MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 69375

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015061	CCG	2	6	50	55	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830734
2	NC_015061	GCA	2	6	72	77	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830734
3	NC_015061	ATA	2	6	224	229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322830734
4	NC_015061	TGC	2	6	272	277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830734
5	NC_015061	GCA	2	6	290	295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830734
6	NC_015061	GCG	3	9	496	504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830734
7	NC_015061	TGG	2	6	555	560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830734
8	NC_015061	CAT	2	6	606	611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830734
9	NC_015061	GTG	2	6	634	639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830734
10	NC_015061	AAC	2	6	688	693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322830734
11	NC_015061	TTC	2	6	790	795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830734
12	NC_015061	CTG	2	6	811	816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830734
13	NC_015061	CAG	2	6	826	831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830734
14	NC_015061	ATC	2	6	832	837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830734
15	NC_015061	AGA	2	6	876	881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830734
16	NC_015061	GCC	2	6	927	932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830734
17	NC_015061	TGA	2	6	959	964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830734
18	NC_015061	CGA	2	6	972	977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830734
19	NC_015061	CTT	2	6	1008	1013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830734
20	NC_015061	ATA	2	6	1172	1177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322830734
21	NC_015061	GGT	2	6	1330	1335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830734
22	NC_015061	GAA	2	6	1387	1392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830734
23	NC_015061	AGA	2	6	1407	1412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830734
24	NC_015061	TTG	2	6	1461	1466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322830735
25	NC_015061	AGT	2	6	1502	1507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830735
26	NC_015061	GAC	2	6	1518	1523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830735
27	NC_015061	TTA	2	6	1550	1555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322830735
28	NC_015061	TGG	2	6	1608	1613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830735
29	NC_015061	CCA	2	6	1650	1655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830735
30	NC_015061	CGA	2	6	1807	1812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830735
31	NC_015061	ATT	2	6	1908	1913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322830735
32	NC_015061	GAA	2	6	1943	1948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830735
33	NC_015061	GCA	2	6	2106	2111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830735
34	NC_015061	CGC	2	6	2183	2188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830735
35	NC_015061	AGA	2	6	2356	2361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830735
36	NC_015061	CGG	2	6	2517	2522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830735
37	NC_015061	CGA	2	6	2650	2655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015061	TAG	2	6	2673	2678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015061	GGC	2	6	2723	2728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830736
40	NC_015061	CGG	2	6	2906	2911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830736
41	NC_015061	TGC	2	6	3013	3018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830736
42	NC_015061	CGG	2	6	3059	3064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830736
43	NC_015061	CGG	2	6	3075	3080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830736
44	NC_015061	GTT	2	6	3097	3102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322830736
45	NC_015061	TCA	2	6	3104	3109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830736
46	NC_015061	AGC	2	6	3157	3162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830736
47	NC_015061	CGC	2	6	3167	3172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830736
48	NC_015061	TCT	2	6	3578	3583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830736
49	NC_015061	ATG	2	6	3699	3704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830736
50	NC_015061	CTC	2	6	3804	3809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322830737
51	NC_015061	CAC	2	6	3895	3900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830737
52	NC_015061	CGA	2	6	3930	3935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830737
53	NC_015061	GAT	2	6	4003	4008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830737
54	NC_015061	GAA	2	6	4036	4041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830737
55	NC_015061	CTG	2	6	4052	4057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830737
56	NC_015061	TTC	2	6	4076	4081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830737
57	NC_015061	TGG	2	6	4086	4091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830737
58	NC_015061	CGA	2	6	4098	4103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830737
59	NC_015061	CGG	2	6	4122	4127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830737
60	NC_015061	CGT	2	6	4149	4154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830737
61	NC_015061	CCG	2	6	4188	4193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830737
62	NC_015061	CTG	2	6	4399	4404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830737
63	NC_015061	ATG	2	6	4562	4567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830737
64	NC_015061	CAA	2	6	4596	4601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322830737
65	NC_015061	AAG	2	6	4682	4687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830737
66	NC_015061	TCT	2	6	4810	4815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830737
67	NC_015061	TGA	2	6	4841	4846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830737
68	NC_015061	TGG	2	6	4856	4861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830737
69	NC_015061	ATC	2	6	4909	4914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830737
70	NC_015061	AGC	2	6	4935	4940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830737
71	NC_015061	CCG	2	6	4962	4967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830737
72	NC_015061	CAT	4	12	5262	5273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830737
73	NC_015061	TTC	2	6	5323	5328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830737
74	NC_015061	GAT	2	6	5428	5433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830737
75	NC_015061	TGG	2	6	5534	5539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830737
76	NC_015061	CGT	2	6	5581	5586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830737
77	NC_015061	GCT	2	6	5598	5603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830737
78	NC_015061	AGC	2	6	5708	5713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830737
79	NC_015061	GAA	2	6	5890	5895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830737
80	NC_015061	CGT	2	6	5977	5982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830737
81	NC_015061	ACC	2	6	6043	6048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830737
82	NC_015061	AAC	2	6	6059	6064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322830737
83	NC_015061	GCT	2	6	6100	6105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830737
84	NC_015061	GTT	2	6	6111	6116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322830737
85	NC_015061	GCA	2	6	6395	6400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830738
86	NC_015061	TCG	2	6	6484	6489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830738
87	NC_015061	CAG	2	6	6522	6527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830738
88	NC_015061	GTT	2	6	6532	6537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322830738
89	NC_015061	CAA	2	6	6548	6553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322830738
90	NC_015061	ACT	2	6	6625	6630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830738
91	NC_015061	CAC	2	6	6737	6742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830738
92	NC_015061	ATG	2	6	6807	6812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830738
