MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 12131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015061	GCTT	2	8	236	243	0 %	50 %	25 %	25 %	322830734
2	NC_015061	CAGC	2	8	315	322	25 %	0 %	25 %	50 %	322830734
3	NC_015061	TTCG	2	8	1114	1121	0 %	50 %	25 %	25 %	322830734
4	NC_015061	GCCC	2	8	1252	1259	0 %	0 %	25 %	75 %	322830734
5	NC_015061	ACCA	2	8	1294	1301	50 %	0 %	0 %	50 %	322830734
6	NC_015061	CGTT	2	8	1900	1907	0 %	50 %	25 %	25 %	322830735
7	NC_015061	CGAC	2	8	1962	1969	25 %	0 %	25 %	50 %	322830735
8	NC_015061	GCAG	2	8	2218	2225	25 %	0 %	50 %	25 %	322830735
9	NC_015061	CAGT	2	8	2509	2516	25 %	25 %	25 %	25 %	322830735
10	NC_015061	ACTG	2	8	2642	2649	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015061	GGTC	2	8	2762	2769	0 %	25 %	50 %	25 %	322830736
12	NC_015061	TTTC	2	8	3334	3341	0 %	75 %	0 %	25 %	322830736
13	NC_015061	GCGG	2	8	3559	3566	0 %	0 %	75 %	25 %	322830736
14	NC_015061	CCGA	2	8	3610	3617	25 %	0 %	25 %	50 %	322830736
15	NC_015061	GCTG	2	8	3626	3633	0 %	25 %	50 %	25 %	322830736
16	NC_015061	ATCC	2	8	4492	4499	25 %	25 %	0 %	50 %	322830737
17	NC_015061	CTGG	2	8	4984	4991	0 %	25 %	50 %	25 %	322830737
18	NC_015061	GCGG	2	8	5068	5075	0 %	0 %	75 %	25 %	322830737
19	NC_015061	CGTG	2	8	5736	5743	0 %	25 %	50 %	25 %	322830737
20	NC_015061	TTCA	2	8	5827	5834	25 %	50 %	0 %	25 %	322830737
21	NC_015061	GGCT	2	8	6281	6288	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_015061	AATT	2	8	6355	6362	50 %	50 %	0 %	0 %	322830738
23	NC_015061	CCGT	2	8	6476	6483	0 %	25 %	25 %	50 %	322830738
24	NC_015061	TCAG	2	8	6844	6851	25 %	25 %	25 %	25 %	322830738
25	NC_015061	AAAC	2	8	7102	7109	75 %	0 %	0 %	25 %	322830738
26	NC_015061	CGTC	2	8	7276	7283	0 %	25 %	25 %	50 %	322830739
27	NC_015061	ATCA	2	8	8687	8694	50 %	25 %	0 %	25 %	322830740
28	NC_015061	AAGC	2	8	8947	8954	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_015061	TTTA	2	8	9302	9309	25 %	75 %	0 %	0 %	322830741
30	NC_015061	GTTG	2	8	9365	9372	0 %	50 %	50 %	0 %	322830741
31	NC_015061	GCTG	2	8	9545	9552	0 %	25 %	50 %	25 %	322830741
32	NC_015061	AGTA	2	8	10298	10305	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015061	TATT	2	8	10316	10323	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015061	TGTA	2	8	11081	11088	25 %	50 %	25 %	0 %	322830744
35	NC_015061	TGTA	2	8	11109	11116	25 %	50 %	25 %	0 %	322830744
36	NC_015061	GTTT	2	8	11119	11126	0 %	75 %	25 %	0 %	322830744
37	NC_015061	ATAA	2	8	11281	11288	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015061	GAAT	2	8	11362	11369	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015061	ATAA	2	8	11396	11403	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015061	AAAC	2	8	12313	12320	75 %	0 %	0 %	25 %	322830745
41	NC_015061	TTCT	2	8	12497	12504	0 %	75 %	0 %	25 %	322830745
42	NC_015061	GCGT	2	8	12679	12686	0 %	25 %	50 %	25 %	322830745
43	NC_015061	TCAT	2	8	12693	12700	25 %	50 %	0 %	25 %	322830745
44	NC_015061	ATTA	2	8	13125	13132	50 %	50 %	0 %	0 %	322830746
45	NC_015061	GCTG	2	8	13269	13276	0 %	25 %	50 %	25 %	322830746
46	NC_015061	GAAA	2	8	13823	13830	75 %	0 %	25 %	0 %	322830746
47	NC_015061	GCTG	2	8	14737	14744	0 %	25 %	50 %	25 %	322830747
