MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Granulicella tundricola plasmid pACIX904

Total Repeats: 220

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015059	AC	3	6	106	111	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015059	CA	3	6	187	192	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015059	GC	4	8	556	563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015059	TG	3	6	775	780	0 %	50 %	50 %	0 %	322433343
5	NC_015059	GC	3	6	836	841	0 %	0 %	50 %	50 %	322433343
6	NC_015059	GA	4	8	1251	1258	50 %	0 %	50 %	0 %	322433343
7	NC_015059	CA	3	6	1777	1782	50 %	0 %	0 %	50 %	322433343
8	NC_015059	TG	3	6	2807	2812	0 %	50 %	50 %	0 %	322433344
9	NC_015059	CA	3	6	3048	3053	50 %	0 %	0 %	50 %	322433344
10	NC_015059	CA	3	6	3482	3487	50 %	0 %	0 %	50 %	322433344
11	NC_015059	AC	3	6	4282	4287	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015059	CT	3	6	4713	4718	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015059	GA	3	6	4976	4981	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015059	TG	3	6	5063	5068	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015059	GC	3	6	5369	5374	0 %	0 %	50 %	50 %	322433345
16	NC_015059	TA	3	6	5711	5716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015059	GC	3	6	6061	6066	0 %	0 %	50 %	50 %	322433346
18	NC_015059	TC	3	6	7818	7823	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015059	TC	4	8	8144	8151	0 %	50 %	0 %	50 %	322433349
20	NC_015059	AG	3	6	8342	8347	50 %	0 %	50 %	0 %	322433349
21	NC_015059	CG	3	6	9156	9161	0 %	0 %	50 %	50 %	322433350
22	NC_015059	CG	3	6	9545	9550	0 %	0 %	50 %	50 %	322433351
23	NC_015059	GC	3	6	10032	10037	0 %	0 %	50 %	50 %	322433351
24	NC_015059	GC	3	6	10610	10615	0 %	0 %	50 %	50 %	322433351
25	NC_015059	AG	3	6	10813	10818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015059	GT	3	6	11181	11186	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015059	GC	3	6	13869	13874	0 %	0 %	50 %	50 %	322433353
28	NC_015059	CG	3	6	14009	14014	0 %	0 %	50 %	50 %	322433353
29	NC_015059	CA	3	6	14256	14261	50 %	0 %	0 %	50 %	322433353
30	NC_015059	CG	3	6	15013	15018	0 %	0 %	50 %	50 %	322433353
31	NC_015059	AT	3	6	15148	15153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015059	CT	3	6	15546	15551	0 %	50 %	0 %	50 %	322433354
33	NC_015059	CT	3	6	16607	16612	0 %	50 %	0 %	50 %	322433355
34	NC_015059	GC	3	6	16927	16932	0 %	0 %	50 %	50 %	322433355
35	NC_015059	GC	3	6	17187	17192	0 %	0 %	50 %	50 %	322433355
36	NC_015059	GT	3	6	17685	17690	0 %	50 %	50 %	0 %	322433356
37	NC_015059	GA	3	6	17728	17733	50 %	0 %	50 %	0 %	322433356
38	NC_015059	CA	3	6	19161	19166	50 %	0 %	0 %	50 %	322433357
39	NC_015059	TA	3	6	19226	19231	50 %	50 %	0 %	0 %	322433357
40	NC_015059	CA	3	6	19326	19331	50 %	0 %	0 %	50 %	322433357
41	NC_015059	TC	3	6	19603	19608	0 %	50 %	0 %	50 %	322433357
42	NC_015059	TC	3	6	19946	19951	0 %	50 %	0 %	50 %	322433357
43	NC_015059	TC	3	6	20374	20379	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015059	GA	3	6	20889	20894	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015059	CG	4	8	20994	21001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_015059	CA	3	6	21718	21723	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015059	AG	3	6	22831	22836	50 %	0 %	50 %	0 %	322433359
48	NC_015059	TA	3	6	23150	23155	50 %	50 %	0 %	0 %	322433359
49	NC_015059	CT	3	6	23286	23291	0 %	50 %	0 %	50 %	322433359
50	NC_015059	GA	3	6	23498	23503	50 %	0 %	50 %	0 %	322433359
