MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio vulnificus MO6-24/O chromosome II

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014966	CTTATT	2	12	23529	23540	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_014966	GAAAGA	2	12	45921	45932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014966	TCAGGC	2	12	46041	46052	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014966	AGAAGG	2	12	65843	65854	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014966	TTCTAT	2	12	67161	67172	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_014966	AATGAA	2	12	100257	100268	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014966	AGCGAG	2	12	100462	100473	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_014966	AATGTT	2	12	182814	182825	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014966	CTTCTA	2	12	191292	191303	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014966	AAAATG	2	12	191345	191356	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014966	TTGATG	2	12	234826	234837	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014966	TAAAAA	2	12	241381	241392	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014966	CCAGAG	2	12	285210	285221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014966	ACGATG	2	12	289506	289517	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_014966	TGCGCG	2	12	291270	291281	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014966	TGAAAT	2	12	296545	296556	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014966	ATTTCA	2	12	337974	337985	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_014966	CTTATT	2	12	387006	387017	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_014966	ATTTGT	2	12	408834	408845	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014966	TTTTAT	2	12	421474	421485	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014966	ACAGTA	2	12	454746	454757	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_014966	ATAAGA	2	12	459111	459122	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014966	ATTGAG	2	12	470823	470834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014966	AGTGGT	2	12	499079	499090	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014966	ATGCAA	2	12	512034	512045	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_014966	TTTTGT	2	12	553063	553074	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014966	TTTAAA	2	12	567417	567428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014966	GATAAC	2	12	603828	603839	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_014966	TTGATT	2	12	810039	810050	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014966	ATTCTC	2	12	864295	864306	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014966	TTAGCG	2	12	877540	877551	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_014966	TTTTGT	2	12	909457	909468	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014966	CTTGGC	2	12	919154	919165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014966	TGGAAC	2	12	925025	925036	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014966	AGGTAA	2	12	929812	929823	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014966	AAGAGA	2	12	957701	957712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014966	TTAAAA	2	12	986665	986676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014966	GTTTAC	2	12	1112240	1112251	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_014966	ACGTAA	2	12	1146580	1146591	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_014966	TTATAT	2	12	1186471	1186482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014966	CATCAC	2	12	1223579	1223590	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_014966	ACAAAA	2	12	1227702	1227713	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_014966	GAATAA	2	12	1244404	1244415	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014966	ATGCGA	2	12	1255986	1255997	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_014966	CAATAT	2	12	1283642	1283653	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_014966	TATTTT	2	12	1295721	1295732	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014966	TCATAT	2	12	1328091	1328102	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_014966	GCAATT	2	12	1347132	1347143	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_014966	AAAAAG	2	12	1375612	1375623	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014966	TTTTTC	2	12	1418061	1418072	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_014966	CAAATG	2	12	1419828	1419839	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_014966	CATTTG	2	12	1423598	1423609	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_014966	CAATTA	2	12	1425002	1425013	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_014966	GGATGC	2	12	1425177	1425188	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_014966	GGAACA	2	12	1425819	1425830	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_014966	AAAAAC	2	12	1436388	1436399	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_014966	ATCCTA	2	12	1454142	1454153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014966	CCTTCC	2	12	1494957	1494968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_014966	TGTGAT	2	12	1509433	1509444	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014966	TTTTTA	2	12	1514551	1514562	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014966	AGGATA	2	12	1534000	1534011	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014966	CTTTTT	2	12	1589799	1589810	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_014966	CCATCA	2	12	1636882	1636893	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_014966	TGAAAG	2	12	1649599	1649610	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014966	TTAGTT	2	12	1682570	1682581	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014966	TACAAA	2	12	1705276	1705287	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_014966	TTTATA	2	12	1747495	1747506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014966	TCGATA	2	12	1793594	1793605	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.