MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. infantis 157F chromosome

Total Repeats: 4069

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015052	TGG	2	6	1587	1592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015052	GAC	2	6	1665	1670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015052	CGA	2	6	1803	1808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015052	CGG	2	6	1890	1895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015052	TGT	2	6	1921	1926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015052	CGA	2	6	1973	1978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015052	TTA	2	6	2103	2108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015052	CAT	2	6	2139	2144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015052	CGA	2	6	2218	2223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015052	TCG	2	6	5138	5143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015052	AGA	2	6	5185	5190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015052	TCC	2	6	7373	7378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_015052	AAC	2	6	7428	7433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015052	CAG	2	6	10119	10124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015052	CTC	2	6	10744	10749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_015052	GTT	2	6	10766	10771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015052	GAT	2	6	10793	10798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015052	CGT	2	6	10834	10839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015052	GAC	2	6	10915	10920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015052	CGT	2	6	10937	10942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015052	CGT	2	6	11040	11045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015052	GCC	2	6	11067	11072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_015052	GTG	2	6	11092	11097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015052	TTG	2	6	11219	11224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015052	CAG	2	6	11310	11315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015052	GTT	2	6	11372	11377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015052	TGC	2	6	13713	13718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015052	GAT	2	6	13913	13918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015052	GTG	2	6	13943	13948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015052	TTG	2	6	13977	13982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015052	CCT	2	6	14010	14015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_015052	TGC	2	6	15504	15509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015052	GGT	2	6	15556	15561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015052	TCT	2	6	16204	16209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015052	AGT	2	6	16284	16289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015052	TGT	2	6	16305	16310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015052	GTG	2	6	16311	16316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015052	TAA	2	6	16348	16353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015052	ACG	2	6	16373	16378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015052	AAT	2	6	16380	16385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015052	GAG	2	6	16392	16397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015052	GAT	2	6	16399	16404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015052	TCC	2	6	18785	18790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_015052	CGC	2	6	18816	18821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_015052	AAC	2	6	18885	18890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015052	CTG	2	6	19155	19160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015052	ACC	2	6	19177	19182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_015052	CGC	2	6	19219	19224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_015052	CTC	2	6	19604	19609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_015052	GCG	3	9	20485	20493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015052	TCA	2	6	20573	20578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015052	TGG	2	6	20812	20817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015052	TGC	2	6	20824	20829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015052	GTC	2	6	20908	20913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015052	ATC	2	6	20945	20950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015052	CCT	2	6	20981	20986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_015052	CGG	2	6	20993	20998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015052	TCC	2	6	21102	21107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_015052	CGC	2	6	21123	21128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_015052	GGT	2	6	21205	21210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015052	ACC	2	6	21221	21226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_015052	TAT	2	6	21301	21306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015052	GGA	2	6	21445	21450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015052	CGG	2	6	21557	21562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015052	TGC	2	6	21660	21665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015052	CTG	2	6	21714	21719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015052	CGG	2	6	21917	21922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015052	CGA	2	6	21939	21944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015052	CGG	2	6	21980	21985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015052	TTC	2	6	22135	22140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_015052	CGC	2	6	22157	22162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_015052	CTG	2	6	22268	22273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015052	CAT	2	6	22279	22284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015052	GTG	2	6	22337	22342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015052	GTT	2	6	22389	22394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015052	GAG	2	6	23736	23741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015052	GTA	2	6	24805	24810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015052	TTG	2	6	24916	24921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015052	CCG	2	6	24923	24928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_015052	CCA	2	6	25830	25835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_015052	GCG	2	6	26247	26252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015052	CGA	2	6	26256	26261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015052	TTG	2	6	26442	26447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015052	CTT	2	6	28500	28505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015052	GGT	2	6	28570	28575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015052	GAC	2	6	30029	30034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015052	CGA	2	6	30070	30075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015052	CTG	2	6	30896	30901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015052	GTG	2	6	30973	30978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015052	CAC	2	6	31018	31023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_015052	GGT	3	9	31033	31041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015052	CAA	3	9	33770	33778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015052	GTT	2	6	33844	33849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015052	ACG	2	6	35229	35234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015052	CAC	2	6	35575	35580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_015052	CCT	2	6	39682	39687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_015052	GTC	2	6	39718	39723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015052	CTC	2	6	39729	39734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_015052	GTT	2	6	39739	39744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015052	GTT	2	6	39785	39790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015052	AGT	2	6	39956	39961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015052	CTC	2	6	41858	41863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_015052	CGC	2	6	41992	41997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_015052	CTG	2	6	43737	43742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015052	CGG	2	6	43894	43899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015052	GAT	2	6	43941	43946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015052	CGG	2	6	43974	43979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015052	CAA	2	6	44856	44861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015052	TGT	2	6	44932	44937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015052	TCG	2	6	44965	44970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015052	ATG	2	6	45044	45049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015052	CAG	2	6	47014	47019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015052	CGC	2	6	47021	47026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_015052	GCG	2	6	47084	47089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015052	TTG	2	6	48280	48285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015052	TCT	2	6	48718	48723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015052	TAA	2	6	48726	48731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015052	GCC	2	6	48783	48788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_015052	TGG	2	6	48791	48796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015052	TCG	2	6	49349	49354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015052	CGA	2	6	49383	49388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015052	ATA	2	6	49404	49409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015052	GAA	2	6	52005	52010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015052	TGA	2	6	52104	52109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015052	CGA	2	6	52195	52200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_015052	AGA	2	6	52231	52236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015052	TAT	2	6	53722	53727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015052	TTG	2	6	53733	53738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015052	CGC	2	6	53825	53830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_015052	CCA	2	6	53835	53840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_015052	GTG	2	6	53934	53939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015052	ATA	2	6	54582	54587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015052	GCG	2	6	54604	54609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_015052	AAG	2	6	54622	54627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015052	GCG	2	6	55458	55463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015052	TTG	2	6	57450	57455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015052	GAC	2	6	65965	65970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_015052	TCC	2	6	66693	66698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_015052	GCG	2	6	66808	66813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_015052	CAC	2	6	66814	66819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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408	NC_015052	ACC	2	6	209368	209373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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413	NC_015052	TCC	2	6	211703	211708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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450	NC_015052	AAT	2	6	248837	248842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_015052	AGG	2	6	249028	249033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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