MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus subtilis BSn5 chromosome

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014976	GCTTAG	2	12	8965	8976	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_014976	CATCAC	2	12	22164	22175	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_014976	ATCGAA	2	12	22447	22458	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_014976	TTTTAA	2	12	59096	59107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014976	AATTTC	2	12	68463	68474	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_014976	CAGGAG	2	12	119019	119030	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_014976	TGCGGC	2	12	120505	120516	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014976	AAGAGA	2	12	128586	128597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014976	ATCATT	2	12	159725	159736	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014976	GAAAAA	2	12	180237	180248	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014976	TATTTT	2	12	180706	180717	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014976	AATCCG	2	12	204102	204113	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014976	TATCAC	2	12	262728	262739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014976	TTATGT	2	12	283492	283503	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014976	TTATTT	2	12	285474	285485	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014976	ATCTTC	2	12	410019	410030	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_014976	TTTCGA	2	12	424187	424198	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_014976	CTTTTC	2	12	504851	504862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014976	TTCTAA	2	12	578024	578035	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_014976	TGACTT	2	12	604124	604135	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_014976	ACAGAC	2	12	631012	631023	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014976	ACACCC	2	12	641640	641651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_014976	TAAAGT	2	12	643746	643757	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014976	ATGCTT	2	12	663745	663756	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_014976	AAGAAA	2	12	663973	663984	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014976	TAATTT	2	12	677075	677086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014976	TATAAA	2	12	730030	730041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014976	ATAAAC	2	12	733267	733278	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_014976	TATTGT	2	12	740372	740383	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014976	CCAAAT	2	12	786212	786223	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014976	GAATAT	2	12	789580	789591	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014976	GATTTT	2	12	823094	823105	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014976	GTTCAC	2	12	826356	826367	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014976	CAAAAA	2	12	866250	866261	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014976	GCCGGA	2	12	873832	873843	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014976	CCCTCT	2	12	916623	916634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_014976	CTCTTT	2	12	964173	964184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014976	TTTAAG	2	12	990959	990970	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014976	TATTCA	2	12	991605	991616	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_014976	TGATTT	2	12	1019128	1019139	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014976	CTTATC	2	12	1053719	1053730	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014976	CATTAT	2	12	1063160	1063171	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_014976	TAAAAA	2	12	1070086	1070097	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014976	CTTATA	2	12	1180039	1180050	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_014976	AAAAAG	2	12	1230796	1230807	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014976	ATTATC	2	12	1299984	1299995	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_014976	GCCTCC	2	12	1334750	1334761	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_014976	GAAATA	2	12	1362463	1362474	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014976	GAAAAA	2	12	1368581	1368592	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014976	AAAAAC	2	12	1448954	1448965	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_014976	CAAAAA	2	12	1504306	1504317	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_014976	GAAGTT	2	12	1505766	1505777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014976	CTCAGT	2	12	1522772	1522783	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014976	AAACAT	2	12	1575312	1575323	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_014976	TCTTTT	2	12	1581228	1581239	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_014976	CAGTAC	2	12	1623936	1623947	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014976	AAAAAC	2	12	1639305	1639316	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014976	GTATAT	2	12	1640064	1640075	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014976	ATTTAA	2	12	1682540	1682551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014976	GTATAC	2	12	1713696	1713707	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_014976	TTTTAT	2	12	1718202	1718213	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014976	TGAGGA	2	12	1789577	1789588	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014976	TCAAAA	2	12	1803637	1803648	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_014976	TGCACC	2	12	2042614	2042625	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
65	NC_014976	TGATAA	2	12	2074054	2074065	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014976	TCGCTC	2	12	2110104	2110115	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
67	NC_014976	TTCTTA	2	12	2121847	2121858	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_014976	CCTTTG	2	12	2134641	2134652	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014976	ACTTTT	2	12	2185639	2185650	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_014976	AGAAAT	2	12	2209406	2209417	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014976	TTTCCC	2	12	2215151	2215162	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_014976	ATAAAT	2	12	2261294	2261305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014976	AAGTAA	2	12	2369902	2369913	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014976	AATAGT	2	12	2428643	2428654	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014976	GTTTTT	2	12	2498272	2498283	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014976	AAATGA	2	12	2522710	2522721	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014976	TTCATT	2	12	2552693	2552704	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_014976	TTTTTA	2	12	2584178	2584189	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014976	AATTGG	2	12	2584596	2584607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014976	ATTTTT	2	12	2590997	2591008	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014976	CTCAGC	2	12	2607970	2607981	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
82	NC_014976	GCCGAA	2	12	2608188	2608199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014976	ATGATA	2	12	2646728	2646739	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014976	TTTTTA	2	12	2664016	2664027	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014976	TCCTTT	2	12	2707909	2707920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014976	ATTTTT	2	12	2742078	2742089	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014976	AAGTTC	2	12	2744706	2744717	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_014976	TTCAAA	2	12	2796610	2796621	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_014976	GAAGTT	2	12	2850514	2850525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014976	TTTTGA	2	12	2920593	2920604	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014976	CTTTCT	2	12	2930134	2930145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014976	TCTCCT	2	12	2951809	2951820	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_014976	TTTATT	2	12	2964147	2964158	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014976	TCTTTT	2	12	2967712	2967723	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_014976	ACATAT	2	12	3005822	3005833	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_014976	TACTTT	2	12	3073110	3073121	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_014976	GTATCA	2	12	3078383	3078394	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_014976	CAATGG	2	12	3118563	3118574	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_014976	ATTTAA	2	12	3122706	3122717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014976	GAACAA	2	12	3154666	3154677	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_014976	GTGTTT	2	12	3163849	3163860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014976	CTTTTT	2	12	3165037	3165048	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_014976	GCGGAA	2	12	3173041	3173052	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_014976	CTGAAG	2	12	3180436	3180447	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_014976	TAAAAA	2	12	3200532	3200543	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014976	CTTTTT	2	12	3219424	3219435	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_014976	TCTTTT	2	12	3284618	3284629	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_014976	CGGAAG	2	12	3285503	3285514	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_014976	GAAAAA	2	12	3304742	3304753	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014976	GAATTT	2	12	3313940	3313951	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014976	CGGACC	2	12	3364069	3364080	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
112	NC_014976	GGTTAA	2	12	3439868	3439879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014976	GAAAAA	2	12	3460257	3460268	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014976	TATACT	2	12	3483170	3483181	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_014976	GTTAAC	2	12	3512952	3512963	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_014976	AAGCAA	2	12	3549857	3549868	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_014976	GCAAAA	2	12	3550030	3550041	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_014976	GAAAAA	2	12	3551546	3551557	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014976	AATTCA	2	12	3599845	3599856	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_014976	TACATA	2	12	3657868	3657879	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_014976	ATAATT	2	12	3665045	3665056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014976	AAAGGA	2	12	3675578	3675589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014976	ATCATT	2	12	3694027	3694038	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_014976	ATCATT	2	12	3697461	3697472	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_014976	TTTGCT	2	12	3705958	3705969	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_014976	CTTTTT	2	12	3786509	3786520	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_014976	AATATG	2	12	3933307	3933318	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014976	TCCTTC	2	12	3952067	3952078	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_014976	TTATGA	2	12	4071802	4071813	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014976	ATGCTT	2	12	4090936	4090947	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_014976	CAAAAT	2	12	4091851	4091862	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.