51	NC_015059	GT	3	6	23573	23578	0 %	50 %	50 %	0 %	322433359
52	NC_015059	TC	3	6	24218	24223	0 %	50 %	0 %	50 %	322433360
53	NC_015059	CT	3	6	24420	24425	0 %	50 %	0 %	50 %	322433360
54	NC_015059	CT	4	8	24820	24827	0 %	50 %	0 %	50 %	322433360
55	NC_015059	CT	4	8	25705	25712	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_015059	GC	3	6	25828	25833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_015059	GA	3	6	25912	25917	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015059	GA	3	6	25942	25947	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015059	CG	4	8	26163	26170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_015059	CT	3	6	26392	26397	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_015059	AG	3	6	26790	26795	50 %	0 %	50 %	0 %	322433361
62	NC_015059	TA	3	6	27430	27435	50 %	50 %	0 %	0 %	322433361
63	NC_015059	TC	4	8	27451	27458	0 %	50 %	0 %	50 %	322433361
64	NC_015059	AG	3	6	27570	27575	50 %	0 %	50 %	0 %	322433361
65	NC_015059	GC	3	6	28916	28921	0 %	0 %	50 %	50 %	322433362
66	NC_015059	AG	3	6	29398	29403	50 %	0 %	50 %	0 %	322433362
67	NC_015059	CG	3	6	30179	30184	0 %	0 %	50 %	50 %	322433362
68	NC_015059	GC	3	6	31238	31243	0 %	0 %	50 %	50 %	322433362
69	NC_015059	AC	3	6	32435	32440	50 %	0 %	0 %	50 %	322433363
70	NC_015059	GA	3	6	32486	32491	50 %	0 %	50 %	0 %	322433363
71	NC_015059	GA	4	8	32603	32610	50 %	0 %	50 %	0 %	322433363
72	NC_015059	GC	3	6	32919	32924	0 %	0 %	50 %	50 %	322433364
73	NC_015059	AC	3	6	33143	33148	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015059	AG	3	6	33895	33900	50 %	0 %	50 %	0 %	322433366
75	NC_015059	AC	3	6	34112	34117	50 %	0 %	0 %	50 %	322433366
76	NC_015059	GC	3	6	34301	34306	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015059	TC	3	6	34403	34408	0 %	50 %	0 %	50 %	322433367
78	NC_015059	AC	3	6	34853	34858	50 %	0 %	0 %	50 %	322433367
79	NC_015059	CA	3	6	36695	36700	50 %	0 %	0 %	50 %	322433369
80	NC_015059	GC	3	6	37729	37734	0 %	0 %	50 %	50 %	322433371
81	NC_015059	TC	3	6	38135	38140	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_015059	GA	3	6	38595	38600	50 %	0 %	50 %	0 %	322433372
83	NC_015059	AG	3	6	38638	38643	50 %	0 %	50 %	0 %	322433372
84	NC_015059	GT	3	6	38984	38989	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015059	TG	3	6	40297	40302	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015059	GT	3	6	40596	40601	0 %	50 %	50 %	0 %	322433375
87	NC_015059	AC	3	6	40783	40788	50 %	0 %	0 %	50 %	322433376
88	NC_015059	TC	3	6	41231	41236	0 %	50 %	0 %	50 %	322433376
89	NC_015059	AC	3	6	41398	41403	50 %	0 %	0 %	50 %	322433376
90	NC_015059	GT	3	6	41625	41630	0 %	50 %	50 %	0 %	322433376
91	NC_015059	CT	3	6	43453	43458	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_015059	AG	4	8	43860	43867	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015059	CT	3	6	44123	44128	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_015059	CA	3	6	45166	45171	50 %	0 %	0 %	50 %	322433378
95	NC_015059	CT	3	6	45245	45250	0 %	50 %	0 %	50 %	322433378
96	NC_015059	GC	3	6	45469	45474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_015059	GC	3	6	45944	45949	0 %	0 %	50 %	50 %	322433379
98	NC_015059	TA	3	6	47576	47581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015059	TG	3	6	48708	48713	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015059	AC	3	6	49850	49855	50 %	0 %	0 %	50 %	322433386
