MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Granulicella tundricola plasmid pACIX903

Total Repeats: 109

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015058	GAAGC	2	10	1433	1442	40 %	0 %	40 %	20 %	322433176
2	NC_015058	CATCG	2	10	6369	6378	20 %	20 %	20 %	40 %	322433177
3	NC_015058	TGCAG	2	10	6481	6490	20 %	20 %	40 %	20 %	322433177
4	NC_015058	CTGCG	2	10	6540	6549	0 %	20 %	40 %	40 %	322433177
5	NC_015058	GCAGA	2	10	7871	7880	40 %	0 %	40 %	20 %	322433178
6	NC_015058	CCCTT	2	10	9165	9174	0 %	40 %	0 %	60 %	322433180
7	NC_015058	TCAAG	2	10	9221	9230	40 %	20 %	20 %	20 %	322433180
8	NC_015058	GGGGA	2	10	15060	15069	20 %	0 %	80 %	0 %	322433182
9	NC_015058	GATCG	2	10	15324	15333	20 %	20 %	40 %	20 %	322433182
10	NC_015058	CCAGC	2	10	15640	15649	20 %	0 %	20 %	60 %	322433182
11	NC_015058	GCAAA	2	10	18694	18703	60 %	0 %	20 %	20 %	322433183
12	NC_015058	CAAAC	2	10	19173	19182	60 %	0 %	0 %	40 %	322433183
13	NC_015058	CGCTC	2	10	19823	19832	0 %	20 %	20 %	60 %	322433184
14	NC_015058	GCGCC	2	10	24112	24121	0 %	0 %	40 %	60 %	322433187
15	NC_015058	ACATC	2	10	24745	24754	40 %	20 %	0 %	40 %	322433187
16	NC_015058	TCAGG	2	10	25627	25636	20 %	20 %	40 %	20 %	322433189
17	NC_015058	CCGCT	2	10	27898	27907	0 %	20 %	20 %	60 %	322433190
18	NC_015058	CCTCC	2	10	29715	29724	0 %	20 %	0 %	80 %	322433191
19	NC_015058	GAAGA	2	10	30427	30436	60 %	0 %	40 %	0 %	322433192
20	NC_015058	ACGCC	2	10	31282	31291	20 %	0 %	20 %	60 %	322433192
21	NC_015058	AAGAA	2	10	33949	33958	80 %	0 %	20 %	0 %	322433194
22	NC_015058	AAAGA	2	10	34426	34435	80 %	0 %	20 %	0 %	322433194
23	NC_015058	GGTTG	2	10	37058	37067	0 %	40 %	60 %	0 %	322433197
24	NC_015058	GAGGT	2	10	37554	37563	20 %	20 %	60 %	0 %	322433198
25	NC_015058	CGAGA	2	10	38525	38534	40 %	0 %	40 %	20 %	322433199
26	NC_015058	GCGGA	2	10	38682	38691	20 %	0 %	60 %	20 %	322433199
27	NC_015058	CGAGC	2	10	40183	40192	20 %	0 %	40 %	40 %	322433201
28	NC_015058	GGGAA	2	10	40486	40495	40 %	0 %	60 %	0 %	322433201
29	NC_015058	TGGCG	2	10	40861	40870	0 %	20 %	60 %	20 %	322433201
30	NC_015058	CGTCT	2	10	41959	41968	0 %	40 %	20 %	40 %	322433202
31	NC_015058	GCAAT	2	10	51067	51076	40 %	20 %	20 %	20 %	322433213
32	NC_015058	TGCAT	2	10	51847	51856	20 %	40 %	20 %	20 %	322433214
33	NC_015058	TTGGC	2	10	52463	52472	0 %	40 %	40 %	20 %	322433215
34	NC_015058	ATCGC	2	10	53192	53201	20 %	20 %	20 %	40 %	322433216
35	NC_015058	CACTT	2	10	56007	56016	20 %	40 %	0 %	40 %	322433221
36	NC_015058	CAGAT	2	10	57557	57566	40 %	20 %	20 %	20 %	322433223
