MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Granulicella tundricola plasmid pACIX903

Total Repeats: 348

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015058	ACAA	2	8	1263	1270	75 %	0 %	0 %	25 %	322433175
2	NC_015058	AGAA	2	8	1971	1978	75 %	0 %	25 %	0 %	322433176
3	NC_015058	GTTT	2	8	1998	2005	0 %	75 %	25 %	0 %	322433176
4	NC_015058	CACT	2	8	5393	5400	25 %	25 %	0 %	50 %	322433177
5	NC_015058	CTGC	2	8	5636	5643	0 %	25 %	25 %	50 %	322433177
6	NC_015058	CTGG	2	8	6532	6539	0 %	25 %	50 %	25 %	322433177
7	NC_015058	GAGC	2	8	8181	8188	25 %	0 %	50 %	25 %	322433179
8	NC_015058	GGCA	2	8	9440	9447	25 %	0 %	50 %	25 %	322433180
9	NC_015058	GCGG	2	8	9598	9605	0 %	0 %	75 %	25 %	322433180
10	NC_015058	TACC	2	8	11827	11834	25 %	25 %	0 %	50 %	322433181
11	NC_015058	CGAT	2	8	12343	12350	25 %	25 %	25 %	25 %	322433182
12	NC_015058	GCAG	2	8	12382	12389	25 %	0 %	50 %	25 %	322433182
13	NC_015058	TGAG	2	8	12424	12431	25 %	25 %	50 %	0 %	322433182
14	NC_015058	TGAC	2	8	13780	13787	25 %	25 %	25 %	25 %	322433182
15	NC_015058	CGGT	2	8	13884	13891	0 %	25 %	50 %	25 %	322433182
16	NC_015058	ATTG	2	8	13923	13930	25 %	50 %	25 %	0 %	322433182
17	NC_015058	CGAA	2	8	14021	14028	50 %	0 %	25 %	25 %	322433182
18	NC_015058	ATGT	2	8	14088	14095	25 %	50 %	25 %	0 %	322433182
19	NC_015058	GCGA	2	8	14301	14308	25 %	0 %	50 %	25 %	322433182
20	NC_015058	AGGT	2	8	14869	14876	25 %	25 %	50 %	0 %	322433182
21	NC_015058	CGAG	2	8	15077	15084	25 %	0 %	50 %	25 %	322433182
22	NC_015058	GCTG	2	8	15263	15270	0 %	25 %	50 %	25 %	322433182
23	NC_015058	ACGA	2	8	15631	15638	50 %	0 %	25 %	25 %	322433182
24	NC_015058	GGAC	2	8	18172	18179	25 %	0 %	50 %	25 %	322433183
25	NC_015058	ATGG	2	8	19337	19344	25 %	25 %	50 %	0 %	322433184
26	NC_015058	AAAC	2	8	19488	19495	75 %	0 %	0 %	25 %	322433184
27	NC_015058	CGAT	2	8	19940	19947	25 %	25 %	25 %	25 %	322433184
28	NC_015058	TGTC	2	8	20162	20169	0 %	50 %	25 %	25 %	322433185
29	NC_015058	TGGC	2	8	20250	20257	0 %	25 %	50 %	25 %	322433185
30	NC_015058	GGCT	2	8	20304	20311	0 %	25 %	50 %	25 %	322433185
31	NC_015058	GCCA	2	8	20396	20403	25 %	0 %	25 %	50 %	322433185
32	NC_015058	TCCC	2	8	23127	23134	0 %	25 %	0 %	75 %	322433186
33	NC_015058	CAGC	2	8	23586	23593	25 %	0 %	25 %	50 %	322433186
34	NC_015058	CCAG	2	8	23606	23613	25 %	0 %	25 %	50 %	322433186
35	NC_015058	GATC	2	8	23847	23854	25 %	25 %	25 %	25 %	322433186
36	NC_015058	CCAC	2	8	24449	24456	25 %	0 %	0 %	75 %	322433187
37	NC_015058	TCCG	2	8	24866	24873	0 %	25 %	25 %	50 %	322433188
38	NC_015058	GCGA	2	8	25657	25664	25 %	0 %	50 %	25 %	322433189
39	NC_015058	CCCG	2	8	25943	25950	0 %	0 %	25 %	75 %	322433189
40	NC_015058	GCTT	2	8	26058	26065	0 %	50 %	25 %	25 %	322433189
41	NC_015058	ATCG	2	8	26351	26358	25 %	25 %	25 %	25 %	322433189
42	NC_015058	CACC	2	8	27093	27100	25 %	0 %	0 %	75 %	322433190
43	NC_015058	CAGC	2	8	27813	27820	25 %	0 %	25 %	50 %	322433190
44	NC_015058	TTCG	2	8	27826	27833	0 %	50 %	25 %	25 %	322433190
45	NC_015058	ATCG	2	8	27931	27938	25 %	25 %	25 %	25 %	322433190
