MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Granulicella tundricola plasmid pACIX904

Total Repeats: 192

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015059	TCGT	2	8	848	855	0 %	50 %	25 %	25 %	322433343
2	NC_015059	GTCA	2	8	1191	1198	25 %	25 %	25 %	25 %	322433343
3	NC_015059	CTCG	2	8	1590	1597	0 %	25 %	25 %	50 %	322433343
4	NC_015059	GAAC	2	8	1598	1605	50 %	0 %	25 %	25 %	322433343
5	NC_015059	GCCT	2	8	2014	2021	0 %	25 %	25 %	50 %	322433343
6	NC_015059	TGCT	2	8	2110	2117	0 %	50 %	25 %	25 %	322433343
7	NC_015059	TTGA	2	8	2358	2365	25 %	50 %	25 %	0 %	322433344
8	NC_015059	GATC	2	8	2832	2839	25 %	25 %	25 %	25 %	322433344
9	NC_015059	CGAC	2	8	3336	3343	25 %	0 %	25 %	50 %	322433344
10	NC_015059	GCCA	2	8	3706	3713	25 %	0 %	25 %	50 %	322433344
11	NC_015059	AATG	2	8	5310	5317	50 %	25 %	25 %	0 %	322433345
12	NC_015059	TTTG	2	8	5334	5341	0 %	75 %	25 %	0 %	322433345
13	NC_015059	GCCA	2	8	5395	5402	25 %	0 %	25 %	50 %	322433345
14	NC_015059	CGGA	2	8	7646	7653	25 %	0 %	50 %	25 %	322433347
15	NC_015059	GAAA	2	8	8193	8200	75 %	0 %	25 %	0 %	322433349
16	NC_015059	ATCG	2	8	8662	8669	25 %	25 %	25 %	25 %	322433350
17	NC_015059	GCCA	2	8	8936	8943	25 %	0 %	25 %	50 %	322433350
18	NC_015059	CGAA	2	8	10499	10506	50 %	0 %	25 %	25 %	322433351
19	NC_015059	TTCG	2	8	12754	12761	0 %	50 %	25 %	25 %	322433352
20	NC_015059	CACG	2	8	13761	13768	25 %	0 %	25 %	50 %	322433353
21	NC_015059	CGCC	2	8	13990	13997	0 %	0 %	25 %	75 %	322433353
22	NC_015059	CGCA	2	8	14488	14495	25 %	0 %	25 %	50 %	322433353
23	NC_015059	CCGC	2	8	14578	14585	0 %	0 %	25 %	75 %	322433353
24	NC_015059	TCGA	2	8	15648	15655	25 %	25 %	25 %	25 %	322433354
25	NC_015059	TTGG	2	8	16315	16322	0 %	50 %	50 %	0 %	322433355
26	NC_015059	GATC	2	8	16358	16365	25 %	25 %	25 %	25 %	322433355
27	NC_015059	ACCT	2	8	16408	16415	25 %	25 %	0 %	50 %	322433355
28	NC_015059	ATCC	2	8	16761	16768	25 %	25 %	0 %	50 %	322433355
29	NC_015059	GAAC	2	8	16843	16850	50 %	0 %	25 %	25 %	322433355
30	NC_015059	AGGC	2	8	17989	17996	25 %	0 %	50 %	25 %	322433356
31	NC_015059	GAAT	2	8	18403	18410	50 %	25 %	25 %	0 %	322433356
32	NC_015059	CCGA	2	8	19104	19111	25 %	0 %	25 %	50 %	322433357
33	NC_015059	CTGG	2	8	19169	19176	0 %	25 %	50 %	25 %	322433357
34	NC_015059	CGGC	2	8	19308	19315	0 %	0 %	50 %	50 %	322433357
35	NC_015059	TTAT	2	8	19346	19353	25 %	75 %	0 %	0 %	322433357
36	NC_015059	CTTC	2	8	19426	19433	0 %	50 %	0 %	50 %	322433357
37	NC_015059	GTCT	2	8	19456	19463	0 %	50 %	25 %	25 %	322433357
38	NC_015059	GATC	2	8	19476	19483	25 %	25 %	25 %	25 %	322433357
39	NC_015059	TCTT	2	8	19902	19909	0 %	75 %	0 %	25 %	322433357
40	NC_015059	TTGC	2	8	21507	21514	0 %	50 %	25 %	25 %	322433358
41	NC_015059	AGGC	2	8	22845	22852	25 %	0 %	50 %	25 %	322433359
42	NC_015059	ACCT	2	8	22871	22878	25 %	25 %	0 %	50 %	322433359
43	NC_015059	GCTC	2	8	23218	23225	0 %	25 %	25 %	50 %	322433359
44	NC_015059	GGAT	2	8	23486	23493	25 %	25 %	50 %	0 %	322433359
45	NC_015059	GGCC	2	8	24671	24678	0 %	0 %	50 %	50 %	322433360
