MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Bifidobacterium longum subsp. infantis 157F plasmid p157F-NC1

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015053	CGA	2	6	6	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690184
2	NC_015053	TGC	2	6	74	79	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690184
3	NC_015053	GAA	2	6	168	173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690184
4	NC_015053	GGA	2	6	228	233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690184
5	NC_015053	TCG	2	6	326	331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690184
6	NC_015053	GCG	2	6	367	372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690184
7	NC_015053	GAC	2	6	440	445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690184
8	NC_015053	AGA	2	6	446	451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690184
9	NC_015053	CAA	2	6	495	500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690184
10	NC_015053	CCA	2	6	629	634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690184
11	NC_015053	CGG	2	6	672	677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690184
12	NC_015053	GAG	2	6	694	699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690184
13	NC_015053	CTC	2	6	727	732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690184
14	NC_015053	GGC	2	6	755	760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690184
15	NC_015053	CGC	2	6	799	804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690184
16	NC_015053	CGC	2	6	887	892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690184
17	NC_015053	GGA	2	6	1026	1031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690184
18	NC_015053	CCG	2	6	1052	1057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690184
19	NC_015053	AAT	2	6	1443	1448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322690185
20	NC_015053	GCA	2	6	1467	1472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690185
21	NC_015053	CCA	2	6	1476	1481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690185
22	NC_015053	GTG	2	6	1553	1558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690185
23	NC_015053	CAG	2	6	1630	1635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690185
24	NC_015053	CCG	2	6	1853	1858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690185
25	NC_015053	AGC	2	6	1914	1919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015053	CCG	2	6	1924	1929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_015053	CGT	2	6	1958	1963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690186
28	NC_015053	CCG	2	6	2008	2013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690186
29	NC_015053	GCA	2	6	2058	2063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690186
30	NC_015053	GCC	2	6	2207	2212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690186
31	NC_015053	ATC	2	6	2298	2303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015053	GCC	2	6	2365	2370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_015053	CCG	2	6	2402	2407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_015053	CAC	2	6	2414	2419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_015053	CGG	2	6	2467	2472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015053	CGC	2	6	2483	2488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_015053	CAT	2	6	2492	2497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015053	GCA	2	6	2595	2600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690187
39	NC_015053	CCG	2	6	2646	2651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690187
40	NC_015053	CAC	2	6	2768	2773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690187
41	NC_015053	GCC	2	6	2807	2812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690187
42	NC_015053	CTT	3	9	2876	2884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690187
43	NC_015053	CAG	2	6	2912	2917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690187
44	NC_015053	CTC	3	9	2927	2935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690187
45	NC_015053	TTG	2	6	2955	2960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690187
46	NC_015053	CGG	2	6	3000	3005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690187
47	NC_015053	CCT	2	6	3056	3061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690187
48	NC_015053	GAT	2	6	3230	3235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690187
49	NC_015053	TTC	2	6	3356	3361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690187
50	NC_015053	TTG	2	6	3462	3467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690187
51	NC_015053	AAT	2	6	3613	3618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015053	GCT	3	9	3773	3781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690188
53	NC_015053	GCT	2	6	3827	3832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690188
54	NC_015053	CCG	2	6	3884	3889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690188
55	NC_015053	CGG	2	6	3941	3946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690188
56	NC_015053	CAG	2	6	3966	3971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690188
57	NC_015053	TCG	2	6	3988	3993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690188
58	NC_015053	TCG	2	6	4006	4011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690188
59	NC_015053	GCC	2	6	4041	4046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690188
60	NC_015053	GAT	2	6	4053	4058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690188
61	NC_015053	GCT	2	6	4127	4132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690188
62	NC_015053	CTC	2	6	4161	4166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690188
63	NC_015053	TCC	2	6	4186	4191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_015053	GCA	2	6	4233	4238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015053	GAA	2	6	4279	4284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015053	TCA	2	6	4325	4330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015053	GCC	2	6	4342	4347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_015053	CCG	2	6	4349	4354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_015053	AGC	2	6	4433	4438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015053	GGT	2	6	4639	4644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015053	CGG	2	6	4725	4730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015053	GCC	2	6	4845	4850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_015053	CCT	2	6	4867	4872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.