46	NC_015058	CTGC	2	8	28729	28736	0 %	25 %	25 %	50 %	322433191
47	NC_015058	GGGA	2	8	28851	28858	25 %	0 %	75 %	0 %	322433191
48	NC_015058	CGAA	2	8	28984	28991	50 %	0 %	25 %	25 %	322433191
49	NC_015058	CGCT	2	8	29446	29453	0 %	25 %	25 %	50 %	322433191
50	NC_015058	ACCA	2	8	29767	29774	50 %	0 %	0 %	50 %	322433191
51	NC_015058	AAAG	2	8	30447	30454	75 %	0 %	25 %	0 %	322433192
52	NC_015058	AAAG	2	8	30459	30466	75 %	0 %	25 %	0 %	322433192
53	NC_015058	AAGA	2	8	30514	30521	75 %	0 %	25 %	0 %	322433192
54	NC_015058	AAGA	2	8	30547	30554	75 %	0 %	25 %	0 %	322433192
55	NC_015058	CGAC	2	8	30938	30945	25 %	0 %	25 %	50 %	322433192
56	NC_015058	GCAG	2	8	31908	31915	25 %	0 %	50 %	25 %	322433193
57	NC_015058	CCGC	2	8	32181	32188	0 %	0 %	25 %	75 %	322433193
58	NC_015058	CAAG	2	8	32189	32196	50 %	0 %	25 %	25 %	322433193
59	NC_015058	CCTG	2	8	32351	32358	0 %	25 %	25 %	50 %	322433193
60	NC_015058	ACGC	2	8	32482	32489	25 %	0 %	25 %	50 %	322433193
61	NC_015058	ACTC	2	8	33125	33132	25 %	25 %	0 %	50 %	322433193
62	NC_015058	CAGC	2	8	33137	33144	25 %	0 %	25 %	50 %	322433193
63	NC_015058	GATC	2	8	33343	33350	25 %	25 %	25 %	25 %	322433193
64	NC_015058	GACT	2	8	33373	33380	25 %	25 %	25 %	25 %	322433194
65	NC_015058	CAAC	2	8	34138	34145	50 %	0 %	0 %	50 %	322433194
66	NC_015058	ACCG	2	8	34279	34286	25 %	0 %	25 %	50 %	322433194
67	NC_015058	CTTG	2	8	34614	34621	0 %	50 %	25 %	25 %	322433194
68	NC_015058	CAGA	2	8	34635	34642	50 %	0 %	25 %	25 %	322433194
69	NC_015058	CTCA	2	8	34774	34781	25 %	25 %	0 %	50 %	322433194
70	NC_015058	GTCA	2	8	34801	34808	25 %	25 %	25 %	25 %	322433194
71	NC_015058	CTTC	2	8	35811	35818	0 %	50 %	0 %	50 %	322433196
72	NC_015058	AAGG	2	8	37622	37629	50 %	0 %	50 %	0 %	322433198
73	NC_015058	CTGC	2	8	37815	37822	0 %	25 %	25 %	50 %	322433198
74	NC_015058	TGAC	2	8	38125	38132	25 %	25 %	25 %	25 %	322433198
75	NC_015058	TCAC	2	8	40946	40953	25 %	25 %	0 %	50 %	322433201
76	NC_015058	CTGG	2	8	41714	41721	0 %	25 %	50 %	25 %	322433202
77	NC_015058	CAGG	2	8	44497	44504	25 %	0 %	50 %	25 %	322433206
78	NC_015058	TGAG	2	8	45537	45544	25 %	25 %	50 %	0 %	322433208
79	NC_015058	ATGG	2	8	46131	46138	25 %	25 %	50 %	0 %	322433210
80	NC_015058	CAAT	2	8	46909	46916	50 %	25 %	0 %	25 %	322433210
81	NC_015058	TTTC	2	8	46964	46971	0 %	75 %	0 %	25 %	322433210
82	NC_015058	CGGC	2	8	47036	47043	0 %	0 %	50 %	50 %	322433210
83	NC_015058	ACCT	2	8	47125	47132	25 %	25 %	0 %	50 %	322433210
84	NC_015058	GTAG	2	8	48339	48346	25 %	25 %	50 %	0 %	322433211
85	NC_015058	GATT	2	8	48667	48674	25 %	50 %	25 %	0 %	322433211
86	NC_015058	CGAG	2	8	50156	50163	25 %	0 %	50 %	25 %	322433212
87	NC_015058	AAGC	2	8	51103	51110	50 %	0 %	25 %	25 %	322433213
88	NC_015058	CGAA	2	8	51977	51984	50 %	0 %	25 %	25 %	322433214
89	NC_015058	ACTC	2	8	52289	52296	25 %	25 %	0 %	50 %	322433215
90	NC_015058	ATCA	2	8	53727	53734	50 %	25 %	0 %	25 %	322433217
91	NC_015058	TCTT	2	8	53952	53959	0 %	75 %	0 %	25 %	322433218
92	NC_015058	CCGA	2	8	55970	55977	25 %	0 %	25 %	50 %	322433221
93	NC_015058	GCTG	2	8	56715	56722	0 %	25 %	50 %	25 %	322433222
