MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 1926

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015061	ACTG	2	8	2642	2649	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015061	GGCT	2	8	6281	6288	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015061	AAGC	2	8	8947	8954	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015061	AGTA	2	8	10298	10305	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015061	TATT	2	8	10316	10323	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015061	ATAA	2	8	11281	11288	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015061	GAAT	2	8	11362	11369	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015061	ATAA	2	8	11396	11403	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015061	CAAA	2	8	22157	22164	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015061	CTCC	2	8	31218	31225	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11	NC_015061	CTGA	2	8	32141	32148	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015061	TTTC	2	8	35140	35147	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_015061	GACG	2	8	35479	35486	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015061	TTAA	2	8	46132	46139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015061	GGGA	2	8	55196	55203	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015061	CGGG	2	8	56580	56587	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015061	TCCG	2	8	59578	59585	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015061	TTTC	2	8	65690	65697	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015061	GATT	2	8	67936	67943	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015061	AGCG	2	8	69573	69580	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015061	TTAA	2	8	84533	84540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015061	GAAA	2	8	85148	85155	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015061	CAGT	2	8	87008	87015	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015061	CTCC	2	8	95403	95410	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
25	NC_015061	CCGC	2	8	98262	98269	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
26	NC_015061	TGTT	3	12	98605	98616	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015061	GCCT	2	8	100555	100562	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_015061	AAGA	2	8	100631	100638	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015061	TTTC	2	8	104784	104791	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_015061	AAGC	2	8	106033	106040	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_015061	ACTG	2	8	107337	107344	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_015061	CCCG	2	8	119118	119125	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33	NC_015061	CTGG	2	8	119322	119329	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_015061	ATGT	2	8	119480	119487	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015061	ATTT	2	8	123235	123242	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015061	CGTT	2	8	123329	123336	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015061	CGAC	2	8	123443	123450	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015061	TCGG	2	8	125037	125044	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_015061	CTCC	2	8	125045	125052	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
40	NC_015061	GTCA	2	8	126213	126220	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_015061	GATA	2	8	126680	126687	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015061	CCTG	2	8	127731	127738	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015061	GGGA	2	8	132117	132124	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015061	TAAA	2	8	132132	132139	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015061	ACTG	2	8	132293	132300	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_015061	TCAG	2	8	132328	132335	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_015061	AAAT	2	8	136141	136148	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015061	GGCA	2	8	144280	144287	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015061	GTCA	2	8	144297	144304	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_015061	CAAA	2	8	155134	155141	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_015061	GATG	2	8	159050	159057	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015061	TGAG	2	8	161340	161347	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015061	ATTT	2	8	168039	168046	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015061	ATTA	2	8	168889	168896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015061	TTAA	2	8	168902	168909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015061	GCAG	2	8	173564	173571	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_015061	TTTA	2	8	173665	173672	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015061	ATCA	2	8	174371	174378	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_015061	CAGC	2	8	175100	175107	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_015061	GCTG	2	8	175120	175127	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_015061	GAAT	2	8	178046	178053	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015061	ACTT	2	8	178092	178099	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_015061	TGCT	2	8	180828	180835	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_015061	TGAT	2	8	180978	180985	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015061	ATAA	2	8	181124	181131	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015061	CCTG	2	8	184698	184705	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_015061	TAAA	2	8	197518	197525	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015061	ATAA	2	8	197569	197576	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015061	GGGC	2	8	197658	197665	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
70	NC_015061	GAAA	2	8	198114	198121	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015061	GAGG	2	8	198125	198132	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015061	TATC	2	8	199845	199852	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_015061	GTCT	2	8	199909	199916	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_015061	ATTA	2	8	203456	203463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015061	AAGC	2	8	206843	206850	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_015061	AGCC	2	8	208874	208881	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015061	GCTC	2	8	208933	208940	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_015061	TAAT	2	8	227646	227653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015061	CTCC	2	8	237173	237180	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
