39994	39999	0 %	50 %	50 %	0 %	322835161
63	NC_015062	GC	3	6	40667	40672	0 %	0 %	50 %	50 %	322835162
64	NC_015062	CT	3	6	40916	40921	0 %	50 %	0 %	50 %	322835162
65	NC_015062	TG	3	6	42327	42332	0 %	50 %	50 %	0 %	322835162
66	NC_015062	AC	3	6	43541	43546	50 %	0 %	0 %	50 %	322835163
67	NC_015062	TC	3	6	43751	43756	0 %	50 %	0 %	50 %	322835163
68	NC_015062	GC	3	6	43958	43963	0 %	0 %	50 %	50 %	322835163
69	NC_015062	GC	3	6	44087	44092	0 %	0 %	50 %	50 %	322835163
70	NC_015062	GC	3	6	44414	44419	0 %	0 %	50 %	50 %	322835163
71	NC_015062	GC	3	6	44854	44859	0 %	0 %	50 %	50 %	322835163
72	NC_015062	AC	3	6	46834	46839	50 %	0 %	0 %	50 %	322835165
73	NC_015062	AC	3	6	46997	47002	50 %	0 %	0 %	50 %	322835165
74	NC_015062	GC	3	6	48467	48472	0 %	0 %	50 %	50 %	322835167
75	NC_015062	GC	3	6	48651	48656	0 %	0 %	50 %	50 %	322835167
76	NC_015062	TG	3	6	50170	50175	0 %	50 %	50 %	0 %	322835168
77	NC_015062	AG	3	6	51372	51377	50 %	0 %	50 %	0 %	322835169
78	NC_015062	TG	3	6	51642	51647	0 %	50 %	50 %	0 %	322835169
79	NC_015062	GC	3	6	52039	52044	0 %	0 %	50 %	50 %	322835170
80	NC_015062	GC	3	6	53928	53933	0 %	0 %	50 %	50 %	322835171
81	NC_015062	AC	3	6	54963	54968	50 %	0 %	0 %	50 %	322835171
82	NC_015062	CT	3	6	55649	55654	0 %	50 %	0 %	50 %	322835172
83	NC_015062	CA	3	6	56107	56112	50 %	0 %	0 %	50 %	322835172
84	NC_015062	GT	3	6	56847	56852	0 %	50 %	50 %	0 %	322835173
85	NC_015062	GA	3	6	58740	58745	50 %	0 %	50 %	0 %	322835176
86	NC_015062	GC	3	6	59917	59922	0 %	0 %	50 %	50 %	322835178
87	NC_015062	GC	4	8	61618	61625	0 %	0 %	50 %	50 %	322835179
88	NC_015062	CA	3	6	61811	61816	50 %	0 %	0 %	50 %	322835179
89	NC_015062	GC	3	6	61873	61878	0 %	0 %	50 %	50 %	322835179
90	NC_015062	TG	3	6	62130	62135	0 %	50 %	50 %	0 %	322835179
91	NC_015062	TG	3	6	62448	62453	0 %	50 %	50 %	0 %	322835179
92	NC_015062	TA	3	6	62840	62845	50 %	50 %	0 %	0 %	322835179
93	NC_015062	CA	3	6	63397	63402	50 %	0 %	0 %	50 %	322835179
94	NC_015062	CA	3	6	64218	64223	50 %	0 %	0 %	50 %	322835180
95	NC_015062	GC	3	6	64242	64247	0 %	0 %	50 %	50 %	322835180
96	NC_015062	TG	3	6	66027	66032	0 %	50 %	50 %	0 %	322835182
97	NC_015062	AT	3	6	67135	67140	50 %	50 %	0 %	0 %	322835183
98	NC_015062	AT	3	6	69068	69073	50 %	50 %	0 %	0 %	322835186
99	NC_015062	AT	3	6	69281	69286	50 %	50 %	0 %	0 %	322835186
100	NC_015062	AT	3	6	69659	69664	50 %	50 %	0 %	0 %	322835186
101	NC_015062	GC	3	6	69810	69815	0 %	0 %	50 %	50 %	322835186
102	NC_015062	CG	3	6	70976	70981	0 %	0 %	50 %	50 %	322835187