94	NC_015058	ATCC	2	8	57533	57540	25 %	25 %	0 %	50 %	322433223
95	NC_015058	GGCA	2	8	58720	58727	25 %	0 %	50 %	25 %	322433226
96	NC_015058	ACCG	2	8	58773	58780	25 %	0 %	25 %	50 %	322433226
97	NC_015058	CGCT	2	8	59420	59427	0 %	25 %	25 %	50 %	322433229
98	NC_015058	CCTT	2	8	59595	59602	0 %	50 %	0 %	50 %	322433229
99	NC_015058	GTCG	2	8	60389	60396	0 %	25 %	50 %	25 %	322433230
100	NC_015058	GTTT	2	8	61275	61282	0 %	75 %	25 %	0 %	322433230
101	NC_015058	CATG	2	8	61609	61616	25 %	25 %	25 %	25 %	322433231
102	NC_015058	GCGA	2	8	61682	61689	25 %	0 %	50 %	25 %	322433231
103	NC_015058	GTTC	2	8	61958	61965	0 %	50 %	25 %	25 %	322433231
104	NC_015058	CTGG	2	8	62441	62448	0 %	25 %	50 %	25 %	322433232
105	NC_015058	AGAC	2	8	62456	62463	50 %	0 %	25 %	25 %	322433232
106	NC_015058	GGCT	2	8	63281	63288	0 %	25 %	50 %	25 %	322433232
107	NC_015058	CCGC	2	8	63653	63660	0 %	0 %	25 %	75 %	322433232
108	NC_015058	TACC	2	8	63703	63710	25 %	25 %	0 %	50 %	322433232
109	NC_015058	TCGT	2	8	64312	64319	0 %	50 %	25 %	25 %	322433233
110	NC_015058	GTCC	2	8	67799	67806	0 %	25 %	25 %	50 %	322433235
111	NC_015058	TTGC	2	8	67807	67814	0 %	50 %	25 %	25 %	322433235
112	NC_015058	CACC	2	8	68110	68117	25 %	0 %	0 %	75 %	322433235
113	NC_015058	ATAG	2	8	68473	68480	50 %	25 %	25 %	0 %	322433235
114	NC_015058	TCCA	2	8	68615	68622	25 %	25 %	0 %	50 %	322433235
115	NC_015058	GACG	2	8	68758	68765	25 %	0 %	50 %	25 %	322433235
116	NC_015058	CTTC	2	8	69923	69930	0 %	50 %	0 %	50 %	322433236
117	NC_015058	GTTC	2	8	69951	69958	0 %	50 %	25 %	25 %	322433236
118	NC_015058	CGAT	2	8	70025	70032	25 %	25 %	25 %	25 %	322433236
119	NC_015058	GCTT	2	8	70581	70588	0 %	50 %	25 %	25 %	322433236
120	NC_015058	CAGG	2	8	70918	70925	25 %	0 %	50 %	25 %	322433236
121	NC_015058	CAGG	2	8	71701	71708	25 %	0 %	50 %	25 %	322433236
122	NC_015058	CAGG	2	8	71962	71969	25 %	0 %	50 %	25 %	322433236
123	NC_015058	GACT	2	8	72570	72577	25 %	25 %	25 %	25 %	322433236
124	NC_015058	CAGC	2	8	72863	72870	25 %	0 %	25 %	50 %	322433236
125	NC_015058	CAAC	2	8	73094	73101	50 %	0 %	0 %	50 %	322433236
126	NC_015058	ACGG	2	8	73553	73560	25 %	0 %	50 %	25 %	322433236
127	NC_015058	ATCC	2	8	73604	73611	25 %	25 %	0 %	50 %	322433236
128	NC_015058	CTCA	2	8	73897	73904	25 %	25 %	0 %	50 %	322433236
129	NC_015058	CTGC	2	8	73988	73995	0 %	25 %	25 %	50 %	322433236
130	NC_015058	TTCA	2	8	74278	74285	25 %	50 %	0 %	25 %	322433236
131	NC_015058	AAGG	2	8	75247	75254	50 %	0 %	50 %	0 %	322433237
132	NC_015058	TTGA	2	8	76503	76510	25 %	50 %	25 %	0 %	322433238
133	NC_015058	GGAA	2	8	76745	76752	50 %	0 %	50 %	0 %	322433238
134	NC_015058	GCCA	2	8	76832	76839	25 %	0 %	25 %	50 %	322433238
135	NC_015058	TGCG	2	8	77063	77070	0 %	25 %	50 %	25 %	322433238
136	NC_015058	CGGC	2	8	77181	77188	0 %	0 %	50 %	50 %	322433238
137	NC_015058	ACGA	2	8	77196	77203	50 %	0 %	25 %	25 %	322433238
138	NC_015058	GCTG	2	8	77624	77631	0 %	25 %	50 %	25 %	322433238
139	NC_015058	AAGG	2	8	79266	79273	50 %	0 %	50 %	0 %	322433239
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.