93	NC_015061	CTG	2	6	6856	6861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830738
94	NC_015061	CAT	2	6	6881	6886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830738
95	NC_015061	TGA	2	6	6988	6993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830738
96	NC_015061	GTG	2	6	7385	7390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830739
97	NC_015061	TCA	2	6	7471	7476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830739
98	NC_015061	CCG	2	6	7557	7562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830739
99	NC_015061	CAT	2	6	7721	7726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830739
100	NC_015061	GAA	2	6	7820	7825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830739
101	NC_015061	GTG	2	6	7914	7919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830739
102	NC_015061	GTG	2	6	7940	7945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830739
103	NC_015061	ATG	2	6	7959	7964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830739
104	NC_015061	TGC	2	6	8013	8018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830739
105	NC_015061	CGG	2	6	8182	8187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830739
106	NC_015061	GCA	2	6	8382	8387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830739
107	NC_015061	ACT	2	6	8491	8496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830740
108	NC_015061	CGA	2	6	8507	8512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830740
109	NC_015061	GTC	2	6	8532	8537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830740
110	NC_015061	TTC	2	6	8588	8593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830740
111	NC_015061	AAT	2	6	8638	8643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322830740
112	NC_015061	GCA	2	6	8650	8655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830740
113	NC_015061	CAG	2	6	8696	8701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830740
114	NC_015061	AAT	2	6	8764	8769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322830740
115	NC_015061	CAC	2	6	8779	8784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830740
116	NC_015061	TCG	2	6	8815	8820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830740
117	NC_015061	TCA	2	6	8839	8844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830740
118	NC_015061	GCG	2	6	8845	8850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830740
119	NC_015061	TCA	2	6	9064	9069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015061	ACA	2	6	9075	9080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015061	ACG	2	6	9139	9144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015061	AGG	2	6	9146	9151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015061	TTC	2	6	9168	9173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015061	TCA	2	6	9176	9181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015061	GCG	2	6	9337	9342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830741
126	NC_015061	ACA	2	6	9445	9450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322830741
127	NC_015061	TGC	2	6	9451	9456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830741
128	NC_015061	CGT	2	6	9614	9619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830741
129	NC_015061	GTC	2	6	9626	9631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830741
130	NC_015061	CAT	2	6	9669	9674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830742
131	NC_015061	GTT	2	6	9676	9681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322830742
132	NC_015061	GAC	2	6	9749	9754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830742
133	NC_015061	ATC	2	6	9759	9764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_015061	AAG	2	6	9773	9778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015061	TCC	2	6	9878	9883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322830743
136	NC_015061	TGA	2	6	9902	9907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830743
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138	NC_015061	TGA	2	6	10273	10278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015061	TGA	2	6	10368	10373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015061	ATA	2	6	10408	10413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322830744
141	NC_015061	TGT	2	6	10500	10505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322830744
142	NC_015061	GTA	2	6	10667	10672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830744
143	NC_015061	TTC	2	6	10721	10726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830744
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145	NC_015061	TGA	2	6	10908	10913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830744
146	NC_015061	ACT	2	6	10924	10929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830744
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149	NC_015061	ATA	2	6	11213	11218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015061	ATG	2	6	11408	11413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015061	TCC	2	6	11489	11494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_015061	CTT	2	6	11542	11547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830745
153	NC_015061	CGC	2	6	11563	11568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830745
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156	NC_015061	GGT	2	6	11711	11716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830745
157	NC_015061	TTC	2	6	11783	11788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830745
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159	NC_015061	GCA	2	6	11869	11874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830745
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162	NC_015061	ATA	2	6	12042	12047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322830745
163	NC_015061	TAA	2	6	12119	12124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322830745
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176	NC_015061	GCA	2	6	12813	12818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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199	NC_015061	CTT	2	6	14300	14305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830747
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242	NC_015061	GAA	2	6	17558	17563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
243	NC_015061	GCC	2	6	17673	17678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830750
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253	NC_015061	CAC	2	6	18206	18211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830750
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255	NC_015061	CAG	2	6	18290	18295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830750
256	NC_015061	GGC	2	6	18317	18322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830750
257	NC_015061	CAG	2	6	18485	18490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830750
258	NC_015061	GTT	2	6	18493	18498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322830750
259	NC_015061	GGC	2	6	18539	18544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830750
260	NC_015061	CTT	2	6	18616	18621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
261	NC_015061	CTG	2	6	18724	18729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830751
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265	NC_015061	CAG	2	6	18942	18947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830751
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352	NC_015061	GCG	2	6	24184	24189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
353	NC_015061	GAT	2	6	24293	24298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830755
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371	NC_015061	GGT	2	6	25280	25285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830756
372	NC_015061	ATT	2	6	25461	25466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
373	NC_015061	TCG	2	6	25498	25503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830757
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498	NC_015061	TTC	2	6	33252	33257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
499	NC_015061	CAG	2	6	33302	33307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
500	NC_015061	TGC	2	6	33368	33373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830764

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