MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 2545

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015061	GTTGC	2	10	4546	4555	0 %	40 %	40 %	20 %	322830737
2	NC_015061	GGCGT	2	10	7119	7128	0 %	20 %	60 %	20 %	322830738
3	NC_015061	CGATG	2	10	10889	10898	20 %	20 %	40 %	20 %	322830744
4	NC_015061	CCTTT	2	10	14094	14103	0 %	60 %	0 %	40 %	322830746
5	NC_015061	CATTC	2	10	14881	14890	20 %	40 %	0 %	40 %	322830747
6	NC_015061	CGTGC	2	10	17866	17875	0 %	20 %	40 %	40 %	322830750
7	NC_015061	GAACA	2	10	19096	19105	60 %	0 %	20 %	20 %	322830751
8	NC_015061	TGCTG	2	10	20508	20517	0 %	40 %	40 %	20 %	322830752
9	NC_015061	TGGCA	2	10	20526	20535	20 %	20 %	40 %	20 %	322830752
10	NC_015061	GCGCG	2	10	21117	21126	0 %	0 %	60 %	40 %	322830752
11	NC_015061	GTGCG	2	10	21629	21638	0 %	20 %	60 %	20 %	322830752
12	NC_015061	TTGAA	2	10	27746	27755	40 %	40 %	20 %	0 %	322830758
13	NC_015061	ATCGA	2	10	30054	30063	40 %	20 %	20 %	20 %	322830761
14	NC_015061	TAAGT	2	10	31203	31212	40 %	40 %	20 %	0 %	322830761
15	NC_015061	CAGCG	2	10	31743	31752	20 %	0 %	40 %	40 %	322830762
16	NC_015061	TCATT	2	10	33577	33586	20 %	60 %	0 %	20 %	322830765
17	NC_015061	ATCAA	2	10	33593	33602	60 %	20 %	0 %	20 %	322830765
18	NC_015061	GCACA	2	10	36916	36925	40 %	0 %	20 %	40 %	322830766
19	NC_015061	TTCCA	2	10	39690	39699	20 %	40 %	0 %	40 %	322830770
20	NC_015061	CAGCG	2	10	45933	45942	20 %	0 %	40 %	40 %	322830775
21	NC_015061	GCTGG	2	10	48486	48495	0 %	20 %	60 %	20 %	322830777
22	NC_015061	GCAAT	2	10	50323	50332	40 %	20 %	20 %	20 %	322830778
23	NC_015061	GTTTT	2	10	51293	51302	0 %	80 %	20 %	0 %	322830779
24	NC_015061	GCGCC	2	10	51979	51988	0 %	0 %	40 %	60 %	322830780
25	NC_015061	CTGCA	2	10	52496	52505	20 %	20 %	20 %	40 %	322830780
26	NC_015061	TTATT	2	10	57815	57824	20 %	80 %	0 %	0 %	322830785
27	NC_015061	CCACA	2	10	63833	63842	40 %	0 %	0 %	60 %	322830791
28	NC_015061	GCCAG	2	10	67173	67182	20 %	0 %	40 %	40 %	322830797
29	NC_015061	CAGAC	2	10	67271	67280	40 %	0 %	20 %	40 %	322830797
30	NC_015061	AATCA	2	10	69204	69213	60 %	20 %	0 %	20 %	322830801
31	NC_015061	CACCG	2	10	69770	69779	20 %	0 %	20 %	60 %	322830802
32	NC_015061	GCCAC	2	10	72435	72444	20 %	0 %	20 %	60 %	322830805
33	NC_015061	CGAGC	2	10	73031	73040	20 %	0 %	40 %	40 %	322830805
34	NC_015061	CGCGG	2	10	74104	74113	0 %	0 %	60 %	40 %	322830806
35	NC_015061	TTCAG	2	10	75581	75590	20 %	40 %	20 %	20 %	322830807
36	NC_015061	AAAAT	2	10	78746	78755	80 %	20 %	0 %	0 %	322830808
37	NC_015061	GCAGG	2	10	81150	81159	20 %	0 %	60 %	20 %	322830809
