MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Bacillus subtilis BSn5 chromosome

Total Repeats: 52927

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014976	TAA	2	6	1405	1410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014976	TAG	2	6	1498	1503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014976	CTT	2	6	1600	1605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014976	GCA	2	6	1648	1653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014976	TAA	2	6	1692	1697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014976	TCC	2	6	1814	1819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	321311378
7	NC_014976	TAA	2	6	1835	1840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	321311378
8	NC_014976	TGA	2	6	1898	1903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	321311378
9	NC_014976	TCA	2	6	2063	2068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	321311378
10	NC_014976	AAT	2	6	2069	2074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	321311378
11	NC_014976	CCA	2	6	2131	2136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	321311378
12	NC_014976	CTT	2	6	2154	2159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	321311378
13	NC_014976	CTG	2	6	2197	2202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	321311378
14	NC_014976	TGA	2	6	2238	2243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	321311378
15	NC_014976	TCC	2	6	2288	2293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	321311378
16	NC_014976	GCC	2	6	2297	2302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	321311378
17	NC_014976	GCG	2	6	2361	2366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	321311378
18	NC_014976	CCT	3	9	2507	2515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	321311379
19	NC_014976	ATA	2	6	2580	2585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	321311379
20	NC_014976	TCC	2	6	2656	2661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	321311379
21	NC_014976	AGC	2	6	2692	2697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	321311379
22	NC_014976	CAG	2	6	2727	2732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	321311379
23	NC_014976	TTA	2	6	2921	2926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	321311379
24	NC_014976	TGG	2	6	2961	2966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	321311379
25	NC_014976	ATA	2	6	2982	2987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	321311379
26	NC_014976	ATG	2	6	3172	3177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	321311379
27	NC_014976	GCA	2	6	3469	3474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	321311380
28	NC_014976	TCA	2	6	3911	3916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	321311380
29	NC_014976	CGT	2	6	4011	4016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	321311380
30	NC_014976	CTG	2	6	4051	4056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	321311380
31	NC_014976	AGC	2	6	4126	4131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	321311380
32	NC_014976	TCA	2	6	4178	4183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	321311380
33	NC_014976	GGA	2	6	4422	4427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	321311381
34	NC_014976	TGA	2	6	4493	4498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	321311381
35	NC_014976	CAC	2	6	4517	4522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	321311381
36	NC_014976	ATA	2	6	4523	4528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	321311381
37	NC_014976	TGC	2	6	4565	4570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	321311381
38	NC_014976	TGT	2	6	4905	4910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	321311381
39	NC_014976	TTC	2	6	4950	4955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	321311381
40	NC_014976	TGG	2	6	5011	5016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	321311381
41	NC_014976	ATC	3	9	5076	5084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	321311381
42	NC_014976	TCA	2	6	5110	5115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	321311381
43	NC_014976	CCG	2	6	5119	5124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	321311381
44	NC_014976	CTT	2	6	5139	5144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	321311381
45	NC_014976	GCT	2	6	5198	5203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	321311381
46	NC_014976	TTC	2	6	5235	5240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	321311381
47	NC_014976	TGC	2	6	5266	5271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	321311381
48	NC_014976	ATC	2	6	5316	5321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	321311381
49	NC_014976	AGC	2	6	5329	5334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	321311381
50	NC_014976	ACA	2	6	5365	5370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	321311381
51	NC_014976	TTA	2	6	5455	5460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	321311381
52	NC_014976	ATT	2	6	5550	5555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	321311381
53	NC_014976	AAT	2	6	5619	5624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	321311381
54	NC_014976	TGC	2	6	5726	5731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014976	CAA	2	6	5811	5816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_014976	GAT	2	6	5841	5846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014976	TAT	2	6	5946	5951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014976	TAC	2	6	6084	6089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014976	ACA	2	6	6126	6131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014976	ATG	2	6	6154	6159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014976	TCT	2	6	6255	6260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	321311382
62	NC_014976	CGT	2	6	6316	6321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	321311382
63	NC_014976	GGA	2	6	6425	6430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	321311383
64	NC_014976	ATA	2	6	6471	6476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	321311383
65	NC_014976	AAG	2	6	6484	6489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	321311383
66	NC_014976	AGA	3	9	6559	6567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	321311383
67	NC_014976	CCT	2	6	6590	6595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	321311383
68	NC_014976	CCT	2	6	6669	6674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_014976	ATT	2	6	6699	6704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014976	GTT	2	6	6751	6756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014976	TTG	2	6	6773	6778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014976	TTG	2	6	6804	6809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014976	CAA	2	6	6868	6873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	321311384
74	NC_014976	GAA	2	6	6978	6983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	321311384
75	NC_014976	GCA	2	6	7164	7169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	321311384
76	NC_014976	ATA	2	6	7237	7242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	321311384
77	NC_014976	ATT	2	6	7336	7341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	321311384
78	NC_014976	ATC	2	6	7510	7515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	321311385
79	NC_014976	TAA	2	6	7657	7662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	321311385
80	NC_014976	TTC	2	6	7681	7686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	321311385
81	NC_014976	TAG	2	6	7700	7705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	321311385
82	NC_014976	GGC	2	6	7735	7740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	321311385
83	NC_014976	TAT	2	6	7783	7788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	321311385
84	NC_014976	TTA	2	6	7815	7820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	321311385