48	NC_015061	CGCA	2	8	15068	15075	25 %	0 %	25 %	50 %	322830747
49	NC_015061	AAAT	2	8	15381	15388	75 %	25 %	0 %	0 %	322830748
50	NC_015061	TTGT	2	8	15599	15606	0 %	75 %	25 %	0 %	322830748
51	NC_015061	ACAA	2	8	15662	15669	75 %	0 %	0 %	25 %	322830748
52	NC_015061	CAGC	2	8	15967	15974	25 %	0 %	25 %	50 %	322830748
53	NC_015061	GCCA	2	8	16062	16069	25 %	0 %	25 %	50 %	322830748
54	NC_015061	AGGC	2	8	16697	16704	25 %	0 %	50 %	25 %	322830749
55	NC_015061	CGCC	2	8	17722	17729	0 %	0 %	25 %	75 %	322830750
56	NC_015061	CTGG	2	8	18422	18429	0 %	25 %	50 %	25 %	322830750
57	NC_015061	TGCC	2	8	19043	19050	0 %	25 %	25 %	50 %	322830751
58	NC_015061	CCGC	2	8	19570	19577	0 %	0 %	25 %	75 %	322830751
59	NC_015061	GCCA	2	8	20090	20097	25 %	0 %	25 %	50 %	322830752
60	NC_015061	AAAT	2	8	21233	21240	75 %	25 %	0 %	0 %	322830752
61	NC_015061	CAAA	2	8	22157	22164	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_015061	CGCC	2	8	22307	22314	0 %	0 %	25 %	75 %	322830753
63	NC_015061	ACCG	2	8	22398	22405	25 %	0 %	25 %	50 %	322830753
64	NC_015061	GCTT	2	8	22949	22956	0 %	50 %	25 %	25 %	322830753
65	NC_015061	CTGC	2	8	24781	24788	0 %	25 %	25 %	50 %	322830756
66	NC_015061	CTTT	2	8	24829	24836	0 %	75 %	0 %	25 %	322830756
67	NC_015061	GGCA	2	8	25485	25492	25 %	0 %	50 %	25 %	322830757
68	NC_015061	GGCG	2	8	26247	26254	0 %	0 %	75 %	25 %	322830757
69	NC_015061	GCTC	2	8	26939	26946	0 %	25 %	25 %	50 %	322830757
70	NC_015061	CGGA	2	8	26992	26999	25 %	0 %	50 %	25 %	322830757
71	NC_015061	ACGG	2	8	27010	27017	25 %	0 %	50 %	25 %	322830757
72	NC_015061	CCGA	2	8	28404	28411	25 %	0 %	25 %	50 %	322830760
73	NC_015061	ACTT	2	8	28647	28654	25 %	50 %	0 %	25 %	322830760
74	NC_015061	CTGC	2	8	28935	28942	0 %	25 %	25 %	50 %	322830760
75	NC_015061	ACCG	2	8	30141	30148	25 %	0 %	25 %	50 %	322830761
76	NC_015061	ACCG	2	8	30228	30235	25 %	0 %	25 %	50 %	322830761
77	NC_015061	CTGG	2	8	30250	30257	0 %	25 %	50 %	25 %	322830761
78	NC_015061	GCAT	2	8	30373	30380	25 %	25 %	25 %	25 %	322830761
79	NC_015061	CTCC	2	8	31218	31225	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
80	NC_015061	GCTG	2	8	31450	31457	0 %	25 %	50 %	25 %	322830762
81	NC_015061	CTGA	2	8	32141	32148	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_015061	ACGT	2	8	32695	32702	25 %	25 %	25 %	25 %	322830763
83	NC_015061	GAAA	2	8	32783	32790	75 %	0 %	25 %	0 %	322830763
84	NC_015061	GCAG	2	8	33074	33081	25 %	0 %	50 %	25 %	322830763
85	NC_015061	ATAA	2	8	34236	34243	75 %	25 %	0 %	0 %	322830765
86	NC_015061	CCAG	2	8	34309	34316	25 %	0 %	25 %	50 %	322830765
87	NC_015061	TTTC	2	8	35140	35147	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_015061	GACG	2	8	35479	35486	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_015061	GCTG	2	8	36069	36076	0 %	25 %	50 %	25 %	322830766
90	NC_015061	ATCT	2	8	36222	36229	25 %	50 %	0 %	25 %	322830766
91	NC_015061	ATTT	2	8	36361	36368	25 %	75 %	0 %	0 %	322830766
92	NC_015061	GGCG	2	8	36696	36703	0 %	0 %	75 %	25 %	322830766
93	NC_015061	CGTA	2	8	36714	36721	25 %	25 %	25 %	25 %	322830766
94	NC_015061	CCTG	2	8	36843	36850	0 %	25 %	25 %	50 %	322830766
95	NC_015061	CTGA	2	8	36883	36890	25 %	25 %	25 %	25 %	322830766