38	NC_015061	TGAAG	2	10	82704	82713	40 %	20 %	40 %	0 %	322830812
39	NC_015061	CAACA	2	10	84027	84036	60 %	0 %	0 %	40 %	322830813
40	NC_015061	ATTCG	2	10	86872	86881	20 %	40 %	20 %	20 %	322830815
41	NC_015061	GTGCC	2	10	89557	89566	0 %	20 %	40 %	40 %	322830818
42	NC_015061	GCCGT	2	10	89764	89773	0 %	20 %	40 %	40 %	322830818
43	NC_015061	GCACG	2	10	89864	89873	20 %	0 %	40 %	40 %	322830818
44	NC_015061	GCCGC	2	10	90074	90083	0 %	0 %	40 %	60 %	322830819
45	NC_015061	TGCCA	2	10	94035	94044	20 %	20 %	20 %	40 %	322830823
46	NC_015061	GCGCC	2	10	96126	96135	0 %	0 %	40 %	60 %	322830824
47	NC_015061	GCCTG	2	10	99757	99766	0 %	20 %	40 %	40 %	322830826
48	NC_015061	CTGCG	2	10	103600	103609	0 %	20 %	40 %	40 %	322830829
49	NC_015061	CTTGT	2	10	106763	106772	0 %	60 %	20 %	20 %	322830833
50	NC_015061	TTTCA	2	10	107120	107129	20 %	60 %	0 %	20 %	322830833
51	NC_015061	CAGCG	2	10	108445	108454	20 %	0 %	40 %	40 %	322830835
52	NC_015061	GTGTG	2	10	108809	108818	0 %	40 %	60 %	0 %	322830835
53	NC_015061	GCTTT	2	10	108925	108934	0 %	60 %	20 %	20 %	322830836
54	NC_015061	AACGG	2	10	109346	109355	40 %	0 %	40 %	20 %	322830836
55	NC_015061	TGACC	2	10	109496	109505	20 %	20 %	20 %	40 %	322830836
56	NC_015061	CAGCG	2	10	109701	109710	20 %	0 %	40 %	40 %	322830836
57	NC_015061	TCGGT	2	10	110231	110240	0 %	40 %	40 %	20 %	322830836
58	NC_015061	CTGAT	2	10	110274	110283	20 %	40 %	20 %	20 %	322830836
59	NC_015061	CGCTG	2	10	111905	111914	0 %	20 %	40 %	40 %	322830836
60	NC_015061	GCGCG	2	10	114199	114208	0 %	0 %	60 %	40 %	322830837
61	NC_015061	GCGGT	2	10	116324	116333	0 %	20 %	60 %	20 %	322830838
62	NC_015061	CGGCG	2	10	118526	118535	0 %	0 %	60 %	40 %	322830840
63	NC_015061	ACCTG	2	10	122571	122580	20 %	20 %	20 %	40 %	322830842
64	NC_015061	GAATT	2	10	126987	126996	40 %	40 %	20 %	0 %	322830846
65	NC_015061	CGTTG	2	10	134779	134788	0 %	40 %	40 %	20 %	322830852
66	NC_015061	CGCTT	2	10	135393	135402	0 %	40 %	20 %	40 %	322830853
67	NC_015061	GACCG	2	10	144476	144485	20 %	0 %	40 %	40 %	322830861
68	NC_015061	TTCCC	2	10	145986	145995	0 %	40 %	0 %	60 %	322830862
69	NC_015061	CAGCG	2	10	149745	149754	20 %	0 %	40 %	40 %	322830864
70	NC_015061	TGACG	2	10	152533	152542	20 %	20 %	40 %	20 %	322830866
71	NC_015061	TGCGT	2	10	154767	154776	0 %	40 %	40 %	20 %	322830867
72	NC_015061	CTGAT	2	10	157432	157441	20 %	40 %	20 %	20 %	322830869
73	NC_015061	ACGCC	2	10	159632	159641	20 %	0 %	20 %	60 %	322830870
74	NC_015061	CCAGC	2	10	160338	160347	20 %	0 %	20 %	60 %	322830870
