MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Granulicella tundricola plasmid pACIX904

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015059	ATGCC	2	10	1828	1837	20 %	20 %	20 %	40 %	322433343
2	NC_015059	CTGGA	2	10	2614	2623	20 %	20 %	40 %	20 %	322433344
3	NC_015059	AGGAA	2	10	4395	4404	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015059	GTTTC	2	10	5083	5092	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_015059	TAATG	2	10	5612	5621	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015059	TGCTT	2	10	11226	11235	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_015059	GCAGC	2	10	14092	14101	20 %	0 %	40 %	40 %	322433353
8	NC_015059	CCCCG	2	10	14634	14643	0 %	0 %	20 %	80 %	322433353
9	NC_015059	CCGCA	2	10	14924	14933	20 %	0 %	20 %	60 %	322433353
10	NC_015059	CAAAG	2	10	15088	15097	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_015059	AACCT	2	10	16011	16020	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_015059	TTACG	2	10	18072	18081	20 %	40 %	20 %	20 %	322433356
13	NC_015059	CCAAC	2	10	19287	19296	40 %	0 %	0 %	60 %	322433357
14	NC_015059	TATCC	2	10	19807	19816	20 %	40 %	0 %	40 %	322433357
15	NC_015059	ATCTC	2	10	19989	19998	20 %	40 %	0 %	40 %	322433357
16	NC_015059	AGAAC	2	10	22341	22350	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_015059	AAGGA	2	10	22919	22928	60 %	0 %	40 %	0 %	322433359
18	NC_015059	AAACG	2	10	24611	24620	60 %	0 %	20 %	20 %	322433360
19	NC_015059	TCTGC	2	10	28385	28394	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_015059	CGGTG	2	10	29629	29638	0 %	20 %	60 %	20 %	322433362
21	NC_015059	CCCTG	2	10	29806	29815	0 %	20 %	20 %	60 %	322433362
22	NC_015059	GCTCC	2	10	31498	31507	0 %	20 %	20 %	60 %	322433362
23	NC_015059	TCCAC	2	10	32402	32411	20 %	20 %	0 %	60 %	322433363
24	NC_015059	ACCTC	2	10	32492	32501	20 %	20 %	0 %	60 %	322433363
25	NC_015059	CCACC	2	10	33824	33833	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
26	NC_015059	GCCGC	2	10	34975	34984	0 %	0 %	40 %	60 %	322433367
27	NC_015059	AGTCG	2	10	35221	35230	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_015059	CGTTA	2	10	36278	36287	20 %	40 %	20 %	20 %	322433368
29	NC_015059	GTGCC	2	10	36353	36362	0 %	20 %	40 %	40 %	322433368
30	NC_015059	CCGCT	2	10	36371	36380	0 %	20 %	20 %	60 %	322433368
31	NC_015059	CAAGG	2	10	37067	37076	40 %	0 %	40 %	20 %	322433370
32	NC_015059	CCCTT	2	10	37403	37412	0 %	40 %	0 %	60 %	322433371
33	NC_015059	TGCTT	2	10	39029	39038	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_015059	TGGAG	2	10	40124	40133	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015059	GTCAC	2	10	40775	40784	20 %	20 %	20 %	40 %	322433376
36	NC_015059	TGCTT	2	10	41670	41679	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_015059	TTCGT	2	10	46903	46912	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_015059	GCCGT	2	10	50060	50069	0 %	20 %	40 %	40 %	322433386
39	NC_015059	TTCAA	2	10	50108	50117	40 %	40 %	0 %	20 %	322433386
40	NC_015059	CGCCC	2	10	51004	51013	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
41	NC_015059	CAATC	2	10	51558	51567	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_015059	TGGAA	2	10	51852	51861	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015059	GCTTC	2	10	52256	52265	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_015059	CGTCG	2	10	52709	52718	0 %	20 %	40 %	40 %	322433389
45	NC_015059	ATCAG	2	10	54482	54491	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_015059	GTTTT	2	10	56325	56334	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015059	TAAGG	2	10	56821	56830	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015059	GTTGC	2	10	58796	58805	0 %	40 %	40 %	20 %	322433395
49	NC_015059	AGCGC	2	10	59492	59501	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
50	NC_015059	CTTCA	2	10	62213	62222	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
51	NC_015059	TACCC	2	10	62282	62291	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
52	NC_015059	AGAGC	2	10	62841	62850	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_015059	GCTGT	2	10	65612	65621	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_015059	CGGTG	2	10	74150	74159	0 %	20 %	60 %	20 %	322433404
55	NC_015059	AACGG	2	10	77793	77802	40 %	0 %	40 %	20 %	322433407
56	NC_015059	CATGT	2	10	78384	78393	20 %	40 %	20 %	20 %	322433407
57	NC_015059	TCTGA	2	10	79722	79731	20 %	40 %	20 %	20 %	322433408
58	NC_015059	ATCGT	2	10	80571	80580	20 %	40 %	20 %	20 %	322433409
59	NC_015059	CCATC	2	10	82671	82680	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
60	NC_015059	CAAAG	2	10	82925	82934	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_015059	GCCGC	2	10	87530	87539	0 %	0 %	40 %	60 %	322433413
62	NC_015059	TTGGG	2	10	90651	90660	0 %	40 %	60 %	0 %	322433415
63	NC_015059	GCTAC	2	10	90945	90954	20 %	20 %	20 %	40 %	322433415
64	NC_015059	GGTTT	2	10	91822	91831	0 %	60 %	40 %	0 %	322433416
65	NC_015059	AAGCT	2	10	94497	94506	40 %	20 %	20 %	20 %	322433418
66	NC_015059	AACGC	2	10	96870	96879	40 %	0 %	20 %	40 %	322433419
67	NC_015059	CACAT	2	10	98140	98149	40 %	20 %	0 %	40 %	322433420
68	NC_015059	TGGAA	2	10	98937	98946	40 %	20 %	40 %	0 %	322433421
69	NC_015059	TGAGC	2	10	99367	99376	20 %	20 %	40 %	20 %	322433421
70	NC_015059	GCAAA	2	10	99676	99685	60 %	0 %	20 %	20 %	322433421
71	NC_015059	TGATC	2	10	102306	102315	20 %	40 %	20 %	20 %	322433424
72	NC_015059	CGATC	2	10	105079	105088	20 %	20 %	20 %	40 %	322433426
73	NC_015059	AAAGC	2	10	108054	108063	60 %	0 %	20 %	20 %	322433427
74	NC_015059	GAACC	2	10	112248	112257	40 %	0 %	20 %	40 %	322433430

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.