MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio vulnificus MO6-24/O chromosome I

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014965	TTAAAG	2	12	37474	37485	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014965	TGAAAT	2	12	52131	52142	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014965	GGCAAT	2	12	62640	62651	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_014965	GGATTC	2	12	68829	68840	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_014965	GCAAAA	2	12	102743	102754	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_014965	TTTGTG	2	12	112709	112720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014965	TGAAAT	2	12	161264	161275	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014965	ATTGTT	2	12	197293	197304	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014965	AGTAAG	2	12	214100	214111	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014965	GTTTTT	2	12	235129	235140	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014965	CTTTTT	2	12	239010	239021	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_014965	CAAGCG	2	12	301846	301857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014965	TAATGA	2	12	311786	311797	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014965	ATGGTG	2	12	335010	335021	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014965	GATGAA	2	12	345361	345372	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014965	ATTTGA	2	12	369928	369939	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014965	TGAAAT	2	12	380378	380389	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014965	TGAAAT	2	12	385883	385894	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014965	TGAAAT	2	12	474494	474505	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014965	AAGAAT	2	12	518393	518404	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014965	ATTAGC	2	12	548246	548257	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_014965	TTCCAT	2	12	621056	621067	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014965	TATTTT	2	12	622851	622862	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014965	CAATAA	2	12	719500	719511	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_014965	TTTTTC	2	12	719532	719543	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_014965	TGCCTC	2	12	768187	768198	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
27	NC_014965	AATGAT	2	12	957307	957318	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014965	TTTTTG	2	12	1017370	1017381	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014965	ATTGAG	2	12	1048021	1048032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014965	CACAAG	2	12	1052948	1052959	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014965	AAAAGC	2	12	1080336	1080347	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_014965	AGATAC	2	12	1084390	1084401	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_014965	GATACT	2	12	1104026	1104037	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014965	AATAAC	2	12	1125443	1125454	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014965	AGAGCA	2	12	1160607	1160618	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_014965	CGTCCG	2	12	1201031	1201042	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
37	NC_014965	ATAAAT	2	12	1208819	1208830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014965	CGGTTT	2	12	1436717	1436728	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_014965	TGGTTT	2	12	1439364	1439375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014965	AGGTAT	2	12	1454853	1454864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014965	GAATAT	7	42	1455067	1455108	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014965	TAAACA	2	12	1460883	1460894	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_014965	GGCAAG	2	12	1492179	1492190	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_014965	AAGATG	2	12	1510708	1510719	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014965	AAGCTT	2	12	1511518	1511529	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_014965	TTTGGT	2	12	1516160	1516171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014965	AATTTC	2	12	1521139	1521150	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_014965	TGGTTT	2	12	1523567	1523578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014965	TTTAGG	2	12	1525743	1525754	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014965	TGGTTT	2	12	1527593	1527604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014965	AAAAGG	2	12	1542073	1542084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014965	TCCTAA	2	12	1560415	1560426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014965	CTTTTT	2	12	1608341	1608352	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_014965	ATTTGT	2	12	1681422	1681433	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014965	CTAGAA	2	12	1699476	1699487	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_014965	ATTTTT	2	12	1710852	1710863	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014965	AACAAA	2	12	1776371	1776382	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014965	ATTTAC	2	12	1786633	1786644	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_014965	TTCAAT	2	12	1786738	1786749	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_014965	TTTTCA	2	12	1793093	1793104	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_014965	TGTCGA	2	12	1850013	1850024	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_014965	ATCTCA	3	18	1879209	1879226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014965	CCTTTC	2	12	1899125	1899136	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_014965	ACCTTG	2	12	1993034	1993045	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014965	TAGTGA	2	12	2074597	2074608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014965	ACATTA	2	12	2076967	2076978	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_014965	TAAAAA	2	12	2081299	2081310	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014965	ATTCTG	2	12	2108570	2108581	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_014965	TGAAAC	2	12	2108643	2108654	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_014965	TCACGG	2	12	2113265	2113276	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014965	AACAAA	2	12	2124700	2124711	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_014965	GTCTTA	2	12	2145355	2145366	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_014965	CAAAAA	2	12	2186637	2186648	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_014965	CACTTA	2	12	2206875	2206886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_014965	CTTTGA	2	12	2241305	2241316	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_014965	GTGTGG	2	12	2409433	2409444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014965	CATCTC	2	12	2440403	2440414	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_014965	TCTGTC	2	12	2505713	2505724	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014965	ACGTAA	2	12	2553479	2553490	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_014965	GAACTT	2	12	2559306	2559317	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_014965	ATTTCA	2	12	2661143	2661154	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_014965	TTTCTA	2	12	2679680	2679691	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_014965	TTATTT	2	12	2700813	2700824	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014965	ACGTCA	2	12	2790772	2790783	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_014965	CGAAAA	2	12	2799438	2799449	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_014965	TAAAAA	2	12	2812111	2812122	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014965	CTTGTT	2	12	2817987	2817998	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_014965	ATTTTT	2	12	2848384	2848395	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014965	ATTTGA	2	12	2860051	2860062	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014965	GCCTAT	2	12	2880898	2880909	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_014965	TGAAAC	2	12	2942711	2942722	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_014965	GAAATA	2	12	2959576	2959587	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014965	AGAGAT	2	12	2959612	2959623	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014965	TTTTTA	2	12	3048704	3048715	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014965	GCTTTC	2	12	3074699	3074710	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014965	ATTTTT	2	12	3097572	3097583	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014965	ATGAAA	2	12	3103001	3103012	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014965	ATTTCA	2	12	3116704	3116715	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_014965	AAAATG	2	12	3130801	3130812	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014965	ATTTCA	2	12	3157379	3157390	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_014965	GGGGAC	2	12	3180316	3180327	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_014965	TGGTTA	2	12	3187010	3187021	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.