75	NC_015061	ATGAC	2	10	163148	163157	40 %	20 %	20 %	20 %	322830872
76	NC_015061	GCTTT	2	10	163765	163774	0 %	60 %	20 %	20 %	322830873
77	NC_015061	GCCAG	2	10	164221	164230	20 %	0 %	40 %	40 %	322830873
78	NC_015061	GCTGT	2	10	165506	165515	0 %	40 %	40 %	20 %	322830874
79	NC_015061	TGTTT	2	10	165869	165878	0 %	80 %	20 %	0 %	322830875
80	NC_015061	TTGAC	2	10	167155	167164	20 %	40 %	20 %	20 %	322830877
81	NC_015061	TCGGT	2	10	169217	169226	0 %	40 %	40 %	20 %	322830879
82	NC_015061	TGGCG	2	10	169500	169509	0 %	20 %	60 %	20 %	322830879
83	NC_015061	ATTCC	2	10	172611	172620	20 %	40 %	0 %	40 %	322830881
84	NC_015061	GTGAG	2	10	172965	172974	20 %	20 %	60 %	0 %	322830881
85	NC_015061	GCACC	2	10	173211	173220	20 %	0 %	20 %	60 %	322830881
86	NC_015061	CCGCA	2	10	177381	177390	20 %	0 %	20 %	60 %	322830887
87	NC_015061	CATAT	2	10	177783	177792	40 %	40 %	0 %	20 %	322830888
88	NC_015061	AAACC	2	10	178440	178449	60 %	0 %	0 %	40 %	322830889
89	NC_015061	AATTT	2	10	181860	181869	40 %	60 %	0 %	0 %	322830893
90	NC_015061	AGCGC	2	10	183744	183753	20 %	0 %	40 %	40 %	322830893
91	NC_015061	GTGCG	2	10	184792	184801	0 %	20 %	60 %	20 %	322830894
92	NC_015061	CGGTG	2	10	186342	186351	0 %	20 %	60 %	20 %	322830895
93	NC_015061	GCTGG	2	10	186820	186829	0 %	20 %	60 %	20 %	322830896
94	NC_015061	AGGCG	2	10	188209	188218	20 %	0 %	60 %	20 %	322830897
95	NC_015061	GCGAG	2	10	188984	188993	20 %	0 %	60 %	20 %	322830898
96	NC_015061	CTTTT	2	10	193802	193811	0 %	80 %	0 %	20 %	322830903
97	NC_015061	ACCTG	2	10	195430	195439	20 %	20 %	20 %	40 %	322830904
98	NC_015061	CGGTC	2	10	195449	195458	0 %	20 %	40 %	40 %	322830904
99	NC_015061	ATGCT	2	10	196111	196120	20 %	40 %	20 %	20 %	322830904
100	NC_015061	CGGCA	2	10	198869	198878	20 %	0 %	40 %	40 %	322830908
101	NC_015061	AGAAC	2	10	199639	199648	60 %	0 %	20 %	20 %	322830908
102	NC_015061	CCGGC	2	10	200732	200741	0 %	0 %	40 %	60 %	322830909
103	NC_015061	CTGTT	2	10	201992	202001	0 %	60 %	20 %	20 %	322830911
104	NC_015061	AATGA	2	10	203764	203773	60 %	20 %	20 %	0 %	322830912
105	NC_015061	TGAAG	2	10	203874	203883	40 %	20 %	40 %	0 %	322830913
106	NC_015061	TGATC	2	10	210158	210167	20 %	40 %	20 %	20 %	322830917
107	NC_015061	CTGCA	2	10	210366	210375	20 %	20 %	20 %	40 %	322830917
108	NC_015061	TGTTC	2	10	211055	211064	0 %	60 %	20 %	20 %	322830918
109	NC_015061	AATAA	2	10	211065	211074	80 %	20 %	0 %	0 %	322830918
110	NC_015061	TCTGT	2	10	212342	212351	0 %	60 %	20 %	20 %	322830918
111	NC_015061	GGGTC	2	10	215058	215067	0 %	20 %	60 %	20 %	322830920