46	NC_015059	CGAG	2	8	26703	26710	25 %	0 %	50 %	25 %	322433361
47	NC_015059	GCAG	2	8	27036	27043	25 %	0 %	50 %	25 %	322433361
48	NC_015059	GTGC	2	8	27265	27272	0 %	25 %	50 %	25 %	322433361
49	NC_015059	GGCA	2	8	28883	28890	25 %	0 %	50 %	25 %	322433362
50	NC_015059	CTGG	2	8	29177	29184	0 %	25 %	50 %	25 %	322433362
51	NC_015059	CGAG	2	8	29236	29243	25 %	0 %	50 %	25 %	322433362
52	NC_015059	GCAC	2	8	29451	29458	25 %	0 %	25 %	50 %	322433362
53	NC_015059	GCGT	2	8	29747	29754	0 %	25 %	50 %	25 %	322433362
54	NC_015059	CTGG	2	8	30302	30309	0 %	25 %	50 %	25 %	322433362
55	NC_015059	CTCA	2	8	30389	30396	25 %	25 %	0 %	50 %	322433362
56	NC_015059	CTGG	2	8	30569	30576	0 %	25 %	50 %	25 %	322433362
57	NC_015059	CGCT	2	8	30641	30648	0 %	25 %	25 %	50 %	322433362
58	NC_015059	GAAC	2	8	30728	30735	50 %	0 %	25 %	25 %	322433362
59	NC_015059	CTGA	2	8	30808	30815	25 %	25 %	25 %	25 %	322433362
60	NC_015059	GCGT	2	8	31080	31087	0 %	25 %	50 %	25 %	322433362
61	NC_015059	CCGG	2	8	31162	31169	0 %	0 %	50 %	50 %	322433362
62	NC_015059	CGTG	2	8	31611	31618	0 %	25 %	50 %	25 %	322433362
63	NC_015059	CGGT	2	8	31802	31809	0 %	25 %	50 %	25 %	322433363
64	NC_015059	TTCC	2	8	32330	32337	0 %	50 %	0 %	50 %	322433363
65	NC_015059	CGAC	2	8	33498	33505	25 %	0 %	25 %	50 %	322433365
66	NC_015059	GAAG	2	8	34596	34603	50 %	0 %	50 %	0 %	322433367
67	NC_015059	TCCA	2	8	36847	36854	25 %	25 %	0 %	50 %	322433370
68	NC_015059	TGGG	2	8	37284	37291	0 %	25 %	75 %	0 %	322433371
69	NC_015059	GTCG	2	8	37737	37744	0 %	25 %	50 %	25 %	322433371
70	NC_015059	GTTC	2	8	41287	41294	0 %	50 %	25 %	25 %	322433376
71	NC_015059	CCAG	2	8	44280	44287	25 %	0 %	25 %	50 %	322433377
72	NC_015059	GAAG	2	8	44617	44624	50 %	0 %	50 %	0 %	322433377
73	NC_015059	GCCC	2	8	47218	47225	0 %	0 %	25 %	75 %	322433381
74	NC_015059	CGGT	2	8	47406	47413	0 %	25 %	50 %	25 %	322433381
75	NC_015059	GTTC	2	8	47828	47835	0 %	50 %	25 %	25 %	322433382
76	NC_015059	GACG	2	8	47854	47861	25 %	0 %	50 %	25 %	322433382
77	NC_015059	CCTC	2	8	48337	48344	0 %	25 %	0 %	75 %	322433383
78	NC_015059	CGCC	2	8	48863	48870	0 %	0 %	25 %	75 %	322433384
79	NC_015059	TCCT	2	8	49966	49973	0 %	50 %	0 %	50 %	322433386
80	NC_015059	TGGT	2	8	50163	50170	0 %	50 %	50 %	0 %	322433386
81	NC_015059	ACGA	2	8	50640	50647	50 %	0 %	25 %	25 %	322433388
82	NC_015059	ATCG	2	8	52874	52881	25 %	25 %	25 %	25 %	322433389
83	NC_015059	CTCC	2	8	52930	52937	0 %	25 %	0 %	75 %	322433389
84	NC_015059	GCTA	2	8	53091	53098	25 %	25 %	25 %	25 %	322433389
85	NC_015059	TGTC	2	8	55532	55539	0 %	50 %	25 %	25 %	322433393
86	NC_015059	TCTA	2	8	55683	55690	25 %	50 %	0 %	25 %	322433393
87	NC_015059	CAGA	2	8	55769	55776	50 %	0 %	25 %	25 %	322433393
88	NC_015059	GTCA	2	8	55859	55866	25 %	25 %	25 %	25 %	322433393
89	NC_015059	TGCC	2	8	58410	58417	0 %	25 %	25 %	50 %	322433395
90	NC_015059	GAAC	2	8	58742	58749	50 %	0 %	25 %	25 %	322433395
91	NC_015059	CATG	2	8	58917	58924	25 %	25 %	25 %	25 %	322433395
92	NC_015059	CAAA	2	8	60218	60225	75 %	0 %	0 %	25 %	322433396