103	NC_015062	TC	3	6	71153	71158	0 %	50 %	0 %	50 %	322835187
104	NC_015062	AT	3	6	72556	72561	50 %	50 %	0 %	0 %	322835189
105	NC_015062	GT	3	6	72984	72989	0 %	50 %	50 %	0 %	322835189
106	NC_015062	GC	3	6	74906	74911	0 %	0 %	50 %	50 %	322835190
107	NC_015062	CG	3	6	75182	75187	0 %	0 %	50 %	50 %	322835190
108	NC_015062	CG	3	6	75551	75556	0 %	0 %	50 %	50 %	322835190
109	NC_015062	TC	3	6	75651	75656	0 %	50 %	0 %	50 %	322835190
110	NC_015062	AT	3	6	77208	77213	50 %	50 %	0 %	0 %	322835191
111	NC_015062	TA	3	6	77448	77453	50 %	50 %	0 %	0 %	322835192
112	NC_015062	CT	3	6	77876	77881	0 %	50 %	0 %	50 %	322835193
113	NC_015062	GT	3	6	78186	78191	0 %	50 %	50 %	0 %	322835193
114	NC_015062	CG	3	6	78272	78277	0 %	0 %	50 %	50 %	322835193
115	NC_015062	AG	3	6	78615	78620	50 %	0 %	50 %	0 %	322835194
116	NC_015062	AG	3	6	78811	78816	50 %	0 %	50 %	0 %	322835194
117	NC_015062	AT	3	6	79227	79232	50 %	50 %	0 %	0 %	322835194
118	NC_015062	GC	3	6	79432	79437	0 %	0 %	50 %	50 %	322835194
119	NC_015062	GC	3	6	79635	79640	0 %	0 %	50 %	50 %	322835194
120	NC_015062	GT	4	8	79802	79809	0 %	50 %	50 %	0 %	322835194
121	NC_015062	GC	3	6	80049	80054	0 %	0 %	50 %	50 %	322835194
122	NC_015062	GC	3	6	81831	81836	0 %	0 %	50 %	50 %	322835196
123	NC_015062	GC	3	6	83241	83246	0 %	0 %	50 %	50 %	322835197
124	NC_015062	TG	3	6	84456	84461	0 %	50 %	50 %	0 %	322835199
125	NC_015062	GT	3	6	84491	84496	0 %	50 %	50 %	0 %	322835200
126	NC_015062	CG	3	6	85661	85666	0 %	0 %	50 %	50 %	322835202
127	NC_015062	CG	3	6	85685	85690	0 %	0 %	50 %	50 %	322835202
128	NC_015062	AG	3	6	86877	86882	50 %	0 %	50 %	0 %	322835204
129	NC_015062	GC	3	6	87066	87071	0 %	0 %	50 %	50 %	322835204
130	NC_015062	GC	4	8	87130	87137	0 %	0 %	50 %	50 %	322835204
131	NC_015062	TG	3	6	87191	87196	0 %	50 %	50 %	0 %	322835204
132	NC_015062	AC	3	6	88118	88123	50 %	0 %	0 %	50 %	322835204
133	NC_015062	AG	3	6	89287	89292	50 %	0 %	50 %	0 %	322835205
134	NC_015062	CG	4	8	89346	89353	0 %	0 %	50 %	50 %	322835205
135	NC_015062	GC	3	6	90625	90630	0 %	0 %	50 %	50 %	322835207
136	NC_015062	GC	4	8	90741	90748	0 %	0 %	50 %	50 %	322835207
137	NC_015062	TA	3	6	91210	91215	50 %	50 %	0 %	0 %	322835207
138	NC_015062	CG	3	6	91591	91596	0 %	0 %	50 %	50 %	322835207
139	NC_015062	AT	3	6	91821	91826	50 %	50 %	0 %	0 %	322835207
140	NC_015062	TC	3	6	91884	91889	0 %	50 %	0 %	50 %	322835207
141	NC_015062	GC	3	6	92323	92328	0 %	0 %	50 %	50 %	322835208
142	NC_015062	AT	3	6	92993	92998	50 %	50 %	0 %	0 %	322835209
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