112	NC_015061	CGCTG	2	10	217623	217632	0 %	20 %	40 %	40 %	322830922
113	NC_015061	TGCCG	2	10	218820	218829	0 %	20 %	40 %	40 %	322830922
114	NC_015061	TGCGA	2	10	220633	220642	20 %	20 %	40 %	20 %	322830924
115	NC_015061	GCGCT	2	10	225224	225233	0 %	20 %	40 %	40 %	322830929
116	NC_015061	TTTCG	2	10	230687	230696	0 %	60 %	20 %	20 %	322830933
117	NC_015061	TGCGC	2	10	231522	231531	0 %	20 %	40 %	40 %	322830933
118	NC_015061	TTCAC	2	10	231850	231859	20 %	40 %	0 %	40 %	322830933
119	NC_015061	ATCAC	2	10	232453	232462	40 %	20 %	0 %	40 %	322830934
120	NC_015061	TTTGT	2	10	234557	234566	0 %	80 %	20 %	0 %	322830935
121	NC_015061	ATGGC	2	10	235983	235992	20 %	20 %	40 %	20 %	322830936
122	NC_015061	GCCGG	2	10	237685	237694	0 %	0 %	60 %	40 %	322830937
123	NC_015061	GCCGC	2	10	239960	239969	0 %	0 %	40 %	60 %	322830939
124	NC_015061	ACACC	2	10	240087	240096	40 %	0 %	0 %	60 %	322830939
125	NC_015061	TGCCA	2	10	243593	243602	20 %	20 %	20 %	40 %	322830942
126	NC_015061	CAGCC	2	10	246218	246227	20 %	0 %	20 %	60 %	322830945
127	NC_015061	GACCT	2	10	248984	248993	20 %	20 %	20 %	40 %	322830948
128	NC_015061	ACCCC	2	10	251275	251284	20 %	0 %	0 %	80 %	322830952
129	NC_015061	CGCTG	2	10	251795	251804	0 %	20 %	40 %	40 %	322830953
130	NC_015061	CGATG	2	10	251900	251909	20 %	20 %	40 %	20 %	322830953
131	NC_015061	CGATC	2	10	253337	253346	20 %	20 %	20 %	40 %	322830953
132	NC_015061	GCTGC	2	10	254246	254255	0 %	20 %	40 %	40 %	322830954
133	NC_015061	CTGGC	2	10	254735	254744	0 %	20 %	40 %	40 %	322830954
134	NC_015061	TGGCA	2	10	256887	256896	20 %	20 %	40 %	20 %	322830956
135	NC_015061	CGCAG	2	10	257316	257325	20 %	0 %	40 %	40 %	322830956
136	NC_015061	TCCGT	2	10	259136	259145	0 %	40 %	20 %	40 %	322830959
137	NC_015061	TGAAC	2	10	261741	261750	40 %	20 %	20 %	20 %	322830961
138	NC_015061	TGCAT	2	10	264715	264724	20 %	40 %	20 %	20 %	322830964
139	NC_015061	TCATC	2	10	268129	268138	20 %	40 %	0 %	40 %	322830970
140	NC_015061	TTACC	2	10	268902	268911	20 %	40 %	0 %	40 %	322830971
141	NC_015061	CATGA	2	10	269162	269171	40 %	20 %	20 %	20 %	322830971
142	NC_015061	GTCGC	2	10	273645	273654	0 %	20 %	40 %	40 %	322830974
143	NC_015061	CAGTT	2	10	274031	274040	20 %	40 %	20 %	20 %	322830974
144	NC_015061	GTGAA	2	10	275964	275973	40 %	20 %	40 %	0 %	322830975
145	NC_015061	GAATG	2	10	276731	276740	40 %	20 %	40 %	0 %	322830975
146	NC_015061	GCGTT	2	10	279093	279102	0 %	40 %	40 %	20 %	322830975
147	NC_015061	GACGC	2	10	279446	279455	20 %	0 %	40 %	40 %	322830975
148	NC_015061	ATCCG	2	10	281838	281847	20 %	20 %	20 %	40 %	322830976