80	NC_015061	CTAA	2	8	237300	237307	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015061	ACAA	2	8	238892	238899	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_015061	GGAG	2	8	239045	239052	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015061	TTTG	2	8	246418	246425	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015061	CAAA	2	8	248207	248214	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_015061	CTGA	2	8	256055	256062	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_015061	CAGA	2	8	257460	257467	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_015061	CTTT	2	8	258446	258453	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_015061	TCTT	2	8	258832	258839	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_015061	TAAC	2	8	261601	261608	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_015061	TGCC	2	8	271031	271038	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_015061	TGAT	2	8	271067	271074	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015061	AATT	2	8	287274	287281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015061	TAAA	2	8	287914	287921	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015061	ATTC	2	8	288058	288065	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_015061	GTGG	2	8	290691	290698	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015061	TTTA	2	8	301416	301423	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015061	GACA	2	8	305115	305122	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_015061	GAAT	2	8	313013	313020	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015061	TAAA	2	8	317523	317530	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015061	TATT	2	8	318243	318250	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015061	CCTG	2	8	319897	319904	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_015061	TTAC	2	8	322826	322833	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_015061	TGAG	2	8	324321	324328	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015061	TTTG	2	8	327828	327835	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015061	GCAG	2	8	329277	329284	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_015061	TGAA	2	8	330328	330335	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015061	TAAA	2	8	343191	343198	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015061	TTAA	2	8	344447	344454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015061	AAAG	2	8	351168	351175	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015061	TGCG	2	8	356048	356055	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_015061	TAAG	2	8	360745	360752	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015061	AGTT	2	8	364880	364887	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015061	CATT	2	8	376926	376933	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_015061	AGCC	2	8	389924	389931	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_015061	TGTA	2	8	389939	389946	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015061	ATTG	2	8	398995	399002	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015061	GTAG	2	8	405245	405252	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015061	TTCC	2	8	405502	405509	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_015061	GCCT	2	8	405660	405667	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_015061	CTGA	2	8	406360	406367	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_015061	GTAC	2	8	406444	406451	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_015061	CGTC	2	8	406885	406892	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_015061	AAAG	2	8	407008	407015	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015061	GCTG	2	8	407690	407697	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_015061	AGCT	2	8	408265	408272	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_015061	CAAA	2	8	409424	409431	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_015061	TTTG	2	8	413534	413541	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015061	AAAG	2	8	413693	413700	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015061	GTCA	2	8	420786	420793	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_015061	ATGA	2	8	424652	424659	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015061	GTTT	2	8	424888	424895	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015061	TTCA	2	8	424904	424911	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_015061	GTCC	2	8	428780	428787	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_015061	TAAT	2	8	428816	428823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015061	GAAA	2	8	431284	431291	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015061	AAAC	2	8	431344	431351	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_015061	CCTG	2	8	436147	436154	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_015061	AGGA	2	8	436215	436222	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015061	CTGC	2	8	436394	436401	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_015061	GCAG	2	8	436410	436417	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_015061	TCCT	2	8	436985	436992	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_015061	TTGT	2	8	440542	440549	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015061	TTTG	2	8	440642	440649	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015061	CTTC	2	8	441714	441721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_015061	ATGA	2	8	449248	449255	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015061	AATT	2	8	449397	449404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015061	CTGT	2	8	451792	451799	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_015061	ATTT	2	8	459830	459837	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015061	ACAA	2	8	459860	459867	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_015061	TATT	2	8	473904	473911	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015061	AAAT	2	8	473938	473945	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015061	TTCC	2	8	478125	478132	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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154	NC_015061	CGGG	2	8	478956	478963	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
155	NC_015061	CATT	2	8	494121	494128	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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166	NC_015061	ACTT	2	8	501024	501031	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
167	NC_015061	GAAA	2	8	505557	505564	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
168	NC_015061	TGTT	2	8	512304	512311	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
169	NC_015061	ATTG	2	8	514390	514397	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
170	NC_015061	GTTC	2	8	517774	517781	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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175	NC_015061	TCAT	3	12	536544	536555	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
176	NC_015061	TATT	2	8	536687	536694	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_015061	CAAA	2	8	571664	571671	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
187	NC_015061	GATA	2	8	571807	571814	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
188	NC_015061	CTTA	2	8	572279	572286	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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481	NC_015061	ACAG	2	8	1311423	1311430	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
482	NC_015061	GGGA	2	8	1313690	1313697	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_015061	CTGA	2	8	1360945	1360952	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

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