96	NC_015061	AGCC	2	8	36996	37003	25 %	0 %	25 %	50 %	322830766
97	NC_015061	TGAC	2	8	37046	37053	25 %	25 %	25 %	25 %	322830766
98	NC_015061	CCAG	2	8	38014	38021	25 %	0 %	25 %	50 %	322830767
99	NC_015061	AAAG	2	8	38818	38825	75 %	0 %	25 %	0 %	322830768
100	NC_015061	CGGG	2	8	38832	38839	0 %	0 %	75 %	25 %	322830768
101	NC_015061	AAAT	2	8	39463	39470	75 %	25 %	0 %	0 %	322830768
102	NC_015061	CCGT	2	8	40454	40461	0 %	25 %	25 %	50 %	322830771
103	NC_015061	GTCA	2	8	40483	40490	25 %	25 %	25 %	25 %	322830771
104	NC_015061	CAGG	2	8	41998	42005	25 %	0 %	50 %	25 %	322830772
105	NC_015061	GAAA	2	8	42039	42046	75 %	0 %	25 %	0 %	322830772
106	NC_015061	AAGA	2	8	42145	42152	75 %	0 %	25 %	0 %	322830772
107	NC_015061	AAGA	2	8	42262	42269	75 %	0 %	25 %	0 %	322830772
108	NC_015061	CTGC	2	8	43351	43358	0 %	25 %	25 %	50 %	322830774
109	NC_015061	CTGC	2	8	44839	44846	0 %	25 %	25 %	50 %	322830774
110	NC_015061	TTTG	2	8	44920	44927	0 %	75 %	25 %	0 %	322830774
111	NC_015061	CTGA	2	8	45029	45036	25 %	25 %	25 %	25 %	322830774
112	NC_015061	TTAA	2	8	46132	46139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015061	GCGG	2	8	46694	46701	0 %	0 %	75 %	25 %	322830776
114	NC_015061	GGCT	2	8	47042	47049	0 %	25 %	50 %	25 %	322830776
115	NC_015061	CGCC	2	8	47658	47665	0 %	0 %	25 %	75 %	322830777
116	NC_015061	GCTG	2	8	47729	47736	0 %	25 %	50 %	25 %	322830777
117	NC_015061	AAAG	2	8	48262	48269	75 %	0 %	25 %	0 %	322830777
118	NC_015061	GCTG	2	8	49151	49158	0 %	25 %	50 %	25 %	322830777
119	NC_015061	GCTG	2	8	49362	49369	0 %	25 %	50 %	25 %	322830777
120	NC_015061	CAAC	2	8	50357	50364	50 %	0 %	0 %	50 %	322830778
121	NC_015061	TGCA	2	8	50617	50624	25 %	25 %	25 %	25 %	322830778
122	NC_015061	TCAG	2	8	50703	50710	25 %	25 %	25 %	25 %	322830778
123	NC_015061	CAAC	2	8	50769	50776	50 %	0 %	0 %	50 %	322830778
124	NC_015061	GTGC	2	8	51831	51838	0 %	25 %	50 %	25 %	322830779
125	NC_015061	CGGG	2	8	52402	52409	0 %	0 %	75 %	25 %	322830780
126	NC_015061	GCAG	2	8	52672	52679	25 %	0 %	50 %	25 %	322830780
127	NC_015061	CTGC	2	8	54251	54258	0 %	25 %	25 %	50 %	322830782
128	NC_015061	GCGG	2	8	54284	54291	0 %	0 %	75 %	25 %	322830782
129	NC_015061	ACAA	2	8	55041	55048	75 %	0 %	0 %	25 %	322830782
130	NC_015061	GGGA	2	8	55196	55203	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015061	GCCA	2	8	55341	55348	25 %	0 %	25 %	50 %	322830783
132	NC_015061	CGCC	2	8	56254	56261	0 %	0 %	25 %	75 %	322830783
133	NC_015061	CGGG	2	8	56580	56587	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
134	NC_015061	GATA	2	8	56774	56781	50 %	25 %	25 %	0 %	322830784
135	NC_015061	TGCG	2	8	56785	56792	0 %	25 %	50 %	25 %	322830784
136	NC_015061	CTGC	2	8	57228	57235	0 %	25 %	25 %	50 %	322830784
137	NC_015061	CAGC	2	8	57332	57339	25 %	0 %	25 %	50 %	322830784
138	NC_015061	GTAC	2	8	57415	57422	25 %	25 %	25 %	25 %	322830784
139	NC_015061	CAGC	2	8	57620	57627	25 %	0 %	25 %	50 %	322830784
140	NC_015061	ATTT	2	8	57803	57810	25 %	75 %	0 %	0 %	322830785
141	NC_015061	AAAT	2	8	57935	57942	75 %	25 %	0 %	0 %	322830785
142	NC_015061	GCCA	2	8	57996	58003	25 %	0 %	25 %	50 %	322830785
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