149	NC_015061	GCCGC	2	10	282100	282109	0 %	0 %	40 %	60 %	322830976
150	NC_015061	TGAAC	2	10	282752	282761	40 %	20 %	20 %	20 %	322830976
151	NC_015061	GTTGA	2	10	283950	283959	20 %	40 %	40 %	0 %	322830978
152	NC_015061	CTGAA	2	10	284568	284577	40 %	20 %	20 %	20 %	322830978
153	NC_015061	AATCA	2	10	287540	287549	60 %	20 %	0 %	20 %	322830980
154	NC_015061	GACAG	2	10	287618	287627	40 %	0 %	40 %	20 %	322830980
155	NC_015061	GATGA	2	10	298135	298144	40 %	20 %	40 %	0 %	322830992
156	NC_015061	CGCAG	2	10	301736	301745	20 %	0 %	40 %	40 %	322830994
157	NC_015061	AATGC	2	10	302175	302184	40 %	20 %	20 %	20 %	322830994
158	NC_015061	TCGTT	2	10	302362	302371	0 %	60 %	20 %	20 %	322830995
159	NC_015061	GGAAA	2	10	303696	303705	60 %	0 %	40 %	0 %	322830996
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163	NC_015061	ATTTG	2	10	305469	305478	20 %	60 %	20 %	0 %	322830998
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166	NC_015061	TCCGC	2	10	312172	312181	0 %	20 %	20 %	60 %	322831005
167	NC_015061	AATGA	2	10	318313	318322	60 %	20 %	20 %	0 %	322831010
168	NC_015061	ATCCG	2	10	318650	318659	20 %	20 %	20 %	40 %	322831010
169	NC_015061	GTTAC	2	10	321065	321074	20 %	40 %	20 %	20 %	322831011
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173	NC_015061	ATTCC	2	10	332309	332318	20 %	40 %	0 %	40 %	322831023
174	NC_015061	GCCGG	2	10	332398	332407	0 %	0 %	60 %	40 %	322831023
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176	NC_015061	GCTGG	2	10	333291	333300	0 %	20 %	60 %	20 %	322831023
177	NC_015061	TGATC	2	10	337196	337205	20 %	40 %	20 %	20 %	322831027
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192	NC_015061	GCCCG	2	10	375435	375444	0 %	0 %	40 %	60 %	322831067
193	NC_015061	TTACA	2	10	378717	378726	40 %	40 %	0 %	20 %	322831070
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201	NC_015061	TTAAA	2	10	393711	393720	60 %	40 %	0 %	0 %	322831100
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227	NC_015061	GCAGA	2	10	457265	457274	40 %	0 %	40 %	20 %	322831154
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229	NC_015061	GCACC	2	10	459027	459036	20 %	0 %	20 %	60 %	322831155
230	NC_015061	CGACA	2	10	459655	459664	40 %	0 %	20 %	40 %	322831155
231	NC_015061	GCACC	2	10	460448	460457	20 %	0 %	20 %	60 %	322831157
232	NC_015061	GCCTG	2	10	462019	462028	0 %	20 %	40 %	40 %	322831158
233	NC_015061	CTGGT	2	10	466058	466067	0 %	40 %	40 %	20 %	322831162
234	NC_015061	GCACG	2	10	468140	468149	20 %	0 %	40 %	40 %	322831163
235	NC_015061	TCGGT	2	10	470173	470182	0 %	40 %	40 %	20 %	322831165