37	NC_015058	GCGTT	2	10	57966	57975	0 %	40 %	40 %	20 %	322433225
38	NC_015058	GGTAG	2	10	58789	58798	20 %	20 %	60 %	0 %	322433226
39	NC_015058	CACGC	2	10	61820	61829	20 %	0 %	20 %	60 %	322433231
40	NC_015058	CAACC	2	10	71532	71541	40 %	0 %	0 %	60 %	322433236
41	NC_015058	CATCG	2	10	74896	74905	20 %	20 %	20 %	40 %	322433237
42	NC_015058	GCTAT	2	10	75041	75050	20 %	40 %	20 %	20 %	322433237
43	NC_015058	GAGAA	2	10	75188	75197	60 %	0 %	40 %	0 %	322433237
44	NC_015058	CGCAC	2	10	75748	75757	20 %	0 %	20 %	60 %	322433237
45	NC_015058	GCGCT	2	10	80644	80653	0 %	20 %	40 %	40 %	322433241
46	NC_015058	AGCGG	2	10	81664	81673	20 %	0 %	60 %	20 %	322433241
47	NC_015058	GACAT	2	10	82304	82313	40 %	20 %	20 %	20 %	322433242
48	NC_015058	CGGAG	2	10	82465	82474	20 %	0 %	60 %	20 %	322433242
49	NC_015058	TTCCG	2	10	82781	82790	0 %	40 %	20 %	40 %	322433243
50	NC_015058	GACCT	2	10	86566	86575	20 %	20 %	20 %	40 %	322433247
51	NC_015058	TCGTC	2	10	89891	89900	0 %	40 %	20 %	40 %	322433250
52	NC_015058	GGGAT	2	10	89905	89914	20 %	20 %	60 %	0 %	322433250
53	NC_015058	CAGCC	2	10	90066	90075	20 %	0 %	20 %	60 %	322433250
54	NC_015058	CAGAC	2	10	90370	90379	40 %	0 %	20 %	40 %	322433250
55	NC_015058	AGGCG	2	10	90637	90646	20 %	0 %	60 %	20 %	322433250
56	NC_015058	GGAAT	2	10	90983	90992	40 %	20 %	40 %	0 %	322433251
57	NC_015058	AATCT	2	10	94372	94381	40 %	40 %	0 %	20 %	322433254
58	NC_015058	AGCGG	2	10	97055	97064	20 %	0 %	60 %	20 %	322433259
59	NC_015058	GATTT	2	10	101459	101468	20 %	60 %	20 %	0 %	322433261
60	NC_015058	GTTTT	2	10	103860	103869	0 %	80 %	20 %	0 %	322433264
61	NC_015058	CACGA	2	10	108459	108468	40 %	0 %	20 %	40 %	322433268
62	NC_015058	GAATG	2	10	108683	108692	40 %	20 %	40 %	0 %	322433268
63	NC_015058	ATGCC	2	10	110358	110367	20 %	20 %	20 %	40 %	322433270
64	NC_015058	CCATT	2	10	110940	110949	20 %	40 %	0 %	40 %	322433270
65	NC_015058	GATCG	2	10	112697	112706	20 %	20 %	40 %	20 %	322433271
66	NC_015058	GCGGA	2	10	113628	113637	20 %	0 %	60 %	20 %	322433273
67	NC_015058	CGATC	2	10	121124	121133	20 %	20 %	20 %	40 %	322433278
68	NC_015058	CCCAA	2	10	123271	123280	40 %	0 %	0 %	60 %	322433280
69	NC_015058	CAACC	2	10	124824	124833	40 %	0 %	0 %	60 %	322433281
70	NC_015058	CAGGT	2	10	124936	124945	20 %	20 %	40 %	20 %	322433281
71	NC_015058	GCCCG	2	10	124955	124964	0 %	0 %	40 %	60 %	322433281
72	NC_015058	CGAAC	2	10	125987	125996	40 %	0 %	20 %	40 %	322433282
73	NC_015058	ATGAG	2	10	126597	126606	40 %	20 %	40 %	0 %	322433283
