MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 6845

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015061	CGA	2	6	2650	2655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015061	TAG	2	6	2673	2678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015061	TCA	2	6	9064	9069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015061	ACA	2	6	9075	9080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015061	ACG	2	6	9139	9144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015061	AGG	2	6	9146	9151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015061	TTC	2	6	9168	9173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015061	TCA	2	6	9176	9181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015061	ATC	2	6	9759	9764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015061	AAG	2	6	9773	9778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015061	TGA	2	6	10273	10278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015061	TGA	2	6	10368	10373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015061	ATA	2	6	11213	11218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015061	ATG	2	6	11408	11413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015061	TCC	2	6	11489	11494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_015061	CCA	2	6	12799	12804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_015061	GCA	2	6	12813	12818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015061	TAA	2	6	12942	12947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015061	AAT	2	6	14239	14244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015061	GTT	2	6	17447	17452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015061	GAA	2	6	17536	17541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015061	GAA	2	6	17558	17563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015061	CTT	2	6	18616	18621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015061	GCT	2	6	22150	22155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015061	TGA	2	6	23372	23377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015061	TAT	2	6	24078	24083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015061	GGA	2	6	24168	24173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015061	GCG	2	6	24184	24189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015061	ATT	2	6	25461	25466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015061	ATT	2	6	27495	27500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015061	ATG	2	6	27514	27519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015061	GAG	2	6	31265	31270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015061	GAA	3	9	31383	31391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015061	TCT	2	6	33148	33153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015061	CTT	2	6	33246	33251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015061	TTC	2	6	33252	33257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015061	CAG	2	6	33302	33307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015061	AGA	2	6	35100	35105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015061	AAT	2	6	35318	35323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015061	TGA	3	9	35356	35364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015061	AAC	2	6	35516	35521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015061	TTG	2	6	37552	37557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015061	GGC	2	6	37569	37574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015061	TAT	2	6	41864	41869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015061	GAG	2	6	42405	42410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015061	GCT	2	6	43129	43134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015061	TCA	2	6	43216	43221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015061	GTT	2	6	45245	45250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015061	TAA	2	6	45251	45256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015061	TAA	2	6	45303	45308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015061	TGG	2	6	45309	45314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015061	GAA	2	6	45321	45326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015061	CAT	3	9	45407	45415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015061	GGC	2	6	45426	45431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015061	GGC	2	6	46084	46089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015061	GAT	2	6	47239	47244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015061	GCT	2	6	52824	52829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015061	CGA	2	6	52847	52852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015061	GAG	2	6	52857	52862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015061	CTC	2	6	55221	55226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_015061	ATT	2	6	56625	56630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015061	CAA	2	6	56721	56726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015061	AAG	2	6	56735	56740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015061	ATT	2	6	57761	57766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015061	CAT	2	6	57773	57778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015061	GAA	2	6	60212	60217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015061	ATG	2	6	60232	60237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015061	GAC	2	6	60250	60255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015061	CCG	2	6	60265	60270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_015061	ATA	2	6	60923	60928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015061	TCG	2	6	62073	62078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015061	TGT	2	6	63371	63376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015061	CTG	2	6	63393	63398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015061	GAG	2	6	64050	64055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015061	CAG	2	6	65575	65580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015061	TTC	2	6	65674	65679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015061	TGA	2	6	67442	67447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015061	AAG	2	6	68128	68133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015061	GGA	2	6	68238	68243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015061	TCT	2	6	69366	69371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015061	CGT	2	6	69435	69440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015061	CGC	2	6	73753	73758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_015061	CTC	2	6	73779	73784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_015061	ACA	2	6	73822	73827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015061	AAG	2	6	73867	73872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015061	GAA	2	6	75167	75172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015061	TGT	2	6	75957	75962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015061	CAT	2	6	81520	81525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015061	TTG	2	6	81538	81543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015061	TGT	2	6	81555	81560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015061	CAC	2	6	81584	81589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_015061	GAT	2	6	81696	81701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015061	TTA	3	9	81702	81710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015061	CTG	2	6	83941	83946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015061	ATA	2	6	83972	83977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015061	GGC	2	6	83996	84001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015061	GTC	2	6	84519	84524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015061	TAA	2	6	84568	84573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015061	TGT	2	6	85056	85061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015061	AGG	2	6	85085	85090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015061	CCT	2	6	85097	85102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_015061	ACG	2	6	85158	85163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015061	AAT	2	6	85179	85184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015061	GGC	2	6	86983	86988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015061	GTA	2	6	87194	87199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015061	AGG	2	6	87221	87226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015061	ATG	2	6	88260	88265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015061	TCA	2	6	88332	88337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015061	AGA	2	6	88403	88408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015061	CTG	2	6	88453	88458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015061	GAG	2	6	95499	95504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015061	TCA	2	6	95520	95525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015061	GGA	2	6	97033	97038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015061	CCG	2	6	97229	97234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_015061	TAA	2	6	98187	98192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015061	TAA	2	6	98198	98203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015061	ACA	2	6	98295	98300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015061	CAC	2	6	98321	98326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_015061	TGA	2	6	98385	98390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015061	TGC	2	6	98403	98408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015061	TCA	2	6	98467	98472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015061	ATT	2	6	98705	98710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015061	GCA	2	6	98790	98795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015061	CTC	2	6	100586	100591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_015061	CCG	2	6	104702	104707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_015061	TAA	2	6	104735	104740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015061	ATC	2	6	104800	104805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015061	CGA	2	6	105872	105877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_015061	ATT	2	6	105881	105886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015061	CAT	2	6	106042	106047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_015061	ACA	2	6	107311	107316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015061	CGC	2	6	112879	112884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_015061	TGT	2	6	119346	119351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015061	TGA	2	6	119399	119404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015061	ATA	2	6	119412	119417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015061	TCA	2	6	119419	119424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015061	ATT	2	6	119459	119464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015061	AAC	2	6	119501	119506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015061	TGT	2	6	119544	119549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015061	GGT	2	6	119652	119657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015061	CTT	2	6	121680	121685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_015061	CTG	2	6	121732	121737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_015061	CAT	2	6	121796	121801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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147	NC_015061	ATA	2	6	123340	123345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_015061	ATT	2	6	138946	138951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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