93	NC_015059	CTAC	2	8	60338	60345	25 %	25 %	0 %	50 %	322433396
94	NC_015059	ATCC	2	8	63919	63926	25 %	25 %	0 %	50 %	322433397
95	NC_015059	TCCG	2	8	63993	64000	0 %	25 %	25 %	50 %	322433397
96	NC_015059	AGTC	2	8	64296	64303	25 %	25 %	25 %	25 %	322433397
97	NC_015059	AGGT	2	8	64563	64570	25 %	25 %	50 %	0 %	322433397
98	NC_015059	ACAT	2	8	65845	65852	50 %	25 %	0 %	25 %	322433398
99	NC_015059	CAAC	2	8	68276	68283	50 %	0 %	0 %	50 %	322433399
100	NC_015059	TCGC	2	8	68392	68399	0 %	25 %	25 %	50 %	322433399
101	NC_015059	GGAT	2	8	68489	68496	25 %	25 %	50 %	0 %	322433399
102	NC_015059	CGGC	2	8	68516	68523	0 %	0 %	50 %	50 %	322433399
103	NC_015059	TGGG	2	8	69062	69069	0 %	25 %	75 %	0 %	322433399
104	NC_015059	TGAT	2	8	69737	69744	25 %	50 %	25 %	0 %	322433400
105	NC_015059	CGAA	2	8	70134	70141	50 %	0 %	25 %	25 %	322433400
106	NC_015059	AGAT	2	8	70878	70885	50 %	25 %	25 %	0 %	322433401
107	NC_015059	TGAC	2	8	71050	71057	25 %	25 %	25 %	25 %	322433401
108	NC_015059	TCCA	2	8	71152	71159	25 %	25 %	0 %	50 %	322433401
109	NC_015059	AGTT	2	8	72571	72578	25 %	50 %	25 %	0 %	322433402
110	NC_015059	GCTG	2	8	72827	72834	0 %	25 %	50 %	25 %	322433402
111	NC_015059	CGAA	2	8	73184	73191	50 %	0 %	25 %	25 %	322433402
112	NC_015059	GGTG	2	8	73278	73285	0 %	25 %	75 %	0 %	322433403
113	NC_015059	CGAG	2	8	73659	73666	25 %	0 %	50 %	25 %	322433403
114	NC_015059	AAGT	2	8	74872	74879	50 %	25 %	25 %	0 %	322433404
115	NC_015059	TTGG	2	8	75222	75229	0 %	50 %	50 %	0 %	322433404
116	NC_015059	CAAT	2	8	75409	75416	50 %	25 %	0 %	25 %	322433405
117	NC_015059	TGAG	2	8	75419	75426	25 %	25 %	50 %	0 %	322433405
118	NC_015059	CACG	2	8	75653	75660	25 %	0 %	25 %	50 %	322433405
119	NC_015059	TTGC	2	8	75672	75679	0 %	50 %	25 %	25 %	322433405
120	NC_015059	GATT	2	8	75724	75731	25 %	50 %	25 %	0 %	322433405
121	NC_015059	AACC	2	8	75796	75803	50 %	0 %	0 %	50 %	322433405
122	NC_015059	ATCC	2	8	76671	76678	25 %	25 %	0 %	50 %	322433406
123	NC_015059	TAGG	2	8	77811	77818	25 %	25 %	50 %	0 %	322433407
124	NC_015059	CATT	2	8	77863	77870	25 %	50 %	0 %	25 %	322433407
125	NC_015059	TTCC	2	8	78156	78163	0 %	50 %	0 %	50 %	322433407
126	NC_015059	TGAT	2	8	79335	79342	25 %	50 %	25 %	0 %	322433408
127	NC_015059	TTGG	2	8	80032	80039	0 %	50 %	50 %	0 %	322433408
128	NC_015059	ACGA	2	8	80562	80569	50 %	0 %	25 %	25 %	322433409
129	NC_015059	CTGC	2	8	80613	80620	0 %	25 %	25 %	50 %	322433409
130	NC_015059	ATCT	2	8	81331	81338	25 %	50 %	0 %	25 %	322433409
131	NC_015059	CAAA	2	8	83266	83273	75 %	0 %	0 %	25 %	322433410
132	NC_015059	AGGC	2	8	83373	83380	25 %	0 %	50 %	25 %	322433410
133	NC_015059	ATGA	2	8	84533	84540	50 %	25 %	25 %	0 %	322433411
134	NC_015059	CTGG	2	8	85569	85576	0 %	25 %	50 %	25 %	322433412
135	NC_015059	CGTA	2	8	85840	85847	25 %	25 %	25 %	25 %	322433412
136	NC_015059	CCTC	2	8	85897	85904	0 %	25 %	0 %	75 %	322433412
137	NC_015059	GACT	2	8	86710	86717	25 %	25 %	25 %	25 %	322433413
138	NC_015059	GCTT	2	8	87277	87284	0 %	50 %	25 %	25 %	322433413
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.