74	NC_015058	TTCAG	2	10	131179	131188	20 %	40 %	20 %	20 %	322433286
75	NC_015058	CCGCC	2	10	132243	132252	0 %	0 %	20 %	80 %	322433287
76	NC_015058	GAACC	2	10	132934	132943	40 %	0 %	20 %	40 %	322433288
77	NC_015058	TTTCG	2	10	134641	134650	0 %	60 %	20 %	20 %	322433289
78	NC_015058	GAACT	2	10	136363	136372	40 %	20 %	20 %	20 %	322433290
79	NC_015058	CATGG	2	10	137191	137200	20 %	20 %	40 %	20 %	322433292
80	NC_015058	TGGAA	2	10	137473	137482	40 %	20 %	40 %	0 %	322433292
81	NC_015058	AAGGG	2	10	143563	143572	40 %	0 %	60 %	0 %	322433297
82	NC_015058	CCAGC	2	10	143968	143977	20 %	0 %	20 %	60 %	322433298
83	NC_015058	GCAGC	2	10	144376	144385	20 %	0 %	40 %	40 %	322433298
84	NC_015058	ACGGC	2	10	146618	146627	20 %	0 %	40 %	40 %	322433301
85	NC_015058	CGCAA	2	10	147230	147239	40 %	0 %	20 %	40 %	322433302
86	NC_015058	GGAAG	2	10	149887	149896	40 %	0 %	60 %	0 %	322433307
87	NC_015058	TTCCG	2	10	150794	150803	0 %	40 %	20 %	40 %	322433308
88	NC_015058	GCACA	2	10	150847	150856	40 %	0 %	20 %	40 %	322433308
89	NC_015058	CACTC	2	10	151451	151460	20 %	20 %	0 %	60 %	322433308
90	NC_015058	TCCAC	2	10	153090	153099	20 %	20 %	0 %	60 %	322433309
91	NC_015058	CGCTT	2	10	159218	159227	0 %	40 %	20 %	40 %	322433313
92	NC_015058	AAAGC	2	10	159888	159897	60 %	0 %	20 %	20 %	322433314
93	NC_015058	AGGAG	2	10	162167	162176	40 %	0 %	60 %	0 %	322433318
94	NC_015058	CAGCC	2	10	162394	162403	20 %	0 %	20 %	60 %	322433318
95	NC_015058	AAACG	2	10	163002	163011	60 %	0 %	20 %	20 %	322433318
96	NC_015058	ATCCG	2	10	164237	164246	20 %	20 %	20 %	40 %	322433318
97	NC_015058	GCCGT	2	10	164296	164305	0 %	20 %	40 %	40 %	322433318
98	NC_015058	GCCAG	2	10	167882	167891	20 %	0 %	40 %	40 %	322433321
99	NC_015058	GATCA	2	10	169483	169492	40 %	20 %	20 %	20 %	322433321
100	NC_015058	CCGCT	2	10	169848	169857	0 %	20 %	20 %	60 %	322433321
101	NC_015058	AGGCA	2	10	172528	172537	40 %	0 %	40 %	20 %	322433324
102	NC_015058	ATTCG	2	10	174028	174037	20 %	40 %	20 %	20 %	322433326
103	NC_015058	ACCAA	2	10	174187	174196	60 %	0 %	0 %	40 %	322433326
104	NC_015058	GCTGG	2	10	180390	180399	0 %	20 %	60 %	20 %	322433331
105	NC_015058	TAGTC	2	10	182289	182298	20 %	40 %	20 %	20 %	322433332
106	NC_015058	GACCA	2	10	183766	183775	40 %	0 %	20 %	40 %	322433334
107	NC_015058	TCGAA	2	10	185538	185547	40 %	20 %	20 %	20 %	322433336
108	NC_015058	TGACC	2	10	186552	186561	20 %	20 %	20 %	40 %	322433337
109	NC_015058	GGGCA	2	10	186787	186796	20 %	0 %	60 %	20 %	322433337

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.