MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bifidobacterium longum subsp. infantis 157F chromosome

Total Repeats: 5632

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015052	CGGT	2	8	428	435	0 %	25 %	50 %	25 %	322688192
2	NC_015052	ACGA	2	8	694	701	50 %	0 %	25 %	25 %	322688192
3	NC_015052	ATGC	2	8	1399	1406	25 %	25 %	25 %	25 %	322688192
4	NC_015052	GACT	2	8	1541	1548	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_015052	GCGA	2	8	1752	1759	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_015052	TTAC	2	8	2115	2122	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_015052	CGTA	2	8	2171	2178	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_015052	GCGT	2	8	2653	2660	0 %	25 %	50 %	25 %	322688193
9	NC_015052	GCCG	2	8	2923	2930	0 %	0 %	50 %	50 %	322688193
10	NC_015052	ATGG	2	8	3166	3173	25 %	25 %	50 %	0 %	322688193
11	NC_015052	GATG	2	8	3924	3931	25 %	25 %	50 %	0 %	322688194
12	NC_015052	CCCG	2	8	4240	4247	0 %	0 %	25 %	75 %	322688194
13	NC_015052	TGGG	2	8	4568	4575	0 %	25 %	75 %	0 %	322688194
14	NC_015052	CGCC	2	8	4640	4647	0 %	0 %	25 %	75 %	322688195
15	NC_015052	GCCG	2	8	4673	4680	0 %	0 %	50 %	50 %	322688195
16	NC_015052	GCCA	2	8	4893	4900	25 %	0 %	25 %	50 %	322688195
17	NC_015052	ACGG	2	8	4920	4927	25 %	0 %	50 %	25 %	322688195
18	NC_015052	ACCT	2	8	4974	4981	25 %	25 %	0 %	50 %	322688195
19	NC_015052	CAAA	2	8	5106	5113	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_015052	GGAA	2	8	5264	5271	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015052	GCCA	2	8	5535	5542	25 %	0 %	25 %	50 %	322688196
22	NC_015052	CTGA	2	8	5988	5995	25 %	25 %	25 %	25 %	322688196
23	NC_015052	CGTG	2	8	6386	6393	0 %	25 %	50 %	25 %	322688196
24	NC_015052	CCTC	2	8	7381	7388	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
25	NC_015052	CGCC	2	8	8625	8632	0 %	0 %	25 %	75 %	322688197
26	NC_015052	TCCA	2	8	9325	9332	25 %	25 %	0 %	50 %	322688197
27	NC_015052	ATCG	2	8	11994	12001	25 %	25 %	25 %	25 %	322688199
28	NC_015052	CGGC	2	8	12336	12343	0 %	0 %	50 %	50 %	322688200
29	NC_015052	ACCG	2	8	12437	12444	25 %	0 %	25 %	50 %	322688200
30	NC_015052	GCCG	2	8	12745	12752	0 %	0 %	50 %	50 %	322688200
31	NC_015052	ACCT	2	8	13193	13200	25 %	25 %	0 %	50 %	322688200
32	NC_015052	GCCA	2	8	13319	13326	25 %	0 %	25 %	50 %	322688200
33	NC_015052	TGTC	2	8	15601	15608	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_015052	GGTC	2	8	16175	16182	0 %	25 %	50 %	25 %	322688202
35	NC_015052	CGTT	2	8	16211	16218	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_015052	TTGA	2	8	17455	17462	25 %	50 %	25 %	0 %	322688203
37	NC_015052	GCGA	2	8	17781	17788	25 %	0 %	50 %	25 %	322688204
38	NC_015052	GGTG	2	8	18069	18076	0 %	25 %	75 %	0 %	322688204
39	NC_015052	GTGG	2	8	18108	18115	0 %	25 %	75 %	0 %	322688204
40	NC_015052	GCAG	2	8	18116	18123	25 %	0 %	50 %	25 %	322688204
41	NC_015052	GGCC	2	8	18257	18264	0 %	0 %	50 %	50 %	322688204
42	NC_015052	GCCA	2	8	18284	18291	25 %	0 %	25 %	50 %	322688204
43	NC_015052	ATCC	2	8	18694	18701	25 %	25 %	0 %	50 %	322688204
44	NC_015052	GCTG	2	8	18931	18938	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_015052	GCCG	2	8	19111	19118	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_015052	TTGC	2	8	19370	19377	0 %	50 %	25 %	25 %	322688205
47	NC_015052	CAGC	2	8	20000	20007	25 %	0 %	25 %	50 %	322688206
48	NC_015052	CAGC	2	8	20375	20382	25 %	0 %	25 %	50 %	322688206
