MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Granulicella tundricola plasmid pACIX903

Total Repeats: 111

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015058	GATC	2	8	127	134	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015058	CGCT	2	8	178	185	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015058	TGGC	2	8	2328	2335	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015058	GCCG	2	8	2339	2346	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015058	GACA	2	8	2441	2448	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_015058	GATC	2	8	3203	3210	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_015058	TCAA	2	8	3677	3684	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_015058	CAAA	2	8	3700	3707	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_015058	GCCA	2	8	4309	4316	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015058	CTGG	2	8	4624	4631	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015058	CCTG	2	8	4710	4717	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015058	GAAG	2	8	5070	5077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015058	GTTT	2	8	6863	6870	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015058	CTTT	2	8	6905	6912	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015058	GCCG	2	8	7184	7191	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_015058	CTGA	2	8	10008	10015	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015058	TCCT	2	8	12182	12189	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015058	TCCT	2	8	12256	12263	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015058	TGGC	2	8	16014	16021	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_015058	GCGG	2	8	16497	16504	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015058	TTGT	2	8	16558	16565	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015058	GTCG	2	8	17055	17062	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_015058	ACTT	2	8	17756	17763	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015058	CGAA	2	8	17979	17986	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_015058	CTGG	2	8	19196	19203	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_015058	AGCC	2	8	21075	21082	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015058	TGCA	2	8	21121	21128	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015058	AGAT	2	8	21459	21466	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015058	CCAT	2	8	21560	21567	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015058	GTCC	2	8	21593	21600	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015058	ACCA	2	8	21649	21656	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_015058	CCCT	2	8	22162	22169	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
33	NC_015058	CTCC	2	8	22258	22265	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
34	NC_015058	ATGG	2	8	22572	22579	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015058	GATG	2	8	22721	22728	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015058	AGCC	2	8	22855	22862	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015058	AGCC	2	8	22937	22944	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015058	TGGG	2	8	23071	23078	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015058	CCGG	2	8	35345	35352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015058	TCGC	2	8	35488	35495	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_015058	CAAA	2	8	35639	35646	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_015058	GGTT	2	8	36512	36519	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015058	GAAG	2	8	39277	39284	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015058	GACT	2	8	39355	39362	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_015058	TTGT	2	8	41303	41310	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015058	TCCG	2	8	42213	42220	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015058	GCCT	2	8	42525	42532	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015058	CCAG	2	8	42747	42754	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015058	GTCG	2	8	44779	44786	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_015058	GGCA	2	8	50650	50657	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_015058	AACT	2	8	55771	55778	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_015058	GCTT	2	8	57142	57149	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_015058	GAAC	2	8	57180	57187	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_015058	GACA	2	8	57673	57680	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_015058	CCAA	2	8	60087	60094	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_015058	AGTC	2	8	62179	62186	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_015058	GAAT	2	8	64758	64765	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015058	CTGG	2	8	64916	64923	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_015058	TGCC	2	8	66355	66362	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_015058	GAGC	2	8	67569	67576	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_015058	AACC	2	8	69070	69077	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015058	AAGG	2	8	69103	69110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015058	GCGA	2	8	69303	69310	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_015058	AAGC	2	8	77781	77788	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_015058	GCTC	2	8	77947	77954	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_015058	TACC	2	8	78334	78341	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_015058	CGCA	2	8	80184	80191	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_015058	CCCG	2	8	85867	85874	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
69	NC_015058	GTTG	2	8	86928	86935	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015058	GTTT	2	8	86948	86955	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015058	GGGA	2	8	95200	95207	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015058	TCCT	2	8	97093	97100	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_015058	TGGA	2	8	97781	97788	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015058	TGCC	2	8	98513	98520	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_015058	TGCC	2	8	103631	103638	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015058	ATGA	2	8	105539	105546	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015058	GATA	2	8	107897	107904	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015058	CGCA	2	8	110028	110035	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_015058	AGTG	2	8	115242	115249	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015058	GAAC	2	8	115257	115264	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015058	TCGG	2	8	115408	115415	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_015058	CGCT	2	8	116197	116204	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_015058	TGCT	2	8	116640	116647	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_015058	GACG	2	8	117031	117038	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_015058	GGTT	2	8	117530	117537	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015058	AAGA	2	8	118188	118195	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015058	ATCT	2	8	118394	118401	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_015058	AAGA	2	8	120752	120759	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015058	CATC	2	8	128508	128515	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_015058	GCGG	2	8	128611	128618	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
91	NC_015058	CTTT	2	8	128822	128829	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_015058	GCGG	2	8	131497	131504	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
93	NC_015058	CCCT	2	8	131531	131538	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
94	NC_015058	TCTG	2	8	132565	132572	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_015058	ACGC	2	8	132612	132619	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_015058	TTCC	2	8	133246	133253	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_015058	GCTT	2	8	133281	133288	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_015058	ACAA	2	8	138060	138067	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_015058	ATCA	2	8	139059	139066	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_015058	CTTA	2	8	155332	155339	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_015058	TCTT	2	8	156773	156780	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_015058	CCGG	2	8	156877	156884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_015058	CCGG	2	8	157778	157785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_015058	CGAA	2	8	157882	157889	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_015058	CAGC	2	8	158367	158374	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_015058	CAAA	2	8	164415	164422	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_015058	CGCT	2	8	164615	164622	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_015058	CCCG	2	8	166793	166800	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
109	NC_015058	GCGT	2	8	170684	170691	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_015058	GACG	2	8	188011	188018	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_015058	TCCA	2	8	188019	188026	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.