MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Granulicella tundricola plasmid pACIX903

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015058	CAAGGA	2	12	1083	1094	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	322433175
2	NC_015058	CATAGC	2	12	6152	6163	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	322433177
3	NC_015058	CACGTA	2	12	6330	6341	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	322433177
4	NC_015058	GCTATC	2	12	6552	6563	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	322433177
5	NC_015058	AGGTTG	2	12	7899	7910	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	322433178
6	NC_015058	GTCGGA	2	12	13533	13544	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	322433182
7	NC_015058	AAGTTC	2	12	13620	13631	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	322433182
8	NC_015058	TACGAC	2	12	19459	19470	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	322433184
9	NC_015058	AAACCC	2	12	24485	24496	50 %	0 %	0 %	50 %	322433187
10	NC_015058	AACTCA	2	12	25899	25910	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	322433189
11	NC_015058	ATCTTC	2	12	26169	26180	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	322433189
12	NC_015058	GCAGGT	2	12	31428	31439	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	322433192
13	NC_015058	GCGCAG	2	12	33222	33233	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	322433193
14	NC_015058	GAACGC	2	12	36014	36025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322433196
15	NC_015058	CTGCGA	2	12	38011	38022	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	322433198
16	NC_015058	TGCGGT	2	12	38903	38914	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	322433199
17	NC_015058	AACACA	2	12	45393	45404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322433208
18	NC_015058	GAAACG	2	12	47318	47329	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	322433210
19	NC_015058	CAGAAA	2	12	48198	48209	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	322433211
20	NC_015058	TGCCGC	2	12	57331	57342	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	322433223
21	NC_015058	CGGCCT	2	12	60667	60678	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	322433230
22	NC_015058	GAAGCC	2	12	60926	60937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322433230
23	NC_015058	GCCTTC	2	12	62599	62610	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	322433232
24	NC_015058	GGATCT	2	12	63313	63324	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	322433232
25	NC_015058	TGAAAG	2	12	68529	68540	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	322433235
26	NC_015058	CTCGTC	2	12	72109	72120	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	322433236
27	NC_015058	CCACCC	2	12	72368	72379	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	322433236
28	NC_015058	CCATCA	2	12	72608	72619	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	322433236
29	NC_015058	CGCCCG	2	12	75170	75181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322433237
30	NC_015058	TCGCCG	2	12	83673	83684	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	322433244
31	NC_015058	AGGCAT	2	12	91434	91445	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	322433251
32	NC_015058	AAAGCT	2	12	94979	94990	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	322433255
33	NC_015058	AAGCAT	2	12	118754	118765	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	322433275
34	NC_015058	GATCCC	2	12	122134	122145	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	322433278
35	NC_015058	GGCCAG	2	12	125885	125896	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	322433282
36	NC_015058	AAACCC	2	12	125901	125912	50 %	0 %	0 %	50 %	322433282
37	NC_015058	GTAAAA	2	12	126368	126379	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	322433282
38	NC_015058	CGCGGA	2	12	136128	136139	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	322433290
39	NC_015058	TTTCCT	2	12	142637	142648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322433296
40	NC_015058	CAAGGG	2	12	150564	150575	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	322433308
41	NC_015058	TACTTG	2	12	160167	160178	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	322433315
42	NC_015058	CCTATA	2	12	169742	169753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322433321
43	NC_015058	GAAGAT	2	12	177179	177190	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	322433328
44	NC_015058	TGAACC	2	12	180290	180301	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	322433331
45	NC_015058	AGAGCC	2	12	182242	182253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322433332
46	NC_015058	TCGCCG	2	12	182309	182320	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	322433332
47	NC_015058	CTGCCG	2	12	183083	183094	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	322433333

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.