85	NC_014976	AAT	2	6	8018	8023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	321311385
86	NC_014976	TTG	2	6	8091	8096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	321311385
87	NC_014976	TTC	2	6	8190	8195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	321311385
88	NC_014976	TTA	2	6	8218	8223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	321311385
89	NC_014976	GAA	2	6	8229	8234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	321311385
90	NC_014976	CTA	2	6	8295	8300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	321311385
91	NC_014976	GAA	2	6	8345	8350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	321311385
92	NC_014976	AGT	2	6	8390	8395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014976	AGG	2	6	8411	8416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014976	GAA	2	6	8431	8436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014976	GCT	2	6	8512	8517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	321311386
96	NC_014976	GTT	2	6	8518	8523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	321311386
97	NC_014976	TAA	2	6	8567	8572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	321311386
98	NC_014976	TTC	2	6	8576	8581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	321311386
99	NC_014976	TGC	2	6	8604	8609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	321311386
100	NC_014976	CTT	2	6	8685	8690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	321311386
101	NC_014976	TTC	2	6	8701	8706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	321311386
102	NC_014976	AGC	2	6	8835	8840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	321311386
103	NC_014976	ATC	2	6	8850	8855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014976	AAT	2	6	9094	9099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014976	GCA	2	6	9201	9206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014976	ATT	2	6	9304	9309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014976	GTT	2	6	9566	9571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	321311387
108	NC_014976	GGA	2	6	9634	9639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	321311388
109	NC_014976	ATT	2	6	9802	9807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	321311388
110	NC_014976	GAA	2	6	9971	9976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	321311388
111	NC_014976	CAA	2	6	9986	9991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	321311388
112	NC_014976	AGC	2	6	10042	10047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	321311388
113	NC_014976	ATT	2	6	10136	10141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	321311388
114	NC_014976	ATG	2	6	10152	10157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	321311388
115	NC_014976	AGA	2	6	10231	10236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	321311388
116	NC_014976	ACA	2	6	10324	10329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_014976	TGA	3	9	10424	10432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	321311389
118	NC_014976	ATG	2	6	10499	10504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	321311389
119	NC_014976	GAA	2	6	10574	10579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	321311390
120	NC_014976	AGA	2	6	10592	10597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	321311390
121	NC_014976	TTG	3	9	10621	10629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	321311390
122	NC_014976	ATT	2	6	10709	10714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014976	TAA	2	6	10856	10861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	321311391
124	NC_014976	CAT	2	6	10871	10876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	321311391
125	NC_014976	ATT	2	6	10880	10885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	321311391
126	NC_014976	AGA	2	6	10934	10939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	321311391
127	NC_014976	TAA	2	6	11117	11122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	321311391
128	NC_014976	ATT	2	6	11155	11160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	321311391
129	NC_014976	TGA	2	6	11171	11176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	321311391
130	NC_014976	TTA	2	6	11202	11207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	321311391
131	NC_014976	AGA	2	6	11217	11222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	321311391
132	NC_014976	AGA	2	6	11227	11232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	321311391
133	NC_014976	ATA	2	6	11233	11238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	321311391
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135	NC_014976	TAA	2	6	11314	11319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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137	NC_014976	ATT	2	6	11476	11481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014976	GAA	2	6	11485	11490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014976	TTA	2	6	11504	11509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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141	NC_014976	TAA	2	6	11715	11720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014976	TAT	2	6	11767	11772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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249	NC_014976	TGT	2	6	20584	20589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	321311398
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255	NC_014976	TCA	3	9	20942	20950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
256	NC_014976	TGA	2	6	20959	20964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
257	NC_014976	CTT	2	6	20974	20979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
258	NC_014976	CAG	2	6	21034	21039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_014976	AAG	2	6	21083	21088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
260	NC_014976	ACG	2	6	21137	21142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
261	NC_014976	ATG	2	6	21163	21168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
262	NC_014976	CAT	2	6	21309	21314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_014976	TGC	2	6	21353	21358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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271	NC_014976	AAT	2	6	22251	22256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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388	NC_014976	TCA	2	6	31140	31145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	321311409
389	NC_014976	TGG	2	6	31158	31163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	321311409
390	NC_014976	CTT	2	6	31193	31198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	321311409
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392	NC_014976	CTT	2	6	31228	31233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	321311409
393	NC_014976	TAA	2	6	31245	31250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	321311409
394	NC_014976	CTC	2	6	31261	31266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
395	NC_014976	TAC	2	6	31276	31281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
396	NC_014976	TAT	2	6	31286	31291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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454	NC_014976	CAG	2	6	35280	35285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
455	NC_014976	TTA	2	6	35362	35367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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497	NC_014976	GAG	2	6	39314	39319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	321311421
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500	NC_014976	CTG	2	6	39389	39394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	321311421

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