MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfobulbus propionicus DSM 2032 chromosome

Total Repeats: 111

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014972	ATTTGG	2	12	64692	64703	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014972	TCCATT	2	12	95768	95779	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014972	AATGAC	2	12	118955	118966	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_014972	TCCCGT	2	12	130250	130261	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014972	CACGGT	2	12	143343	143354	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014972	GGCCGG	2	12	143364	143375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014972	CTTGGT	2	12	155118	155129	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_014972	TGGCGG	2	12	157971	157982	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014972	CTGCCT	2	12	158685	158696	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10	NC_014972	CTTTTT	2	12	226790	226801	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_014972	CTGGTT	2	12	262457	262468	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_014972	GTACTT	2	12	264190	264201	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_014972	CAAATT	2	12	265518	265529	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_014972	CCGGCC	2	12	394315	394326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_014972	GACAAA	2	12	425061	425072	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_014972	CATAAG	2	12	493371	493382	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_014972	TGGCCG	2	12	500271	500282	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014972	AATTAA	2	12	508932	508943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014972	TTAAAA	2	12	559856	559867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014972	TAAAAG	2	12	560008	560019	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014972	TGAAAT	2	12	561809	561820	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014972	TGTGGC	2	12	572597	572608	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_014972	AAAGAG	2	12	604036	604047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014972	CACATG	2	12	641269	641280	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014972	AAATAT	2	12	652265	652276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014972	GGTTGC	2	12	689530	689541	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_014972	TCCACC	2	12	706912	706923	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_014972	CTTTCC	2	12	730131	730142	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_014972	TTTCGC	2	12	742671	742682	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014972	GAAACA	2	12	807534	807545	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_014972	CCGTTG	2	12	817122	817133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014972	TTTTCC	2	12	851809	851820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014972	ATTAAA	2	12	979731	979742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014972	ATTTTT	2	12	1049598	1049609	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014972	GAAAGG	2	12	1075690	1075701	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014972	GCCGAT	2	12	1132640	1132651	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014972	TAAAGA	2	12	1138258	1138269	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014972	ACGCCG	2	12	1143000	1143011	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014972	CGGGTG	2	12	1144981	1144992	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_014972	GGAGCC	2	12	1324415	1324426	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014972	AAAGAT	2	12	1353122	1353133	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014972	CATCAA	3	18	1465671	1465688	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014972	TAGATG	2	12	1540906	1540917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014972	CCGTGG	2	12	1583045	1583056	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014972	TTGCTG	2	12	1583105	1583116	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_014972	ATGACG	2	12	1631503	1631514	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_014972	CGTCGC	2	12	1702064	1702075	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
48	NC_014972	CTCGCC	2	12	1726090	1726101	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_014972	TCCCTC	2	12	1726126	1726137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_014972	ACGCGC	2	12	1743245	1743256	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
51	NC_014972	GCGGTC	2	12	1753711	1753722	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014972	TGAATA	2	12	1778607	1778618	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014972	CCTTTG	2	12	1779023	1779034	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014972	GTGGAC	2	12	1829238	1829249	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_014972	AGGCGG	2	12	1885780	1885791	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_014972	TAATTC	2	12	1991629	1991640	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_014972	TTTTTC	2	12	2033964	2033975	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014972	TGCACC	2	12	2088777	2088788	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
59	NC_014972	GAAAAA	2	12	2114266	2114277	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014972	CGCAAC	2	12	2151127	2151138	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
61	NC_014972	ATACCG	2	12	2167208	2167219	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014972	AAACAA	2	12	2312460	2312471	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_014972	AATGAA	2	12	2353856	2353867	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014972	CAACCC	2	12	2377193	2377204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_014972	ACGGGT	2	12	2390848	2390859	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_014972	CAACCC	2	12	2401557	2401568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_014972	GGAAAG	2	12	2417133	2417144	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014972	TCTTGC	2	12	2452290	2452301	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014972	CCTGGC	2	12	2487591	2487602	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
70	NC_014972	CTTTAC	2	12	2521190	2521201	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014972	TCCCGA	2	12	2536015	2536026	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
72	NC_014972	CCCTGT	2	12	2539204	2539215	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73	NC_014972	AGTATA	2	12	2575599	2575610	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014972	CTTTTC	2	12	2617402	2617413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_014972	GCAAAA	2	12	2651517	2651528	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_014972	CGGATC	2	12	2671949	2671960	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014972	CCAGTG	2	12	2675890	2675901	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014972	TAATTT	2	12	2699585	2699596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014972	TTTTTC	2	12	2744373	2744384	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_014972	AAAAAG	2	12	2753121	2753132	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014972	TTATCA	2	12	2755677	2755688	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_014972	CCATTA	2	12	2776375	2776386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014972	GCACCG	2	12	2784614	2784625	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
84	NC_014972	CTCATC	2	12	2788548	2788559	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_014972	TTTCTC	2	12	2792507	2792518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014972	TGATCG	2	12	2841630	2841641	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_014972	CGGCCG	2	12	2926550	2926561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_014972	CACTGG	2	12	2987353	2987364	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014972	GATCCG	2	12	2991294	2991305	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_014972	CCAAGG	2	12	3030048	3030059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_014972	CAATCC	2	12	3034176	3034187	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_014972	CAAAAA	2	12	3048616	3048627	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_014972	ATCATT	2	12	3150792	3150803	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_014972	ATGCGC	2	12	3174866	3174877	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014972	GGCGGG	2	12	3176494	3176505	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_014972	TGGCGC	2	12	3184960	3184971	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_014972	TGGGGA	2	12	3184992	3185003	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014972	TGTTTT	2	12	3252303	3252314	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014972	GACGGC	2	12	3278733	3278744	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014972	GCCCCT	2	12	3313029	3313040	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_014972	TTCGCC	2	12	3318959	3318970	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
102	NC_014972	GCAGCC	2	12	3328667	3328678	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
103	NC_014972	GGGACA	2	12	3464170	3464181	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_014972	AAACAG	2	12	3503024	3503035	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_014972	GCCGTC	2	12	3506627	3506638	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
106	NC_014972	GCATCC	2	12	3608169	3608180	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
107	NC_014972	GTCAAG	2	12	3608279	3608290	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_014972	CCGCAA	2	12	3658158	3658169	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
109	NC_014972	TCCCTT	2	12	3671733	3671744	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_014972	GGACAG	2	12	3687025	3687036	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_014972	GCCCTT	2	12	3739373	3739384	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.