236	NC_015061	CGGCG	2	10	471566	471575	0 %	0 %	60 %	40 %	322831166
237	NC_015061	ACGCG	2	10	477629	477638	20 %	0 %	40 %	40 %	322831174
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239	NC_015061	GCGGT	2	10	478639	478648	0 %	20 %	60 %	20 %	322831175
240	NC_015061	TTGCC	2	10	480928	480937	0 %	40 %	20 %	40 %	322831176
241	NC_015061	CACCG	2	10	482056	482065	20 %	0 %	20 %	60 %	322831178
242	NC_015061	GTCAG	2	10	484087	484096	20 %	20 %	40 %	20 %	322831180
243	NC_015061	CCGGC	2	10	490624	490633	0 %	0 %	40 %	60 %	322831183
244	NC_015061	GCGCA	2	10	493336	493345	20 %	0 %	40 %	40 %	322831187
245	NC_015061	GCTGA	2	10	499611	499620	20 %	20 %	40 %	20 %	322831194
246	NC_015061	CGGAA	2	10	499763	499772	40 %	0 %	40 %	20 %	322831194
247	NC_015061	AGGGA	2	10	501358	501367	40 %	0 %	60 %	0 %	322831196
248	NC_015061	GCCTG	2	10	504179	504188	0 %	20 %	40 %	40 %	322831200
249	NC_015061	TGATC	2	10	505213	505222	20 %	40 %	20 %	20 %	322831201
250	NC_015061	GATGC	2	10	506533	506542	20 %	20 %	40 %	20 %	322831202
251	NC_015061	GGGTC	2	10	509915	509924	0 %	20 %	60 %	20 %	322831205
252	NC_015061	AAGCT	2	10	510723	510732	40 %	20 %	20 %	20 %	322831206
253	NC_015061	TTCAT	2	10	512655	512664	20 %	60 %	0 %	20 %	322831209
254	NC_015061	AAAGC	2	10	512755	512764	60 %	0 %	20 %	20 %	322831209
255	NC_015061	CGAAG	2	10	512822	512831	40 %	0 %	40 %	20 %	322831209
256	NC_015061	GGATG	2	10	515882	515891	20 %	20 %	60 %	0 %	322831211
257	NC_015061	GTTCG	2	10	516960	516969	0 %	40 %	40 %	20 %	322831212
258	NC_015061	TGCGC	2	10	519402	519411	0 %	20 %	40 %	40 %	322831213
259	NC_015061	CTGAA	2	10	521783	521792	40 %	20 %	20 %	20 %	322831214
260	NC_015061	GTGAT	2	10	522344	522353	20 %	40 %	40 %	0 %	322831214
261	NC_015061	AACGC	2	10	528745	528754	40 %	0 %	20 %	40 %	322831220
262	NC_015061	TTTCA	2	10	535326	535335	20 %	60 %	0 %	20 %	322831225
263	NC_015061	GATCT	2	10	544005	544014	20 %	40 %	20 %	20 %	322831237
264	NC_015061	GACAA	2	10	544505	544514	60 %	0 %	20 %	20 %	322831238
265	NC_015061	AGTCC	2	10	545516	545525	20 %	20 %	20 %	40 %	322831239
266	NC_015061	GCAGC	2	10	546116	546125	20 %	0 %	40 %	40 %	322831240
267	NC_015061	TTGCT	2	10	550721	550730	0 %	60 %	20 %	20 %	322831246
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381	NC_015061	GAAAT	2	10	772730	772739	60 %	20 %	20 %	0 %	322831457
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389	NC_015061	GCGCT	2	10	795069	795078	0 %	20 %	40 %	40 %	322831470
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