49	NC_015052	CTTC	2	8	20611	20618	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_015052	GTCG	2	8	20843	20850	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_015052	CCTC	2	8	21673	21680	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
52	NC_015052	CGGG	2	8	21929	21936	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
53	NC_015052	GGCC	2	8	22063	22070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015052	ACGG	2	8	22218	22225	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_015052	GCGG	2	8	22960	22967	0 %	0 %	75 %	25 %	322688208
56	NC_015052	TTCC	2	8	23447	23454	0 %	50 %	0 %	50 %	322688208
57	NC_015052	GCCG	2	8	23770	23777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015052	CATC	2	8	25043	25050	25 %	25 %	0 %	50 %	322688210
59	NC_015052	CCTA	2	8	25696	25703	25 %	25 %	0 %	50 %	322688210
60	NC_015052	TTCG	2	8	25807	25814	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_015052	GACC	2	8	26380	26387	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015052	CAGG	2	8	26497	26504	25 %	0 %	50 %	25 %	322688212
63	NC_015052	ACGA	2	8	27168	27175	50 %	0 %	25 %	25 %	322688212
64	NC_015052	GGCA	2	8	27185	27192	25 %	0 %	50 %	25 %	322688212
65	NC_015052	TATG	2	8	27932	27939	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015052	GTGC	2	8	28375	28382	0 %	25 %	50 %	25 %	322688213
67	NC_015052	CGAA	2	8	28560	28567	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_015052	CCGT	2	8	28980	28987	0 %	25 %	25 %	50 %	322688214
69	NC_015052	GATG	2	8	29017	29024	25 %	25 %	50 %	0 %	322688214
70	NC_015052	GCTG	2	8	29973	29980	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_015052	CTGA	2	8	30862	30869	25 %	25 %	25 %	25 %	322688215
72	NC_015052	CGGC	2	8	31873	31880	0 %	0 %	50 %	50 %	322688217
73	NC_015052	CGCT	2	8	31895	31902	0 %	25 %	25 %	50 %	322688217
74	NC_015052	GCCG	2	8	32196	32203	0 %	0 %	50 %	50 %	322688217
75	NC_015052	CACG	2	8	32612	32619	25 %	0 %	25 %	50 %	322688217
76	NC_015052	CGGC	2	8	32653	32660	0 %	0 %	50 %	50 %	322688217
77	NC_015052	CCCG	2	8	32977	32984	0 %	0 %	25 %	75 %	322688217
78	NC_015052	CGCT	2	8	32989	32996	0 %	25 %	25 %	50 %	322688217
79	NC_015052	TCGT	2	8	33402	33409	0 %	50 %	25 %	25 %	322688217
80	NC_015052	TGCT	2	8	33544	33551	0 %	50 %	25 %	25 %	322688217
81	NC_015052	CGAT	2	8	33815	33822	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_015052	ACGA	2	8	34008	34015	50 %	0 %	25 %	25 %	322688218
83	NC_015052	CGTG	2	8	34069	34076	0 %	25 %	50 %	25 %	322688218
84	NC_015052	GCCG	2	8	34571	34578	0 %	0 %	50 %	50 %	322688218
85	NC_015052	TGAT	2	8	35464	35471	25 %	50 %	25 %	0 %	322688219
86	NC_015052	CCTT	2	8	35889	35896	0 %	50 %	0 %	50 %	322688220
87	NC_015052	AGAT	2	8	36976	36983	50 %	25 %	25 %	0 %	322688221
88	NC_015052	CTGC	2	8	36989	36996	0 %	25 %	25 %	50 %	322688221
89	NC_015052	CGTC	2	8	37250	37257	0 %	25 %	25 %	50 %	322688221
90	NC_015052	CGGG	2	8	37470	37477	0 %	0 %	75 %	25 %	322688221
91	NC_015052	ACCG	2	8	37773	37780	25 %	0 %	25 %	50 %	322688221
92	NC_015052	CGAC	2	8	37819	37826	25 %	0 %	25 %	50 %	322688221
93	NC_015052	CGCT	2	8	38608	38615	0 %	25 %	25 %	50 %	322688221
94	NC_015052	CGTG	2	8	40178	40185	0 %	25 %	50 %	25 %	322688222
95	NC_015052	TGGC	2	8	41612	41619	0 %	25 %	50 %	25 %	322688222
96	NC_015052	TCTG	2	8	41776	41783	0 %	50 %	25 %	25 %	322688222
97	NC_015052	GCGG	2	8	42200	42207	0 %	0 %	75 %	25 %	322688223