101	NC_015059	CG	3	6	50546	50551	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_015059	AG	3	6	52193	52198	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015059	AG	3	6	53229	53234	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015059	AG	3	6	53780	53785	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015059	AG	3	6	54026	54031	50 %	0 %	50 %	0 %	322433391
106	NC_015059	GC	3	6	54381	54386	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_015059	CT	3	6	54884	54889	0 %	50 %	0 %	50 %	322433392
108	NC_015059	GT	5	10	55042	55051	0 %	50 %	50 %	0 %	322433392
109	NC_015059	AG	4	8	55670	55677	50 %	0 %	50 %	0 %	322433393
110	NC_015059	AG	3	6	56167	56172	50 %	0 %	50 %	0 %	322433393
111	NC_015059	AG	3	6	56506	56511	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015059	AT	3	6	56800	56805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015059	TA	3	6	57196	57201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015059	GA	3	6	57947	57952	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015059	AG	3	6	58035	58040	50 %	0 %	50 %	0 %	322433394
116	NC_015059	CG	3	6	58378	58383	0 %	0 %	50 %	50 %	322433395
117	NC_015059	AC	3	6	59414	59419	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_015059	GC	4	8	59522	59529	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_015059	CG	3	6	60028	60033	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_015059	CT	3	6	60871	60876	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_015059	AC	3	6	62204	62209	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_015059	AG	4	8	63648	63655	50 %	0 %	50 %	0 %	322433397
123	NC_015059	GA	3	6	63692	63697	50 %	0 %	50 %	0 %	322433397
124	NC_015059	CA	3	6	64834	64839	50 %	0 %	0 %	50 %	322433397
125	NC_015059	CA	5	10	64984	64993	50 %	0 %	0 %	50 %	322433397
126	NC_015059	AG	3	6	67986	67991	50 %	0 %	50 %	0 %	322433399
127	NC_015059	CT	3	6	68177	68182	0 %	50 %	0 %	50 %	322433399
128	NC_015059	TC	3	6	68430	68435	0 %	50 %	0 %	50 %	322433399
129	NC_015059	TG	3	6	68834	68839	0 %	50 %	50 %	0 %	322433399
130	NC_015059	TC	3	6	69364	69369	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_015059	TG	3	6	71373	71378	0 %	50 %	50 %	0 %	322433401
132	NC_015059	AT	3	6	71437	71442	50 %	50 %	0 %	0 %	322433401
133	NC_015059	TA	3	6	72085	72090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015059	CA	3	6	72097	72102	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_015059	GT	3	6	72216	72221	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015059	CG	3	6	72515	72520	0 %	0 %	50 %	50 %	322433402
137	NC_015059	GC	4	8	73921	73928	0 %	0 %	50 %	50 %	322433403
138	NC_015059	GC	3	6	74307	74312	0 %	0 %	50 %	50 %	322433404
139	NC_015059	AG	3	6	75645	75650	50 %	0 %	50 %	0 %	322433405
140	NC_015059	CA	3	6	75884	75889	50 %	0 %	0 %	50 %	322433405
141	NC_015059	GA	3	6	75923	75928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015059	TC	3	6	76067	76072	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_015059	AT	3	6	76228	76233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015059	AC	3	6	76255	76260	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_015059	AC	3	6	76552	76557	50 %	0 %	0 %	50 %	322433406
146	NC_015059	CA	3	6	76793	76798	50 %	0 %	0 %	50 %	322433406
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148	NC_015059	CT	3	6	78348	78353	0 %	50 %	0 %	50 %	322433407
149	NC_015059	TG	3	6	79307	79312	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.