MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Granulicella tundricola plasmid pACIX901

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015057	CTTCA	2	10	22199	22208	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_015057	GGTGC	2	10	57639	57648	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3	NC_015057	GCCAA	2	10	70819	70828	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_015057	GGCGA	2	10	74672	74681	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_015057	AGTTG	2	10	78790	78799	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015057	AAGTG	2	10	83529	83538	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015057	TGATT	2	10	83562	83571	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015057	CAAAG	2	10	91076	91085	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_015057	AGCAA	2	10	94624	94633	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_015057	CTCTT	2	10	98491	98500	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_015057	TCTGA	2	10	99074	99083	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_015057	GACAC	2	10	102381	102390	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_015057	CCCAA	2	10	114790	114799	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
14	NC_015057	CTCGT	2	10	133016	133025	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_015057	GTGGA	2	10	138962	138971	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015057	CGCCC	2	10	149510	149519	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
17	NC_015057	ACCTC	2	10	149914	149923	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
18	NC_015057	CCTCA	2	10	150496	150505	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
19	NC_015057	CACTT	2	10	153463	153472	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_015057	GAAAG	2	10	160306	160315	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015057	TTCCC	2	10	168927	168936	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
22	NC_015057	GAAGA	2	10	170132	170141	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015057	TGGTT	2	10	230870	230879	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015057	GAGGC	2	10	235157	235166	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
25	NC_015057	GGCTT	2	10	235170	235179	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_015057	GGCCT	2	10	251161	251170	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_015057	TTGAG	2	10	270926	270935	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015057	ATGCT	2	10	270952	270961	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_015057	TTGGG	2	10	286054	286063	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015057	GGGGT	2	10	292119	292128	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015057	GGCTT	2	10	295817	295826	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_015057	GGATT	2	10	309062	309071	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015057	AGCCA	2	10	324979	324988	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_015057	GAGAA	2	10	333302	333311	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015057	AAGCC	2	10	334955	334964	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_015057	GAGGT	2	10	354807	354816	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015057	TTTGT	2	10	369820	369829	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015057	CAATA	2	10	381332	381341	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_015057	AATGT	2	10	383984	383993	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015057	GCGAA	2	10	385915	385924	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_015057	AGAAA	2	10	390571	390580	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015057	TTTTG	2	10	390604	390613	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015057	GAAGC	2	10	410593	410602	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_015057	GCGTC	2	10	421574	421583	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
45	NC_015057	CCAGC	2	10	427498	427507	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
46	NC_015057	GAGGC	2	10	432436	432445	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
47	NC_015057	TGCGG	2	10	438039	438048	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
48	NC_015057	GCAAC	2	10	439363	439372	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_015057	TCAGG	2	10	450260	450269	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_015057	GACAC	2	10	450303	450312	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_015057	CGCAG	2	10	450353	450362	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
52	NC_015057	AGCCG	2	10	453630	453639	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.