98	NC_015052	GGCT	2	8	42263	42270	0 %	25 %	50 %	25 %	322688223
99	NC_015052	TTCA	2	8	42656	42663	25 %	50 %	0 %	25 %	322688223
100	NC_015052	GCGG	2	8	42719	42726	0 %	0 %	75 %	25 %	322688223
101	NC_015052	GACT	2	8	44039	44046	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_015052	CCAG	2	8	44287	44294	25 %	0 %	25 %	50 %	322688224
103	NC_015052	GCAG	2	8	45218	45225	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_015052	CGGC	2	8	46086	46093	0 %	0 %	50 %	50 %	322688225
105	NC_015052	CGGA	2	8	46227	46234	25 %	0 %	50 %	25 %	322688225
106	NC_015052	TGCC	2	8	46369	46376	0 %	25 %	25 %	50 %	322688225
107	NC_015052	CACG	2	8	46426	46433	25 %	0 %	25 %	50 %	322688225
108	NC_015052	GATC	2	8	46440	46447	25 %	25 %	25 %	25 %	322688225
109	NC_015052	CGGC	2	8	46572	46579	0 %	0 %	50 %	50 %	322688225
110	NC_015052	TGGC	2	8	46664	46671	0 %	25 %	50 %	25 %	322688225
111	NC_015052	CGTA	2	8	46907	46914	25 %	25 %	25 %	25 %	322688225
112	NC_015052	GCGG	2	8	47371	47378	0 %	0 %	75 %	25 %	322688226
113	NC_015052	TCGG	2	8	47412	47419	0 %	25 %	50 %	25 %	322688226
114	NC_015052	CAGA	2	8	47530	47537	50 %	0 %	25 %	25 %	322688226
115	NC_015052	CGGC	2	8	47818	47825	0 %	0 %	50 %	50 %	322688226
116	NC_015052	CGGT	2	8	47931	47938	0 %	25 %	50 %	25 %	322688226
117	NC_015052	GCCG	2	8	48037	48044	0 %	0 %	50 %	50 %	322688226
118	NC_015052	TGCC	2	8	48154	48161	0 %	25 %	25 %	50 %	322688226
119	NC_015052	TAAA	2	8	48211	48218	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015052	GAGC	2	8	48419	48426	25 %	0 %	50 %	25 %	322688227
121	NC_015052	CTTA	2	8	48797	48804	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_015052	GGAA	2	8	49428	49435	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015052	ACCC	2	8	50415	50422	25 %	0 %	0 %	75 %	322688229
124	NC_015052	GGCC	2	8	50557	50564	0 %	0 %	50 %	50 %	322688229
125	NC_015052	CTGA	2	8	51886	51893	25 %	25 %	25 %	25 %	322688229
126	NC_015052	CTGA	2	8	52078	52085	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_015052	TGCA	2	8	52656	52663	25 %	25 %	25 %	25 %	322688231
128	NC_015052	CGTG	2	8	52738	52745	0 %	25 %	50 %	25 %	322688231
129	NC_015052	GTGG	2	8	53235	53242	0 %	25 %	75 %	0 %	322688231
130	NC_015052	GGTG	2	8	53261	53268	0 %	25 %	75 %	0 %	322688231
131	NC_015052	ATGT	2	8	53503	53510	25 %	50 %	25 %	0 %	322688232
132	NC_015052	GATA	2	8	54053	54060	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015052	GGCA	2	8	55445	55452	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_015052	GGCA	2	8	55620	55627	25 %	0 %	50 %	25 %	322688235
135	NC_015052	GAGC	2	8	55718	55725	25 %	0 %	50 %	25 %	322688235
136	NC_015052	GCGT	2	8	57209	57216	0 %	25 %	50 %	25 %	322688236
137	NC_015052	TCAC	2	8	57593	57600	25 %	25 %	0 %	50 %	322688237
138	NC_015052	GACC	2	8	58024	58031	25 %	0 %	25 %	50 %	322688237
139	NC_015052	TGGG	2	8	58686	58693	0 %	25 %	75 %	0 %	322688237
140	NC_015052	GCTG	2	8	59305	59312	0 %	25 %	50 %	25 %	322688237
141	NC_015052	TCCC	2	8	59673	59680	0 %	25 %	0 %	75 %	322688238
142	NC_015052	GCGA	2	8	63482	63489	25 %	0 %	50 %	25 %	322688240
143	NC_015052	CTGG	2	8	63539	63546	0 %	25 %	50 %	25 %	322688240
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278	NC_015052	ATAC	2	8	122114	122121	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
279	NC_015052	CCAT	2	8	123164	123171	25 %	25 %	0 %	50 %	322688287
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